Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

U1GB83

Protein Details
Accession U1GB83    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
230-258SEDEYESDRPRKRRKLPARARSMKRHSSPBasic
325-356EAVYRSRMKRWSSRRREARRKAQKVNQAQDKYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
238-255RPRKRRKLPARARSMKRH
298-302KRRRK
331-346RMKRWSSRRREARRKA
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd22254  CSB_WHD  
cd18000  DEXHc_ERCC6  
cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MDGDRGHPEDNQSSSAVMATHEQNGASITESDRLKDLQTEVRDQEDLEKDIGRQADMLLFEQANERDQQRLEKTSASKQKLESQIRKLRERVSQPIGTTQRAKLKNDIDRFQVQLDEMVADLVEIEDRMDQRRREVGQATGEGEGSGSGRLANESQRDYLIRTGKITPFSRFGLAAQGRSASNLQDALLDAEDEPPEEEVELPKETLQFMSHRNLRQPGFRTSEVSNVSSEDEYESDRPRKRRKLPARARSMKRHSSPNGSDESAWSRTPAPSAAEDSDIPANEDDSESMPDTLAPEKRRRKVKAAAGYEDAEIEDLRGVDDGNEAVYRSRMKRWSSRRREARRKAQKVNQAQDKYTNTGDMSDGDEAQDESHMPHPEIDDTQFDGGYRIPGDIYPSLFDYQKTGVQWLWELYSQKVGGIIGDEMGLGKTIQIIAFLAGLHYSNMLTKPIIVVCPATVMKQWVNEIHRWWPPFRVTILHSSGSGMINLHRESTQEERLLQQMWDPNASRVKLTAGQKSAKKVLNPILEHGGVLVTTYSGLQTYAPLLIPVSWQYAILDEGHKIRNPNTAITIYCKELRTPNRVILSGTPMQNNLVELWSLFDFVFPMRLGTLVNFRTQFEIPIRQGGYANASNLQVQTALKCAETLKDAISPYLLQRFKIDVAADLPKKSEQVLFCRLTALQRKAYEDFLASEEMKSILSGKRQVLYGIDILRKICNHPDLQDHKNLAGKSGYDYGNPAKSGKMQVVGSLLELWKESGHKTLLFAQHRIMLDILEKYIKSMRGLTYRRMDGNTPIQLRQSMVDEFNNSPELHVFLLTTKVGGLGINLTGADRVIIYDPDWNPSTDLQARERAWRLGQKREVTIYRLMTAGTIEEKIYHRQIFKQFLTNKILRDPKQRQTFHLSDLHDLFTLADEKAPTETTTLFKDAEVKYLTNTSKHPPAQIQDGQQPIKDEKIDLDLKNVPGIRFTEQFAGEATEEKQAATQGSTNSESRVMEGIFARSGIRSAVEHDQIVGGKKVITADPQMIEQEAKKVAAEAAKELRRAGEVARTVPAGTPTWTGQFGVVGKPQEVSAASAFGASARYRAGPLSSSLLAGLQRAQGVNVNTTPDRGDSGRVSRASTPTGSITGGSRPGTSTPPRGRDFGKLIRDYLMGHGGSAYTQMLIDHFNRLCTTPQATMDFKETLKVIATLDKGSRARGKWVLKDEYKSIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.18
4 0.13
5 0.15
6 0.15
7 0.17
8 0.18
9 0.17
10 0.17
11 0.17
12 0.17
13 0.15
14 0.14
15 0.13
16 0.18
17 0.19
18 0.2
19 0.21
20 0.21
21 0.21
22 0.23
23 0.25
24 0.27
25 0.31
26 0.37
27 0.36
28 0.39
29 0.38
30 0.35
31 0.38
32 0.35
33 0.33
34 0.28
35 0.28
36 0.25
37 0.28
38 0.29
39 0.22
40 0.17
41 0.16
42 0.17
43 0.17
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.16
48 0.2
49 0.2
50 0.19
51 0.21
52 0.21
53 0.22
54 0.24
55 0.31
56 0.33
57 0.37
58 0.37
59 0.41
60 0.44
61 0.5
62 0.59
63 0.57
64 0.56
65 0.54
66 0.61
67 0.65
68 0.7
69 0.69
70 0.69
71 0.72
72 0.75
73 0.78
74 0.74
75 0.7
76 0.69
77 0.67
78 0.65
79 0.65
80 0.62
81 0.56
82 0.61
83 0.59
84 0.55
85 0.52
86 0.49
