Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HIE7

Protein Details
Accession U1HIE7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
402-422PAEPPKRLTKKDKKAAETKLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
370-379AKRAKRGAGK
407-415KRLTKKDKK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 11, cyto_nucl 8.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MPSRQPPPYQPPSNAFSPSYGSPSPSFLPNMSSQLSQTQFKRQTQYSGGTQSPVNSPHFASVSLPRANSPPNGAGVNGFYSAPAAPGSMGPPSRPADKATDIRTLEDPLAGTGVNLDEEERNLTSSTYYSQQQGANTSFGSQGTTFGPGSGAGSFERPGSSGYQNGNEENAEDMQRRGQAEADFSAGRWAQHPLWDAFLQGDSLGKRLDKWSYENGIKSPKDGLFYATKGQTRPQTTRVTGHDGASLIIDRGQTIISTESGDVLGDIMKLVSLATRDRITGLLDHSARLACERRDHSAGRVPTDWKAVAITPPAPSIVSQSAVNAAAPTSLKRTFSQMDEEQPASTAHQIVSVFQKVSNANRASEQARLAKRAKRGAGKPADIGAANGAATPSGAQTPVAAPAEPPKRLTKKDKKAAETKLSGAQQQKSANETARMAMGLGSSNKFKKYSWLQNGGAASPAASPGPTPNRSNAGLSSTASTLGSVRTGPSAGRGKQFGEWDENDDRAVQARDVLLVLETDGKAIKALSKGYNTPEKPEKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.5
3 0.41
4 0.38
5 0.34
6 0.35
7 0.31
8 0.3
9 0.27
10 0.3
11 0.3
12 0.29
13 0.3
14 0.24
15 0.28
16 0.27
17 0.3
18 0.28
19 0.27
20 0.25
21 0.29
22 0.33
23 0.34
24 0.34
25 0.4
26 0.46
27 0.5
28 0.56
29 0.52
30 0.55
31 0.54
32 0.58
33 0.53
34 0.52
35 0.47
36 0.42
37 0.4
38 0.36
39 0.34
40 0.33
41 0.3
42 0.25
43 0.25
44 0.27
45 0.27
46 0.25
47 0.24
48 0.26
49 0.29
50 0.31
51 0.3
52 0.28
53 0.3
54 0.33
55 0.32
56 0.3
57 0.26
58 0.25
59 0.25
60 0.24
61 0.22
62 0.2
63 0.2
64 0.16
65 0.13
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.09
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.12
76 0.13
77 0.13
78 0.18
79 0.2
80 0.24
81 0.24
82 0.26
83 0.27
84 0.33
85 0.39
86 0.38
87 0.43
88 0.4
89 0.42
90 0.4
91 0.37
92 0.3
93 0.26
94 0.22
95 0.14
96 0.14
97 0.11
98 0.09
99 0.07
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.13
114 0.13
115 0.15
116 0.16
117 0.19
118 0.21
119 0.21
120 0.25
121 0.25
122 0.23
123 0.21
124 0.2
125 0.18
126 0.16
127 0.16
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.14
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.1
136 0.11
137 0.09
138 0.09
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.12
147 0.13
148 0.17
149 0.18
150 0.23
151 0.24
152 0.24
153 0.23
154 0.2
155 0.19
156 0.16
157 0.15
158 0.12
159 0.11
160 0.12
161 0.13
162 0.15
163 0.15
164 0.14
165 0.16
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.17
170 0.14
171 0.13
172 0.16
173 0.14
174 0.13
175 0.12
176 0.15
177 0.13
178 0.16
179 0.19
180 0.17
181 0.19
182 0.19
183 0.18
184 0.15
185 0.15
186 0.11
187 0.08
188 0.1
189 0.07
190 0.08
191 0.09
192 0.08
193 0.09
194 0.11
195 0.14
196 0.14
197 0.18
198 0.23
199 0.27
200 0.3
201 0.31
202 0.31
203 0.36
204 0.34
205 0.31
206 0.29
207 0.25
208 0.24
209 0.23
210 0.23
211 0.18
212 0.2
213 0.22
214 0.22
215 0.23
216 0.21
217 0.25
218 0.28
219 0.3
220 0.32
221 0.34
222 0.36
223 0.36
224 0.4
225 0.4
226 0.41
227 0.38
228 0.35
229 0.31
230 0.25
231 0.23
232 0.19
233 0.16
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.05
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.04
260 0.05
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.13
276 0.15
277 0.11
278 0.17
279 0.18
280 0.22
281 0.25
282 0.26
283 0.27
284 0.32
285 0.32
286 0.29
287 0.29
288 0.27
289 0.25
290 0.26
291 0.23
292 0.16
293 0.15
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.1
302 0.1
303 0.12
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.08
312 0.07
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.1
317 0.12
318 0.14
319 0.14
320 0.19
321 0.2
322 0.21
323 0.27
324 0.25
325 0.28
326 0.3
327 0.3
328 0.25
329 0.24
330 0.22
331 0.17
332 0.15
333 0.12
334 0.08
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.14
339 0.16
340 0.15
341 0.14
342 0.18
343 0.17
344 0.2
345 0.27
346 0.25
347 0.24
348 0.25
349 0.27
350 0.25
351 0.26
352 0.27
353 0.26
354 0.27
355 0.32
356 0.36
357 0.38
358 0.43
359 0.47
360 0.49
361 0.5
362 0.52
363 0.56
364 0.59
365 0.56
366 0.51
367 0.46
368 0.41
369 0.32
370 0.29
371 0.19
372 0.12
373 0.09
374 0.08
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.07
385 0.11
386 0.11
387 0.11
388 0.1
389 0.19
390 0.24
391 0.25
392 0.27
393 0.32
394 0.38
395 0.46
396 0.57
397 0.6
398 0.65
399 0.73
400 0.79
401 0.78
402 0.8
403 0.82
404 0.79
405 0.71
406 0.63
407 0.61
408 0.54
409 0.51
410 0.48
411 0.42
412 0.39
413 0.39
414 0.38
415 0.35
416 0.36
417 0.34
418 0.31
419 0.29
420 0.25
421 0.22
422 0.2
423 0.17
424 0.13
425 0.11
426 0.11
427 0.12
428 0.13
429 0.17
430 0.2
431 0.22
432 0.23
433 0.23
434 0.29
435 0.37
436 0.46
437 0.51
438 0.57
439 0.55
440 0.59
441 0.6
442 0.52
443 0.43
444 0.32
445 0.23
446 0.15
447 0.14
448 0.09
449 0.08
450 0.08
451 0.13
452 0.22
453 0.26
454 0.28
455 0.31
456 0.36
457 0.38
458 0.4
459 0.34
460 0.31
461 0.28
462 0.27
463 0.25
464 0.21
465 0.2
466 0.17
467 0.16
468 0.12
469 0.11
470 0.11
471 0.09
472 0.1
473 0.11
474 0.11
475 0.11
476 0.18
477 0.25
478 0.28
479 0.33
480 0.34
481 0.35
482 0.38
483 0.43
484 0.38
485 0.38
486 0.35
487 0.37
488 0.38
489 0.36
490 0.33
491 0.29
492 0.26
493 0.23
494 0.23
495 0.17
496 0.16
497 0.16
498 0.16
499 0.16
500 0.16
501 0.12
502 0.1
503 0.1
504 0.12
505 0.11
506 0.11
507 0.12
508 0.11
509 0.12
510 0.12
511 0.15
512 0.15
513 0.2
514 0.24
515 0.29
516 0.33
517 0.39
518 0.49
519 0.46
520 0.51