Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

U1GD09

Protein Details
Accession U1GD09    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
534-558TTTSGEGKDKSRRKRRATMVPTFGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
543-549KSRRKRR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 9, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09123  PLDc_Tdp1_2  
cd09194  PLDc_yTdp1_1  
Amino Acid Sequences MSSPDRKRQRIDDHSLRTSHPVAVEIRSRRAAFLASLDRGVSPPAGRELPPPATTVIEKAPQTERKTETPPKPPISPLIGKLRTQSATTSKCSIIQSPFKLTHIRDLPANANIDTISVRDILGDVMLKEVWLFDFLYDVDWVMQQFDPDIQHIVSVVLVHGSWRREDPNKIHIDEACKRYSNVKAVTAYMPEPFGTHHTKGMVLFRRDDLAQVIVHTANMIEQDWRNLSQGVWLSPLLPRLASPVSKETSGVLPAIGSGSRFKRDFMAYLQHYQHRTASLVSQLEQYDFSAIKAALVAHVPAKFDGIETEPSVQLWGWPALKRTLKNISPEKLPEQHSNIQSPPHIVCQVSSIASLPEKWIRDTLFAALAKTSTAVDIPTKNSRTFSQARPRYSIIFPTPSEIRTCLDGYAAGASIHCKLQNTQQRKQFEFMKPHLCHWNAEHSRSAVTSTGTSPSSRTGKALRGPAAPHIKTFIRFSDSTAQKTIDWALLTSANLSTQAWGTAAQIGSGEVKVSSYELGVLVWPDLFLDSDTTTTSGEGKDKSRRKRRATMVPTFGSNTPSDAQIRDVVTASPTRRLGGNREERTEKDSDDEEAAAEDDELVIVALRMPYDLPLTPYSPDDEVWSAKSSHTEPDSFGGVWNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.75
3 0.67
4 0.62
5 0.54
6 0.47
7 0.37
8 0.32
9 0.28
10 0.3
11 0.37
12 0.36
13 0.39
14 0.43
15 0.42
16 0.39
17 0.39
18 0.35
19 0.28
20 0.31
21 0.32
22 0.27
23 0.28
24 0.27
25 0.26
26 0.25
27 0.25
28 0.2
29 0.14
30 0.14
31 0.18
32 0.21
33 0.21
34 0.24
35 0.29
36 0.32
37 0.32
38 0.31
39 0.28
40 0.28
41 0.28
42 0.28
43 0.25
44 0.26
45 0.25
46 0.27
47 0.34
48 0.39
49 0.43
50 0.47
51 0.48
52 0.48
53 0.57
54 0.63
55 0.64
56 0.66
57 0.71
58 0.69
59 0.67
60 0.64
61 0.61
62 0.59
63 0.55
64 0.51
65 0.52
66 0.51
67 0.49
68 0.49
69 0.49
70 0.42
71 0.39
72 0.38
73 0.36
74 0.37
75 0.4
76 0.41
77 0.35
78 0.38
79 0.39
80 0.4
81 0.39
82 0.42
83 0.42
84 0.45
85 0.46
86 0.44
87 0.48
88 0.43
89 0.45
90 0.42
91 0.39
92 0.35
93 0.36
94 0.37
95 0.36
96 0.37
97 0.27
98 0.23
99 0.21
100 0.19
101 0.16
102 0.13
103 0.1
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.08
132 0.09
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.13
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.08
142 0.08
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.09
148 0.1
149 0.12
150 0.14
151 0.19
152 0.24
153 0.31
154 0.34
155 0.4
156 0.45
157 0.45
158 0.45
159 0.42
160 0.45
161 0.46
162 0.45
163 0.4
164 0.35
165 0.35
166 0.37
167 0.4
168 0.39
169 0.35
170 0.35
171 0.33
172 0.34
173 0.35
174 0.32
175 0.28
176 0.21
177 0.19
178 0.14
179 0.13
180 0.11
181 0.15
182 0.18
183 0.19
184 0.2
185 0.2
186 0.21
187 0.22
188 0.29
189 0.32
190 0.28
191 0.29
192 0.28
193 0.29
194 0.28
195 0.27
196 0.21
197 0.15
198 0.13
199 0.11
200 0.12
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.1
211 0.11
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.15
218 0.14
219 0.14
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.15
224 0.11
225 0.1
226 0.09
227 0.11
228 0.13
229 0.13
230 0.15
231 0.17
232 0.18
233 0.19
234 0.19
235 0.17
236 0.16
237 0.16
238 0.14
239 0.09
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.06
244 0.06
245 0.08
246 0.1
247 0.14
248 0.14
249 0.15
250 0.18
251 0.19
252 0.2
253 0.2
254 0.26
255 0.25
256 0.3
257 0.32
258 0.33
259 0.34
260 0.33
261 0.31
262 0.24
263 0.22
264 0.17
265 0.16
266 0.15
267 0.15
268 0.14
269 0.15
270 0.15
271 0.14
272 0.14
273 0.13
274 0.1
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.08
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.07
302 0.07
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.12
307 0.17
308 0.21
309 0.21
310 0.24
311 0.29
312 0.3
313 0.37
314 0.41
315 0.38
316 0.38
317 0.39
318 0.38
319 0.37
320 0.38
321 0.34
322 0.34
323 0.38
324 0.37
325 0.37
326 0.34
327 0.3
328 0.27
329 0.25
330 0.21
331 0.17
332 0.16
333 0.13
334 0.12
335 0.13
336 0.13
337 0.11
338 0.1
339 0.09
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.14
348 0.14
349 0.16
350 0.17
351 0.16
352 0.17
353 0.16
354 0.16
355 0.13
356 0.13
357 0.11
358 0.1
359 0.09
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.08
364 0.09
365 0.13
366 0.19
367 0.21
368 0.22
369 0.24
370 0.24
371 0.29
372 0.32
373 0.37
374 0.41
375 0.46
376 0.48
377 0.5
378 0.51
379 0.48
380 0.45
381 0.41
382 0.34
383 0.32
384 0.28
385 0.28
386 0.27
387 0.24
388 0.24
389 0.21
390 0.18
391 0.16
392 0.17
393 0.13
394 0.12
395 0.11
396 0.1
397 0.1
398 0.09
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.07
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.1
407 0.19
408 0.28
409 0.35
410 0.41
411 0.47
412 0.52
413 0.54
414 0.57
415 0.57
416 0.55
417 0.56
418 0.54
419 0.57
420 0.52
421 0.53
422 0.57
423 0.5
424 0.44
425 0.38
426 0.44
427 0.37
428 0.38
429 0.37
430 0.3
431 0.29
432 0.28
433 0.27
434 0.17
435 0.15
436 0.13
437 0.12
438 0.14
439 0.14
440 0.14
441 0.14
442 0.18
443 0.21
444 0.2
445 0.22
446 0.23
447 0.27
448 0.32
449 0.37
450 0.35
451 0.35
452 0.36
453 0.41
454 0.46
455 0.41
456 0.36
457 0.34
458 0.33
459 0.32
460 0.33
461 0.28
462 0.24
463 0.24
464 0.27
465 0.34
466 0.35
467 0.36
468 0.36
469 0.35
470 0.29
471 0.3
472 0.28
473 0.2
474 0.17
475 0.14
476 0.13
477 0.13
478 0.13
479 0.13
480 0.11
481 0.09
482 0.09
483 0.09
484 0.08
485 0.07
486 0.08
487 0.07
488 0.08
489 0.08
490 0.11
491 0.11
492 0.1
493 0.1
494 0.1
495 0.11
496 0.1
497 0.1
498 0.06
499 0.06
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.06
511 0.06
512 0.05
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.07
517 0.08
518 0.08
519 0.09
520 0.1
521 0.1
522 0.1
523 0.11
524 0.11
525 0.14
526 0.17
527 0.22
528 0.32
529 0.4
530 0.51
531 0.6
532 0.68
533 0.74
534 0.81
535 0.85
536 0.86
537 0.87
538 0.86
539 0.83
540 0.76
541 0.69
542 0.62
543 0.54
544 0.46
545 0.36
546 0.3
547 0.22
548 0.23
549 0.22
550 0.19
551 0.2
552 0.22
553 0.22
554 0.2
555 0.2
556 0.18
557 0.19
558 0.23
559 0.23
560 0.25
561 0.25
562 0.25
563 0.28
564 0.3
565 0.35
566 0.4
567 0.48
568 0.48
569 0.54
570 0.57
571 0.55
572 0.57
573 0.54
574 0.44
575 0.37
576 0.33
577 0.29
578 0.27
579 0.25
580 0.2
581 0.18
582 0.17
583 0.13
584 0.11
585 0.09
586 0.06
587 0.06
588 0.05
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.05
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.07
597 0.08
598 0.11
599 0.12
600 0.15
601 0.18
602 0.2
603 0.21
604 0.22
605 0.24
606 0.23
607 0.22
608 0.22
609 0.22
610 0.23
611 0.24
612 0.25
613 0.23
614 0.22
615 0.27
616 0.24
617 0.28
618 0.3
619 0.29
620 0.28
621 0.31
622 0.33
623 0.29