FuNGI

U1GSH0

Protein Details

Accession

U1GSH0

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-23	DFSRYRKTAVLKKKNEAEQA	Hydrophilic
44-68	DRGTKFGSKKFDKWLKKKGVRIEDS	Basic
160-180	RGKMAPRSKKMRKITLTRDAV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
42-62	RKDRGTKFGSKKFDKWLKKKG
160-171	RGKMAPRSKKMR

Subcellular Location(s)

cyto 10.5, cyto_nucl 9.833, cyto_mito 8.166, nucl 7, mito 4.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MTDDFSRYRKTAVLKKKNEAEQAIKEFIAEIEAKGYRTEGIRKDRGTKFGSKKFDKWLKKKGVRIEDSALYTPEQNGVSERAVGLVCEKARAMLLATDLPASLWAEAVLTATDLMYSSPTRALPHRGTPYEKFHGKKPSLLHLRVFGCVAYGRIPKQLVRGKMAPRSKKMRKITLTRDAVFIKEDLGFGTPQGIMAPQEAVAEKSVAEKSVAAESTEESENETLADIAKEALGLLDFENLEEEAPIAASVRSVKPQEGVPRTYAQAKRSVGASEWQEAMEKQMEALTSNDTWQEVDLESLPARTKVLSGKWVYKEKEKENGEQVKKARWVVRGFEQQDKDINWDDLTTATVRAQTTRILFAMAAEKNWDIQQMDAVAAFLNGDIKENVYIEMPMRWRQKGKICKLKKTLYGLKTSSGVWYGLQTSFLQSVGFVQSKYDPALFSKRGAEGVVFISSHVDDYLITGSDKQGVQELKRAMAKRFKMKDMGAAVSYLGMEIERKEDGVIKLTQERYLTQLLKETGMWNVKSKPTPIEAGLELKPAEAGKAVRQEDYRRLVGKVQWPAVVTRPDISHTVSRLASVSNTPTKEAWGALKRLLRYLRGTLRRGLRYGGKSELRGYSDANWAEGEDGKATTGIIFMMNGGPIHWFSRKQNIVALSTCEAEYIAAATATQDAAWLGPHVQEMLGEKEQAVPILVDNQGAIALAKKDGWNRRTRHINVRYQYVQEALRQRKIRMEYVPSEEQLGDGLTKALKTELFERWQVRI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.71
3	0.78
4	0.81
5	0.8
6	0.77
7	0.73
8	0.71
9	0.69
10	0.62
11	0.53
12	0.45
13	0.38
14	0.31
15	0.27
16	0.19
17	0.13
18	0.15
19	0.16
20	0.17
21	0.17
22	0.18
23	0.17
24	0.2
25	0.27
26	0.31
27	0.39
28	0.46
29	0.5
30	0.59
31	0.62
32	0.65
33	0.63
34	0.65
35	0.66
36	0.67
37	0.73
38	0.7
39	0.7
40	0.73
41	0.78
42	0.79
43	0.78
44	0.8
45	0.81
46	0.82
47	0.85
48	0.84
49	0.84
50	0.79
51	0.75
52	0.7
53	0.64
54	0.6
55	0.54
56	0.45
57	0.36
58	0.31
59	0.26
60	0.24
61	0.19
62	0.16
63	0.16
64	0.18
65	0.17
66	0.17
67	0.17
68	0.15
69	0.14
70	0.14
71	0.13
72	0.15
73	0.14
74	0.15
75	0.15
76	0.14
77	0.14
78	0.14
79	0.14
80	0.1
81	0.12
82	0.12
83	0.13
84	0.13
85	0.12
86	0.11
87	0.11
88	0.11
89	0.08
90	0.07
91	0.06
92	0.06
93	0.06
94	0.07
95	0.06
96	0.05
97	0.05
98	0.05
99	0.05
100	0.05
101	0.05
102	0.07
103	0.08
104	0.09
105	0.11
106	0.12
107	0.15
108	0.19
109	0.26
110	0.28
111	0.36
112	0.43
113	0.46
114	0.51
115	0.53
116	0.58
117	0.59
118	0.61
119	0.55
120	0.53
121	0.59
122	0.55
123	0.55
124	0.51
125	0.53
126	0.56
127	0.57
128	0.53
129	0.5
130	0.49
131	0.45
132	0.41
133	0.3
134	0.22
135	0.19
136	0.17
137	0.16
138	0.18
139	0.18
140	0.22
141	0.24
142	0.24
143	0.33
144	0.38
145	0.37
146	0.4
147	0.45
148	0.46
149	0.54
150	0.61
151	0.6
152	0.62
153	0.68
154	0.71
155	0.74
156	0.77
157	0.78
158	0.78
159	0.79
160	0.81
161	0.8
