FuNGI

U1GAA6

Protein Details

Accession

U1GAA6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
314-334	FTPCRRCEAKGRNPNHRQTNC	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1086-1104	PRKDKGSPSEKPQERKSRG

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR000477 RT_dom IPR041577 RT_RNaseH_2 IPR013087 Znf_C2H2_type
Pfam	View protein in Pfam PF17919 RT_RNaseH_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL PS50157 ZINC_FINGER_C2H2_2
CDD	cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MTQPIRTTRQTRGQTKAAEQAEEDKEEIESEEDTPEEHEEEAPTTKEKGTQKDTSRFASLSSVGAESAKSSVKRVPASDSSNMTLKPSELYLFKPTSRQDEKSARIFVERIEDARRIYKNQSEKLALLLPRCLDNEIAHAWYSALSLEDKDALSDSVNGWIRIIKRDFMGTLSELRSAASKESFNWNQGRLPTEYVDEKVGKLRIAGMNSEEDIVQRVYEGFDDVPELQAALAPYSEESLANFRKRLRALQPIHKRMYDEKIAKPRESRTKWSSGYSSNYKANRDSEKLIQKPKAEEVPKRQIDSSANRTSDYFTPCRRCEAKGRNPNHRQTNCPLRDEKKEKGFAGKEDDSSEEESTSAPQRQRRGYAGKQASDMSDDGKSDNSRGEGEILANFGVTCHECNKFFPSGNQLHGHLKSFNAHAIESAQTVLDLSTNLKGEPLEGISNSTETRVTAYPNTDAGSSNTFIAVIDSGFGHSAVNRELLAMLPHTVKPVKQLIIRGIGGRQAVSEIATFVFYIRGGQGVILKLKIAALIFDDLGTDLLISTDYIKAWNIVIDIPRQLAIFHRSEKIRKPIAFVRLQVTRQPISNFVVRVSKDSTIPPHSMGQIALRLNHSGKADLLFTSNRPEIPDGVITATQSTVMYSNQESTPQTIKRGTILGTASSIRAGSFATSEIATEILNGFLGRESLRLDIGCTCIAKSCTCVITNSFQGQKTKDTISAEKEKVKDSRWLEKPYRPHYRYDIPKGIVVPNVSTSTYQEAHVNEDLPLMQQKQLRQLAKRFAVIFNDAPGMARQPEDEWLRIRVPSELEQKLKPRALYRNAPRAKKDIDVTFSQNVRLGRMALAKHSPYSLPVFVVYKYTPEGDVKKARPVVDLRPLNDIAESDAYPLPLQEDILASLAQASYISSIDFVSSFYQHFLHPNDQYRTATVSHRGLEQFCVAPMGFKNSPAHNQRTFERLFTGLLWKIVNVYVDDVNIFTKGAFEQHLYDLDVVFRRLADAGYTFKASKTYLGFQKLVTLGKLVSRLGYSTAEEKLQAIANWDIPRNGHDLERFIGFVGWHRQQVPYFAQRSEILQELKTSIFRAPRKDKGSPSEKPQERKSRGSKALGNLWTNQHNAAFEDLKAAFTKADDILRHFDPVKILYVFLDASKELGFGVAAYQLEGEEAQDPHKPSRTFLRPIIFLSKCLTPAERNYWPTDLELAGLVWAVKQLRIYIEQTRTIIYTDHRERIQSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.67
3	0.68
4	0.6
5	0.52
6	0.45
7	0.46
8	0.42
9	0.39
10	0.35
11	0.26
12	0.23
13	0.22
14	0.22
15	0.15
16	0.13
17	0.11
18	0.12
19	0.12
20	0.12
21	0.13
22	0.14
23	0.13
24	0.13
25	0.13
26	0.14
27	0.16
28	0.19
29	0.19
30	0.19
31	0.2
32	0.21
33	0.27
34	0.32
35	0.38
36	0.43
37	0.5
38	0.57
39	0.64
40	0.67
41	0.65
42	0.63
43	0.55
44	0.48
45	0.44
46	0.36
47	0.28
48	0.25
49	0.21
50	0.16
51	0.17
52	0.15
53	0.12
54	0.13
55	0.16
56	0.15
57	0.18
58	0.22
59	0.28
60	0.32
61	0.33
62	0.38
63	0.41
64	0.46
65	0.49
66	0.49
67	0.45
68	0.45
69	0.43
70	0.38
71	0.32
72	0.27
73	0.22
74	0.2
75	0.2
76	0.17
77	0.21
78	0.26
79	0.29
80	0.29
81	0.34
82	0.36
83	0.42
84	0.48
85	0.48
86	0.5
87	0.55
88	0.6
89	0.61
90	0.62
91	0.54
92	0.5
93	0.47
94	0.39
95	0.37
96	0.33
97	0.28
98	0.28
99	0.29
100	0.29
101	0.36
102	0.37
103	0.34
104	0.38
105	0.43
106	0.48
107	0.52
108	0.56
109	0.52
110	0.49
111	0.49
112	0.49
113	0.44
114	0.37
115	0.34
116	0.29
117	0.28
118	0.28
119	0.26
120	0.21
121	0.19
122	0.21
123	0.2
124	0.21
125	0.18
126	0.17
127	0.16
128	0.14
129	0.14
130	0.1
131	0.09
132	0.08
133	0.08
134	0.09
135	0.11
136	0.11
137	0.11
138	0.12
139	0.11
140	0.11
141	0.12
142	0.11
143	0.17
144	0.19
145	0.19
146	0.18
147	0.22
148	0.23
149	0.29
150	0.31
151	0.26
152	0.25
153	0.27
154	0.27
155	0.25
156	0.27
157	0.21
158	0.23
159	0.22
160	0.22
161	0.19
162	0.19
163	0.2
164	0.17
165	0.19
166	0.17
167	0.17
168	0.18
169	0.27
170	0.3
171	0.33
172	0.36
173	0.35
174	0.36
175	0.38
176	0.39
177	0.32
178	0.33
179	0.29
180	0.28
181	0.28
182	0.26
183	0.28
184	0.25
185	0.23
186	0.26
187	0.26
188	0.23
189	0.21
190	0.25
191	0.24
192	0.25
193	0.25
194	0.22
195	0.22
196	0.23
197	0.23
198	0.17
199	0.14
200	0.14
201	0.13
202	0.11
203	0.08
204	0.08
205	0.08
206	0.09
207	0.1
208	0.08
209	0.08
210	0.11
211	0.1
212	0.11
213	0.1
214	0.1
215	0.08
216	0.09
217	0.1
218	0.07
219	0.07
220	0.06
221	0.07
222	0.08
223	0.08
224	0.07
225	0.08
226	0.14
227	0.2
228	0.23
229	0.26
230	0.27
231	0.34
232	0.36
233	0.42
234	0.42
235	0.47
236	0.51
237	0.59
238	0.68
239	0.7
240	0.72
241	0.66
242	0.62
243	0.57
244	0.56
245	0.55
246	0.5
247	0.49
248	0.55
249	0.58
250	0.58
251	0.58
252	0.6
253	0.61
254	0.61
255	0.62
256	0.58
257	0.62
258	0.61
259	0.62
260	0.57
261	0.51
262	0.53
263	0.5
264	0.49
265	0.47
266	0.48
267	0.46
268	0.46
269	0.46
270	0.45
271	0.43
272	0.42
273	0.43
274	0.49
275	0.53
276	0.58
277	0.57
278	0.55
279	0.54
280	0.55
281	0.55
282	0.52
283	0.53
284	0.55
285	0.6
286	0.61
287	0.6
288	0.55
289	0.51
290	0.5
291	0.5
292	0.5
293	0.47
294	0.43
295	0.41
296	0.41
297	0.41
298	0.39
299	0.38
300	0.35
301	0.34
302	0.42
303	0.42
304	0.49
305	0.48
306	0.47
307	0.51
308	0.56
309	0.6
310	0.61
311	0.68
312	0.71
313	0.78
314	0.83
315	0.83
316	0.76
317	0.7
318	0.69
319	0.73
320	0.66
321	0.62
322	0.6
323	0.54
324	0.61
325	0.62
326	0.61
327	0.59
328	0.61
329	0.56
330	0.59
331	0.57
332	0.49
333	0.51
334	0.46
335	0.38
336	0.34
337	0.35
338	0.28
339	0.28
340	0.25
341	0.17
342	0.15
343	0.13
344	0.14
345	0.16
346	0.19
347	0.2
348	0.24
349	0.3
350	0.34
351	0.38
352	0.42
353	0.47
354	0.47
355	0.54
356	0.56
357	0.51
358	0.49
359	0.46
360	0.4
361	0.34
362	0.29
363	0.2
364	0.15
365	0.13
366	0.12
367	0.14
368	0.14
369	0.13
370	0.14
371	0.13
372	0.13
373	0.13
374	0.14
375	0.12
376	0.12
377	0.12
378	0.11
379	0.09
380	0.08
381	0.07
382	0.06
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.1
387	0.12
388	0.13
389	0.16
390	0.2
391	0.21
392	0.21
393	0.22
394	0.27
395	0.28
396	0.31
397	0.31
398	0.3
399	0.32
400	0.32
401	0.32
402	0.25
403	0.23
404	0.21
405	0.2
406	0.2
407	0.16
408	0.14
409	0.13
410	0.14
411	0.13
412	0.12
413	0.11
414	0.08
415	0.07
416	0.07
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.07
422	0.08
423	0.08
424	0.09
425	0.08
426	0.08
427	0.09
428	0.09
429	0.08
430	0.08
431	0.1
432	0.09
433	0.11
434	0.1
435	0.1
436	0.09
437	0.08
438	0.11
439	0.1
440	0.12
441	0.13
442	0.15
443	0.15
444	0.16
445	0.16
446	0.14
447	0.14
448	0.14
449	0.14
450	0.13
451	0.12
452	0.11
453	0.1
454	0.09
455	0.09
456	0.07
457	0.05
458	0.04
459	0.04
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.06
466	0.06
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.08
476	0.08
477	0.1
478	0.11
479	0.11
480	0.14
481	0.18
482	0.2
483	0.21
484	0.23
485	0.24
486	0.28
487	0.28
488	0.25
489	0.21
490	0.21
491	0.18
492	0.16
493	0.13
494	0.09
495	0.08
496	0.08
497	0.07
498	0.05
499	0.05
500	0.06
501	0.05
502	0.05
503	0.06
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.07
511	0.08
512	0.09
513	0.09
514	0.09
515	0.08
516	0.08
517	0.09
518	0.06
519	0.05
520	0.05
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.06
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.04
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.04
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.07
541	0.06
542	0.07
543	0.08
544	0.09
545	0.09
546	0.09
547	0.1
548	0.09
549	0.09
550	0.1
551	0.12
552	0.14
553	0.15
554	0.19
555	0.21
556	0.25
557	0.3
558	0.35
559	0.38
560	0.36
561	0.39
562	0.4
563	0.45
564	0.44
565	0.4
566	0.36
567	0.34
568	0.34
569	0.33
570	0.31
571	0.25
572	0.24
573	0.23
574	0.22
575	0.2
576	0.22
577	0.19
578	0.16
579	0.2
580	0.18
581	0.2
582	0.2
583	0.18
584	0.17
585	0.18
586	0.21
587	0.2
588	0.21
589	0.2
590	0.19
591	0.18
592	0.18
593	0.17
594	0.14
595	0.14
596	0.13
597	0.13
598	0.12
599	0.13
600	0.13
601	0.15
602	0.15
603	0.11
604	0.11
605	0.11
606	0.11
607	0.09
608	0.11
609	0.09
610	0.09
611	0.12
612	0.13
613	0.12
614	0.13
615	0.13
616	0.12
617	0.13
618	0.13
619	0.1
620	0.1
621	0.1
622	0.09
623	0.08
624	0.07
625	0.06
626	0.06
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.07
631	0.07
632	0.09
633	0.08
634	0.11
635	0.11
636	0.13
637	0.18
638	0.17
639	0.19
640	0.19
641	0.19
642	0.18
643	0.19
644	0.17
645	0.15
646	0.15
647	0.13
648	0.12
649	0.13
650	0.11
651	0.1
652	0.1
653	0.06
654	0.06
655	0.06
656	0.05
657	0.05
658	0.05
659	0.06
660	0.06
661	0.06
662	0.05
663	0.06
664	0.05
665	0.05
666	0.05
667	0.04
668	0.04
669	0.04
670	0.04
671	0.03
672	0.04
673	0.04
674	0.05
675	0.06
676	0.06
677	0.07
678	0.07
679	0.08
680	0.08
681	0.1
682	0.1
683	0.09
684	0.09
685	0.1
686	0.12
687	0.11
688	0.12
689	0.13
690	0.14
691	0.14
692	0.15
693	0.15
694	0.17
695	0.19
696	0.2
697	0.21
698	0.22
699	0.24
700	0.24
701	0.25
702	0.24
703	0.23
704	0.24
705	0.24
706	0.24
707	0.28
708	0.34
709	0.34
710	0.36
711	0.36
712	0.36
713	0.36
714	0.35
715	0.37
716	0.33
717	0.41
718	0.43
719	0.49
720	0.5
721	0.53
722	0.6
723	0.61
724	0.68
725	0.6
726	0.56
727	0.55
728	0.59
729	0.62
730	0.61
731	0.59
732	0.49
733	0.49
734	0.47
735	0.43
736	0.36
737	0.28
738	0.2
739	0.15
740	0.15
741	0.14
742	0.13
743	0.12
744	0.14
745	0.14
746	0.14
747	0.15
748	0.14
749	0.18
750	0.18
751	0.17
752	0.14
753	0.13
754	0.13
755	0.11
756	0.12
757	0.1
758	0.13
759	0.14
760	0.16
761	0.24
762	0.3
763	0.34
764	0.36
765	0.41
766	0.46
767	0.46
768	0.48
769	0.41
770	0.36
771	0.34
772	0.33
773	0.27
774	0.21
775	0.19
776	0.15
777	0.14
778	0.13
779	0.12
780	0.09
781	0.09
782	0.08
783	0.08
784	0.14
785	0.15
786	0.17
787	0.17
788	0.2
789	0.21
790	0.21
791	0.21
792	0.17
793	0.18
794	0.22
795	0.28
796	0.29
797	0.31
798	0.34
799	0.38
800	0.42
801	0.42
802	0.38
803	0.37
804	0.41
805	0.45
806	0.51
807	0.54
808	0.59
809	0.63
810	0.66
811	0.63
812	0.6
813	0.55
814	0.5
815	0.46
816	0.4
817	0.37
818	0.35
819	0.37
820	0.37
821	0.35
822	0.31
823	0.3
824	0.26
825	0.23
826	0.21
827	0.17
828	0.14
829	0.17
830	0.17
831	0.17
832	0.21
833	0.2
834	0.2
835	0.2
836	0.18
837	0.17
838	0.2
839	0.18
840	0.14
841	0.15
842	0.15
843	0.14
844	0.17
845	0.15
846	0.13
847	0.14
848	0.14
849	0.14
850	0.16
851	0.19
852	0.23
853	0.31
854	0.31
855	0.37
856	0.39
857	0.38
858	0.39
859	0.4
860	0.39
861	0.41
862	0.44
863	0.38
864	0.4
865	0.4
866	0.36
867	0.32
868	0.26
869	0.18
870	0.16
871	0.15
872	0.12
873	0.12
874	0.12
875	0.12
876	0.12
877	0.1
878	0.08
879	0.09
880	0.06
881	0.06
882	0.07
883	0.08
884	0.08
885	0.06
886	0.07
887	0.07
888	0.06
889	0.05
890	0.05
891	0.05
892	0.05
893	0.05
894	0.05
895	0.05
896	0.06
897	0.06
898	0.07
899	0.08
900	0.09
901	0.09
902	0.1
903	0.11
904	0.12
905	0.15
906	0.18
907	0.22
908	0.27
909	0.34
910	0.36
911	0.39
912	0.39
913	0.36
914	0.35
915	0.31
916	0.29
917	0.27
918	0.27
919	0.24
920	0.27
921	0.28
922	0.26
923	0.26
924	0.25
925	0.2
926	0.17
927	0.18
928	0.14
929	0.14
930	0.14
931	0.19
932	0.17
933	0.2
934	0.23
935	0.24
936	0.33
937	0.37
938	0.44
939	0.41
940	0.44
941	0.43
942	0.46
943	0.45
944	0.38
945	0.34
946	0.28
947	0.24
948	0.22
949	0.25
950	0.2
951	0.2
952	0.19
953	0.16
954	0.16
955	0.16
956	0.16
957	0.11
