Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HG61

Protein Details
Accession U1HG61    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-113QTSHENGPSPRKRKNKKPKAPLHNAGPLRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-107SPRKRKNKKPKAPLH
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MTSNLTSWALPHLQRLLPVDEESLKETITYSASLSKEAAAEHLKNLLGDSALALEFISSFNSRRPETTYTNSSQPSEPAEPSRPQTSHENGPSPRKRKNKKPKAPLHNAGPLRRPDNYGDVGGGYNKSSTEQDYMPKALRATTTGLSHSLSLSQEPAALQISDQTHQIASSPTHPREHSPTSQPKLPPSASGSLISDLPNVKSKAAKKQAHSSGSSTPQKTTTTSSINDLTSAIALLELSTNPSLSSERRRCPCNASIHPLFETAPNCLSCGKIICALEGLQPCSFCDNLILSKEQVQTMIRTLKDERGQERMAAHNAAASHSGRGSPMLGSRVATPESSGDEASAAAAKARAHRDRLLAFQRDNAQRTKVHDEAADFDMTVTSGATQWMSPVQRAAALKKQQKYLRELGEANKPEWEKKKMVMSMSIRNGKLVRTYENVRSTAPPEADDAADAADEDQEVDSSMSQTGQGLSRNPLLAGGGLIRPIWKAPDEEKGKGKVREPTERRETWRRVQDDNDDNEHWILDGGIHGFEDGSNQGKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.35
3 0.33
4 0.31
5 0.31
6 0.3
7 0.27
8 0.27
9 0.27
10 0.24
11 0.2
12 0.17
13 0.17
14 0.15
15 0.14
16 0.13
17 0.12
18 0.18
19 0.18
20 0.2
21 0.19
22 0.19
23 0.18
24 0.18
25 0.21
26 0.2
27 0.21
28 0.21
29 0.24
30 0.23
31 0.22
32 0.22
33 0.18
34 0.13
35 0.11
36 0.1
37 0.09
38 0.08
39 0.08
40 0.07
41 0.06
42 0.07
43 0.07
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.15
48 0.21
49 0.22
50 0.24
51 0.29
52 0.33
53 0.38
54 0.45
55 0.48
56 0.46
57 0.52
58 0.52
59 0.49
60 0.44
61 0.39
62 0.38
63 0.34
64 0.33
65 0.32
66 0.35
67 0.36
68 0.39
69 0.44
70 0.38
71 0.38
72 0.43
73 0.43
74 0.47
75 0.49
76 0.52
77 0.5
78 0.6
79 0.66
80 0.65
81 0.69
82 0.71
83 0.75
84 0.78
85 0.85
86 0.86
87 0.87
88 0.92
89 0.93
90 0.93
91 0.94
92 0.91
93 0.87
94 0.85
95 0.8
96 0.73
97 0.69
98 0.63
99 0.56
100 0.5
101 0.45
102 0.39
103 0.39
104 0.36
105 0.3
106 0.25
107 0.23
108 0.22
109 0.2
110 0.18
111 0.12
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.13
117 0.14
118 0.16
119 0.2
120 0.23
121 0.26
122 0.26
123 0.26
124 0.24
125 0.23
126 0.22
127 0.19
128 0.2
129 0.19
130 0.19
131 0.19
132 0.2
133 0.19
134 0.18
135 0.16
136 0.15
137 0.13
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.11
148 0.13
149 0.12
150 0.13
151 0.13
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.1
156 0.1
157 0.16
158 0.23
159 0.25
160 0.29
161 0.3
162 0.32
163 0.37
164 0.42
165 0.4
166 0.42
167 0.49
168 0.5
169 0.56
170 0.54
171 0.5
172 0.5
173 0.46
174 0.39
175 0.34
176 0.32
177 0.28
178 0.27
179 0.25
180 0.2
181 0.2
182 0.18
183 0.15
184 0.13
185 0.13
186 0.17
187 0.17
188 0.17
189 0.21
190 0.24
191 0.32
192 0.42
193 0.45
194 0.44
195 0.53
196 0.59
197 0.58
198 0.57
199 0.5
200 0.45
201 0.48
202 0.5
203 0.42
204 0.35
205 0.33
206 0.33
207 0.31
208 0.3
209 0.26
210 0.23
211 0.23
212 0.25
213 0.25
214 0.24
215 0.23
216 0.19
217 0.15
218 0.11
219 0.1
220 0.07
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.08
232 0.1
233 0.2
234 0.25
235 0.32
236 0.36
237 0.39
238 0.4
239 0.45
240 0.49
241 0.48
242 0.45
243 0.46
244 0.45
245 0.44
246 0.42
247 0.37
248 0.31
249 0.24
250 0.21
251 0.14
252 0.14
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.09
258 0.1
259 0.09
260 0.11
261 0.11
262 0.1
263 0.11
264 0.11
265 0.14
266 0.14
267 0.15
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.13
272 0.12
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.09
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.15
281 0.16
282 0.15
283 0.15
284 0.14
285 0.14
286 0.16
287 0.2
288 0.16
289 0.17
290 0.18
291 0.22
292 0.26
293 0.29
294 0.28
295 0.29
296 0.3
297 0.29
298 0.3
299 0.28
300 0.25
301 0.21
302 0.19
303 0.15
304 0.14
305 0.13
306 0.13
307 0.11
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.13
321 0.13
322 0.12
323 0.11
324 0.1
325 0.12
326 0.12
327 0.11
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.06
334 0.05
335 0.07
336 0.07
337 0.12
338 0.19
339 0.22
340 0.25
341 0.28
342 0.32
343 0.32
344 0.39
345 0.41
346 0.4
347 0.37
348 0.37
349 0.43
350 0.44
351 0.44
352 0.39
353 0.35
354 0.33
355 0.38
356 0.42
357 0.35
358 0.32
359 0.3
360 0.29
361 0.29
362 0.29
363 0.24
364 0.16
365 0.15
366 0.13
367 0.11
368 0.1
369 0.06
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.1
377 0.11
378 0.11
379 0.12
380 0.12
381 0.16
382 0.18
383 0.21
384 0.25
385 0.33
386 0.4
387 0.44
388 0.51
389 0.52
390 0.56
391 0.58
392 0.57
393 0.54
394 0.51
395 0.49
396 0.45
397 0.51
398 0.47
399 0.41
400 0.39
401 0.35
402 0.37
403 0.4
404 0.42
405 0.36
406 0.37
407 0.45
408 0.44
409 0.44
410 0.47
411 0.45
412 0.48
413 0.54
414 0.57
415 0.49
416 0.47
417 0.46
418 0.39
419 0.4
420 0.34
421 0.29
422 0.28
423 0.33
424 0.38
425 0.42
426 0.43
427 0.38
428 0.38
429 0.37
430 0.37
431 0.33
432 0.26
433 0.23
434 0.24
435 0.22
436 0.19
437 0.17
438 0.11
439 0.1
440 0.09
441 0.07
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.07
450 0.07
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.11
457 0.14
458 0.15
459 0.19
460 0.22
461 0.22
462 0.22
463 0.2
464 0.18
465 0.16
466 0.14
467 0.12
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.1
473 0.11
474 0.13
475 0.13
476 0.17
477 0.19
478 0.29
479 0.34
480 0.39
481 0.45
482 0.5
483 0.56
484 0.57
485 0.59
486 0.57
487 0.59
488 0.65
489 0.64
490 0.66
491 0.67
492 0.69
493 0.72
494 0.74
495 0.74
496 0.73
497 0.77
498 0.72
499 0.68
500 0.68
501 0.69
502 0.68
503 0.67
504 0.63
505 0.54
506 0.52
507 0.47
508 0.41
509 0.31
510 0.22
511 0.15
512 0.09
513 0.1
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.1
521 0.1