Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

U1HPF9

Protein Details
Accession U1HPF9    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
169-194TTSTAAAPPPKKKKQRKPGTNDATPGHydrophilic
391-411LTPPMKHVRARRFKNTKRTSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-201PPPKKKKQRKPGTNDATPGSSAKKRK
242-249KHKGRIPK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MSADSSQGAFRGLRSRNPRSSTSSPSTLTWEPSRERIPGIPNNSGDIPSTYSHPLSQDYSPRPQRNSNLRYVLLTDALETPEHSSTSTPSPSSFISSDEESDDLDVNETPTRTAIMSSVERPKLKLNFSKNRVPSQESVTSPAPQTILRTPSLKLRVKPEVTSETTNPTTSTAAAPPPKKKKQRKPGTNDATPGSSAKKRKQPDEDGSDDELSRKPAQVRKITLTTKSLAAQSPITPTLKIKHKGRIPKRPLGLGYDSELDEREADPTILEAFILRMPPGPDADYLRDAVQHGTIGVARSQGGADVQMKFLDRSGRRGLVIIRGQRWAATLVDLPCIVEGMKSWDKKGWVKSADICQMLLVLGKVQNDDQAKDYPLPEDVNQDTWQYAHGLTPPMKHVRARRFKNTKRTSVNAIEAVERKVNQLLADDDNAVHTKFELLDHDPETRSLAESDTEGGEGYDEGGDEDAYGEEIDGDFFDEQNGAHADVMVETPTIIEPQPLQEEDNDDFIFKELEAQEQAGAEDPLRPAITGLSAPGVDVSNAITSTSPSVADTAAETPAAAETSEADEEESEDFDAEEDESMDEEDREAAAQKQKARDEIQELKEERKKQIDELKGQRNEILRAKLIRRIEQINGDMETARKAAGLEEDAEDSAEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.51
3 0.58
4 0.63
5 0.65
6 0.65
7 0.68
8 0.68
9 0.66
10 0.62
11 0.56
12 0.52
13 0.53
14 0.47
15 0.46
16 0.42
17 0.41
18 0.38
19 0.42
20 0.44
21 0.4
22 0.41
23 0.4
24 0.44
25 0.46
26 0.49
27 0.49
28 0.46
29 0.48
30 0.46
31 0.42
32 0.35
33 0.29
34 0.25
35 0.2
36 0.22
37 0.22
38 0.22
39 0.23
40 0.23
41 0.24
42 0.25
43 0.29
44 0.34
45 0.36
46 0.45
47 0.54
48 0.59
49 0.61
50 0.65
51 0.7
52 0.72
53 0.72
54 0.71
55 0.68
56 0.62
57 0.59
58 0.53
59 0.46
60 0.37
61 0.3
62 0.23
63 0.18
64 0.17
65 0.16
66 0.14
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.14
71 0.13
72 0.15
73 0.2
74 0.23
75 0.2
76 0.2
77 0.22
78 0.22
79 0.26
80 0.24
81 0.2
82 0.21
83 0.22
84 0.22
85 0.21
86 0.21
87 0.16
88 0.17
89 0.15
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.13
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.13
103 0.16
104 0.21
105 0.29
106 0.34
107 0.35
108 0.36
109 0.42
110 0.43
111 0.47
112 0.5
113 0.52
114 0.57
115 0.62
116 0.7
117 0.68
118 0.7
119 0.67
120 0.64
121 0.57
122 0.53
123 0.54
124 0.46
125 0.46
126 0.4
127 0.38
128 0.33
129 0.31
130 0.25
131 0.19
132 0.22
133 0.21
134 0.23
135 0.23
136 0.24
137 0.24
138 0.31
139 0.4
140 0.42
141 0.4
142 0.44
143 0.51
144 0.52
145 0.52
146 0.5
147 0.47
148 0.46
149 0.47
150 0.41
151 0.38
152 0.37
153 0.36
154 0.3
155 0.25
156 0.21
157 0.18
158 0.19
159 0.14
160 0.18
161 0.25
162 0.3
163 0.38
164 0.47
165 0.56
166 0.65
167 0.74
168 0.79
169 0.84
170 0.89
171 0.91
172 0.9
173 0.92
174 0.9
175 0.84
176 0.76
177 0.67
178 0.57
179 0.47
180 0.39
181 0.33
182 0.3
183 0.31
184 0.35
185 0.41
186 0.45
187 0.52
188 0.6
189 0.65
190 0.67
191 0.68
192 0.65
193 0.62
194 0.59
195 0.52
196 0.43
197 0.36
198 0.28
199 0.24
200 0.21
201 0.19
202 0.21
203 0.24
204 0.32
205 0.37
206 0.41
207 0.43
208 0.49
209 0.49
210 0.47
211 0.46
212 0.4
213 0.34
214 0.31
215 0.28
216 0.22
217 0.2
218 0.18
219 0.16
220 0.18
221 0.19
222 0.18
223 0.16
224 0.17
225 0.22
226 0.29
227 0.35
228 0.36
229 0.42
230 0.47
231 0.57
232 0.66
233 0.7
234 0.69
235 0.7
236 0.68
237 0.64
238 0.6
239 0.54
240 0.47
241 0.37
242 0.32
243 0.26
244 0.23
245 0.19
246 0.18
247 0.13
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.06
257 0.05
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.12
270 0.15
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.13
276 0.12
277 0.1
278 0.08
279 0.07
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.06
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.16
299 0.15
300 0.19
301 0.22
302 0.23
303 0.23
304 0.24
305 0.24
306 0.23
307 0.27
308 0.25
309 0.24
310 0.23
311 0.23
312 0.22
313 0.22
314 0.16
315 0.12
316 0.1
317 0.11
318 0.1
319 0.11
320 0.11
321 0.1
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.04
326 0.04
327 0.1
328 0.15
329 0.16
330 0.17
331 0.19
332 0.22
333 0.27
334 0.31
335 0.31
336 0.28
337 0.3
338 0.33
339 0.36
340 0.38
341 0.34
342 0.29
343 0.22
344 0.2
345 0.18
346 0.15
347 0.09
348 0.05
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.11
354 0.12
355 0.13
356 0.14
357 0.15
358 0.16
359 0.16
360 0.17
361 0.13
362 0.14
363 0.14
364 0.13
365 0.15
366 0.14
367 0.16
368 0.16
369 0.16
370 0.15
371 0.13
372 0.13
373 0.1
374 0.1
375 0.08
376 0.09
377 0.12
378 0.13
379 0.15
380 0.18
381 0.21
382 0.23
383 0.26
384 0.32
385 0.39
386 0.48
387 0.53
388 0.6
389 0.67
390 0.73
391 0.81
392 0.81
393 0.8
394 0.76
395 0.73
396 0.69
397 0.63
398 0.58
399 0.49
400 0.42
401 0.36
402 0.31
403 0.29
404 0.24
405 0.2
406 0.17
407 0.16
408 0.16
409 0.13
410 0.12
411 0.13
412 0.13
413 0.14
414 0.13
415 0.12
416 0.13
417 0.13
418 0.12
419 0.09
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.1
425 0.12
426 0.15
427 0.17
428 0.2
429 0.19
430 0.19
431 0.2
432 0.18
433 0.16
434 0.13
435 0.12
436 0.1
437 0.1
438 0.11
439 0.09
440 0.09
441 0.08
442 0.07
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.05
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.08
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.09
475 0.07
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.07
481 0.06
482 0.07
483 0.07
484 0.1
485 0.13
486 0.14
487 0.14
488 0.14
489 0.18
490 0.19
491 0.22
492 0.19
493 0.16
494 0.16
495 0.16
496 0.15
497 0.11
498 0.15
499 0.11
500 0.13
501 0.14
502 0.14
503 0.14
504 0.14
505 0.14
506 0.1
507 0.1
508 0.08
509 0.1
510 0.1
511 0.11
512 0.11
513 0.11
514 0.1
515 0.1
516 0.11
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.09
522 0.09
523 0.09
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.1
533 0.11
534 0.1
535 0.09
536 0.1
537 0.09
538 0.1
539 0.11
540 0.1
541 0.1
542 0.09
543 0.09
544 0.08
545 0.09
546 0.09
547 0.07
548 0.05
549 0.06
550 0.09
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.09
555 0.11
556 0.11
557 0.11
558 0.08
559 0.08
560 0.08
561 0.07
562 0.08
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.07
568 0.08
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.08
573 0.08
574 0.08
575 0.09
576 0.13
577 0.2
578 0.25
579 0.29
580 0.36
581 0.4
582 0.45
583 0.47
584 0.48
585 0.5
586 0.55
587 0.54
588 0.56
589 0.55
590 0.57
591 0.61
592 0.6
593 0.58
594 0.57
595 0.54
596 0.53
597 0.61
598 0.61
599 0.64
600 0.69
601 0.73
602 0.69
603 0.68
604 0.64
605 0.59
606 0.56
607 0.53
608 0.49
609 0.44
610 0.47
611 0.49
612 0.51
613 0.53
614 0.53
615 0.52
616 0.51
617 0.5
618 0.5
619 0.5
620 0.47
621 0.43
622 0.37
623 0.32
624 0.28
625 0.25
626 0.19
627 0.16
628 0.13
629 0.11
630 0.12
631 0.15
632 0.16
633 0.16
634 0.17
635 0.19
636 0.18
637 0.18