87 0.51
88 0.52
89 0.53
90 0.52
91 0.56
92 0.6
93 0.64
94 0.62
95 0.59
96 0.57
97 0.55
98 0.48
99 0.41
100 0.32
101 0.26
102 0.22
103 0.17
104 0.13
105 0.11
106 0.09
107 0.07
108 0.06
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.05
113 0.07
114 0.09
115 0.15
116 0.22
117 0.23
118 0.27
119 0.35
120 0.37
121 0.4
122 0.42
123 0.41
124 0.4
125 0.42
126 0.39
127 0.32
128 0.3
129 0.24
130 0.21
131 0.16
132 0.1
133 0.08
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.08
138 0.1
139 0.14
140 0.18
141 0.21
142 0.22
143 0.24
144 0.25
145 0.26
146 0.31
147 0.32
148 0.29
149 0.29
150 0.34
151 0.35
152 0.42
153 0.43
154 0.4
155 0.38
156 0.39
157 0.38
158 0.33
159 0.29
160 0.32
161 0.31
162 0.28
163 0.25
164 0.25
165 0.23
166 0.25
167 0.25
168 0.16
169 0.15
170 0.14
171 0.13
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.12
188 0.13
189 0.13
190 0.14
191 0.14
192 0.15
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.18
197 0.26
198 0.32
199 0.34
200 0.4
201 0.45
202 0.46
203 0.5
204 0.51
205 0.49
206 0.5
207 0.48
208 0.46
209 0.4
210 0.45
211 0.4
212 0.37
213 0.3
214 0.25
215 0.25
216 0.21
217 0.2
218 0.15
219 0.12
220 0.14
221 0.17
222 0.22
223 0.28
224 0.34
225 0.43
226 0.52
227 0.62
228 0.68
229 0.76
230 0.81
231 0.85
232 0.89
233 0.91
234 0.92
235 0.92
236 0.9
237 0.9
238 0.88
239 0.86
240 0.8
241 0.79
242 0.73
243 0.72
244 0.68
245 0.61
246 0.57
247 0.49
248 0.44
249 0.38
250 0.37
251 0.31
252 0.27
253 0.24
254 0.21
255 0.2
256 0.21
257 0.2
258 0.17
259 0.16
260 0.2
261 0.2
262 0.2
263 0.2
264 0.2
265 0.21
266 0.19
267 0.18
268 0.14
269 0.13
270 0.11
271 0.12
272 0.1
273 0.09
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.1
279 0.12
280 0.15
281 0.19
282 0.22
283 0.31
284 0.4
285 0.48
286 0.57
287 0.61
288 0.65
289 0.68
290 0.73
291 0.73
292 0.71
293 0.68
294 0.62
295 0.58
296 0.5
297 0.41
298 0.31
299 0.21
300 0.14
301 0.1
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.09
315 0.13
316 0.15
317 0.21
318 0.27
319 0.32
320 0.42
321 0.52
322 0.62
323 0.68
324 0.76
325 0.81
326 0.86
327 0.92
328 0.93
329 0.93
330 0.93
331 0.92
332 0.91
333 0.88
334 0.86
335 0.85
336 0.84
337 0.82
338 0.75
339 0.66
340 0.64
341 0.59
342 0.52
343 0.43
344 0.35
345 0.25
346 0.23
347 0.22
348 0.16
349 0.15
350 0.12
351 0.11
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.06
358 0.07
359 0.12
360 0.13
361 0.13
362 0.14
363 0.14
364 0.16
365 0.17
366 0.17
367 0.13
368 0.14
369 0.14