958	0.12
959	0.11
960	0.11
961	0.12
962	0.11
963	0.1
964	0.1
965	0.09
966	0.06
967	0.07
968	0.07
969	0.08
970	0.09
971	0.1
972	0.12
973	0.14
974	0.16
975	0.16
976	0.16
977	0.15
978	0.16
979	0.16
980	0.14
981	0.13
982	0.11
983	0.11
984	0.11
985	0.11
986	0.1
987	0.1
988	0.13
989	0.14
990	0.17
991	0.17
992	0.17
993	0.19
994	0.18
995	0.2
996	0.2
997	0.26
998	0.3
999	0.35
1000	0.35
1001	0.33
1002	0.38
1003	0.37
1004	0.34
1005	0.28
1006	0.22
1007	0.17
1008	0.19
1009	0.21
1010	0.16
1011	0.14
1012	0.13
1013	0.14
1014	0.15
1015	0.16
1016	0.15
1017	0.16
1018	0.17
1019	0.17
1020	0.17
1021	0.17
1022	0.16
1023	0.16
1024	0.15
1025	0.16
1026	0.16
1027	0.2
1028	0.23
1029	0.23
1030	0.23
1031	0.21
1032	0.23
1033	0.23
1034	0.22
1035	0.21
1036	0.2
1037	0.22
1038	0.23
1039	0.23
1040	0.21
1041	0.18
1042	0.18
1043	0.14
1044	0.17
1045	0.22
1046	0.23
1047	0.25
1048	0.26
1049	0.28
1050	0.28
1051	0.33
1052	0.35
1053	0.36
1054	0.36
1055	0.34
1056	0.36
1057	0.34
1058	0.35
1059	0.33
1060	0.32
1061	0.25
1062	0.23
1063	0.24
1064	0.23
1065	0.23
1066	0.22
1067	0.2
1068	0.19
1069	0.26
1070	0.3
1071	0.38
1072	0.45
1073	0.52
1074	0.58
1075	0.64
1076	0.67
1077	0.69
1078	0.73
1079	0.69
1080	0.7
1081	0.72
1082	0.72
1083	0.72
1084	0.75
1085	0.76
1086	0.74
1087	0.78
1088	0.78
1089	0.78
1090	0.78
1091	0.78
1092	0.74
1093	0.69
1094	0.72
1095	0.68
1096	0.61
1097	0.55
1098	0.52
1099	0.48
1100	0.44
1101	0.39
1102	0.31
1103	0.26
1104	0.25
1105	0.25
1106	0.22
1107	0.18
1108	0.21
1109	0.19
1110	0.19
1111	0.19
1112	0.19
1113	0.14
1114	0.13
1115	0.16
1116	0.14
1117	0.19
1118	0.19
1119	0.22
1120	0.27
1121	0.28
1122	0.31
1123	0.29
1124	0.29
1125	0.27
1126	0.27
1127	0.28
1128	0.23
1129	0.22
1130	0.19
1131	0.2
1132	0.19
1133	0.16
1134	0.17
1135	0.12
1136	0.12
1137	0.12
1138	0.11
1139	0.09
1140	0.09
1141	0.08
1142	0.06
1143	0.07
1144	0.08
1145	0.08
1146	0.08
1147	0.08
1148	0.08
1149	0.09
1150	0.08
1151	0.09
1152	0.09
1153	0.1
1154	0.12
1155	0.17
1156	0.21
1157	0.25
1158	0.33
1159	0.33
1160	0.33
1161	0.43
1162	0.49
1163	0.51
1164	0.55
1165	0.57
1166	0.51
1167	0.55
1168	0.62
1169	0.52
1170	0.46
1171	0.42
1172	0.38
1173	0.33
1174	0.33
1175	0.32
1176	0.28
1177	0.34
1178	0.4
1179	0.45
1180	0.46
1181	0.48
1182	0.48
1183	0.45
1184	0.42
1185	0.38
1186	0.29
1187	0.22
1188	0.19
1189	0.14
1190	0.12
1191	0.11
1192	0.09
1193	0.07
1194	0.1
1195	0.1
1196	0.1
1197	0.11
1198	0.13
1199	0.17
1200	0.21
1201	0.25
1202	0.31
1203	0.35
1204	0.39
1205	0.39
1206	0.39
1207	0.36
1208	0.33
1209	0.31
1210	0.27
1211	0.32
1212	0.35
1213	0.4
1214	0.4

U1GAA6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer