Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

U1GKQ1

Protein Details
Accession U1GKQ1    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
111-133VDEKMDRRRKMRRLVSPNPVPHPBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.833, cyto 8, cyto_mito 6.333, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MASRRDFLNQQAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPTPEQIQEALAKRAQQLGAAPPTAYGAPDKKKEDEHDDDDERFQDPENEVGLFAYGTYDRDDDEADRIYQDVDEKMDRRRKMRRLVSPNPVPHPSCPFGKTNGLSFPSFEVQIADLNLLDTHREAREKLEREEYERNNPKIQQQFADLKRSLATVSDGDWANIPEVGDLTGKNRRAKQNLRQRFYAVPDSVIAGARDATQFETSIQDDGTQTNGSSKDQADGTMTNFAEIGAARDKVLRVKLDQAAQGTSTDAGTGIATNIDPKGYLTSLSQTELKAGEVEIGDIKRVRALLESVIKTNPKHAPGWIAIARLEEIAGKIVSARKFIAQGCEQCPKSEDAWLENIRLNDNHNAKIIAANAIKNNDRSTRLWIEAMKLEADARAKKRVLRQAIDHIPQSVAIWKEAVNLEEDPADARLLLAKATDIIPLSVELWLALARLETPEKAQAVLNKARKAVPTSHEIWVAAARLQEQMGNDKINVMKRAVQALAKESAMLKREEWIAEAEKCEEEGAILTCGAIIRENLGWTLDEDDDRVKIWMDDAKQSIGHGKYETARAMYAYALRVFPTKKDIWLAAADLEQNHGTKEALWQLLEKAVEACPQSETLWMQFAKEKWQAGEIDSARRILAQAFKQNIDNENIFLAAAKLETDAKQIEAARQVLSTAREEAGTDRIWIKSVAFERQYGTNERALDLVNQGLQIYPKAAKLWMMKGQIYESQGQVPQARQTYSTGLRACPKSVPLRLLAARLEERSGVIVKARSILDQGRLAVPKNAELWTESVRVERRANNIAQAKVLMAKALQDVPNSGLLWSENIWNLESRTQRKPRSLEAIKKVDNDPILFVTVARIFWGERKLDKAMSWFEKAIVLDSALGDTWGWYYKFLLQHGTEEKREDVIAKCVVSAPRHGEVWQSVAKDPQNADLGTEEVLKLVVAKLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.31
3 0.23
4 0.2
5 0.15
6 0.13
7 0.1
8 0.09
9 0.08
10 0.09
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.21
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.31
23 0.29
24 0.32
25 0.34
26 0.33
27 0.38
28 0.37
29 0.32
30 0.32
31 0.29
32 0.27
33 0.31
34 0.32
35 0.28
36 0.27
37 0.29
38 0.28
39 0.33
40 0.32
41 0.26
42 0.26
43 0.29
44 0.32
45 0.3
46 0.29
47 0.23
48 0.25
49 0.24
50 0.21
51 0.19
52 0.22
53 0.28
54 0.36
55 0.4
56 0.42
57 0.48
58 0.53
59 0.57
60 0.57
61 0.56
62 0.57
63 0.57
64 0.55
65 0.51
66 0.46
67 0.38
68 0.3
69 0.25
70 0.22
71 0.19
72 0.2
73 0.19
74 0.18
75 0.17
76 0.17
77 0.16
78 0.11
79 0.09
80 0.08
81 0.07
82 0.08
83 0.1
84 0.1
85 0.11
86 0.12
87 0.13
88 0.13
89 0.16
90 0.17
91 0.16
92 0.16
93 0.16
94 0.15
95 0.14
96 0.15
97 0.14
98 0.15
99 0.19
100 0.21
101 0.3
102 0.38
103 0.42
104 0.48
105 0.57
106 0.62
107 0.68
108 0.76
109 0.77
110 0.79
111 0.83
112 0.86
113 0.85
114 0.83
115 0.79
116 0.75
117 0.67
118 0.6
119 0.58
120 0.51
121 0.46
122 0.43
123 0.39
124 0.38
125 0.43
126 0.41
127 0.38
128 0.4
129 0.39
130 0.36
131 0.34
132 0.34
133 0.28
134 0.26
135 0.23
136 0.17
137 0.15
138 0.16
139 0.15
140 0.12
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.1
148 0.13
149 0.15
150 0.15
151 0.21
152 0.31
153 0.34
154 0.38
155 0.44
156 0.44
157 0.49
158 0.58
159 0.55
160 0.57
161 0.62
162 0.61
163 0.57
164 0.58
165 0.59
166 0.57
167 0.56
168 0.47
169 0.44
170 0.5
171 0.48
172 0.54
173 0.47
174 0.4
175 0.37
176 0.35
177 0.29
178 0.21
179 0.19
180 0.12
181 0.13
182 0.16
183 0.16
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.14
188 0.14
189 0.12
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.12
196 0.18
197 0.23
198 0.29
199 0.36
200 0.43
201 0.52
202 0.61
203 0.67
204 0.72
205 0.77
206 0.76
207 0.72
208 0.68
209 0.62
210 0.58
211 0.56
212 0.45
213 0.36
214 0.31
215 0.3
216 0.27
217 0.24
218 0.18
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.13
236 0.1
237 0.1
238 0.12
239 0.14
240 0.13
241 0.15
242 0.15
243 0.16
244 0.16
245 0.16
246 0.15
247 0.15
248 0.16
249 0.19
250 0.18
251 0.16
252 0.15
253 0.14
254 0.13
255 0.12
256 0.13
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.12
261 0.13
262 0.16
263 0.19
264 0.19
265 0.18
266 0.24
267 0.27
268 0.29
269 0.31
270 0.28
271 0.26
272 0.24
273 0.23
274 0.17
275 0.14
276 0.1
277 0.08
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.12
295 0.13
296 0.15
297 0.16
298 0.14
299 0.15
300 0.15
301 0.14
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.08
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.1
313 0.11
314 0.1
315 0.09
316 0.1
317 0.13
318 0.2
319 0.21
320 0.21
321 0.24
322 0.26
323 0.24
324 0.29
325 0.29
326 0.25
327 0.25
328 0.24
329 0.26
330 0.24
331 0.3
332 0.26
333 0.23
334 0.2
335 0.2
336 0.19
337 0.15
338 0.14
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.11
346 0.12
347 0.13
348 0.13
349 0.13
350 0.16
351 0.17
352 0.21
353 0.21
354 0.25
355 0.28
356 0.34
357 0.34
358 0.31
359 0.32
360 0.3
361 0.26
362 0.26
363 0.22
364 0.17
365 0.23
366 0.24
367 0.24
368 0.23
369 0.23
370 0.2
371 0.2
372 0.2
373 0.21
374 0.22
375 0.22
376 0.21
377 0.2
378 0.19
379 0.2
380 0.18
381 0.16
382 0.14
383 0.15
384 0.15
385 0.18
386 0.19
387 0.19
388 0.21
389 0.19
390 0.21
391 0.21
392 0.26
393 0.27
394 0.27
395 0.28
396 0.26
397 0.25
398 0.23
399 0.23
400 0.16
401 0.13
402 0.11
403 0.11
404 0.13
405 0.15
406 0.16
407 0.21
408 0.22
409 0.25
410 0.32
411 0.38
412 0.42
413 0.4
414 0.42
415 0.45
416 0.51
417 0.5
418 0.43
419 0.36
420 0.29
421 0.27
422 0.23
423 0.18
424 0.12
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.11
429 0.11
430 0.11
431 0.1
432 0.09
433 0.1
434 0.09
435 0.09
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.05
440 0.04
441 0.05
442 0.05
443 0.06
444 0.05
445 0.04
446 0.05
447 0.06
448 0.07
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.06
453 0.06
454 0.05
455 0.05
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.03
462 0.03
463 0.04
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.08
468 0.09
469 0.09
470 0.1
471 0.12
472 0.17
473 0.24
474 0.28
475 0.27
476 0.28
477 0.29
478 0.29
479 0.29
480 0.28
481 0.24
482 0.24
483 0.25
484 0.26
485 0.25
486 0.24
487 0.21
488 0.18
489 0.16
490 0.12
491 0.09
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.09
496 0.08
497 0.11
498 0.11
499 0.11
500 0.11
501 0.12
502 0.14
503 0.15
504 0.16
505 0.14
506 0.17
507 0.17
508 0.2
509 0.19
510 0.19
511 0.17
512 0.18
513 0.19
514 0.14
515 0.13
516 0.12
517 0.14
518 0.14
519 0.14
520 0.12
521 0.12
522 0.13
523 0.13
524 0.13
525 0.13
526 0.14
527 0.14
528 0.15
529 0.14
530 0.13
531 0.13
532 0.12
533 0.09
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.04
545 0.05
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.07
551 0.07
552 0.09
553 0.08
554 0.08
555 0.08
556 0.09
557 0.08
558 0.09
559 0.09
560 0.07
561 0.06
562 0.07
563 0.1
564 0.11
565 0.14
566 0.15
567 0.16
568 0.16
569 0.16
570 0.2
571 0.18
572 0.17
573 0.14
574 0.15
575 0.16
576 0.18
577 0.19
578 0.14
579 0.13
580 0.12
581 0.12
582 0.11
583 0.11
584 0.1
585 0.1
586 0.1
587 0.1
588 0.13
589 0.13
590 0.13
591 0.18
592 0.17
593 0.18
594 0.2
595 0.2
596 0.19
597 0.19
598 0.19
599 0.13
600 0.13
601 0.12
602 0.1
603 0.11
604 0.1
605 0.09
606 0.09
607 0.08
608 0.08
609 0.07
610 0.1
611 0.12
612 0.13
613 0.13
614 0.13
615 0.13
616 0.16
617 0.15
618 0.13
619 0.1
620 0.1
621 0.12
622 0.12
623 0.12
624 0.1
625 0.11
626 0.11
627 0.12
628 0.13
629 0.11
630 0.15
631 0.14
632 0.14
633 0.17
634 0.17
635 0.22
636 0.25
637 0.25
638 0.21
639 0.24
640 0.24
641 0.22
642 0.29
643 0.24
644 0.25
645 0.25
646 0.25
647 0.21
648 0.21
649 0.2
650 0.14
651 0.19
652 0.18
653 0.24
654 0.26
655 0.28
656 0.3
657 0.32
658 0.32
659 0.3
660 0.27
661 0.2
662 0.18
663 0.17
664 0.14
665 0.12
666 0.09
667 0.06
668 0.05
669 0.04
670 0.05
671 0.06
672 0.07
673 0.09
674 0.1
675 0.1
676 0.13
677 0.13
678 0.15
679 0.17
680 0.18
681 0.17
682 0.16
683 0.16
684 0.16
685 0.17
686 0.16
687 0.14
688 0.13
689 0.13
690 0.13
691 0.14
692 0.15
693 0.14
694 0.14
695 0.14
696 0.14
697 0.15
698 0.14
699 0.13
700 0.16
701 0.18
702 0.23
703 0.23
704 0.23
705 0.24
706 0.28
707 0.31
708 0.29
709 0.29
710 0.26
711 0.25
712 0.25
713 0.24
714 0.2
715 0.19
716 0.16
717 0.14
718 0.11
719 0.1
720 0.1
721 0.1
722 0.1
723 0.09
724 0.1
725 0.1
726 0.11
727 0.12
728 0.12
729 0.17
730 0.2
731 0.25
732 0.29
733 0.31
734 0.31
735 0.31
736 0.33
737 0.32
738 0.31
739 0.27
740 0.21
741 0.21
742 0.21
743 0.22
744 0.23
745 0.21
746 0.23
747 0.24
748 0.24
749 0.23
750 0.24
751 0.27
752 0.28
753 0.33
754 0.3
755 0.3
756 0.37
757 0.37
758 0.37
759 0.33
760 0.35
761 0.36
762 0.39
763 0.38
764 0.33
765 0.37
766 0.37
767 0.38
768 0.33
769 0.31
770 0.29
771 0.27
772 0.26
773 0.2
774 0.19
775 0.18
776 0.18
777 0.14
778 0.15
779 0.15
780 0.15
781 0.18
782 0.19
783 0.17
784 0.19
785 0.21
786 0.22
787 0.23
788 0.24
789 0.25
790 0.26
791 0.27
792 0.27
793 0.26
794 0.24
795 0.24
796 0.23
797 0.19
798 0.19
799 0.21
800 0.2
801 0.21
802 0.19
803 0.23
804 0.25
805 0.28
806 0.32
807 0.34
808 0.36
809 0.4
810 0.41
811 0.44
812 0.47
813 0.43
814 0.39
815 0.35
816 0.3
817 0.27
818 0.26
819 0.18
820 0.12
821 0.12
822 0.14
823 0.18
824 0.19
825 0.16
826 0.18
827 0.19
828 0.22
829 0.21
830 0.18
831 0.14
832 0.13
833 0.14
834 0.13
835 0.14
836 0.14
837 0.15
838 0.16
839 0.16
840 0.18
841 0.22
842 0.29
843 0.32
844 0.4
845 0.49
846 0.55
847 0.61
848 0.65
849 0.66
850 0.69
851 0.73
852 0.73
853 0.73
854 0.76
855 0.72
856 0.71
857 0.65
858 0.59
859 0.53
860 0.44
861 0.37
862 0.29
863 0.26
864 0.22
865 0.2
866 0.19
867 0.17
868 0.16
869 0.14
870 0.13
871 0.12
872 0.17
873 0.22
874 0.22
875 0.24
876 0.28
877 0.31
878 0.33
879 0.34
880 0.35
881 0.38
882 0.39
883 0.41
884 0.37
885 0.34
886 0.35
887 0.33
888 0.3
889 0.22
890 0.18
891 0.14
892 0.14
893 0.14
894 0.1
895 0.1
896 0.08
897 0.07
898 0.08
899 0.12
900 0.12
901 0.12
902 0.14
903 0.19
904 0.23
905 0.25
906 0.3
907 0.27
908 0.34
909 0.42
910 0.46
911 0.43
912 0.43
913 0.42
914 0.37
915 0.37
916 0.33
917 0.27
918 0.27
919 0.29
920 0.25
921 0.25
922 0.27
923 0.31
924 0.3
925 0.33
926 0.33
927 0.32
928 0.34
929 0.33
930 0.33
931 0.31
932 0.34
933 0.32
934 0.29
935 0.27
936 0.32
937 0.34
938 0.35
939 0.34
940 0.34
941 0.35
942 0.32
943 0.32
944 0.27
945 0.26
946 0.22
947 0.22
948 0.16
949 0.11
950 0.11
951 0.1
952 0.09