Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GCA5

Protein Details
Accession U1GCA5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-62VYDSILREKEKRRERHAQQKQGTAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
191-202KAREKARLKKLG
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022617  Rad60/SUMO-like_dom  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
Pfam View protein in Pfam  
PF11976  Rad60-SLD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50053  UBIQUITIN_2  
CDD cd01763  Ubl_SUMO_like  
Amino Acid Sequences MATAPAPSIKKSFFKKPNWATIAPPTESRDFFRHSDTVYDSILREKEKRRERHAQQKQGTAGLDDEDSDRESKRRRILIDEENQKEDSCSGSETASIRRGEQDTAPTGHLKTRAKSPARRGPIQAGRASPTYLESSLNPTTLLHSNVIELDSHKENNQHQPIGPERKVQARLSDEEASEEEDEYVLALKQKAREKARLKKLGIEPARKQEPALQALEAQQQRHSPSGDEPTFFPQRAAPTPPSQRDETIVQIFIDTKIPNAKPLIVNRKVSQPMQQVRAVWCARQNFTDDITAQVIFTWRGKRLYDTTTSTHLLNVLKMERARQLGGLAGDDDEDPSNGRIEVVAMTKDMYEQKQNKNDAEADANGITDPTLQDRQSQARSATPEPKYTIVMNAQGLEPLQLKVRPSTPVAKMMAGFKKLRHIDPAKTCWLIHDGDRLEPESLVRDTEIEDGDAVEVHVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.7
3 0.74
4 0.8
5 0.79
6 0.74
7 0.68
8 0.68
9 0.66
10 0.57
11 0.52
12 0.46
13 0.44
14 0.45
15 0.44
16 0.4
17 0.38
18 0.38
19 0.4
20 0.38
21 0.34
22 0.37
23 0.36
24 0.34
25 0.3
26 0.3
27 0.25
28 0.28
29 0.3
30 0.29
31 0.33
32 0.39
33 0.47
34 0.55
35 0.64
36 0.67
37 0.75
38 0.81
39 0.85
40 0.87
41 0.87
42 0.84
43 0.83
44 0.77
45 0.7
46 0.6
47 0.5
48 0.4
49 0.3
50 0.24
51 0.17
52 0.15
53 0.12
54 0.13
55 0.13
56 0.14
57 0.18
58 0.25
59 0.32
60 0.38
61 0.43
62 0.45
63 0.5
64 0.57
65 0.61
66 0.64
67 0.67
68 0.62
69 0.6
70 0.57
71 0.5
72 0.43
73 0.34
74 0.26
75 0.17
76 0.15
77 0.12
78 0.12
79 0.14
80 0.15
81 0.19
82 0.23
83 0.22
84 0.21
85 0.25
86 0.26
87 0.26
88 0.26
89 0.27
90 0.25
91 0.27
92 0.28
93 0.25
94 0.25
95 0.26
96 0.31
97 0.3
98 0.28
99 0.34
100 0.42
101 0.48
102 0.55
103 0.61
104 0.64
105 0.68
106 0.7
107 0.64
108 0.65
109 0.64
110 0.62
111 0.56
112 0.48
113 0.44
114 0.4
115 0.37
116 0.28
117 0.22
118 0.19
119 0.17
120 0.16
121 0.13
122 0.18
123 0.19
124 0.19
125 0.17
126 0.14
127 0.17
128 0.18
129 0.19
130 0.14
131 0.13
132 0.14
133 0.14
134 0.14
135 0.11
136 0.1
137 0.12
138 0.13
139 0.14
140 0.15
141 0.19
142 0.22
143 0.31
144 0.35
145 0.32
146 0.31
147 0.35
148 0.41
149 0.46
150 0.44
151 0.38
152 0.36
153 0.41
154 0.45
155 0.41
156 0.39
157 0.34
158 0.35
159 0.36
160 0.36
161 0.3
162 0.26
163 0.25
164 0.22
165 0.18
166 0.16
167 0.11
168 0.08
169 0.08
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.06
174 0.07
175 0.09
176 0.15
177 0.2
178 0.28
179 0.32
180 0.41
181 0.48
182 0.57
183 0.66
184 0.69
185 0.65
186 0.65
187 0.65
188 0.66
189 0.63
190 0.6
191 0.54
192 0.52
193 0.55
194 0.47
195 0.43
196 0.39
197 0.37
198 0.33
199 0.3
200 0.23
201 0.2
202 0.22
203 0.28
204 0.23
205 0.19
206 0.17
207 0.18
208 0.19
209 0.2
210 0.19
211 0.14
212 0.15
213 0.22
214 0.22
215 0.21
216 0.2
217 0.24
218 0.25
219 0.24
220 0.22
221 0.16
222 0.18
223 0.2
224 0.22
225 0.2
226 0.25
227 0.31
228 0.35
229 0.36
230 0.35
231 0.33
232 0.32
233 0.31
234 0.28
235 0.23
236 0.2
237 0.16
238 0.15
239 0.15
240 0.13
241 0.14
242 0.1
243 0.09
244 0.14
245 0.14
246 0.16
247 0.16
248 0.18
249 0.19
250 0.27
251 0.35
252 0.35
253 0.38
254 0.37
255 0.43
256 0.44
257 0.42
258 0.41
259 0.4
260 0.4
261 0.41
262 0.42
263 0.37
264 0.36
265 0.42
266 0.36
267 0.29
268 0.28
269 0.27
270 0.27
271 0.26
272 0.27
273 0.21
274 0.23
275 0.23
276 0.19
277 0.18
278 0.18
279 0.16
280 0.13
281 0.12
282 0.11
283 0.1
284 0.13
285 0.14
286 0.15
287 0.18
288 0.19
289 0.22
290 0.25
291 0.28
292 0.3
293 0.31
294 0.31
295 0.33
296 0.34
297 0.31
298 0.27
299 0.26
300 0.21
301 0.18
302 0.18
303 0.15
304 0.16
305 0.17
306 0.19
307 0.19
308 0.21
309 0.21
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.17
314 0.15
315 0.11
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.09
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.12
336 0.15
337 0.15
338 0.23
339 0.3
340 0.38
341 0.46
342 0.5
343 0.49
344 0.5
345 0.49
346 0.43
347 0.39
348 0.31
349 0.26
350 0.22
351 0.2
352 0.16
353 0.14
354 0.12
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.14
359 0.14
360 0.18
361 0.23
362 0.29
363 0.32
364 0.35
365 0.33
366 0.34
367 0.39
368 0.41
369 0.46
370 0.42
371 0.43
372 0.43
373 0.43
374 0.4
375 0.36
376 0.35
377 0.29
378 0.3
379 0.26
380 0.24
381 0.22
382 0.21
383 0.2
384 0.17
385 0.15
386 0.12
387 0.15
388 0.15
389 0.17
390 0.2
391 0.23
392 0.24
393 0.27
394 0.34
395 0.34
396 0.39
397 0.39
398 0.38
399 0.37
400 0.42
401 0.43
402 0.41
403 0.4
404 0.35
405 0.42
406 0.45
407 0.46
408 0.48
409 0.47
410 0.51
411 0.58
412 0.63
413 0.6
414 0.57
415 0.55
416 0.48
417 0.46
418 0.38
419 0.32
420 0.34
421 0.29
422 0.3
423 0.33
424 0.33
425 0.3
426 0.28
427 0.26
428 0.22
429 0.21
430 0.19
431 0.17
432 0.15
433 0.16
434 0.19
435 0.19
436 0.15
437 0.14
438 0.13
439 0.13
440 0.12