370 0.13
371 0.12
372 0.11
373 0.1
374 0.1
375 0.09
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.13
384 0.14
385 0.14
386 0.14
387 0.13
388 0.14
389 0.16
390 0.15
391 0.15
392 0.14
393 0.14
394 0.15
395 0.14
396 0.13
397 0.13
398 0.14
399 0.13
400 0.16
401 0.15
402 0.14
403 0.14
404 0.12
405 0.09
406 0.09
407 0.08
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.06
431 0.06
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.08
436 0.09
437 0.09
438 0.08
439 0.08
440 0.07
441 0.1
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.12
446 0.13
447 0.13
448 0.15
449 0.17
450 0.2
451 0.21
452 0.22
453 0.25
454 0.29
455 0.3
456 0.29
457 0.28
458 0.27
459 0.28
460 0.27
461 0.24
462 0.22
463 0.26
464 0.29
465 0.25
466 0.23
467 0.21
468 0.22
469 0.19
470 0.17
471 0.11
472 0.09
473 0.11
474 0.11
475 0.12
476 0.1
477 0.1
478 0.13
479 0.17
480 0.2
481 0.18
482 0.19
483 0.19
484 0.2
485 0.21
486 0.17
487 0.16
488 0.16
489 0.15
490 0.18
491 0.17
492 0.19
493 0.22
494 0.22
495 0.2
496 0.16
497 0.18
498 0.21
499 0.24
500 0.26
501 0.26
502 0.31
503 0.34
504 0.37
505 0.41
506 0.37
507 0.34
508 0.33
509 0.36
510 0.38
511 0.36
512 0.35
513 0.32
514 0.29
515 0.28
516 0.23
517 0.16
518 0.09
519 0.08
520 0.06
521 0.03
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.06
536 0.06
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.08
543 0.08
544 0.08
545 0.07
546 0.1
547 0.11
548 0.12
549 0.13
550 0.14
551 0.19
552 0.2
553 0.2
554 0.2
555 0.19
556 0.19
557 0.22
558 0.22
559 0.18
560 0.2
561 0.2
562 0.18
563 0.24
564 0.28
565 0.3
566 0.31
567 0.34
568 0.32
569 0.33
570 0.32
571 0.26
572 0.27
573 0.24
574 0.23
575 0.19
576 0.17
577 0.17
578 0.17
579 0.16
580 0.11
581 0.07
582 0.06
583 0.05
584 0.06
585 0.06
586 0.07
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.07
592 0.06
593 0.06
594 0.05
595 0.05
596 0.05
597 0.06
598 0.11
599 0.1
600 0.13
601 0.13
602 0.14
603 0.16
604 0.16
605 0.18
606 0.15
607 0.19
608 0.17
609 0.2
610 0.2
611 0.18
612 0.18
613 0.17
614 0.19
615 0.14
616 0.15
617 0.12
618 0.12
619 0.12
620 0.12
621 0.11
622 0.08
623 0.07
624 0.07
625 0.08
626 0.08
627 0.07
628 0.08
629 0.08
630 0.08
631 0.09
632 0.1
633 0.09
634 0.11
635 0.11
636 0.11
637 0.11
638 0.1
639 0.1
640 0.18
641 0.17
642 0.15
643 0.16
644 0.18
645 0.18
646 0.19
647 0.18
648 0.11
649 0.13
650 0.19
651 0.19
652 0.17
653 0.18
654 0.16
655 0.17
656 0.17
657 0.18
658 0.14
659 0.18
660 0.25
661 0.26
662 0.25
663 0.26
664 0.25
665 0.27
666 0.32
667 0.3
668 0.28
669 0.28
670 0.31
671 0.32
672 0.32
673 0.28
674 0.21
675 0.19
676 0.15
677 0.16
678 0.13
679 0.11
680 0.11
681 0.1
682 0.09
683 0.08
684 0.09
685 0.09
686 0.11
687 0.15
688 0.16
689 0.17
690 0.18
691 0.18
692 0.17
693 0.17
694 0.17
695 0.16
696 0.16
697 0.15
698 0.16
699 0.17
700 0.16
701 0.16
702 0.17
703 0.17
704 0.17
705 0.18
706 0.26
707 0.31
708 0.33
709 0.37
710 0.35
711 0.33
712 0.36
713 0.34
714 0.26
715 0.21
716 0.18
717 0.15
718 0.19
719 0.18
720 0.14
721 0.17
722 0.18
723 0.19
724 0.2
725 0.18
726 0.14
727 0.16
728 0.17
729 0.16
730 0.17
731 0.15
732 0.15
733 0.16
734 0.15
735 0.13
736 0.13
737 0.11
738 0.08
739 0.08
740 0.08
741 0.07
742 0.08
743 0.08
744 0.1
745 0.11
746 0.11
747 0.13
748 0.19
749 0.26
750 0.27
751 0.28
752 0.26
753 0.29
754 0.29
755 0.28
756 0.22
757 0.14
758 0.13
759 0.13
760 0.13
761 0.1
762 0.09
763 0.1
764 0.13
765 0.14
766 0.13
767 0.16
768 0.19
769 0.26
770 0.29
771 0.34
772 0.37
773 0.39
774 0.4
775 0.38
776 0.36
777 0.32
778 0.36
779 0.36
780 0.32
781 0.3
782 0.3
783 0.28
784 0.28
785 0.24
786 0.2
787 0.15
788 0.15
789 0.15
790 0.17
791 0.17
792 0.18
793 0.2
794 0.17
795 0.15
796 0.13
797 0.13
798 0.11
799 0.1
800 0.09
801 0.07
802 0.09
803 0.09
804 0.08
805 0.07
806 0.07
807 0.07
808 0.06
809 0.06
810 0.05
811 0.05
812 0.05
813 0.05
814 0.05
815 0.05
816 0.05
817 0.04
818 0.03
819 0.04
820 0.05
821 0.06
822 0.06
823 0.12
824 0.13
825 0.17
826 0.18
827 0.17
828 0.18
829 0.18
830 0.22
831 0.21
832 0.23
833 0.22
834 0.28
835 0.29
836 0.33
837 0.35
838 0.33
839 0.32
840 0.37
841 0.39
842 0.42
843 0.48
844 0.46
845 0.46
846 0.49
847 0.48
848 0.43
849 0.44
850 0.36
851 0.3
852 0.27
853 0.24
854 0.18
855 0.16
856 0.13
857 0.09
858 0.09
859 0.08
860 0.1
861 0.12
862 0.16
863 0.2
864 0.23
865 0.23
866 0.29
867 0.35
868 0.4
869 0.4
870 0.46
871 0.44
872 0.47
873 0.53
874 0.49
875 0.44
876 0.44
877 0.5
878 0.46
879 0.53
880 0.55
881 0.57
882 0.64
883 0.65
884 0.62
885 0.63
886 0.61
887 0.55
888 0.54
889 0.46
890 0.4
891 0.4
892 0.36
893 0.27
894 0.25
895 0.2
896 0.15
897 0.15
898 0.1
899 0.1
900 0.09
901 0.09
902 0.11
903 0.12
904 0.11
905 0.11
906 0.12
907 0.13
908 0.16
909 0.17
910 0.16
911 0.16
912 0.22
913 0.21
914 0.25
915 0.25
916 0.22
917 0.22
918 0.28
919 0.29
920 0.25
921 0.28
922 0.27
923 0.34
924 0.35
925 0.37
926 0.35
927 0.36
928 0.42
929 0.44
930 0.43
931 0.4
932 0.45
933 0.43
934 0.4
935 0.4
936 0.33
937 0.32
938 0.28
939 0.23
940 0.17
941 0.23
942 0.28
943 0.25
944 0.28
945 0.29
946 0.29
947 0.32
948 0.33
949 0.27
950 0.23
951 0.25
952 0.25
953 0.22
954 0.23
955 0.24
956 0.22
957 0.22
958 0.2
959 0.2
960 0.17
961 0.17
962 0.16
963 0.15
964 0.15
965 0.14
966 0.14
967 0.13
968 0.14
969 0.13
970 0.15
971 0.13
972 0.17
973 0.2
974 0.2
975 0.2
976 0.22
977 0.2
978 0.19
979 0.2
980 0.16
981 0.15
982 0.16
983 0.17
984 0.14
985 0.15
986 0.14
987 0.11
988 0.12
989 0.1
990 0.1
991 0.08
992 0.12
993 0.18
994 0.2
995 0.19
996 0.19
997 0.21
998 0.21
999 0.23
1000 0.2
1001 0.15
1002 0.13
1003 0.14
1004 0.15
1005 0.15
1006 0.16
1007 0.16
1008 0.18
1009 0.19
1010 0.19
1011 0.19
1012 0.18
1013 0.19
1014 0.17
1015 0.18
1016 0.16
1017 0.16
1018 0.15
1019 0.15
1020 0.16
1021 0.18
1022 0.18
1023 0.19
1024 0.26
1025 0.29
1026 0.3
1027 0.29
1028 0.28
1029 0.26
1030 0.26
1031 0.23
1032 0.22
1033 0.21
1034 0.22
1035 0.24
1036 0.23
1037 0.22
1038 0.23
1039 0.24
1040 0.18
1041 0.17
1042 0.18
1043 0.17
1044 0.19
1045 0.2
1046 0.19
1047 0.16
1048 0.18
1049 0.17
1050 0.18
1051 0.21
1052 0.2
1053 0.19
1054 0.2
1055 0.19
1056 0.18
1057 0.17
1058 0.16
1059 0.13
1060 0.12
1061 0.12
1062 0.11
1063 0.11
1064 0.1
1065 0.12
1066 0.09
1067 0.1
1068 0.1
1069 0.11
1070 0.12
1071 0.13
1072 0.14
1073 0.13
1074 0.16
1075 0.2
1076 0.19
1077 0.18
1078 0.18
1079 0.18
1080 0.17
1081 0.16
1082 0.15
1083 0.12
1084 0.13
1085 0.13
1086 0.14
1087 0.17
1088 0.18
1089 0.21
1090 0.21
1091 0.24
1092 0.22
1093 0.23
1094 0.24
1095 0.2
1096 0.22
1097 0.19
1098 0.23
1099 0.23
1100 0.28
1101 0.34
1102 0.34
1103 0.36
1104 0.37
1105 0.39
1106 0.39
1107 0.35
1108 0.32
1109 0.27
1110 0.28
1111 0.25
1112 0.21
1113 0.2
1114 0.19
1115 0.23
1116 0.21
1117 0.19
1118 0.19
1119 0.21
1120 0.27
1121 0.31
1122 0.38
1123 0.42
1124 0.49
1125 0.52
1126 0.54
1127 0.54
1128 0.55
1129 0.58
1130 0.57
1131 0.57
1132 0.52
1133 0.5
1134 0.49
1135 0.47
1136 0.41
1137 0.36
1138 0.33
1139 0.23
1140 0.21
1141 0.19
1142 0.17
1143 0.16
1144 0.16
1145 0.13
1146 0.07
1147 0.07
1148 0.07
1149 0.08
1150 0.12
1151 0.13
1152 0.19
1153 0.19
1154 0.21
1155 0.23
1156 0.24
1157 0.26
1158 0.27
1159 0.31
1160 0.27
1161 0.31
1162 0.34
1163 0.35
1164 0.36
1165 0.37
1166 0.36
1167 0.31
1168 0.3
1169 0.26
1170 0.22
1171 0.22
1172 0.21
1173 0.18
1174 0.2
1175 0.22
1176 0.23
1177 0.24
1178 0.31
1179 0.3
1180 0.35
1181 0.41
1182 0.37
1183 0.43
1184 0.48
1185 0.54
1186 0.55
1187 0.63
1188 0.66
1189 0.65
1190 0.68