Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A090CHR5

Protein Details
Accession A0A090CHR5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-146WEDIDEKMANRRRKQRTKYQRSTFCEQGSTRKSRTRRIRATEPKDSAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-157KSRTRRIRATEPKDSAAAKDATGKTKRA
Subcellular Location(s) mito 11.5, nucl 9, cyto_mito 8.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
PF13181  TPR_8  
Amino Acid Sequences MSRRDFLSMPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEDQIKAAVAKRTAQLGLGGDNAKDDDTDDAARYQDPDNEVGLFAGGFYDKEDEEADKIWEDIDEKMANRRRKQRTKYQRSTFCEQGSTRKSRTRRIRATEPKDSAAAKDATGKTKRARQARMERFYAVPDSVLAAARDQGQFGTTVADDGTATSAIPGGTETTTDFAKIGAARDKVLKARLEQTSQTSGLATAGSATSLDPRGYLTSLASTQGAEQSIGDIEQFRKMLKSAVDSNPKQASSWMAAARLEMTAGKPGAARKLIAAGCQHCPKNEDIWLENININDTHNAKIIAAEAIRNNPKSVKLWVAAMKLENDQRSRKKVIRKALDHNPQSEALWIHAVNLEEDVEDARILLAKATELIPESLDLWLRLAHLETPENARKVLNKAVKKLTNSHELWIAAARLEEQLGEGARRPVMKNAVKFLAKQNAMPKREEWIAEAEKCEEEGAVITCSNIIEETLGWGLDEDDDRKELWMEDAKASISREKYATARAIYAYALRVFPNSKSLYLAAVDLEREHGNKEDLWNALEKAVEACPHQETFWLMLAREKAGEINEARRVLARAFKQNPDNEDIWLAAVKLEADNGFIDQARDLLKTARQNAPTDRVWMRSVAFERQLGNSEAALDLVIDALRLFPNAPKLWMMKGQIYEDMDQPAQAREAYGAGVRAVPSSVPLWLLYSRLEERLNNVVKARSVLDRARQAVPKSAELWTELIRLERRAGNITQAKTLMATALQQMPKSGLLWAERILHLEQRTQRKSLLAEAMKKVENDPVLMVTAAYILWKERKLEQADKWFERALKLDTDHGDTWAWYYKFLLQHGTEEKRVGLVSRCVLAEPRHGEYWQRVAKMPKNAGKGTEEMLKLVAASLPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.2
3 0.15
4 0.12
5 0.1
6 0.09
7 0.09
8 0.09
9 0.09
10 0.08
11 0.09
12 0.1
13 0.11
14 0.15
15 0.15
16 0.16
17 0.21
18 0.23
19 0.25
20 0.3
21 0.3
22 0.29
23 0.31
24 0.32
25 0.31
26 0.36
27 0.37
28 0.31
29 0.3
30 0.27
31 0.26
32 0.29
33 0.3
34 0.27
35 0.25
36 0.28
37 0.3
38 0.33
39 0.32
40 0.28
41 0.26
42 0.22
43 0.21
44 0.22
45 0.21
46 0.17
47 0.17
48 0.17
49 0.15
50 0.13
51 0.12
52 0.1
53 0.12
54 0.14
55 0.14
56 0.15
57 0.16
58 0.17
59 0.18
60 0.18
61 0.2
62 0.2
63 0.21
64 0.21
65 0.21
66 0.2
67 0.18
68 0.16
69 0.11
70 0.08
71 0.07
72 0.06
73 0.05
74 0.06
75 0.08
76 0.08
77 0.1
78 0.11
79 0.12
80 0.14
81 0.15
82 0.16
83 0.14
84 0.14
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.15
90 0.16
91 0.16
92 0.26
93 0.34
94 0.42
95 0.49
96 0.59
97 0.65
98 0.73
99 0.81
100 0.83
101 0.87
102 0.9
103 0.92
104 0.92
105 0.91
106 0.88
107 0.86
108 0.82
109 0.74
110 0.69
111 0.6
112 0.59
113 0.57
114 0.57
115 0.55
116 0.56
117 0.59
118 0.62
119 0.71
120 0.73
121 0.74
122 0.76
123 0.82
124 0.85
125 0.88
126 0.88
127 0.81
128 0.72
129 0.65
130 0.57
131 0.48
132 0.42
133 0.34
134 0.25
135 0.29
136 0.29
137 0.34
138 0.37
139 0.41
140 0.41
141 0.48
142 0.55
143 0.56
144 0.61
145 0.63
146 0.71
147 0.76
148 0.77
149 0.72
150 0.67
151 0.59
152 0.54
153 0.47
154 0.36
155 0.25
156 0.18
157 0.16
158 0.15
159 0.15
160 0.12
161 0.1
162 0.11
163 0.14
164 0.14
165 0.13
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.07
194 0.09
195 0.1
196 0.13
197 0.17
198 0.18
199 0.19
200 0.23
201 0.26
202 0.27
203 0.31
204 0.3
205 0.27
206 0.33
207 0.36
208 0.36
209 0.36
210 0.37
211 0.36
212 0.35
213 0.32
214 0.25
215 0.21
216 0.17
217 0.15
218 0.1
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.08
228 0.09
229 0.11
230 0.11
231 0.12
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.11
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.15
255 0.15
256 0.19
257 0.23
258 0.3
259 0.39
260 0.39
261 0.45
262 0.45
263 0.44
264 0.39
265 0.33
266 0.28
267 0.22
268 0.25
269 0.2
270 0.18
271 0.17
272 0.17
273 0.17
274 0.14
275 0.12
276 0.08
277 0.07
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.12
283 0.16
284 0.16
285 0.16
286 0.13
287 0.19
288 0.19
289 0.2
290 0.23
291 0.22
292 0.26
293 0.31
294 0.32
295 0.27
296 0.28
297 0.28
298 0.27
299 0.29
300 0.27
301 0.22
302 0.25
303 0.26
304 0.25
305 0.25
306 0.21
307 0.18
308 0.15
309 0.15
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.11
316 0.12
317 0.12
318 0.11
319 0.09
320 0.1
321 0.1
322 0.15
323 0.19
324 0.19
325 0.2
326 0.19
327 0.21
328 0.22
329 0.23
330 0.22
331 0.19
332 0.22
333 0.25
334 0.25
335 0.24
336 0.23
337 0.22
338 0.21
339 0.23
340 0.23
341 0.22
342 0.28
343 0.32
344 0.37
345 0.41
346 0.44
347 0.5
348 0.54
349 0.6
350 0.62
351 0.63
352 0.66
353 0.7
354 0.74
355 0.67
356 0.62
357 0.54
358 0.45
359 0.39
360 0.33
361 0.23
362 0.14
363 0.13
364 0.11
365 0.1
366 0.11
367 0.11
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.06
372 0.07
373 0.06
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.08
402 0.09
403 0.14
404 0.18
405 0.18
406 0.18
407 0.18
408 0.19
409 0.21
410 0.28
411 0.29
412 0.29
413 0.33
414 0.4
415 0.43
416 0.43
417 0.46
418 0.42
419 0.43
420 0.41
421 0.37
422 0.32
423 0.29
424 0.27
425 0.22
426 0.18
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.04
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.09
441 0.09
442 0.11
443 0.19
444 0.23
445 0.23
446 0.26
447 0.29
448 0.28
449 0.29
450 0.3
451 0.3
452 0.27
453 0.28
454 0.33
455 0.36
456 0.38
457 0.38
458 0.34
459 0.3
460 0.31
461 0.29
462 0.23
463 0.21
464 0.22
465 0.21
466 0.22
467 0.19
468 0.17
469 0.17
470 0.15
471 0.09
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.05
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.05
482 0.04
483 0.03
484 0.03
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.05
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.07
496 0.07
497 0.08
498 0.08
499 0.07
500 0.09
501 0.12
502 0.13
503 0.13
504 0.14
505 0.14
506 0.15
507 0.16
508 0.17
509 0.14
510 0.14
511 0.14
512 0.15
513 0.16
514 0.18
515 0.21
516 0.18
517 0.18
518 0.16
519 0.16
520 0.15
521 0.14
522 0.12
523 0.1
524 0.1
525 0.09
526 0.1
527 0.11
528 0.11
529 0.16
530 0.16
531 0.16
532 0.16
533 0.17
534 0.16
535 0.15
536 0.15
537 0.1
538 0.09
539 0.08
540 0.07
541 0.09
542 0.08
543 0.08
544 0.09
545 0.09
546 0.1
547 0.11
548 0.12
549 0.13
550 0.13
551 0.14
552 0.14
553 0.13
554 0.13
555 0.12
556 0.11
557 0.09
558 0.1
559 0.1
560 0.09
561 0.1
562 0.11
563 0.12
564 0.12
565 0.11
566 0.12
567 0.13
568 0.17
569 0.16
570 0.14
571 0.16
572 0.17
573 0.17
574 0.15
575 0.13
576 0.1
577 0.1
578 0.14
579 0.12
580 0.15
581 0.19
582 0.19
583 0.19
584 0.19
585 0.2
586 0.18
587 0.23
588 0.23
589 0.28
590 0.32
591 0.37
592 0.41
593 0.44
594 0.45
595 0.44
596 0.41
597 0.32
598 0.29
599 0.24
600 0.19
601 0.16
602 0.12
603 0.07
604 0.06
605 0.06
606 0.05
607 0.06
608 0.05
609 0.06
610 0.06
611 0.06
612 0.07
613 0.07
614 0.07
615 0.06
616 0.08
617 0.08
618 0.08
619 0.09
620 0.1
621 0.14
622 0.19
623 0.25
624 0.3
625 0.31
626 0.35
627 0.38
628 0.42
629 0.39
630 0.39
631 0.36
632 0.32
633 0.3
634 0.29
635 0.25
636 0.25
637 0.26
638 0.25
639 0.26
640 0.24
641 0.25
642 0.25
643 0.27
644 0.23
645 0.21
646 0.17
647 0.15
648 0.13
649 0.11
650 0.1
651 0.07
652 0.05
653 0.04
654 0.04
655 0.03
656 0.03
657 0.04
658 0.04
659 0.05
660 0.06
661 0.07
662 0.14
663 0.15
664 0.16
665 0.18
666 0.2
667 0.22
668 0.26
669 0.27
670 0.25
671 0.27
672 0.27
673 0.28
674 0.29
675 0.27
676 0.24
677 0.24
678 0.2
679 0.18
680 0.18
681 0.15
682 0.14
683 0.12
684 0.11
685 0.08
686 0.09
687 0.09
688 0.09
689 0.09
690 0.08
691 0.09
692 0.09
693 0.09
694 0.09
695 0.08
696 0.09
697 0.08
698 0.09
699 0.08
700 0.08
701 0.1
702 0.1
703 0.12
704 0.11
705 0.15
706 0.16
707 0.19
708 0.21
709 0.19
710 0.23
711 0.31
712 0.33
713 0.31
714 0.31
715 0.3
716 0.29
717 0.3
718 0.28
719 0.22
720 0.24
721 0.27
722 0.31
723 0.36
724 0.39
725 0.43
726 0.46
727 0.44
728 0.47
729 0.46
730 0.42
731 0.38
732 0.36
733 0.31
734 0.28
735 0.28
736 0.21
737 0.2
738 0.18
739 0.2
740 0.21
741 0.21
742 0.23
743 0.23
744 0.24
745 0.27
746 0.27
747 0.32
748 0.36
749 0.37
750 0.36
751 0.33
752 0.31
753 0.27
754 0.27
755 0.18
756 0.12
757 0.11
758 0.11
759 0.18
760 0.19
761 0.19
762 0.19
763 0.2
764 0.21
765 0.2
766 0.18
767 0.15
768 0.15
769 0.17
770 0.19
771 0.21
772 0.2
773 0.23
774 0.23
775 0.25
776 0.24
777 0.29
778 0.34
779 0.41
780 0.45
781 0.44
782 0.44
783 0.43
784 0.43
785 0.43
786 0.45
787 0.41
788 0.44
789 0.46
790 0.49
791 0.48
792 0.46
793 0.41
794 0.37
795 0.31
796 0.25
797 0.22
798 0.19
799 0.17
800 0.17
801 0.15
802 0.1
803 0.09
804 0.08
805 0.07
806 0.06
807 0.08
808 0.13
809 0.15
810 0.18
811 0.22
812 0.31
813 0.37
814 0.45
815 0.5
816 0.57
817 0.64
818 0.64
819 0.63
820 0.59
821 0.53
822 0.48
823 0.44
824 0.36
825 0.33
826 0.31
827 0.34
828 0.33
829 0.37
830 0.35
831 0.33
832 0.3
833 0.24
834 0.25
835 0.28
836 0.25
837 0.2
838 0.21
839 0.25
840 0.28
841 0.3
842 0.34
843 0.26
844 0.34
845 0.41
846 0.45
847 0.42
848 0.4
849 0.38
850 0.33
851 0.33
852 0.29
853 0.25
854 0.25
855 0.26
856 0.27
857 0.27
858 0.26
859 0.3
860 0.3
861 0.33
862 0.33
863 0.35
864 0.35
865 0.35
866 0.39
867 0.4
868 0.47
869 0.44
870 0.42
871 0.42
872 0.48
873 0.54
874 0.6
875 0.64
876 0.61
877 0.63
878 0.63
879 0.62
880 0.57
881 0.52
882 0.46
883 0.44
884 0.37
885 0.3
886 0.28
887 0.24
888 0.2
889 0.19