Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HF09

Protein Details
Accession U1HF09    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-143PFTAHCRKRYRLTQSKNSNAPPCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
376-380KRHAR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013859  Ssr4_N  
IPR046464  SWI-SNF_Ssr4_C  
Gene Ontology GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF20497  SWI-SNF_Ssr4_C  
PF08549  SWI-SNF_Ssr4_N  
Amino Acid Sequences MQQPLRDPAAGVARELLPHLHLVSKYRYPFLNQMSLDTVVSYLTEAPKIVHDLQPVVWQFLEAPPDGTVLLVWQPLDYLGANFASDGYVWGDAEHAFNSEHNGYMVEMWLHRGGYHWPNEPFTAHCRKRYRLTQSKNSNAPPCDPSLWIIHYSRADRENVIPSSQLPLQPNVQTALSQRRFLQSQGHLARKEFMLHDKANWPTINMPSSQGLQYPPHMIARQQAAAAAAAQIQMGAAPIKSVPERNQHRRGPSNALEPTLEEEEDVSRGDMLDFMTPREISRMRYEQHHEWMEEIMSSPFAMKQILPTDLGLGRKGELEALTSGFFDTPTSVLQETPANASRLSVGRMEVAKAEEFTAKAAKKVAEMEAELEHLKKRHARRMAKLDRSLSLVSAEKKLRAATAEGGQPSTFGNSEAESGQRATANIDDIVRDVETASGKKIKPVSAVECVQKGGLEERLQTPTAVISNRQPTPENAIIENKTNNSNTEASNTTETRVSPEAEQLQHPSANAPQTSQSVTNGHRPENQPPAGEETTMEESTVPSLDDMDVDIEMAGLDHDDRQVETQTVENEGSEWVMVDDLNADIRKEDAPGLAEAQIEVPEPVTERAGPPAASDFAHSPTAHATQGLTPAEPSGGQLGEGEDMNTADFDLGQGGFDANLDDTGHDLVDFGDEHGDLNLEGMDDSAFGDAFHPPDEDQSHLLEHGDMS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.21
4 0.14
5 0.15
6 0.15
7 0.17
8 0.18
9 0.22
10 0.28
11 0.34
12 0.36
13 0.38
14 0.39
15 0.4
16 0.46
17 0.48
18 0.5
19 0.43
20 0.43
21 0.43
22 0.42
23 0.37
24 0.29
25 0.23
26 0.14
27 0.14
28 0.11
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.11
33 0.12
34 0.14
35 0.2
36 0.22
37 0.23
38 0.24
39 0.25
40 0.26
41 0.33
42 0.31
43 0.28
44 0.25
45 0.21
46 0.2
47 0.21
48 0.23
49 0.15
50 0.16
51 0.14
52 0.15
53 0.15
54 0.13
55 0.1
56 0.09
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.1
64 0.09
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.14
86 0.14
87 0.14
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.1
94 0.1
95 0.12
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.13
100 0.18
101 0.23
102 0.27
103 0.31
104 0.32
105 0.35
106 0.36
107 0.36
108 0.33
109 0.34
110 0.41
111 0.39
112 0.46
113 0.51
114 0.55
115 0.63
116 0.69
117 0.73
118 0.72
119 0.77
120 0.79
121 0.82
122 0.85
123 0.83
124 0.81
125 0.77
126 0.69
127 0.63
128 0.56
129 0.49
130 0.42
131 0.36
132 0.31
133 0.28
134 0.28
135 0.27
136 0.25
137 0.25
138 0.27
139 0.28
140 0.3
141 0.29
142 0.28
143 0.27
144 0.3
145 0.32
146 0.3
147 0.28
148 0.25
149 0.23
150 0.25
151 0.25
152 0.26
153 0.21
154 0.22
155 0.24
156 0.26
157 0.26
158 0.24
159 0.22
160 0.19
161 0.21
162 0.29
163 0.28
164 0.28
165 0.29
166 0.31
167 0.32
168 0.32
169 0.36
170 0.29
171 0.36
172 0.41
173 0.46
174 0.43
175 0.43
176 0.44
177 0.37
178 0.36
179 0.27
180 0.26
181 0.26
182 0.25
183 0.27
184 0.31
185 0.32
186 0.34
187 0.32
188 0.27
189 0.24
190 0.27
191 0.26
192 0.21
193 0.21
194 0.18
195 0.2
196 0.19
197 0.18
198 0.17
199 0.17
200 0.18
201 0.18
202 0.18
203 0.19
204 0.19
205 0.18
206 0.2
207 0.22
208 0.21
209 0.19
210 0.18
211 0.15
212 0.15
213 0.14
214 0.1
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.06
227 0.07
228 0.1
229 0.14
230 0.24
231 0.34
232 0.43
233 0.52
234 0.55
235 0.61
236 0.65
237 0.65
238 0.63
239 0.57
240 0.56
241 0.48
242 0.45
243 0.37
244 0.31
245 0.3
246 0.24
247 0.2
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.07
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.14
266 0.15
267 0.14
268 0.21
269 0.25
270 0.25
271 0.31
272 0.37
273 0.36
274 0.42
275 0.42
276 0.36
277 0.32
278 0.31
279 0.25
280 0.19
281 0.16
282 0.09
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.08
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.11
295 0.13
296 0.14
297 0.15
298 0.13
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.09
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.11
324 0.13
325 0.13
326 0.12
327 0.12
328 0.13
329 0.13
330 0.14
331 0.11
332 0.09
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.11
338 0.09
339 0.09
340 0.1
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.12
345 0.11
346 0.12
347 0.14
348 0.13
349 0.13
350 0.15
351 0.15
352 0.12
353 0.12
354 0.12
355 0.11
356 0.12
357 0.11
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.12
362 0.16
363 0.21
364 0.28
365 0.37
366 0.43
367 0.5
368 0.61
369 0.68
370 0.7
371 0.7
372 0.64
373 0.55
374 0.52
375 0.44
376 0.33
377 0.25
378 0.2
379 0.17
380 0.2
381 0.2
382 0.17
383 0.18
384 0.18
385 0.17
386 0.15
387 0.15
388 0.12
389 0.14
390 0.16
391 0.16
392 0.16
393 0.15
394 0.15
395 0.13
396 0.12
397 0.09
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.08
405 0.09
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.09
417 0.08
418 0.07
419 0.06
420 0.07
421 0.08
422 0.08
423 0.1
424 0.16
425 0.16
426 0.2
427 0.22
428 0.23
429 0.25
430 0.29
431 0.31
432 0.3
433 0.34
434 0.32
435 0.3
436 0.29
437 0.24
438 0.21
439 0.17
440 0.13
441 0.14
442 0.13
443 0.14
444 0.16
445 0.18
446 0.19
447 0.18
448 0.16
449 0.13
450 0.15
451 0.14
452 0.13
453 0.16
454 0.21
455 0.23
456 0.25
457 0.25
458 0.24
459 0.31
460 0.34
461 0.31
462 0.26
463 0.29
464 0.29
465 0.3
466 0.31
467 0.24
468 0.23
469 0.22
470 0.22
471 0.21
472 0.21
473 0.19
474 0.21
475 0.21
476 0.2
477 0.24
478 0.23
479 0.2
480 0.2
481 0.19
482 0.2
483 0.2
484 0.19
485 0.16
486 0.2
487 0.23
488 0.23
489 0.25
490 0.24
491 0.25
492 0.24
493 0.23
494 0.2
495 0.18
496 0.2
497 0.19
498 0.17
499 0.17
500 0.18
501 0.2
502 0.2
503 0.19
504 0.2
505 0.22
506 0.29
507 0.3
508 0.3
509 0.35
510 0.37
511 0.41
512 0.45
513 0.45
514 0.38
515 0.37
516 0.41
517 0.35
518 0.32
519 0.26
520 0.22
521 0.25
522 0.23
523 0.22
524 0.15
525 0.14
526 0.15
527 0.15
528 0.1
529 0.06
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.05
539 0.05
540 0.04
541 0.04
542 0.03
543 0.04
544 0.04
545 0.05
546 0.06
547 0.07
548 0.08
549 0.1
550 0.11
551 0.11
552 0.13
553 0.14
554 0.16
555 0.16
556 0.14
557 0.13
558 0.12
559 0.12
560 0.09
561 0.08
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.09
569 0.09
570 0.09
571 0.09
572 0.1
573 0.11
574 0.12
575 0.12
576 0.11
577 0.12
578 0.13
579 0.15
580 0.15
581 0.14
582 0.13
583 0.13
584 0.12
585 0.1
586 0.09
587 0.08
588 0.07
589 0.09
590 0.1
591 0.11
592 0.12
593 0.12
594 0.16
595 0.18
596 0.17
597 0.16
598 0.18
599 0.18
600 0.17
601 0.19
602 0.17
603 0.18
604 0.22
605 0.21
606 0.18
607 0.21
608 0.23
609 0.21
610 0.19
611 0.17
612 0.15
613 0.21
614 0.21
615 0.18
616 0.16
617 0.16
618 0.16
619 0.15
620 0.14
621 0.11
622 0.1
623 0.1
624 0.1
625 0.1
626 0.11
627 0.11
628 0.1
629 0.08
630 0.08
631 0.08
632 0.08
633 0.07
634 0.06
635 0.05
636 0.05
637 0.06
638 0.06
639 0.06
640 0.07
641 0.07
642 0.06
643 0.07
644 0.08
645 0.06
646 0.07
647 0.07
648 0.07
649 0.08
650 0.09
651 0.09
652 0.08
653 0.07
654 0.07
655 0.08
656 0.09
657 0.08
658 0.09
659 0.09
660 0.09
661 0.09
662 0.1
663 0.08
664 0.08
665 0.08
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.05
671 0.06
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.07
676 0.08
677 0.1
678 0.11
679 0.12
680 0.12
681 0.17
682 0.19
683 0.21
684 0.21
685 0.22
686 0.23
687 0.22
688 0.22