Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GFT5

Protein Details
Accession U1GFT5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
284-316DEEFTRRETEKKKRKESKFKSKLEDLKKRTRVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
292-325TEKKKRKESKFKSKLEDLKKRTRVEAWRRSRRGG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017900  4Fe4S_Fe_S_CS  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR022658  XPA_CS  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00198  4FE4S_FER_1  
PS00753  XPA_2  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
Amino Acid Sequences MTSIRPSTPPPQPAGLEAKSPLTPEQIRRLEISRLKAKALREQREAERAAANPTPPSLSLSKSTVAGQKRSFATFNAQTPATSRDAKKDQASSDRPLEAIQPARNFAKYIEYDLSKMTDTKGGFLTAEDDPYNKALHREDGDVKPADMTLKEWERQRLLRSLQSRKVGPFEPGINELKREEQNKQCRECGSLEIDWKWEEILKCAVCNACKDKCPEKYSLLTKTEAKDDYLLTDPELKDENLLPHLERPNPHKSTWNNMMLYLRYQVEGYAFSERKWGSPEALDEEFTRRETEKKKRKESKFKSKLEDLKKRTRVEAWRRSRRGGSGGNFGDDLPGGKHVHEWSRPIENPKTGVSVKTCIGCGMDVEELQF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.44
3 0.38
4 0.35
5 0.34
6 0.3
7 0.3
8 0.27
9 0.26
10 0.3
11 0.32
12 0.41
13 0.43
14 0.44
15 0.45
16 0.47
17 0.49
18 0.49
19 0.52
20 0.5
21 0.48
22 0.5
23 0.5
24 0.5
25 0.51
26 0.56
27 0.55
28 0.54
29 0.58
30 0.59
31 0.63
32 0.61
33 0.54
34 0.47
35 0.4
36 0.39
37 0.35
38 0.31
39 0.24
40 0.23
41 0.23
42 0.19
43 0.22
44 0.19
45 0.19
46 0.21
47 0.23
48 0.23
49 0.23
50 0.25
51 0.27
52 0.31
53 0.34
54 0.32
55 0.36
56 0.37
57 0.39
58 0.37
59 0.32
60 0.35
61 0.34
62 0.36
63 0.33
64 0.31
65 0.28
66 0.29
67 0.31
68 0.27
69 0.28
70 0.26
71 0.3
72 0.35
73 0.39
74 0.42
75 0.43
76 0.43
77 0.47
78 0.51
79 0.48
80 0.47
81 0.43
82 0.38
83 0.34
84 0.31
85 0.26
86 0.27
87 0.26
88 0.23
89 0.25
90 0.27
91 0.27
92 0.26
93 0.22
94 0.24
95 0.2
96 0.23
97 0.24
98 0.23
99 0.23
100 0.23
101 0.24
102 0.18
103 0.18
104 0.14
105 0.15
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.14
111 0.13
112 0.16
113 0.11
114 0.13
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.13
120 0.1
121 0.12
122 0.11
123 0.15
124 0.16
125 0.19
126 0.24
127 0.25
128 0.29
129 0.27
130 0.26
131 0.22
132 0.2
133 0.17
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.15
138 0.19
139 0.21
140 0.24
141 0.27
142 0.3
143 0.31
144 0.32
145 0.31
146 0.35
147 0.4
148 0.44
149 0.46
150 0.48
151 0.47
152 0.42
153 0.43
154 0.37
155 0.31
156 0.26
157 0.22
158 0.19
159 0.21
160 0.23
161 0.19
162 0.19
163 0.18
164 0.2
165 0.22
166 0.22
167 0.25
168 0.3
169 0.4
170 0.46
171 0.48
172 0.46
173 0.43
174 0.44
175 0.4
176 0.33
177 0.27
178 0.23
179 0.22
180 0.2
181 0.2
182 0.18
183 0.17
184 0.14
185 0.13
186 0.11
187 0.11
188 0.15
189 0.14
190 0.13
191 0.15
192 0.16
193 0.15
194 0.18
195 0.22
196 0.2
197 0.23
198 0.28
199 0.34
200 0.4
201 0.42
202 0.42
203 0.41
204 0.45
205 0.47
206 0.49
207 0.45
208 0.4
209 0.4
210 0.37
211 0.38
212 0.32
213 0.27
214 0.22
215 0.19
216 0.19
217 0.18
218 0.17
219 0.13
220 0.18
221 0.17
222 0.17
223 0.18
224 0.16
225 0.15
226 0.16
227 0.17
228 0.13
229 0.14
230 0.13
231 0.17
232 0.21
233 0.22
234 0.24
235 0.28
236 0.36
237 0.38
238 0.38
239 0.41
240 0.4
241 0.46
242 0.51
243 0.52
244 0.43
245 0.42
246 0.43
247 0.36
248 0.35
249 0.29
250 0.21
251 0.15
252 0.14
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.17
258 0.17
259 0.17
260 0.23
261 0.23
262 0.24
263 0.26
264 0.26
265 0.2
266 0.22
267 0.24
268 0.23
269 0.24
270 0.24
271 0.21
272 0.24
273 0.23
274 0.22
275 0.22
276 0.17
277 0.24
278 0.32
279 0.42
280 0.49
281 0.58
282 0.68
283 0.76
284 0.86
285 0.9
286 0.92
287 0.93
288 0.93
289 0.91
290 0.88
291 0.87
292 0.86
293 0.85
294 0.85
295 0.81
296 0.81
297 0.81
298 0.76
299 0.71
300 0.69
301 0.69
302 0.69
303 0.72
304 0.72
305 0.75
306 0.77
307 0.79
308 0.75
309 0.69
310 0.66
311 0.63
312 0.57
313 0.55
314 0.52
315 0.48
316 0.43
317 0.39
318 0.32
319 0.24
320 0.2
321 0.12
322 0.14
323 0.13
324 0.13
325 0.16
326 0.2
327 0.27
328 0.3
329 0.32
330 0.34
331 0.42
332 0.46
333 0.5
334 0.53
335 0.5
336 0.49
337 0.48
338 0.49
339 0.42
340 0.42
341 0.39
342 0.36
343 0.34
344 0.34
345 0.32
346 0.26
347 0.26
348 0.22
349 0.18
350 0.18
351 0.17