Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

U1HWH1

Protein Details
Accession U1HWH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-107KRDIPDWQSKPHRPKDPKNWWKVYKKLKEQTEKDREQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
350-354PPKRK
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 12, cyto_nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MESHGARSLAFLAQKACIKSLKRIDDIGDCPYELIRPVLLKLENPDQLHQLEINCPHLVGRVDEIWLQLIKRDIPDWQSKPHRPKDPKNWWKVYKKLKEQTEKDREQGAEKLKAALDIINDEREQNLAKVLSRKELPKEPINYKAKTLYNYNSGKTGSKSGHKLTLLEKIRKEARNARLARMNQPVPRIANKATEVKQAPRGFVEDQKLLARQKTSAPVAIRQPTVPRVAKPPIAIVRQEKPASDKAFLEREERLRALTEGRRNKAITISETSSPKTDAISKGSTASQALSRPQRPLPQSDGADDEDMGGTQASSPITRRRNQNVSASRSTPKHHTGTPPSTRFASPPPPPKRKAEPSIFMSLKKPKAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.28
4 0.3
5 0.32
6 0.39
7 0.47
8 0.5
9 0.49
10 0.5
11 0.51
12 0.52
13 0.51
14 0.47
15 0.39
16 0.31
17 0.28
18 0.26
19 0.23
20 0.17
21 0.16
22 0.13
23 0.12
24 0.13
25 0.18
26 0.19
27 0.2
28 0.24
29 0.3
30 0.33
31 0.34
32 0.35
33 0.33
34 0.33
35 0.32
36 0.29
37 0.23
38 0.23
39 0.23
40 0.25
41 0.22
42 0.21
43 0.19
44 0.21
45 0.21
46 0.17
47 0.18
48 0.15
49 0.16
50 0.17
51 0.18
52 0.16
53 0.16
54 0.15
55 0.13
56 0.15
57 0.15
58 0.16
59 0.16
60 0.17
61 0.22
62 0.31
63 0.32
64 0.39
65 0.48
66 0.55
67 0.64
68 0.7
69 0.75
70 0.75
71 0.83
72 0.85
73 0.86
74 0.88
75 0.88
76 0.89
77 0.88
78 0.87
79 0.85
80 0.85
81 0.84
82 0.84
83 0.82
84 0.82
85 0.83
86 0.81
87 0.83
88 0.82
89 0.76
90 0.68
91 0.64
92 0.56
93 0.49
94 0.48
95 0.42
96 0.37
97 0.34
98 0.34
99 0.28
100 0.28
101 0.25
102 0.2
103 0.15
104 0.13
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.1
113 0.11
114 0.09
115 0.12
116 0.17
117 0.18
118 0.21
119 0.23
120 0.26
121 0.29
122 0.35
123 0.38
124 0.39
125 0.45
126 0.44
127 0.51
128 0.54
129 0.5
130 0.45
131 0.46
132 0.42
133 0.38
134 0.39
135 0.32
136 0.35
137 0.36
138 0.35
139 0.31
140 0.3
141 0.29
142 0.26
143 0.27
144 0.21
145 0.23
146 0.27
147 0.26
148 0.3
149 0.29
150 0.29
151 0.27
152 0.33
153 0.34
154 0.35
155 0.34
156 0.33
157 0.4
158 0.41
159 0.43
160 0.43
161 0.43
162 0.48
163 0.49
164 0.47
165 0.47
166 0.46
167 0.47
168 0.45
169 0.43
170 0.36
171 0.36
172 0.35
173 0.3
174 0.31
175 0.28
176 0.23
177 0.23
178 0.23
179 0.27
180 0.26
181 0.3
182 0.29
183 0.28
184 0.35
185 0.33
186 0.31
187 0.26
188 0.28
189 0.23
190 0.26
191 0.27
192 0.2
193 0.2
194 0.21
195 0.23
196 0.21
197 0.21
198 0.18
199 0.16
200 0.18
201 0.21
202 0.21
203 0.22
204 0.22
205 0.24
206 0.29
207 0.31
208 0.29
209 0.26
210 0.27
211 0.25
212 0.31
213 0.29
214 0.25
215 0.27
216 0.3
217 0.31
218 0.3
219 0.33
220 0.31
221 0.32
222 0.34
223 0.33
224 0.33
225 0.37
226 0.37
227 0.32
228 0.3
229 0.34
230 0.34
231 0.31
232 0.29
233 0.26
234 0.3
235 0.31
236 0.3
237 0.27
238 0.28
239 0.3
240 0.29
241 0.26
242 0.23
243 0.22
244 0.25
245 0.28
246 0.34
247 0.38
248 0.4
249 0.44
250 0.43
251 0.43
252 0.42
253 0.39
254 0.33
255 0.31
256 0.31
257 0.31
258 0.32
259 0.33
260 0.29
261 0.27
262 0.24
263 0.2
264 0.22
265 0.2
266 0.23
267 0.24
268 0.24
269 0.24
270 0.25
271 0.24
272 0.2
273 0.18
274 0.16
275 0.16
276 0.22
277 0.28
278 0.3
279 0.34
280 0.37
281 0.44
282 0.44
283 0.47
284 0.47
285 0.46
286 0.45
287 0.43
288 0.42
289 0.37
290 0.34
291 0.29
292 0.23
293 0.15
294 0.13
295 0.12
296 0.08
297 0.06
298 0.05
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.12
303 0.2
304 0.27
305 0.34
306 0.42
307 0.5
308 0.57
309 0.62
310 0.69
311 0.69
312 0.71
313 0.71
314 0.66
315 0.63
316 0.59
317 0.58
318 0.54
319 0.52
320 0.49
321 0.48
322 0.53
323 0.56
324 0.63
325 0.69
326 0.65
327 0.62
328 0.61
329 0.57
330 0.5
331 0.48
332 0.47
333 0.46
334 0.53
335 0.6
336 0.66
337 0.69
338 0.75
339 0.78
340 0.78
341 0.79
342 0.78
343 0.76
344 0.72
345 0.78
346 0.72
347 0.65
348 0.62
349 0.61