Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HW07

Protein Details
Accession U1HW07    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-58DEPLTVSKRSKRHSSRKPSTTTAEHydrophilic
60-85TSFKVPLPPSRPKRKHTPPTETDEPPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 6.5, cyto_nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
Gene Ontology GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MSLRRSARTASIPLKSGMTTRASISDPKRPLTPDDEPLTVSKRSKRHSSRKPSTTTAEPTSFKVPLPPSRPKRKHTPPTETDEPPPLTPTPSLVGLISAPTYSSGDIDNATPPPPSRPADPHISNATLVTPGGTQATAYSSYVPESSPSKLGLKGPSHPTSTASNLLSQACAHLISVEPKLAPLIRKHTCHIFSPSGLAEKIDPFRSLASGIMAQQVSGAAAKSIKNKFIGLFNGDDPPQSNFPTPVQVVATDISRLRLAGLSQRKAEYIHGLAEKFATGELSTSMLLQASDEEVMEKLIAVRGLGKWSVEMFACFGLKRMDVFSTGDLGVQRGMAAFMGKDVSKLKAKGGGKWKYMSEKDMLEGSEKYRPYRSLFMWYMWRAEDVDVSAVEGNGEGAASV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.38
3 0.35
4 0.31
5 0.27
6 0.24
7 0.23
8 0.25
9 0.25
10 0.32
11 0.35
12 0.4
13 0.41
14 0.42
15 0.45
16 0.44
17 0.46
18 0.47
19 0.48
20 0.46
21 0.46
22 0.45
23 0.42
24 0.42
25 0.41
26 0.38
27 0.37
28 0.37
29 0.4
30 0.46
31 0.55
32 0.63
33 0.7
34 0.76
35 0.82
36 0.86
37 0.87
38 0.87
39 0.83
40 0.78
41 0.74
42 0.7
43 0.65
44 0.61
45 0.53
46 0.5
47 0.48
48 0.43
49 0.35
50 0.35
51 0.34
52 0.36
53 0.42
54 0.5
55 0.55
56 0.66
57 0.74
58 0.73
59 0.79
60 0.81
61 0.84
62 0.84
63 0.84
64 0.79
65 0.81
66 0.82
67 0.74
68 0.66
69 0.63
70 0.55
71 0.45
72 0.42
73 0.33
74 0.28
75 0.25
76 0.24
77 0.18
78 0.17
79 0.17
80 0.13
81 0.13
82 0.11
83 0.12
84 0.1
85 0.07
86 0.06
87 0.07
88 0.08
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.1
95 0.11
96 0.11
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.15
101 0.19
102 0.2
103 0.23
104 0.27
105 0.31
106 0.38
107 0.4
108 0.41
109 0.39
110 0.38
111 0.34
112 0.29
113 0.25
114 0.17
115 0.14
116 0.11
117 0.07
118 0.06
119 0.07
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.14
136 0.15
137 0.17
138 0.2
139 0.24
140 0.25
141 0.29
142 0.34
143 0.36
144 0.36
145 0.34
146 0.34
147 0.3
148 0.3
149 0.28
150 0.22
151 0.2
152 0.2
153 0.19
154 0.17
155 0.15
156 0.12
157 0.09
158 0.08
159 0.07
160 0.05
161 0.06
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.12
170 0.12
171 0.2
172 0.23
173 0.26
174 0.27
175 0.33
176 0.33
177 0.34
178 0.36
179 0.3
180 0.26
181 0.26
182 0.24
183 0.2
184 0.18
185 0.16
186 0.11
187 0.11
188 0.13
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.08
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.04
208 0.05
209 0.07
210 0.14
211 0.16
212 0.18
213 0.19
214 0.2
215 0.2
216 0.22
217 0.23
218 0.18
219 0.19
220 0.17
221 0.18
222 0.18
223 0.17
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.14
230 0.15
231 0.19
232 0.18
233 0.16
234 0.14
235 0.13
236 0.13
237 0.12
238 0.12
239 0.09
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.15
248 0.23
249 0.25
250 0.27
251 0.27
252 0.27
253 0.28
254 0.28
255 0.24
256 0.18
257 0.19
258 0.2
259 0.19
260 0.19
261 0.18
262 0.17
263 0.13
264 0.11
265 0.07
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.06
287 0.07
288 0.06
289 0.08
290 0.09
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.11
295 0.12
296 0.13
297 0.12
298 0.11
299 0.1
300 0.11
301 0.12
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.13
306 0.13
307 0.14
308 0.14
309 0.14
310 0.16
311 0.16
312 0.17
313 0.16
314 0.17
315 0.15
316 0.14
317 0.13
318 0.11
319 0.1
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.06
326 0.08
327 0.08
328 0.1
329 0.12
330 0.16
331 0.22
332 0.23
333 0.25
334 0.31
335 0.33
336 0.39
337 0.47
338 0.51
339 0.5
340 0.53
341 0.55
342 0.56
343 0.58
344 0.53
345 0.47
346 0.4
347 0.37
348 0.37
349 0.33
350 0.26
351 0.25
352 0.25
353 0.27
354 0.27
355 0.29
356 0.31
357 0.34
358 0.36
359 0.41
360 0.41
361 0.44
362 0.45
363 0.46
364 0.49
365 0.48
366 0.45
367 0.39
368 0.38
369 0.29
370 0.28
371 0.25
372 0.18
373 0.18
374 0.15
375 0.15
376 0.14
377 0.13
378 0.12
379 0.1
380 0.09
381 0.06