Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GC86

Protein Details
Accession U1GC86    Localization Confidence Low Confidence Score 7.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
308-327AKGATRRYARRQERWIRTHFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.333, cyto 10, nucl 9.5, cyto_mito 8.333, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
PF12874  zf-met  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MSTKIPVDPLIAIVGATGTGKSKLAIELAQRFNGEIINGDAMQMYKGLPIITNKVSEAEKQNIPHHIFDQIGLEDQPWTVSNFRREAHKAIGEIRSRGRLPILVGGTHYYTKAVLFNDYLLTGEGASSGSEDDSRERFPILEAPTTEILAKLREVDPKIASRWHPLDRRKIRRSLEIWLQTGKTASQTYEEQSQRRLSMRACGPSDGNDSCLKYSSLIFWLRAKDDVLKRRLNNRVDAMLECGLIQEAQAISQAERSLNAAGIQINKAKGIWASIGYKETEPYISALADTSKTLGELEAIKATCIEAAKGATRRYARRQERWIRTHFSDALTESDAMDTLYPIDCTNPDEWDTNVNQPVTDITESFLAGNPRPTPESLSDMAREAISAIKAELEHGNVRECRYCEVCDKTLMTEKEWTAHLRSNTHKKALAGRKRWEAFKAWQARQGAAEEHRKNDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.07
3 0.07
4 0.06
5 0.07
6 0.08
7 0.09
8 0.1
9 0.11
10 0.12
11 0.14
12 0.17
13 0.23
14 0.31
15 0.34
16 0.36
17 0.35
18 0.34
19 0.32
20 0.29
21 0.23
22 0.15
23 0.13
24 0.14
25 0.13
26 0.13
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.11
31 0.09
32 0.07
33 0.08
34 0.09
35 0.1
36 0.13
37 0.19
38 0.21
39 0.22
40 0.22
41 0.24
42 0.25
43 0.28
44 0.31
45 0.31
46 0.33
47 0.36
48 0.4
49 0.45
50 0.46
51 0.44
52 0.39
53 0.36
54 0.32
55 0.28
56 0.27
57 0.19
58 0.18
59 0.16
60 0.15
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.1
65 0.11
66 0.13
67 0.18
68 0.24
69 0.27
70 0.29
71 0.35
72 0.39
73 0.41
74 0.44
75 0.43
76 0.39
77 0.4
78 0.46
79 0.42
80 0.41
81 0.4
82 0.38
83 0.35
84 0.34
85 0.31
86 0.25
87 0.23
88 0.26
89 0.25
90 0.2
91 0.2
92 0.21
93 0.21
94 0.2
95 0.18
96 0.12
97 0.11
98 0.11
99 0.13
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.1
108 0.09
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.09
120 0.11
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.14
126 0.19
127 0.19
128 0.2
129 0.2
130 0.23
131 0.23
132 0.23
133 0.22
134 0.16
135 0.14
136 0.12
137 0.11
138 0.1
139 0.12
140 0.17
141 0.18
142 0.21
143 0.23
144 0.25
145 0.26
146 0.28
147 0.27
148 0.29
149 0.32
150 0.37
151 0.42
152 0.46
153 0.55
154 0.61
155 0.7
156 0.7
157 0.73
158 0.69
159 0.7
160 0.66
161 0.61
162 0.59
163 0.54
164 0.49
165 0.43
166 0.4
167 0.32
168 0.3
169 0.24
170 0.17
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.14
176 0.22
177 0.25
178 0.23
179 0.26
180 0.28
181 0.27
182 0.28
183 0.28
184 0.21
185 0.25
186 0.28
187 0.3
188 0.29
189 0.28
190 0.27
191 0.26
192 0.3
193 0.23
194 0.21
195 0.18
196 0.17
197 0.16
198 0.17
199 0.15
200 0.12
201 0.12
202 0.11
203 0.13
204 0.14
205 0.15
206 0.16
207 0.18
208 0.17
209 0.18
210 0.17
211 0.19
212 0.24
213 0.3
214 0.33
215 0.37
216 0.39
217 0.46
218 0.53
219 0.49
220 0.47
221 0.42
222 0.38
223 0.34
224 0.32
225 0.27
226 0.2
227 0.17
228 0.13
229 0.11
230 0.08
231 0.07
232 0.06
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.08
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.1
251 0.12
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.11
261 0.12
262 0.13
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.13
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.07
294 0.08
295 0.13
296 0.16
297 0.17
298 0.21
299 0.26
300 0.31
301 0.39
302 0.49
303 0.53
304 0.58
305 0.68
306 0.73
307 0.78
308 0.8
309 0.77
310 0.74
311 0.68
312 0.65
313 0.57
314 0.48
315 0.4
316 0.34
317 0.3
318 0.25
319 0.22
320 0.16
321 0.14
322 0.12
323 0.1
324 0.09
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.08
331 0.08
332 0.11
333 0.12
334 0.13
335 0.15
336 0.15
337 0.16
338 0.2
339 0.22
340 0.24
341 0.27
342 0.24
343 0.22
344 0.21
345 0.21
346 0.2
347 0.19
348 0.14
349 0.11
350 0.12
351 0.12
352 0.13
353 0.14
354 0.14
355 0.14
356 0.18
357 0.18
358 0.21
359 0.22
360 0.23
361 0.25
362 0.25
363 0.29
364 0.27
365 0.29
366 0.27
367 0.26
368 0.26
369 0.21
370 0.18
371 0.13
372 0.13
373 0.11
374 0.1
375 0.09
376 0.1
377 0.1
378 0.12
379 0.13
380 0.14
381 0.17
382 0.18
383 0.24
384 0.25
385 0.28
386 0.31
387 0.31
388 0.33
389 0.32
390 0.35
391 0.36
392 0.41
393 0.4
394 0.4
395 0.4
396 0.39
397 0.44
398 0.43
399 0.38
400 0.38
401 0.36
402 0.34
403 0.35
404 0.34
405 0.3
406 0.34
407 0.36
408 0.36
409 0.45
410 0.53
411 0.57
412 0.6
413 0.59
414 0.56
415 0.62
416 0.66
417 0.67
418 0.65
419 0.67
420 0.72
421 0.73
422 0.74
423 0.68
424 0.64
425 0.61
426 0.61
427 0.64
428 0.57
429 0.58
430 0.56
431 0.53
432 0.49
433 0.45
434 0.4
435 0.38
436 0.45
437 0.43