FuNGI

U1GAH4

Protein Details

Accession

U1GAH4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

5.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
230-253	STVEVVSTRKRKKRWDVSSEPTAG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 12, cyto 7, E.R. 3, nucl 2, golg 1, cysk 1, vacu 1, mito_nucl 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDGTLYSGPKPSTMLTAFDVADFDTIRRLQAERNAQAGGKKGSRTFDLTSQRTDTSTKASLTESFDTTLYEPNGSDKFAGYSTTIAADGDDEDMADTDDSRRLVGQYTASKEQMNEFSSGNGVEEEDILLGREKSLRISDRETDYQKRRFDRGPLTPTRADPFAANKHAGVEEDGQTYRDVMQLQELEREEARVQKLLAEKQANGENGVAEHKPTLKDEADKENTEAGSTVEVVSTRKRKKRWDVSSEPTAGSEAPAADSKTKRSRWDQTPAPPGAEVIPSKRSRWDQAPVMGGATPVGNQGLATPMHPSQTPAVLAGFGTDIGGRSGPLTDEEIDMMLPSEGYEVLEPPPGYEPARIVRKAMATPTPAASANGFGGFMMQEPENPRAMGKQLPTEIPGVGDLQFFKAEDMAYFGKLVDGSDENTMSVEDLKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARQFGAGPLFNQILPLLMEKTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLSKAAGLAHMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAVLPHLKGLVDCIGDNLSDEQAKVRTVTSLAIAALAEAANPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYANYYTSQIMEILLREFASPDEEMKKVVLKVVSQCAGTDGVTAGYLKEHVLQDFFKSFWVRRMALDKRNYRQVVETTVDLGQKVGVSEIVERIVVNLKDESEAYRKMTVETVEKVIASLGAADIGERLEERLIDGVLHAFQEQSIEDVIMLNGFGTVVNALGTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLISRIAMVMKQCGEDALMGKLGIVLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGINQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHVALGVVGLGCEDAMLHLLNLLYPNLFETSPHVIDRIVEAIDAIRMAVGTGIVMNYVWAGLFHPARKVRTPYWRLYNDAYVQGADAMVPYYPNLADEGLARHELAIVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.27
3	0.24
4	0.27
5	0.26
6	0.24
7	0.24
8	0.17
9	0.17
10	0.15
11	0.12
12	0.14
13	0.14
14	0.15
15	0.17
16	0.18
17	0.22
18	0.3
19	0.4
20	0.38
21	0.41
22	0.42
23	0.41
24	0.42
25	0.43
26	0.42
27	0.36
28	0.37
29	0.37
30	0.39
31	0.42
32	0.44
33	0.42
34	0.44
35	0.49
36	0.48
37	0.5
38	0.5
39	0.47
40	0.44
41	0.42
42	0.35
43	0.32
44	0.33
45	0.28
46	0.27
47	0.28
48	0.29
49	0.33
50	0.35
51	0.3
52	0.27
53	0.26
54	0.26
55	0.25
56	0.27
57	0.22
58	0.2
59	0.18
60	0.21
61	0.22
62	0.21
63	0.21
64	0.16
65	0.17
66	0.16
67	0.18
68	0.14
69	0.14
70	0.13
71	0.14
72	0.13
73	0.11
74	0.11
75	0.09
76	0.09
77	0.09
78	0.08
79	0.07
80	0.07
81	0.07
82	0.08
83	0.08
84	0.08
85	0.08
86	0.12
87	0.12
88	0.12
89	0.13
90	0.13
91	0.15
92	0.17
93	0.22
94	0.26
95	0.32
96	0.36
97	0.37
98	0.37
99	0.36
100	0.38
101	0.37
102	0.33
103	0.28
104	0.24
105	0.23
106	0.23
107	0.22
108	0.18
109	0.12
110	0.11
111	0.09
112	0.09
113	0.08
114	0.07
115	0.07
116	0.07
117	0.09
118	0.09
119	0.09
120	0.12
121	0.12
122	0.15
123	0.22
124	0.26
125	0.28
126	0.34
127	0.39
128	0.44
129	0.51
130	0.54
131	0.57
132	0.61
133	0.64
134	0.66
135	0.65
136	0.64
137	0.62
138	0.64
139	0.64
140	0.65
141	0.67
142	0.67
143	0.69
144	0.66
145	0.64
146	0.59
147	0.5
148	0.42
149	0.35
150	0.34
151	0.34
152	0.36
153	0.34
154	0.3
155	0.31
156	0.31
157	0.29
158	0.25
159	0.21
160	0.19
161	0.21
162	0.21
163	0.2
164	0.19
165	0.19
166	0.17
167	0.15
168	0.14
169	0.11
170	0.15
171	0.18
172	0.19
173	0.23
174	0.24
175	0.24
176	0.24
177	0.26
178	0.22
179	0.25
180	0.26
181	0.23
182	0.22
183	0.23
184	0.29
185	0.3
186	0.37
187	0.34
188	0.33
189	0.35
190	0.4
191	0.37
192	0.32
193	0.28
194	0.21
195	0.18
196	0.21
197	0.17
198	0.12
199	0.13
200	0.15
201	0.16
202	0.18
203	0.22
204	0.21
205	0.27
206	0.3
207	0.38
208	0.41
209	0.41
210	0.41
211	0.39
212	0.37
213	0.32
214	0.27
215	0.18
216	0.13
217	0.12
218	0.11
219	0.08
220	0.09
221	0.1
222	0.17
223	0.26
224	0.35
225	0.42
226	0.49
227	0.58
228	0.69
229	0.78
230	0.81
231	0.82
232	0.82
233	0.82
234	0.84
235	0.76
236	0.65
237	0.55
238	0.45
239	0.34
240	0.26
241	0.19
242	0.11
243	0.09
244	0.11
245	0.12
246	0.17
247	0.18
248	0.25
249	0.33
250	0.37
251	0.42
252	0.48
253	0.56
254	0.59
255	0.66
256	0.67
257	0.67
258	0.72
259	0.67
260	0.6
261	0.5
262	0.43
263	0.36
264	0.31
265	0.24
266	0.18
267	0.25
268	0.25
269	0.27
270	0.32
271	0.35
272	0.37
273	0.41
274	0.45
275	0.43
276	0.45
277	0.48
278	0.41
279	0.38
280	0.33
281	0.27
282	0.2
283	0.14
284	0.09
285	0.07
286	0.06
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.08
291	0.08
292	0.08
293	0.1
294	0.11
295	0.12
296	0.13
297	0.14
298	0.13
299	0.15
300	0.16
301	0.13
302	0.13
303	0.12
304	0.11
305	0.1
306	0.08
307	0.06
308	0.06
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.06
313	0.05
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.07
318	0.09
319	0.1
320	0.1
321	0.1
322	0.1
323	0.09
324	0.09
325	0.08
326	0.06
327	0.05
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.07
335	0.1
336	0.1
337	0.11
338	0.13
339	0.14
340	0.15
341	0.15
342	0.17
343	0.2
344	0.28
345	0.27
346	0.26
347	0.27
348	0.29
349	0.3
350	0.31
351	0.28
352	0.23
353	0.24
354	0.24
355	0.23
356	0.21
357	0.2
358	0.17
359	0.14
360	0.12
361	0.11
362	0.09
363	0.07
364	0.07
365	0.06
366	0.06
367	0.07
368	0.06
369	0.08
370	0.11
371	0.14
372	0.15
373	0.15
374	0.15
375	0.14
376	0.16
377	0.18
378	0.17
379	0.19
380	0.2
381	0.21
382	0.22
383	0.22
384	0.2
385	0.16
386	0.15
387	0.12
388	0.1
389	0.1
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.09
394	0.08
395	0.08
396	0.07
397	0.06
398	0.1
399	0.1
400	0.1
401	0.1
402	0.1
403	0.1
404	0.1
405	0.1
406	0.08
407	0.08
408	0.09
409	0.1
410	0.1
411	0.09
412	0.09
413	0.09
414	0.08
415	0.08
416	0.07
417	0.09
418	0.11
419	0.12
420	0.16
421	0.17
422	0.18
423	0.21
424	0.26
425	0.27
426	0.35
427	0.41
428	0.43
429	0.48
430	0.48
431	0.46
432	0.48
433	0.48
434	0.44
435	0.44
436	0.41
437	0.41
438	0.44
439	0.43
440	0.41
441	0.47
442	0.5
443	0.45
444	0.42
445	0.41
446	0.44
447	0.51
448	0.5
449	0.41
450	0.32
451	0.31
452	0.3
453	0.28
454	0.22
455	0.15
456	0.12
457	0.13
458	0.14
459	0.13
460	0.13
461	0.1
462	0.08
463	0.08
464	0.09
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.07
469	0.1
470	0.12
471	0.13
472	0.12
473	0.12
474	0.16
475	0.17
476	0.18
477	0.15
478	0.15
479	0.14
480	0.18
481	0.19
482	0.17
483	0.18
484	0.17
485	0.18
486	0.17
487	0.17
488	0.13
489	0.13
490	0.14
491	0.13
492	0.15
493	0.16
494	0.16
495	0.16
496	0.18
497	0.18
498	0.16
499	0.14
500	0.13
501	0.13
502	0.14
503	0.13
504	0.12
505	0.09
506	0.09
507	0.08
508	0.08
509	0.06
510	0.04
511	0.03
512	0.04
513	0.05
514	0.05
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.07
519	0.09
520	0.1
521	0.12
522	0.12
523	0.13
524	0.14
525	0.14
526	0.14
527	0.12
528	0.1
529	0.07
530	0.07
531	0.06
532	0.05
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.05
542	0.06
543	0.08
544	0.1
545	0.1
546	0.1
547	0.12
548	0.13
549	0.14
550	0.15
551	0.13
552	0.11
553	0.11
554	0.11
555	0.11
556	0.1
557	0.1
558	0.09
559	0.08
560	0.09
561	0.08
562	0.07
563	0.06
564	0.05
565	0.04
566	0.04
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.02
572	0.03
573	0.03
574	0.04
575	0.06
576	0.07
577	0.11
578	0.16
579	0.2
580	0.22
581	0.27
582	0.36
583	0.45
584	0.52
585	0.55
586	0.57
587	0.6
588	0.65
589	0.62
590	0.56
591	0.49
592	0.45
593	0.43
594	0.37
595	0.33
596	0.25
597	0.23
598	0.19
599	0.17
600	0.12
601	0.08
602	0.06
603	0.04
604	0.04
605	0.04
606	0.05
607	0.04
608	0.04
609	0.05
610	0.05
611	0.05
612	0.06
613	0.07
614	0.07
615	0.07
616	0.07
617	0.07
618	0.07
619	0.07
620	0.07
621	0.06
622	0.06
623	0.06
624	0.06
625	0.07
626	0.07
627	0.07
628	0.07
629	0.07
630	0.07
631	0.08
632	0.07
633	0.07
634	0.07
635	0.06
636	0.06
637	0.05
638	0.05
639	0.04
640	0.04
641	0.03
642	0.03
643	0.03
644	0.03
645	0.03
646	0.03
647	0.03
648	0.04
649	0.04
650	0.05
651	0.06
652	0.06
653	0.06
654	0.06
655	0.06
656	0.06
657	0.05
658	0.05
659	0.06
660	0.08
661	0.13
662	0.22
663	0.24
664	0.26
665	0.31
666	0.34
667	0.36
668	0.36
669	0.38
670	0.32
671	0.31
672	0.3
673	0.24
674	0.2
675	0.18
676	0.15
677	0.08
678	0.05
679	0.04
680	0.03
681	0.04
682	0.04
683	0.04
684	0.05
685	0.05
686	0.04
687	0.07
688	0.08
689	0.08
690	0.08
691	0.08
692	0.08
693	0.08
694	0.08
695	0.06
696	0.06
697	0.06
698	0.06
699	0.06
700	0.06
701	0.06
702	0.06
703	0.06
704	0.06
705	0.07
706	0.07
707	0.08
708	0.11
709	0.11
710	0.11
711	0.11
712	0.13
713	0.11
714	0.14
715	0.13
716	0.12
717	0.15
718	0.19
719	0.2
720	0.17
721	0.17
722	0.16
723	0.16
724	0.14
725	0.11
726	0.07
727	0.06
728	0.06
729	0.06
730	0.05
731	0.04
732	0.05
733	0.05
734	0.08
735	0.08
736	0.09
737	0.1
738	0.11
739	0.13
740	0.13
741	0.13
742	0.13
743	0.14
744	0.14
745	0.19
746	0.23
747	0.22
748	0.23
749	0.31
750	0.35
751	0.41
752	0.49
753	0.51
754	0.5
755	0.58
756	0.57
757	0.5
758	0.47
759	0.41
760	0.37
761	0.31
762	0.27
763	0.2
764	0.21
765	0.2
766	0.17
767	0.15
768	0.1
769	0.09
770	0.08
771	0.07
772	0.05
773	0.05
774	0.06
775	0.07
776	0.07
777	0.07
778	0.07
779	0.07
780	0.12
781	0.11
782	0.12
783	0.12
784	0.12
785	0.12
786	0.13
787	0.15
788	0.14
789	0.16
790	0.16
791	0.19
792	0.19
793	0.19
794	0.2
795	0.19
796	0.19
797	0.19
798	0.19
799	0.17
800	0.17
801	0.16
802	0.14
803	0.12
804	0.08
805	0.06
806	0.04
807	0.04
808	0.03
809	0.03
810	0.04
811	0.04
812	0.04
813	0.04
814	0.04
815	0.04
816	0.04
817	0.05
818	0.06
819	0.06
820	0.06
821	0.06
822	0.06
823	0.06
824	0.07
825	0.06
826	0.05
827	0.05
828	0.06
829	0.06
830	0.06
831	0.06
832	0.05
833	0.05
834	0.06
835	0.06
836	0.05
837	0.05
838	0.04
839	0.03
840	0.03
841	0.03
842	0.03
843	0.03
844	0.03
845	0.04
846	0.04
847	0.04
848	0.08
849	0.09
850	0.12
851	0.13
852	0.13
853	0.14
854	0.2
855	0.3
856	0.29
857	0.31
858	0.31
859	0.33
860	0.33
861	0.32
862	0.29
863	0.22
864	0.22
865	0.21
866	0.22
867	0.25
868	0.27
869	0.27
870	0.3
871	0.32
872	0.37
873	0.41
874	0.4
875	0.34
876	0.33
877	0.33
878	0.29
879	0.27
880	0.2
881	0.15
882	0.12
883	0.12
884	0.1
885	0.1
886	0.09
887	0.08
888	0.1
889	0.1
890	0.11
891	0.11
892	0.11
893	0.11
894	0.1
895	0.11
896	0.09
897	0.09
898	0.08
899	0.08
900	0.09
901	0.08
902	0.07
903	0.06
904	0.05
905	0.04
906	0.05
907	0.06
908	0.06
909	0.06
910	0.06
911	0.06
912	0.06
913	0.06
914	0.05
915	0.05
916	0.04
917	0.04
918	0.04
919	0.04
920	0.05
921	0.04
922	0.04
923	0.04
924	0.04
925	0.04
926	0.04
927	0.04
928	0.04
929	0.04
930	0.05
931	0.08
932	0.08
933	0.09
934	0.1
935	0.13
936	0.14
937	0.14
938	0.16
939	0.16
940	0.17
941	0.19
942	0.2
943	0.24
944	0.26
945	0.27
946	0.28
947	0.29
948	0.34
949	0.37
950	0.46
951	0.45
952	0.51
953	0.53
954	0.59
955	0.62
956	0.64
957	0.61
958	0.61
959	0.58
960	0.53
961	0.5
962	0.42
963	0.35
964	0.28
965	0.23
966	0.14
967	0.11
968	0.08
969	0.08
970	0.08
971	0.09
972	0.1
973	0.11
974	0.14
975	0.18
976	0.2
977	0.22
978	0.23
979	0.23
980	0.26
981	0.25
982	0.24
983	0.25
984	0.23
985	0.21
986	0.19
987	0.18
988	0.19
989	0.19
990	0.19
991	0.15
992	0.18
993	0.22
994	0.22
995	0.24
996	0.22
997	0.27
998	0.33
999	0.43
1000	0.5
1001	0.51
1002	0.59
1003	0.65
1004	0.72
1005	0.67
1006	0.6
1007	0.51
1008	0.42
1009	0.36
1010	0.28
1011	0.2
1012	0.12
1013	0.14
1014	0.13
1015	0.12
1016	0.11
1017	0.11
1018	0.11
1019	0.1
1020	0.1
1021	0.07
1022	0.07
1023	0.08
1024	0.1
1025	0.12
1026	0.12
1027	0.13
1028	0.14
1029	0.16
1030	0.19
1031	0.26
1032	0.31
1033	0.35
1034	0.39
1035	0.42
1036	0.42
1037	0.41
1038	0.38
1039	0.29
1040	0.25
1041	0.19
1042	0.15
1043	0.11
1044	0.09
1045	0.08
1046	0.07
1047	0.06
1048	0.04
1049	0.04
1050	0.04
1051	0.05
1052	0.05
1053	0.06
1054	0.09
1055	0.1
1056	0.1
1057	0.11
1058	0.16
1059	0.16
1060	0.18
1061	0.18
1062	0.17
1063	0.18
1064	0.18
1065	0.19
1066	0.21
1067	0.23
1068	0.26
1069	0.26
1070	0.25
1071	0.28
1072	0.27
1073	0.26
1074	0.2
1075	0.17
1076	0.14
1077	0.14
1078	0.15
1079	0.11
1080	0.11
1081	0.11
1082	0.11
1083	0.13
1084	0.12
1085	0.13
1086	0.11
1087	0.11
1088	0.11
1089	0.1
1090	0.1
1091	0.09
1092	0.08
1093	0.07
1094	0.08
1095	0.08
1096	0.08
1097	0.08
1098	0.08
1099	0.08
1100	0.07
1101	0.06
1102	0.07
1103	0.11
1104	0.1
1105	0.1
1106	0.11
1107	0.14
1108	0.19
1109	0.21
1110	0.23
1111	0.2
1112	0.2
1113	0.22
1114	0.27
1115	0.3
1116	0.27
1117	0.27
1118	0.26
1119	0.26
1120	0.25
1121	0.23
1122	0.18
1123	0.11
1124	0.1
1125	0.08
1126	0.06
1127	0.05
1128	0.05
1129	0.05
1130	0.04
1131	0.04
1132	0.04
1133	0.03
1134	0.05
1135	0.05
1136	0.05
1137	0.06
1138	0.06
1139	0.07
1140	0.09
1141	0.09
1142	0.08
1143	0.08
1144	0.1
1145	0.11
1146	0.11
1147	0.1
1148	0.14
1149	0.21
1150	0.23
1151	0.24
1152	0.23
1153	0.21
1154	0.22
1155	0.24
1156	0.21
1157	0.14
1158	0.11
1159	0.11
1160	0.11
1161	0.11
1162	0.1
1163	0.08
1164	0.06
1165	0.05
1166	0.05
1167	0.05
1168	0.05
1169	0.04
1170	0.05
1171	0.05
1172	0.05
1173	0.05
1174	0.05
1175	0.05
1176	0.05
1177	0.05
1178	0.04
1179	0.06
1180	0.11
1181	0.15
1182	0.17
1183	0.25
1184	0.31
1185	0.36
1186	0.43
1187	0.49
1188	0.52
1189	0.59
1190	0.65
1191	0.66
1192	0.7
1193	0.7
1194	0.68
1195	0.66
1196	0.66
1197	0.58
1198	0.55
1199	0.47
1200	0.36
1201	0.32
1202	0.27
1203	0.22
1204	0.14
1205	0.11
1206	0.08
1207	0.07
1208	0.07
1209	0.07
1210	0.08
1211	0.08
1212	0.09
1213	0.1
1214	0.1
1215	0.1
1216	0.12
1217	0.15
1218	0.16
1219	0.17
1220	0.17
1221	0.15

U1GAH4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer