FuNGI

U1GC40

Protein Details

Accession

U1GC40

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
373-399	ATWKSSKRSAYYRKRRRWMRIKSVVDS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
385-389	RKRRR

Subcellular Location(s)

mito 12, nucl 7, cyto 5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017423 TRM6
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0031515 C:tRNA (m1A) methyltransferase complex GO:0030488 P:tRNA methylation
Pfam	View protein in Pfam PF04189 Gcd10p

Amino Acid Sequences

MRTIDPLMQVPLKSFSSSMHPTIQPNQYVALRLPSDQLKVQQIVQNNIISLGKYGAFHADQILGRPFHLTFEIINGEELRIVPAAELHAHALIQQMETPSASPGDEGDIEHQRDGLLDDNHTNQIIIDDPTSQRLTVAEIEALKSDGSGNSKDVFAKVIGAHSTSEERTAFSLAKYTLRKNRKYLRRFCVLPLDVPTLTDWLMNERDFGKVMELRNDVLGLIGCWANIYHADGSHSEIRPSGRYLLVDDTGGLLVAAMAERMGILYAEGDNNDTAESNHPYTEDQGSESPDHSRRGDRDIPSMSAISNTITLLHSNSQPNLALLKYFDYDVNTPSPKHPLFTHLKTLSWLQLLSPSEDPAYTEPDTATPETLATWKSSKRSAYYRKRRRWMRIKSVVDSTRQGGFHGLILATLTSPGSILNHAVPLLAGAAQVVVYSPYLEPLAELADLYSTARRTAFLNTPEEQRVVPSTDFPVDPTLLLAPSVQTARLRRWQVLPGRTHPLMMGKGGAEGYIFVATRVLPAQEKVTARGRVGGKRRKVENLADPLDVVGAAIEAQAYSEETRPSVNLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.2
3	0.25
4	0.3
5	0.31
6	0.33
7	0.35
8	0.38
9	0.46
10	0.51
11	0.45
12	0.41
13	0.42
14	0.37
15	0.36
16	0.33
17	0.32
18	0.27
19	0.25
20	0.28
21	0.28
22	0.29
23	0.3
24	0.33
25	0.32
26	0.33
27	0.36
28	0.36
29	0.38
30	0.39
31	0.4
32	0.37
33	0.31
34	0.31
35	0.27
36	0.24
37	0.19
38	0.16
39	0.13
40	0.12
41	0.13
42	0.15
43	0.15
44	0.15
45	0.16
46	0.18
47	0.17
48	0.2
49	0.25
50	0.21
51	0.21
52	0.23
53	0.21
54	0.19
55	0.2
56	0.17
57	0.12
58	0.15
59	0.18
60	0.16
61	0.17
62	0.16
63	0.15
64	0.14
65	0.14
66	0.12
67	0.1
68	0.09
69	0.08
70	0.08
71	0.09
72	0.1
73	0.1
74	0.1
75	0.1
76	0.1
77	0.1
78	0.12
79	0.11
80	0.11
81	0.12
82	0.12
83	0.12
84	0.13
85	0.13
86	0.11
87	0.11
88	0.1
89	0.09
90	0.08
91	0.1
92	0.1
93	0.1
94	0.14
95	0.2
96	0.21
97	0.21
98	0.2
99	0.18
100	0.17
101	0.18
102	0.19
103	0.14
104	0.15
105	0.17
106	0.19
107	0.21
108	0.2
109	0.19
110	0.13
111	0.13
112	0.13
113	0.12
114	0.1
115	0.11
116	0.12
117	0.16
118	0.17
119	0.16
120	0.14
121	0.14
122	0.16
123	0.15
124	0.15
125	0.13
126	0.13
127	0.14
128	0.14
129	0.14
130	0.11
131	0.09
132	0.09
133	0.09
134	0.11
135	0.12
136	0.13
137	0.14
138	0.15
139	0.16
140	0.15
141	0.15
142	0.12
143	0.13
144	0.12
145	0.13
146	0.13
147	0.13
148	0.13
149	0.13
150	0.15
151	0.13
152	0.15
153	0.13
154	0.13
155	0.13
156	0.15
157	0.14
158	0.12
159	0.15
160	0.14
161	0.2
162	0.23
163	0.29
164	0.36
165	0.45
166	0.5
167	0.55
168	0.64
169	0.68
170	0.75
171	0.78
172	0.76
173	0.75
174	0.71
175	0.65
176	0.65
177	0.56
178	0.48
179	0.42
180	0.39
181	0.31
182	0.3
183	0.27
184	0.18
185	0.16
186	0.15
187	0.1
188	0.1
189	0.12
190	0.11
191	0.12
192	0.12
193	0.13
194	0.13
195	0.13
196	0.13
197	0.14
198	0.15
199	0.19
200	0.19
201	0.19
202	0.18
203	0.18
204	0.15
205	0.12
206	0.11
207	0.06
208	0.06
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.07
216	0.06
217	0.06
218	0.08
219	0.08
220	0.12
221	0.17
222	0.17
223	0.16
224	0.17
225	0.18
226	0.18
227	0.19
228	0.18
229	0.13
230	0.13
231	0.15
232	0.15
233	0.15
234	0.13
235	0.12
236	0.1
237	0.09
238	0.08
239	0.06
240	0.04
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.02
245	0.02
246	0.02
247	0.02
248	0.02
249	0.02
250	0.02
251	0.02
252	0.03
253	0.03
254	0.04
255	0.04
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.07
263	0.1
264	0.1
265	0.1
266	0.1
267	0.11
268	0.12
269	0.13
270	0.11
271	0.1
272	0.1
273	0.12
274	0.13
275	0.13
276	0.15
277	0.16
278	0.18
279	0.18
280	0.2
281	0.2
282	0.26
283	0.32
284	0.3
285	0.32
286	0.32
287	0.32
288	0.3
289	0.28
290	0.21
291	0.16
292	0.14
293	0.09
294	0.08
295	0.07
296	0.06
297	0.06
298	0.07
299	0.07
300	0.09
301	0.12
302	0.13
303	0.13
304	0.13
305	0.13
306	0.13
307	0.13
308	0.11
309	0.08
310	0.07
311	0.09
312	0.08
313	0.09
314	0.09
315	0.1
316	0.11
317	0.12
318	0.16
319	0.16
320	0.16
321	0.17
322	0.23
323	0.21
324	0.22
325	0.21
326	0.24
327	0.3
328	0.33
329	0.41
330	0.35
331	0.35
332	0.35
333	0.36
334	0.31
335	0.24
336	0.2
337	0.11
338	0.15
339	0.16
340	0.17
341	0.16
342	0.15
343	0.14
344	0.14
345	0.15
346	0.11
347	0.15
348	0.13
349	0.13
350	0.12
351	0.13
352	0.16
353	0.15
354	0.15
355	0.1
356	0.09
357	0.09
358	0.11
359	0.11
360	0.1
361	0.13
362	0.15
363	0.18
364	0.22
365	0.24
366	0.27
367	0.37
368	0.46
369	0.54
370	0.62
371	0.71
372	0.77
373	0.84
374	0.89
375	0.89
376	0.89
377	0.89
378	0.89
379	0.88
380	0.84
381	0.78
382	0.77
383	0.7
384	0.62
385	0.53
386	0.44
387	0.38
388	0.32
389	0.29
390	0.22
391	0.19
392	0.16
393	0.15
394	0.13
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.06
399	0.06
400	0.05
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.05
405	0.06
406	0.07
407	0.07
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.08
412	0.07
413	0.07
414	0.05
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.04
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.05
424	0.05
425	0.06
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.08
431	0.07
432	0.07
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.07
437	0.09
438	0.08
439	0.1
440	0.1
441	0.11
442	0.12
443	0.17
444	0.23
445	0.25
446	0.3
447	0.31
448	0.36
449	0.37
450	0.37
451	0.31
452	0.27
453	0.25
454	0.24
455	0.22
456	0.19
457	0.2
458	0.22
459	0.22
460	0.21
461	0.21
462	0.18
463	0.17
464	0.16
465	0.14
466	0.12
467	0.12
468	0.11
469	0.08
470	0.1
471	0.11
472	0.12
473	0.15
474	0.18
475	0.24
476	0.32
477	0.36
478	0.37
479	0.41
480	0.47
481	0.52
482	0.57
483	0.57
484	0.54
485	0.59
486	0.55
487	0.51
488	0.44
489	0.41
490	0.34
491	0.29
492	0.25
493	0.17
494	0.18
495	0.17
496	0.16
497	0.1
498	0.09
499	0.09
500	0.09
501	0.09
502	0.08
503	0.09
504	0.09
505	0.1
506	0.11
507	0.12
508	0.12
509	0.13
510	0.16
511	0.22
512	0.23
513	0.27
514	0.34
515	0.35
516	0.34
517	0.4
518	0.43
519	0.46
520	0.54
521	0.6
522	0.61
523	0.66
524	0.71
525	0.72
526	0.73
527	0.72
528	0.71
529	0.71
530	0.65
531	0.57
532	0.52
533	0.43
534	0.37
535	0.28
536	0.18
537	0.09
538	0.05
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.03
543	0.04
544	0.05
545	0.07
546	0.09
547	0.11
548	0.13
549	0.14
550	0.15

U1GC40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer