Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

U1GGT1

Protein Details
Accession U1GGT1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
252-279DYRSEQPGPPRWRRRRRLSPGPARRETKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-276PPRWRRRRRLSPGPARR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MKRSAFPELEEVQAIKRQEKHIENAAPATLMRPVSPPTIARKASKPSPRLSAVEAGELTVDDHFGLFSSKLLEASRTVLPGTSRISHGAWCELYQRNLNPQGRHFVIHQHDHPVAGTHYDLRLQCNGTSSISFAIMYGLPGDPNSRRLSRNATETRVHNLWNHLIETASHSTGSMLIWDTGEYSILPYRESEQAQKSSSDESDDSEPINPQHGLSESQKLHDAFQQGRIRIRLHGTRLPHNYTVSLRLSKDDYRSEQPGPPRWRRRRRLSPGPARRETKQTSSSESESDASASSSAPFAVVKKDQLTSFRRTASPPLRDHHTTAGHISPSDHSSTSKKRPTKPAFLHTNHPSKPNSVNKVSNITGAHSGNVNENKDEDEDELETTRLTNTYPGGATNTISSIHQRRWFLTLDRHNSGFVSQLNQATGLKRWVRRWRADDDTRDGFERFHVLGRDVERSVVTGRLAREILSDEGVDGFVPRVGWRGVVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.3
4 0.33
5 0.41
6 0.45
7 0.49
8 0.54
9 0.57
10 0.54
11 0.51
12 0.46
13 0.38
14 0.32
15 0.27
16 0.22
17 0.17
18 0.15
19 0.15
20 0.18
21 0.2
22 0.23
23 0.25
24 0.29
25 0.38
26 0.41
27 0.43
28 0.47
29 0.52
30 0.58
31 0.64
32 0.62
33 0.59
34 0.63
35 0.63
36 0.59
37 0.55
38 0.53
39 0.45
40 0.43
41 0.37
42 0.29
43 0.24
44 0.22
45 0.18
46 0.11
47 0.1
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.1
56 0.1
57 0.12
58 0.13
59 0.14
60 0.13
61 0.17
62 0.18
63 0.16
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.18
68 0.21
69 0.19
70 0.19
71 0.21
72 0.22
73 0.22
74 0.23
75 0.24
76 0.21
77 0.2
78 0.24
79 0.25
80 0.27
81 0.3
82 0.31
83 0.34
84 0.43
85 0.47
86 0.45
87 0.44
88 0.49
89 0.45
90 0.45
91 0.38
92 0.37
93 0.38
94 0.41
95 0.4
96 0.38
97 0.37
98 0.35
99 0.34
100 0.28
101 0.22
102 0.17
103 0.16
104 0.12
105 0.12
106 0.17
107 0.17
108 0.18
109 0.21
110 0.21
111 0.21
112 0.22
113 0.23
114 0.2
115 0.19
116 0.17
117 0.15
118 0.13
119 0.13
120 0.1
121 0.1
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.1
129 0.1
130 0.14
131 0.18
132 0.21
133 0.22
134 0.25
135 0.33
136 0.34
137 0.43
138 0.44
139 0.44
140 0.45
141 0.46
142 0.49
143 0.42
144 0.4
145 0.32
146 0.3
147 0.29
148 0.26
149 0.25
150 0.19
151 0.18
152 0.16
153 0.19
154 0.18
155 0.15
156 0.13
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.08
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.06
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.11
176 0.15
177 0.16
178 0.2
179 0.22
180 0.26
181 0.26
182 0.27
183 0.25
184 0.24
185 0.22
186 0.2
187 0.16
188 0.15
189 0.16
190 0.16
191 0.15
192 0.14
193 0.15
194 0.12
195 0.14
196 0.12
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.13
201 0.14
202 0.21
203 0.19
204 0.2
205 0.23
206 0.23
207 0.23
208 0.22
209 0.24
210 0.18
211 0.26
212 0.3
213 0.28
214 0.3
215 0.31
216 0.29
217 0.28
218 0.31
219 0.26
220 0.26
221 0.28
222 0.29
223 0.34
224 0.37
225 0.39
226 0.37
227 0.33
228 0.3
229 0.28
230 0.29
231 0.24
232 0.22
233 0.18
234 0.18
235 0.2
236 0.21
237 0.23
238 0.22
239 0.24
240 0.25
241 0.28
242 0.29
243 0.3
244 0.32
245 0.38
246 0.43
247 0.49
248 0.56
249 0.64
250 0.72
251 0.78
252 0.84
253 0.86
254 0.87
255 0.89
256 0.89
257 0.89
258 0.89
259 0.88
260 0.85
261 0.77
262 0.69
263 0.66
264 0.59
265 0.54
266 0.51
267 0.44
268 0.43
269 0.43
270 0.42
271 0.35
272 0.33
273 0.27
274 0.2
275 0.19
276 0.13
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.09
287 0.1
288 0.12
289 0.13
290 0.16
291 0.17
292 0.23
293 0.27
294 0.3
295 0.32
296 0.33
297 0.33
298 0.33
299 0.4
300 0.42
301 0.45
302 0.43
303 0.43
304 0.46
305 0.47
306 0.47
307 0.44
308 0.39
309 0.32
310 0.31
311 0.3
312 0.24
313 0.22
314 0.21
315 0.17
316 0.16
317 0.17
318 0.15
319 0.15
320 0.2
321 0.28
322 0.36
323 0.43
324 0.49
325 0.54
326 0.65
327 0.71
328 0.75
329 0.75
330 0.75
331 0.76
332 0.72
333 0.73
334 0.69
335 0.71
336 0.62
337 0.59
338 0.51
339 0.45
340 0.51
341 0.51
342 0.5
343 0.48
344 0.51
345 0.49
346 0.53
347 0.5
348 0.45
349 0.37
350 0.32
351 0.3
352 0.26
353 0.23
354 0.19
355 0.19
356 0.21
357 0.26
358 0.25
359 0.21
360 0.21
361 0.22
362 0.22
363 0.22
364 0.16
365 0.14
366 0.13
367 0.14
368 0.14
369 0.13
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.09
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.12
378 0.12
379 0.13
380 0.15
381 0.16
382 0.16
383 0.14
384 0.14
385 0.12
386 0.13
387 0.18
388 0.2
389 0.26
390 0.31
391 0.33
392 0.33
393 0.36
394 0.39
395 0.38
396 0.44
397 0.47
398 0.48
399 0.51
400 0.5
401 0.47
402 0.44
403 0.39
404 0.33
405 0.24
406 0.2
407 0.19
408 0.2
409 0.2
410 0.21
411 0.22
412 0.2
413 0.22
414 0.26
415 0.29
416 0.33
417 0.42
418 0.51
419 0.59
420 0.66
421 0.69
422 0.69
423 0.73
424 0.76
425 0.74
426 0.71
427 0.68
428 0.61
429 0.58
430 0.5
431 0.41
432 0.34
433 0.31
434 0.24
435 0.23
436 0.22
437 0.21
438 0.26
439 0.28
440 0.32
441 0.27
442 0.28
443 0.23
444 0.23
445 0.23
446 0.21
447 0.19
448 0.19
449 0.19
450 0.23
451 0.23
452 0.21
453 0.21
454 0.22
455 0.23
456 0.2
457 0.19
458 0.15
459 0.15
460 0.15
461 0.13
462 0.1
463 0.09
464 0.08
465 0.09
466 0.09
467 0.12
468 0.12