Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GGF4

Protein Details
Accession U1GGF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-252DDDARRKRRRVPARNMASSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-242RRKRRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025676  Clr5_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF14420  Clr5  
Amino Acid Sequences MSETTSRVVEATFKAPALQVSEWDRHRSLITRLYTTEHKPLKEVISILHEQHGFIATPRQYKQRIKAWNLSKNLKSEEIEYVLRSLPKDQLQDAIMDPSQSAVTVKGRTLRLSLLQRYLRRTRVSQTPKRCSPASSTRPQSDASSSHGSFRKLPQAQTPLPDNCNESAPGKIQLLSTLPSQPQTSCSITTSPHHVSQSSHEFEMEDDSFLAGFKRFSAPSTTEKRTNLSEEGDDDARRKRRRVPARNMASSTGTKTLACPFYKHDPQKYNPQNDNISSAMRYRTCAGPGWESISRLRQHLFRAHIAAKHCPRCNLTLHSRSEIENHAQDGCSDQLIDLNSSPEAISEEQQRQLRRKQPSSLTKEDSWLRMYGILFPHDSNIPSPYYQSDKERSKDATHVSLSLDQPSPETQQIDCLVRYLCRILPDKVLNRLQGQPKAESHSIWTETLNATTLQFAENPIQQCSRTHNEPHTEAHSCNTGQYSATEEGLKTVISEGVLETCSEWLRTRMEQDDDSDEEKSEYENEQSRSSSSLQDLSLAPITTVPDQWNRYAETQTPGDHHLAPSSTVVSDYWSQPIFDFTSCARNLNATTGALLGSTHMQLQGKRLSLPSAQPGWVHGGIFDGPAGGTPGDWIWSSTNLSADPSTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.22
4 0.23
5 0.2
6 0.22
7 0.25
8 0.32
9 0.35
10 0.4
11 0.39
12 0.36
13 0.38
14 0.37
15 0.38
16 0.39
17 0.4
18 0.38
19 0.39
20 0.42
21 0.45
22 0.45
23 0.49
24 0.47
25 0.43
26 0.42
27 0.45
28 0.44
29 0.42
30 0.38
31 0.31
32 0.31
33 0.33
34 0.32
35 0.33
36 0.3
37 0.26
38 0.26
39 0.25
40 0.18
41 0.17
42 0.23
43 0.22
44 0.28
45 0.32
46 0.39
47 0.45
48 0.53
49 0.6
50 0.61
51 0.67
52 0.68
53 0.75
54 0.76
55 0.77
56 0.77
57 0.76
58 0.72
59 0.67
60 0.64
61 0.59
62 0.5
63 0.45
64 0.41
65 0.37
66 0.34
67 0.29
68 0.27
69 0.25
70 0.26
71 0.24
72 0.22
73 0.23
74 0.27
75 0.29
76 0.28
77 0.29
78 0.28
79 0.29
80 0.27
81 0.26
82 0.21
83 0.18
84 0.17
85 0.14
86 0.13
87 0.11
88 0.11
89 0.09
90 0.13
91 0.15
92 0.17
93 0.22
94 0.24
95 0.25
96 0.27
97 0.27
98 0.3
99 0.36
100 0.39
101 0.41
102 0.46
103 0.49
104 0.55
105 0.59
106 0.58
107 0.55
108 0.54
109 0.51
110 0.55
111 0.61
112 0.64
113 0.68
114 0.71
115 0.73
116 0.75
117 0.71
118 0.62
119 0.6
120 0.61
121 0.59
122 0.58
123 0.59
124 0.56
125 0.57
126 0.56
127 0.5
128 0.43
129 0.37
130 0.33
131 0.33
132 0.3
133 0.35
134 0.37
135 0.36
136 0.36
137 0.38
138 0.42
139 0.38
140 0.4
141 0.42
142 0.46
143 0.46
144 0.47
145 0.5
146 0.44
147 0.42
148 0.41
149 0.36
150 0.29
151 0.29
152 0.26
153 0.21
154 0.19
155 0.19
156 0.2
157 0.18
158 0.18
159 0.16
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.16
164 0.17
165 0.16
166 0.17
167 0.18
168 0.17
169 0.18
170 0.21
171 0.22
172 0.2
173 0.21
174 0.2
175 0.21
176 0.23
177 0.27
178 0.26
179 0.28
180 0.27
181 0.27
182 0.26
183 0.3
184 0.36
185 0.32
186 0.29
187 0.25
188 0.24
189 0.23
190 0.27
191 0.21
192 0.13
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.16
205 0.19
206 0.25
207 0.33
208 0.36
209 0.38
210 0.39
211 0.41
212 0.39
213 0.39
214 0.34
215 0.28
216 0.25
217 0.21
218 0.23
219 0.22
220 0.2
221 0.18
222 0.23
223 0.29
224 0.32
225 0.34
226 0.39
227 0.48
228 0.59
229 0.67
230 0.71
231 0.74
232 0.78
233 0.81
234 0.74
235 0.66
236 0.58
237 0.49
238 0.4
239 0.32
240 0.24
241 0.18
242 0.17
243 0.2
244 0.22
245 0.22
246 0.21
247 0.23
248 0.3
249 0.39
250 0.43
251 0.46
252 0.47
253 0.5
254 0.59
255 0.63
256 0.64
257 0.59
258 0.59
259 0.54
260 0.48
261 0.49
262 0.38
263 0.31
264 0.23
265 0.21
266 0.19
267 0.16
268 0.16
269 0.15
270 0.15
271 0.16
272 0.17
273 0.18
274 0.17
275 0.17
276 0.2
277 0.19
278 0.19
279 0.19
280 0.23
281 0.22
282 0.21
283 0.22
284 0.2
285 0.23
286 0.27
287 0.29
288 0.25
289 0.28
290 0.28
291 0.3
292 0.29
293 0.33
294 0.35
295 0.38
296 0.38
297 0.37
298 0.36
299 0.36
300 0.38
301 0.36
302 0.37
303 0.38
304 0.39
305 0.39
306 0.38
307 0.35
308 0.34
309 0.3
310 0.25
311 0.18
312 0.16
313 0.15
314 0.13
315 0.13
316 0.12
317 0.1
318 0.08
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.08
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.05
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.12
334 0.14
335 0.18
336 0.22
337 0.25
338 0.28
339 0.34
340 0.4
341 0.45
342 0.47
343 0.49
344 0.55
345 0.62
346 0.66
347 0.65
348 0.62
349 0.54
350 0.54
351 0.5
352 0.43
353 0.34
354 0.27
355 0.21
356 0.18
357 0.17
358 0.17
359 0.16
360 0.15
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.13
365 0.14
366 0.11
367 0.12
368 0.12
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.16
373 0.17
374 0.21
375 0.27
376 0.32
377 0.33
378 0.37
379 0.38
380 0.36
381 0.39
382 0.37
383 0.34
384 0.29
385 0.28
386 0.25
387 0.27
388 0.25
389 0.23
390 0.21
391 0.16
392 0.16
393 0.17
394 0.18
395 0.15
396 0.16
397 0.13
398 0.16
399 0.19
400 0.19
401 0.18
402 0.17
403 0.16
404 0.15
405 0.16
406 0.15
407 0.13
408 0.16
409 0.2
410 0.2
411 0.26
412 0.32
413 0.34
414 0.39
415 0.41
416 0.39
417 0.38
418 0.43
419 0.43
420 0.41
421 0.4
422 0.37
423 0.35
424 0.38
425 0.36
426 0.3
427 0.28
428 0.27
429 0.27
430 0.24
431 0.22
432 0.18
433 0.18
434 0.18
435 0.16
436 0.11
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.09
443 0.11
444 0.14
445 0.16
446 0.18
447 0.19
448 0.19
449 0.2
450 0.25
451 0.29
452 0.29
453 0.33
454 0.37
455 0.41
456 0.43
457 0.46
458 0.44
459 0.41
460 0.36
461 0.33
462 0.3
463 0.25
464 0.23
465 0.21
466 0.16
467 0.14
468 0.14
469 0.17
470 0.15
471 0.16
472 0.16
473 0.14
474 0.15
475 0.15
476 0.14
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.08
484 0.08
485 0.08
486 0.07
487 0.08
488 0.09
489 0.1
490 0.11
491 0.12
492 0.15
493 0.17
494 0.21
495 0.24
496 0.28
497 0.28
498 0.3
499 0.32
500 0.31
501 0.31
502 0.28
503 0.24
504 0.2
505 0.19
506 0.17
507 0.14
508 0.13
509 0.16
510 0.21
511 0.23
512 0.25
513 0.25
514 0.26
515 0.27
516 0.27
517 0.25
518 0.21
519 0.22
520 0.2
521 0.21
522 0.21
523 0.21
524 0.22
525 0.18
526 0.16
527 0.14
528 0.16
529 0.15
530 0.16
531 0.17
532 0.21
533 0.23
534 0.26
535 0.28
536 0.29
537 0.3
538 0.32
539 0.32
540 0.3
541 0.3
542 0.3
543 0.29
544 0.29
545 0.3
546 0.28
547 0.25
548 0.23
549 0.22
550 0.21
551 0.19
552 0.18
553 0.15
554 0.14
555 0.13
556 0.14
557 0.16
558 0.16
559 0.19
560 0.18
561 0.19
562 0.18
563 0.21
564 0.2
565 0.18
566 0.19
567 0.16
568 0.24
569 0.24
570 0.25
571 0.23
572 0.24
573 0.24
574 0.26
575 0.27
576 0.18
577 0.18
578 0.17
579 0.16
580 0.13
581 0.12
582 0.09
583 0.09
584 0.09
585 0.09
586 0.12
587 0.15
588 0.16
589 0.22
590 0.26
591 0.26
592 0.28
593 0.29
594 0.29
595 0.31
596 0.34
597 0.36
598 0.34
599 0.34
600 0.32
601 0.33
602 0.35
603 0.33
604 0.28
605 0.2
606 0.19
607 0.18
608 0.18
609 0.16
610 0.09
611 0.08
612 0.08
613 0.1
614 0.07
615 0.07
616 0.08
617 0.08
618 0.1
619 0.1
620 0.12
621 0.12
622 0.15
623 0.18
624 0.18
625 0.2
626 0.18
627 0.21