162	0.79
163	0.7
164	0.66
165	0.56
166	0.49
167	0.4
168	0.31
169	0.22
170	0.15
171	0.14
172	0.1
173	0.11
174	0.1
175	0.09
176	0.1
177	0.09
178	0.08
179	0.08
180	0.08
181	0.07
182	0.08
183	0.08
184	0.06
185	0.08
186	0.08
187	0.09
188	0.09
189	0.08
190	0.08
191	0.1
192	0.11
193	0.1
194	0.1
195	0.1
196	0.11
197	0.14
198	0.15
199	0.12
200	0.12
201	0.12
202	0.15
203	0.15
204	0.14
205	0.12
206	0.11
207	0.11
208	0.1
209	0.1
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.06
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.07
237	0.08
238	0.12
239	0.13
240	0.14
241	0.15
242	0.19
243	0.27
244	0.29
245	0.3
246	0.29
247	0.31
248	0.32
249	0.38
250	0.38
251	0.32
252	0.34
253	0.33
254	0.31
255	0.3
256	0.3
257	0.22
258	0.23
259	0.23
260	0.18
261	0.18
262	0.17
263	0.16
264	0.15
265	0.17
266	0.14
267	0.11
268	0.09
269	0.1
270	0.09
271	0.1
272	0.11
273	0.11
274	0.09
275	0.1
276	0.1
277	0.09
278	0.09
279	0.08
280	0.09
281	0.06
282	0.07
283	0.07
284	0.08
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.08
289	0.09
290	0.08
291	0.09
292	0.11
293	0.13
294	0.18
295	0.2
296	0.27
297	0.32
298	0.39
299	0.39
300	0.43
301	0.48
302	0.45
303	0.52
304	0.48
305	0.47
306	0.49
307	0.56
308	0.51
309	0.5
310	0.48
311	0.44
312	0.44
313	0.44
314	0.4
315	0.36
316	0.36
317	0.34
318	0.39
319	0.43
320	0.42
321	0.45
322	0.42
323	0.37
324	0.38
325	0.35
326	0.31
327	0.24
328	0.21
329	0.15
330	0.13
331	0.12
332	0.1
333	0.1
334	0.08
335	0.07
336	0.06
337	0.09
338	0.09
339	0.09
340	0.1
341	0.11
342	0.12
343	0.13
344	0.12
345	0.11
346	0.1
347	0.1
348	0.15
349	0.12
350	0.11
351	0.11
352	0.11
353	0.11
354	0.12
355	0.12
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.06
362	0.06
363	0.05
364	0.04
365	0.04
366	0.03
367	0.04
368	0.04
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.06
374	0.07
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.08
379	0.1
380	0.16
381	0.19
382	0.21
383	0.23
384	0.27
385	0.35
386	0.42
387	0.5
388	0.54
389	0.57
390	0.64
391	0.7
392	0.71
393	0.67
394	0.66
395	0.64
396	0.57
397	0.58
398	0.5
399	0.43
400	0.39
401	0.34
402	0.26
403	0.19
404	0.16
405	0.1
406	0.1
407	0.1
408	0.09
409	0.1
410	0.09
411	0.09
412	0.09
413	0.09
414	0.08
415	0.06
416	0.07
417	0.09
418	0.1
419	0.09
420	0.09
421	0.1
422	0.11
423	0.12
424	0.12
425	0.09
426	0.11
427	0.18
428	0.18
429	0.19
430	0.19
431	0.19
432	0.19
433	0.19
434	0.16
435	0.11
436	0.11
437	0.11
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.06
444	0.05
445	0.04
446	0.05
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.09
453	0.1
454	0.09
455	0.12
456	0.14
457	0.15
458	0.2
459	0.21
460	0.21
461	0.26
462	0.28
463	0.28
464	0.34
465	0.38
466	0.42
467	0.46
468	0.46
469	0.46
470	0.44
471	0.46
472	0.41
473	0.38
474	0.28
475	0.24
476	0.21
477	0.16
478	0.15
479	0.09
480	0.06
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.07
488	0.11
489	0.11
490	0.15
491	0.15
492	0.16
493	0.21
494	0.22
495	0.24
496	0.21
497	0.21
498	0.2
499	0.25
500	0.24
501	0.19
502	0.24
503	0.22
504	0.22
505	0.22
506	0.2
507	0.19
508	0.22
509	0.23
510	0.21
511	0.24
512	0.27
513	0.29
514	0.3
515	0.28
516	0.26
517	0.28
518	0.26
519	0.25
520	0.22
521	0.24
522	0.23
523	0.22
524	0.19
525	0.16
526	0.16
527	0.13
528	0.11
529	0.09
530	0.1
531	0.12
532	0.2
533	0.21
534	0.23
535	0.26
536	0.3
537	0.35
538	0.39
539	0.39
540	0.33
541	0.34
542	0.35
543	0.37
544	0.4
545	0.39
546	0.36
547	0.34
548	0.33
549	0.33
550	0.34
551	0.32
552	0.26
553	0.22
554	0.2
555	0.21
556	0.22
557	0.24
558	0.22
559	0.21
560	0.24
561	0.21
562	0.21
563	0.2
564	0.19
565	0.17
566	0.15
567	0.19
568	0.21
569	0.22
570	0.23
571	0.23
572	0.24
573	0.23
574	0.23
575	0.25
576	0.24
577	0.26
578	0.29
579	0.33
580	0.32
581	0.37
582	0.38
583	0.34
584	0.33
585	0.38
586	0.43
587	0.47
588	0.49
589	0.5
590	0.55
591	0.55
592	0.53
593	0.49
594	0.48
595	0.44
596	0.45
597	0.46
598	0.41
599	0.39
600	0.42
601	0.42
602	0.36
603	0.33
604	0.31
605	0.27
606	0.3
607	0.29
608	0.26
609	0.22
610	0.19
611	0.19
612	0.19
613	0.16
614	0.1
615	0.1
616	0.1
617	0.1
618	0.09
619	0.08
620	0.07
621	0.06
622	0.05
623	0.05
624	0.06
625	0.06
626	0.07
627	0.07
628	0.07
629	0.08
630	0.09
631	0.12
632	0.15
633	0.18
634	0.2
635	0.31
636	0.34
637	0.34
638	0.38
639	0.39
640	0.39
641	0.38
642	0.39
643	0.3
644	0.28
645	0.26
646	0.21
647	0.18
648	0.14
649	0.12
650	0.08
651	0.07
652	0.05
653	0.05
654	0.06
655	0.06
656	0.07
657	0.06
658	0.05
659	0.05
660	0.05
661	0.06
662	0.07
663	0.07
664	0.08
665	0.09
666	0.09
667	0.09
668	0.1
669	0.12
670	0.17
671	0.18
672	0.17
673	0.17
674	0.2
675	0.2
676	0.19
677	0.17
678	0.11
679	0.11
680	0.14
681	0.14
682	0.11
683	0.11
684	0.1
685	0.1
686	0.09
687	0.09
688	0.08
689	0.08
690	0.09
691	0.11
692	0.15
693	0.23
694	0.32
695	0.39
696	0.46
697	0.49
698	0.58
699	0.66
700	0.7
701	0.73
702	0.73
703	0.76
704	0.73
705	0.77
706	0.72
707	0.64
708	0.6
709	0.53
710	0.45
711	0.42
712	0.46
713	0.45
714	0.5
715	0.51
716	0.51
717	0.55
718	0.59
719	0.58
720	0.55
721	0.56
722	0.53
723	0.57
724	0.6
725	0.52
726	0.5
727	0.43
728	0.36
729	0.28
730	0.23
731	0.15
732	0.11
733	0.12
734	0.1
735	0.1
736	0.11
737	0.12
738	0.12
739	0.15
740	0.2
741	0.26
742	0.3
743	0.37

U1GSH0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer