FuNGI

U1GG30

Protein Details

Accession

U1GG30

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
320-344	VEKAQKQAKEQKKSNKKEEKSTEKP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
316-339	SKAAVEKAQKQAKEQKKSNKKEEK

Subcellular Location(s)

nucl 10, cyto 8.5, cyto_mito 8.5, mito 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MTSSTSSMTTKVSITLTRPEDWDEWMLIVNSMARNGDVKDLINPDWPIEPPQLSEPKRPTAADIKPGAASLTELDTGEQKLFTLLREDYKYDMMRYRDRQSALSSIQDFILTRIDRQHLILLGGKETVYQMLTALKKRLAPTDRAREMDVIRRYRDLQRAPKYQQIDKWLLQWERVYTEAEQLSLPDVQKERPLYDFLNALRPVDTAFVAGREATVEERIRRGEDLPTVLDMLENYRNHVRISKAFSNKGSSYTAFATFQGSPEDKEKKKQKCPCGEEHLFKECPYLIESLRASSYGLQTQKSNRRSTRSWRRYQSKAAVEKAQKQAKEQKKSNKKEEKSTEKPATAMGAFAVESFSYKLKNCWTLDSGTDTHVCNNRTRFKFERMATEEDVLMAGKTTYAIEAFGRVEITVKTPRFSDESGVPATSVDDYWVLEYGPPEPLDDSRAAFALNKPSRAPKAPVKATATEWHRILAYARPESIAYLEQSVEGAKVIGRAPFTTDYETCLLTKAHELVSRRTDEEEPPIEPLSRIGERTLRKAYAEVTKKYKITIERSAPYTAAQNGNTERAGGVLILRARALRIEAKLPDELWPEAFKTAGYLNNRTPKRGLRWKTPLEAILKKRLQLSHLYPYGCRAYPLRKNILHSYKLEPRALIRNAAEKKISELAKKGTYEVILKDKISELAKKGTYEVILKDMQKEILPLTWVFKYKFNTDGYLEKFKARLAFEAALLKRFEMKSLGELKWFLADSKGAPKTPLPADGVPLANNDEDSDPQRTHAFQSRIGSLNFAAVVTRPDIAFTTSKLAQNWKNPSAAHIAVANRVIAYLYATRNYAIEYDGRATAQIFMASSDAAYADNESRHSSDGYLFQLYGGAIDWRAAKQRTVTTSSTEAELLALSRAAKEIIWWRRFFASIRFDTQQEMVINCDNLQTIRHPAYLNSEVRITMARN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.31
3	0.33
4	0.33
5	0.34
6	0.37
7	0.35
8	0.35
9	0.35
10	0.27
11	0.24
12	0.23
13	0.22
14	0.17
15	0.16
16	0.16
17	0.14
18	0.14
19	0.14
20	0.12
21	0.14
22	0.15
23	0.19
24	0.17
25	0.18
26	0.21
27	0.25
28	0.26
29	0.3
30	0.29
31	0.26
32	0.27
33	0.27
34	0.26
35	0.26
36	0.26
37	0.23
38	0.3
39	0.38
40	0.4
41	0.47
42	0.49
43	0.52
44	0.55
45	0.53
46	0.51
47	0.5
48	0.52
49	0.52
50	0.49
51	0.44
52	0.41
53	0.4
54	0.35
55	0.26
56	0.21
57	0.14
58	0.13
59	0.12
60	0.12
61	0.12
62	0.14
63	0.15
64	0.15
65	0.14
66	0.11
67	0.12
68	0.13
69	0.13
70	0.16
71	0.17
72	0.22
73	0.26
74	0.27
75	0.28
76	0.34
77	0.35
78	0.33
79	0.38
80	0.37
81	0.43
82	0.48
83	0.5
84	0.51
85	0.51
86	0.5
87	0.48
88	0.48
89	0.42
90	0.42
91	0.38
92	0.32
93	0.3
94	0.29
95	0.25
96	0.2
97	0.24
98	0.18
99	0.19
100	0.23
101	0.26
102	0.26
103	0.27
104	0.29
105	0.23
106	0.24
107	0.28
108	0.23
109	0.21
110	0.21
111	0.19
112	0.16
113	0.15
114	0.14
115	0.09
116	0.08
117	0.08
118	0.14
119	0.18
120	0.22
121	0.25
122	0.26
123	0.3
124	0.32
125	0.4
126	0.39
127	0.43
128	0.49
129	0.56
130	0.59
131	0.57
132	0.57
133	0.52
134	0.51
135	0.51
136	0.5
137	0.44
138	0.41
139	0.42
140	0.44
141	0.47
142	0.53
143	0.53
144	0.55
145	0.59
146	0.66
147	0.68
148	0.71
149	0.69
150	0.66
151	0.62
152	0.59
153	0.57
154	0.49
155	0.49
156	0.5
157	0.45
158	0.42
159	0.4
160	0.34
161	0.29
162	0.29
163	0.27
164	0.2
165	0.25
166	0.22
167	0.2
168	0.18
169	0.16
170	0.17
171	0.17
172	0.17
173	0.15
174	0.17
175	0.17
176	0.23
177	0.25
178	0.25
179	0.24
180	0.27
181	0.24
182	0.25
183	0.28
184	0.23
185	0.29
186	0.28
187	0.26
188	0.23
189	0.22
190	0.21
191	0.18
192	0.17
193	0.09
194	0.09
195	0.09
196	0.09
197	0.09
198	0.08
199	0.07
200	0.08
201	0.08
202	0.12
203	0.15
204	0.16
205	0.19
206	0.21
207	0.21
208	0.22
209	0.23
210	0.22
211	0.22
212	0.23
213	0.21
214	0.2
215	0.19
216	0.18
217	0.16
218	0.13
219	0.13
220	0.17
221	0.16
222	0.18
223	0.21
224	0.23
225	0.23
226	0.27
227	0.27
228	0.26
229	0.35
230	0.4
231	0.44
232	0.47
233	0.48
234	0.51
235	0.48
236	0.45
237	0.4
238	0.32
239	0.28
240	0.26
241	0.26
242	0.2
243	0.2
244	0.2
245	0.17
246	0.17
247	0.19
248	0.17
249	0.17
250	0.23
251	0.31
252	0.3
253	0.39
254	0.48
255	0.53
256	0.62
257	0.69
258	0.73
259	0.75
260	0.8
261	0.79
262	0.79
263	0.77
264	0.73
265	0.69
266	0.65
267	0.55
268	0.49
269	0.42
270	0.33
271	0.27
272	0.22
273	0.19
274	0.13
275	0.18
276	0.18
277	0.17
278	0.17
279	0.16
280	0.15
281	0.14
282	0.16
283	0.16
284	0.18
285	0.18
286	0.21
287	0.29
288	0.38
289	0.42
290	0.48
291	0.48
292	0.52
293	0.57
294	0.65
295	0.68
296	0.69
297	0.72
298	0.74
299	0.77
300	0.76
301	0.79
302	0.77
303	0.74
304	0.71
305	0.65
306	0.63
307	0.6
308	0.61
309	0.62
310	0.58
311	0.49
312	0.48
313	0.54
314	0.55
315	0.61
316	0.61
317	0.63
318	0.69
319	0.77
320	0.83
321	0.83
322	0.78
323	0.79
324	0.81
325	0.8
326	0.76
327	0.77
328	0.72
329	0.62
330	0.58
331	0.48
332	0.41
333	0.3
334	0.23
335	0.14
336	0.08
337	0.08
338	0.07
339	0.07
340	0.04
341	0.05
342	0.06
343	0.07
344	0.08
345	0.09
346	0.11
347	0.14
348	0.21
349	0.21
350	0.24
351	0.25
352	0.25
353	0.26
354	0.28
355	0.25
356	0.2
357	0.21
358	0.18
359	0.2
360	0.23
361	0.23
362	0.23
363	0.28
364	0.36
365	0.36
366	0.43
367	0.43
368	0.45
369	0.52
370	0.49
371	0.53
372	0.48
373	0.51
374	0.46
375	0.42
376	0.35
377	0.27
378	0.26
379	0.16
380	0.11
381	0.06
382	0.04
383	0.03
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.07
396	0.07
397	0.1
398	0.15
399	0.15
400	0.16
401	0.16
402	0.18
403	0.2
404	0.2
405	0.19
406	0.15
407	0.17
408	0.17
409	0.17
410	0.15
411	0.12
412	0.12
413	0.1
414	0.08
415	0.06
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.06
420	0.05
421	0.05
422	0.06
423	0.06
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.08
428	0.08
429	0.1
430	0.1
431	0.1
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.09
436	0.1
437	0.18
438	0.19
439	0.2
440	0.2
441	0.23
442	0.26
443	0.28
444	0.32
445	0.28
446	0.36
447	0.37
448	0.41
449	0.41
450	0.4
451	0.39
452	0.41
453	0.37
454	0.31
455	0.28
456	0.24
457	0.21
458	0.19
459	0.18
460	0.16
461	0.17
462	0.15
463	0.15
464	0.15
465	0.15
466	0.14
467	0.15
468	0.12
469	0.08
470	0.08
471	0.08
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.06
476	0.05
477	0.04
478	0.04
479	0.05
480	0.06
481	0.07
482	0.08
483	0.08
484	0.1
485	0.12
486	0.13
487	0.15
488	0.14
489	0.15
490	0.16
491	0.17
492	0.14
493	0.14
494	0.12
495	0.1
496	0.11
497	0.1
498	0.11
499	0.13
500	0.15
501	0.17
502	0.22
503	0.23
504	0.22
505	0.24
506	0.24
507	0.22
508	0.25
509	0.23
510	0.2
511	0.2
512	0.2
513	0.17
514	0.16
515	0.15
516	0.14
517	0.13
518	0.13
519	0.12
520	0.18
521	0.19
522	0.24
523	0.27
524	0.24
525	0.23
526	0.23
527	0.25
528	0.27
529	0.32
530	0.31
531	0.34
532	0.37
533	0.37
534	0.37
535	0.38
536	0.35
537	0.35
538	0.39
539	0.39
540	0.38
541	0.41
542	0.41
543	0.37
544	0.32
545	0.28
546	0.23
547	0.2
548	0.17
549	0.17
550	0.17
551	0.19
552	0.18
553	0.16
554	0.13
555	0.1
556	0.1
557	0.07
558	0.06
559	0.06
560	0.07
561	0.07
562	0.07
563	0.07
564	0.07
565	0.07
566	0.09
567	0.1
568	0.11
569	0.14
570	0.15
571	0.17
572	0.18
573	0.18
574	0.19
575	0.18
576	0.17
577	0.15
578	0.15
579	0.13
580	0.13
581	0.12
582	0.1
583	0.08
584	0.1
585	0.13
586	0.16
587	0.19
588	0.24
589	0.33
590	0.34
591	0.35
592	0.36
593	0.37
594	0.43
595	0.49
596	0.5
597	0.51
598	0.6
599	0.62
600	0.63
601	0.6
602	0.55
603	0.51
604	0.53
605	0.47
606	0.47
607	0.44
608	0.42
609	0.43
610	0.4
611	0.36
612	0.35
613	0.36
614	0.35
615	0.38
616	0.37
617	0.33
618	0.35
619	0.37
620	0.3
621	0.26
622	0.21
623	0.25
624	0.32
625	0.38
626	0.43
627	0.42
628	0.47
629	0.54
630	0.59
631	0.54
632	0.5
633	0.5
634	0.5
635	0.52
636	0.48
637	0.4
638	0.36
639	0.4
640	0.38
641	0.36
642	0.29
643	0.33
644	0.35
645	0.36
646	0.35
647	0.26
648	0.28
649	0.31
650	0.32
651	0.25
652	0.26
653	0.29
654	0.32
655	0.32
656	0.3
657	0.25
658	0.25
659	0.25
660	0.24
661	0.26
662	0.23
663	0.22
664	0.22
665	0.22
666	0.23
667	0.24
668	0.24
669	0.21
670	0.25
671	0.27
672	0.26
673	0.27
674	0.24
675	0.24
676	0.22
677	0.21
678	0.18
679	0.2
680	0.21
681	0.22
682	0.21
683	0.21
684	0.18
685	0.18
686	0.15
687	0.13
688	0.14
689	0.12
690	0.14
691	0.16
692	0.19
693	0.2
694	0.24
695	0.27
696	0.27
697	0.32
698	0.31
699	0.31
700	0.3
701	0.35
702	0.36
703	0.4
704	0.39
705	0.35
706	0.34
707	0.32
708	0.34
709	0.29
710	0.26
711	0.23
712	0.23
713	0.23
714	0.3
715	0.29
716	0.28
717	0.27
718	0.25
719	0.25
720	0.24
721	0.24
722	0.18
723	0.19
724	0.21
725	0.28
726	0.28
727	0.25
728	0.26
729	0.25
730	0.25
731	0.24
732	0.18
733	0.13
734	0.13
735	0.13
736	0.22
737	0.25
738	0.22
739	0.24
740	0.24
741	0.29
742	0.3
743	0.31
744	0.27
745	0.24
746	0.26
747	0.28
748	0.28
749	0.23
750	0.22
751	0.2
752	0.15
753	0.15
754	0.14
755	0.12
756	0.13
757	0.15
758	0.18
759	0.17
760	0.18
761	0.2
762	0.2
763	0.24
764	0.31
765	0.3
766	0.31
767	0.35
768	0.38
769	0.39
770	0.38
771	0.35
772	0.26
773	0.25
774	0.2
775	0.16
776	0.12
777	0.09
778	0.11
779	0.1
780	0.11
781	0.09
782	0.1
783	0.11
784	0.13
785	0.14
786	0.14
787	0.19
788	0.21
789	0.25
790	0.26
791	0.32
792	0.35
793	0.43
794	0.5
795	0.47
796	0.47
797	0.44
798	0.45
799	0.45
800	0.39
801	0.31
802	0.27
803	0.25
804	0.24
805	0.25
806	0.22
807	0.15
808	0.15
809	0.14
810	0.1
811	0.11
812	0.13
813	0.14
814	0.15
815	0.16
816	0.17
817	0.17
818	0.18
819	0.16
820	0.13
821	0.13
822	0.14
823	0.16
824	0.16
825	0.16
826	0.16
827	0.16
828	0.16
829	0.14
830	0.12
831	0.1
832	0.1
833	0.1
834	0.1
835	0.09
836	0.07
837	0.07
838	0.06
839	0.07
840	0.08
841	0.1
842	0.12
843	0.14
844	0.16
845	0.17
846	0.19
847	0.19
848	0.18
849	0.19
850	0.21
851	0.23
852	0.22
853	0.2
854	0.19
855	0.19
856	0.17
857	0.15
858	0.12
859	0.09
860	0.08
861	0.09
862	0.11
863	0.12
864	0.2
865	0.21
866	0.23
867	0.27
868	0.33
869	0.38
870	0.42
871	0.42
872	0.4
873	0.43
874	0.41
875	0.38
876	0.31
877	0.25
878	0.2
879	0.18
880	0.14
881	0.1
882	0.1
883	0.08
884	0.09
885	0.1
886	0.1
887	0.09
888	0.13
889	0.22
890	0.31
891	0.38
892	0.38
893	0.4
894	0.43
895	0.45
896	0.44
897	0.43
898	0.42
899	0.4
900	0.45
901	0.45
902	0.43
903	0.44
904	0.42
905	0.39
906	0.32
907	0.28
908	0.25
909	0.25
910	0.25
911	0.23
912	0.23
913	0.18
914	0.17
915	0.18
916	0.18
917	0.22
918	0.24
919	0.27
920	0.27
921	0.27
922	0.35
923	0.41
924	0.4
925	0.35
926	0.33
927	0.3
928	0.31

U1GG30

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer