Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HGC1

Protein Details
Accession U1HGC1    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21SPSVVKPKSPPPYQRPNLYIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 17, mito 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012328  Chalcone/stilbene_synt_C  
IPR001099  Chalcone/stilbene_synt_N  
IPR011141  Polyketide_synthase_type-III  
IPR016039  Thiolase-like  
Gene Ontology GO:0016747  F:acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups  
GO:0009058  P:biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF02797  Chal_sti_synt_C  
PF00195  Chal_sti_synt_N  
CDD cd00831  CHS_like  
Amino Acid Sequences MSPSVVKPKSPPPYQRPNLYIHGIGAAYPPHSVKAEELSIIARRFHPSTPALEKVLYINEFTGIETRSTIATIDHPLANRPEAPNISELSKVFLDHGVRLSVEACRKAVADWGGDLSDLTHMVAVTCTNSANPGYDHHVVKQLGLNTSIEKVLLHGVGCSGGLAALRTAANIAQGASFRNRPARILVLACEITSLLVRSELESIAQLQETRIGVTLFSDCASAVVLGNGFGDDPMEEPILELLGWDHRIIDDTEDDLGFDVDPLGWKVILTPRVPKLASASVAPVFTDLVTSIPELTDADKVNATDFDWALHPGGATVITGVEQAMGLTPEHLRASYDIYMNHGNSSSATVFAVIDRLLRMGEGNQYITSCAFGPGIAIEMMMLKRLGSSRAGTESPGTASFGSESPAEINGEELLDVPAVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.81
3 0.76
4 0.72
5 0.69
6 0.63
7 0.55
8 0.44
9 0.39
10 0.3
11 0.26
12 0.22
13 0.17
14 0.14
15 0.14
16 0.14
17 0.14
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.19
22 0.2
23 0.19
24 0.19
25 0.2
26 0.24
27 0.25
28 0.25
29 0.22
30 0.25
31 0.27
32 0.28
33 0.31
34 0.28
35 0.34
36 0.38
37 0.4
38 0.37
39 0.35
40 0.35
41 0.31
42 0.33
43 0.27
44 0.21
45 0.17
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.17
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.09
58 0.11
59 0.14
60 0.16
61 0.17
62 0.17
63 0.2
64 0.23
65 0.24
66 0.24
67 0.23
68 0.26
69 0.25
70 0.26
71 0.25
72 0.24
73 0.24
74 0.23
75 0.22
76 0.2
77 0.19
78 0.17
79 0.16
80 0.18
81 0.18
82 0.17
83 0.18
84 0.15
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.16
89 0.19
90 0.19
91 0.18
92 0.17
93 0.18
94 0.18
95 0.21
96 0.19
97 0.15
98 0.14
99 0.15
100 0.14
101 0.13
102 0.13
103 0.09
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.16
122 0.2
123 0.21
124 0.21
125 0.27
126 0.26
127 0.26
128 0.27
129 0.24
130 0.21
131 0.21
132 0.21
133 0.15
134 0.16
135 0.15
136 0.12
137 0.09
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.05
161 0.06
162 0.08
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.18
167 0.18
168 0.18
169 0.2
170 0.21
171 0.2
172 0.2
173 0.19
174 0.17
175 0.16
176 0.15
177 0.13
178 0.11
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.03
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.05
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.07
255 0.11
256 0.16
257 0.17
258 0.21
259 0.24
260 0.28
261 0.28
262 0.27
263 0.27
264 0.25
265 0.25
266 0.2
267 0.2
268 0.17
269 0.17
270 0.17
271 0.13
272 0.1
273 0.09
274 0.08
275 0.06
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.1
285 0.1
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.06
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.07
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.15
323 0.17
324 0.19
325 0.17
326 0.21
327 0.25
328 0.24
329 0.25
330 0.2
331 0.17
332 0.16
333 0.19
334 0.15
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.11
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.14
350 0.15
351 0.16
352 0.17
353 0.17
354 0.18
355 0.17
356 0.17
357 0.12
358 0.11
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.1
364 0.08
365 0.07
366 0.06
367 0.09
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.08
372 0.1
373 0.12
374 0.14
375 0.14
376 0.17
377 0.19
378 0.24
379 0.25
380 0.25
381 0.25
382 0.25
383 0.24
384 0.23
385 0.21
386 0.16
387 0.16
388 0.17
389 0.15
390 0.15
391 0.13
392 0.13
393 0.12
394 0.14
395 0.14
396 0.12
397 0.13
398 0.11
399 0.11
400 0.1
401 0.1
402 0.09