Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HSH8

Protein Details
Accession U1HSH8    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
120-142APTEAKKKRKRAAHDPNAPKRALBasic
258-285EPVREPSPPKSGKRRKTSDKPAATPVKEHydrophilic
288-325KPTAAAEKDKRSKKAKKEPTPPPASKTGEKKKKSRKAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-137APTEAKKKRKRAAHDPNA
264-325SPPKSGKRRKTSDKPAATPVKETPKPTAAAEKDKRSKKAKKEPTPPPASKTGEKKKKSRKAA
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 9.5, cyto 7, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MKKGGYVTLSCDHLAMVVSNEQRTVEMIHILTDQLASLIDTVVSSSVDHDSLAKTYGKVIVALATLQNSVQDLSKAYINHANTVLNPGRAGTLDLNLTTTLLDSGLLTHRAPSPGMKPEAPTEAKKKRKRAAHDPNAPKRALTPYFLYMQSARPQIAQELGSNAKPKEVADEGTRRWSIMPDADKNVWNAAYQRNLAVYRVKTAAYKAGKPVPSDEEAEKIAQTDTTIAAVPVEEEEEEVEEEPEAVEEESDSESSPEPVREPSPPKSGKRRKTSDKPAATPVKETPKPTAAAEKDKRSKKAKKEPTPPPASKTGEKKKKSRKAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.13
3 0.12
4 0.15
5 0.17
6 0.18
7 0.19
8 0.18
9 0.18
10 0.18
11 0.18
12 0.13
13 0.14
14 0.14
15 0.15
16 0.15
17 0.15
18 0.14
19 0.12
20 0.1
21 0.07
22 0.07
23 0.06
24 0.05
25 0.05
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.07
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.1
37 0.1
38 0.11
39 0.14
40 0.13
41 0.12
42 0.14
43 0.17
44 0.16
45 0.16
46 0.15
47 0.14
48 0.13
49 0.13
50 0.12
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.1
61 0.13
62 0.13
63 0.15
64 0.2
65 0.2
66 0.22
67 0.22
68 0.21
69 0.18
70 0.25
71 0.24
72 0.19
73 0.18
74 0.16
75 0.15
76 0.15
77 0.17
78 0.11
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.08
86 0.07
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.04
91 0.05
92 0.07
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.12
97 0.13
98 0.14
99 0.15
100 0.17
101 0.21
102 0.24
103 0.23
104 0.23
105 0.24
106 0.3
107 0.31
108 0.31
109 0.34
110 0.41
111 0.5
112 0.56
113 0.63
114 0.64
115 0.68
116 0.73
117 0.75
118 0.77
119 0.77
120 0.8
121 0.82
122 0.84
123 0.81
124 0.72
125 0.61
126 0.51
127 0.47
128 0.38
129 0.3
130 0.24
131 0.21
132 0.24
133 0.24
134 0.23
135 0.18
136 0.19
137 0.2
138 0.19
139 0.17
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.15
144 0.13
145 0.1
146 0.11
147 0.12
148 0.13
149 0.15
150 0.14
151 0.13
152 0.13
153 0.12
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.15
158 0.19
159 0.19
160 0.24
161 0.24
162 0.21
163 0.2
164 0.19
165 0.16
166 0.17
167 0.21
168 0.18
169 0.22
170 0.24
171 0.25
172 0.24
173 0.24
174 0.19
175 0.15
176 0.15
177 0.14
178 0.15
179 0.15
180 0.14
181 0.16
182 0.16
183 0.17
184 0.2
185 0.18
186 0.17
187 0.18
188 0.18
189 0.17
190 0.17
191 0.24
192 0.22
193 0.23
194 0.25
195 0.3
196 0.32
197 0.32
198 0.34
199 0.3
200 0.29
201 0.3
202 0.27
203 0.23
204 0.21
205 0.21
206 0.18
207 0.15
208 0.13
209 0.1
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.1
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.15
247 0.17
248 0.23
249 0.28
250 0.32
251 0.41
252 0.47
253 0.53
254 0.62
255 0.7
256 0.73
257 0.78
258 0.82
259 0.83
260 0.87
261 0.9
262 0.9
263 0.88
264 0.83
265 0.82
266 0.82
267 0.72
268 0.66
269 0.61
270 0.61
271 0.56
272 0.54
273 0.51
274 0.46
275 0.47
276 0.45
277 0.48
278 0.43
279 0.5
280 0.54
281 0.59
282 0.64
283 0.69
284 0.75
285 0.76
286 0.8
287 0.8
288 0.83
289 0.84
290 0.85
291 0.88
292 0.91
293 0.92
294 0.92
295 0.86
296 0.8
297 0.78
298 0.73
299 0.71
300 0.71
301 0.72
302 0.72
303 0.75
304 0.8
305 0.83