Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

U1HRN8

Protein Details
Accession U1HRN8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-35ATSNRPPAKRRTAAHGRVRRNTPESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-28RPPAKRRTAAHGRV
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038609  HDA1_su2/3_sf  
IPR021006  Hda2/3  
Gene Ontology GO:0070823  C:HDA1 complex  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF11496  HDA2-3  
Amino Acid Sequences MAPTLERKGIATSNRPPAKRRTAAHGRVRRNTPESRDQEPAGYPDEEWPLKRILRERKKEYLVDKEDVGIAAIEEWEAEKRQRGNRLANSAGNHHNQHRRTLRSHIREVTALGTNRSSSPAIGEKVQHSPRISRHRYSRIRIIPSSSQSVEIPETQQEVLPNRNNIAVEISRPIDFYSQDYAVATNSQVERNLATQDTANSKDNTEGDSTLGSSIPPDSPIRSTAGRIAAPESLTQVLLSSPRTNPLSEHNSLASVRTHPIALSSGVEASPAGKELQSGRQGLLVVRSDPVSDTVRSLVAEHPTDHTNSSPPPSPLFYPNEGELDLQPIIDPNRVEEESGTEGELEFLPSFSSSVSKRYHLAVQPGTTRPHPNSARLRQSRLAKEDKPSTPKTLRKQVEHEDTSQAIGNRTDRSHSTSALPSSTKFAPNSSPTSSRRFHFQPSPLGASVTLLESPRATSRVKSTHKPTIVVPHPSQVPSISSSRTPISYVPTRRRSRLASSPRHSALSPNHSVLTRQPNFLPIQPNMANSHRESSPRVRRPPNAPSEMAPEIGLREKLRQIRATSRANQNARSKNQANTGDSRSPTTSRLETRSLRRPSPERKVEPMMAISMPTEDQPVPSLENVDGPAGDVEVEKADMESALNSSLSAPLPDLNAPSAEHTMPVPDHEAEKTVTNLDIPTMPLLQPCEFVVPLPIDGRIKHQYVAELAERYKDINDFLNSPKSPRLFNAMVQMIRQLNDTVVHTDLGLNGPATQVVSTTEEALWAEDASSKFAFLGHLFRILRRSNHHIVLVARSGTTQNLLNSYLKGKGVTYRQYSGLDTVGTLQEGAPDDQMMYSLLCTDKDSLKSIPRSASLIIAFDDSFEASMLPEWCATTRFVPVLLLLIVNSAEHVGRCIPQDIPQPERLRRLVKAVVHVQGELGEMPLQLDYRHAFNLDPGARLALVKKDLGAKIGHAAAHVADALRSKNFALEFALQSISELDLAGLEDQPPSTEDSKEASLSASRAGTPAGQKRLRDDRSSSAVQAKRQRLTPLRDMTHISDSVRHSQSHIDELKLALKKAQLEATEERKARLKAEDLASYTEARLKETRQSLSELQYRYETRTKQVHELKRSTQKLHVDLETSNQRLEKLQTDTIALKDQRIELQKELREARDALKSSVVPGIAELELAREQARTAASQVQQLRTSLNNLRRDFDFTGSQYQDASTKAADLAAQVSELESANTELKRRASDERRRLAELNYREDRKRDLARIDELEAELANRENVLKRVEEEVKALRKGRGVQTRGSSVQPRDVGMLAGGASPRPGAASGANGGSRAGSPALGVIGGVGGNYGPVGGRASVLRNER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.61
3 0.62
4 0.65
5 0.69
6 0.69
7 0.65
8 0.64
9 0.68
10 0.75
11 0.81
12 0.81
13 0.8
14 0.8
15 0.84
16 0.82
17 0.77
18 0.75
19 0.72
20 0.73
21 0.69
22 0.66
23 0.64
24 0.57
25 0.54
26 0.49
27 0.44
28 0.37
29 0.33
30 0.28
31 0.26
32 0.32
33 0.31
34 0.29
35 0.29
36 0.31
37 0.32
38 0.37
39 0.42
40 0.46
41 0.55
42 0.64
43 0.69
44 0.73
45 0.78
46 0.8
47 0.78
48 0.78
49 0.73
50 0.66
51 0.59
52 0.5
53 0.44
54 0.37
55 0.3
56 0.19
57 0.12
58 0.09
59 0.08
60 0.07
61 0.06
62 0.07
63 0.08
64 0.11
65 0.13
66 0.19
67 0.26
68 0.33
69 0.42
70 0.48
71 0.56
72 0.62
73 0.67
74 0.67
75 0.64
76 0.61
77 0.57
78 0.56
79 0.52
80 0.49
81 0.49
82 0.53
83 0.5
84 0.58
85 0.6
86 0.6
87 0.58
88 0.65
89 0.67
90 0.67
91 0.74
92 0.7
93 0.65
94 0.59
95 0.56
96 0.49
97 0.46
98 0.39
99 0.32
100 0.28
101 0.25
102 0.25
103 0.27
104 0.23
105 0.16
106 0.19
107 0.23
108 0.24
109 0.26
110 0.28
111 0.29
112 0.37
113 0.41
114 0.42
115 0.39
116 0.43
117 0.49
118 0.57
119 0.6
120 0.6
121 0.65
122 0.71
123 0.77
124 0.78
125 0.8
126 0.77
127 0.78
128 0.73
129 0.7
130 0.67
131 0.62
132 0.61
133 0.51
134 0.45
135 0.37
136 0.37
137 0.33
138 0.27
139 0.24
140 0.2
141 0.21
142 0.19
143 0.2
144 0.21
145 0.22
146 0.28
147 0.32
148 0.32
149 0.31
150 0.33
151 0.32
152 0.29
153 0.31
154 0.24
155 0.2
156 0.22
157 0.22
158 0.2
159 0.2
160 0.21
161 0.17
162 0.17
163 0.18
164 0.2
165 0.18
166 0.19
167 0.19
168 0.18
169 0.16
170 0.17
171 0.14
172 0.14
173 0.15
174 0.16
175 0.16
176 0.17
177 0.18
178 0.18
179 0.21
180 0.16
181 0.16
182 0.15
183 0.18
184 0.22
185 0.24
186 0.27
187 0.25
188 0.25
189 0.28
190 0.28
191 0.26
192 0.24
193 0.2
194 0.17
195 0.17
196 0.17
197 0.14
198 0.13
199 0.1
200 0.08
201 0.1
202 0.09
203 0.11
204 0.12
205 0.14
206 0.16
207 0.18
208 0.21
209 0.21
210 0.22
211 0.24
212 0.27
213 0.26
214 0.25
215 0.25
216 0.24
217 0.23
218 0.22
219 0.19
220 0.15
221 0.14
222 0.13
223 0.11
224 0.1
225 0.11
226 0.14
227 0.15
228 0.15
229 0.2
230 0.22
231 0.22
232 0.23
233 0.29
234 0.34
235 0.32
236 0.34
237 0.29
238 0.3
239 0.29
240 0.29
241 0.23
242 0.18
243 0.18
244 0.16
245 0.16
246 0.13
247 0.15
248 0.15
249 0.14
250 0.13
251 0.11
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.09
262 0.11
263 0.18
264 0.22
265 0.23
266 0.23
267 0.24
268 0.25
269 0.24
270 0.26
271 0.21
272 0.17
273 0.16
274 0.16
275 0.15
276 0.15
277 0.17
278 0.16
279 0.14
280 0.15
281 0.15
282 0.15
283 0.15
284 0.16
285 0.16
286 0.17
287 0.18
288 0.18
289 0.2
290 0.21
291 0.22
292 0.21
293 0.19
294 0.18
295 0.19
296 0.22
297 0.24
298 0.23
299 0.25
300 0.26
301 0.28
302 0.31
303 0.34
304 0.33
305 0.32
306 0.32
307 0.31
308 0.28
309 0.27
310 0.21
311 0.19
312 0.16
313 0.12
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.14
318 0.13
319 0.12
320 0.17
321 0.17
322 0.18
323 0.16
324 0.18
325 0.18
326 0.19
327 0.17
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.1
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.1
340 0.09
341 0.15
342 0.18
343 0.19
344 0.21
345 0.23
346 0.3
347 0.3
348 0.36
349 0.34
350 0.35
351 0.38
352 0.4
353 0.4
354 0.37
355 0.38
356 0.33
357 0.39
358 0.38
359 0.42
360 0.49
361 0.54
362 0.62
363 0.62
364 0.65
365 0.62
366 0.69
367 0.67
368 0.64
369 0.63
370 0.56
371 0.58
372 0.6
373 0.6
374 0.59
375 0.55
376 0.56
377 0.57
378 0.61
379 0.63
380 0.65
381 0.64
382 0.62
383 0.66
384 0.67
385 0.68
386 0.63
387 0.57
388 0.5
389 0.44
390 0.4
391 0.35
392 0.27
393 0.19
394 0.18
395 0.18
396 0.18
397 0.18
398 0.19
399 0.19
400 0.24
401 0.25
402 0.24
403 0.26
404 0.26
405 0.27
406 0.27
407 0.26
408 0.2
409 0.22
410 0.23
411 0.24
412 0.21
413 0.21
414 0.23
415 0.26
416 0.31
417 0.31
418 0.35
419 0.34
420 0.4
421 0.41
422 0.37
423 0.4
424 0.38
425 0.4
426 0.4
427 0.42
428 0.43
429 0.45
430 0.48
431 0.42
432 0.4
433 0.34
434 0.27
435 0.22
436 0.15
437 0.12
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.09
442 0.1
443 0.12
444 0.12
445 0.13
446 0.19
447 0.28
448 0.33
449 0.39
450 0.44
451 0.51
452 0.52
453 0.52
454 0.47
455 0.48
456 0.48
457 0.47
458 0.41
459 0.36
460 0.36
461 0.35
462 0.33
463 0.24
464 0.2
465 0.17
466 0.18
467 0.16
468 0.15
469 0.17
470 0.17
471 0.17
472 0.17
473 0.15
474 0.19
475 0.25
476 0.32
477 0.39
478 0.48
479 0.52
480 0.54
481 0.57
482 0.56
483 0.55
484 0.57
485 0.58
486 0.58
487 0.59
488 0.62
489 0.59
490 0.57
491 0.5
492 0.44
493 0.4
494 0.38
495 0.36
496 0.3
497 0.3
498 0.28
499 0.29
500 0.29
501 0.34
502 0.28
503 0.27
504 0.26
505 0.28
506 0.3
507 0.33
508 0.32
509 0.22
510 0.26
511 0.26
512 0.27
513 0.27
514 0.28
515 0.27
516 0.23
517 0.26
518 0.21
519 0.22
520 0.25
521 0.31
522 0.39
523 0.45
524 0.53
525 0.56
526 0.6
527 0.65
528 0.69
529 0.67
530 0.61
531 0.54
532 0.47
533 0.47
534 0.42
535 0.35
536 0.27
537 0.18
538 0.15
539 0.15
540 0.16
541 0.11
542 0.12
543 0.16
544 0.21
545 0.24
546 0.27
547 0.29
548 0.35
549 0.41
550 0.45
551 0.47
552 0.5
553 0.55
554 0.53
555 0.57
556 0.58
557 0.59
558 0.55
559 0.56
560 0.51
561 0.45
562 0.51
563 0.48
564 0.43
565 0.39
566 0.42
567 0.38
568 0.36
569 0.36
570 0.3
571 0.27
572 0.26
573 0.24
574 0.23
575 0.22
576 0.25
577 0.29
578 0.32
579 0.37
580 0.45
581 0.46
582 0.45
583 0.47
584 0.51
585 0.53
586 0.59
587 0.62
588 0.56
589 0.57
590 0.59
591 0.55
592 0.48
593 0.4
594 0.32
595 0.22
596 0.18
597 0.13
598 0.09
599 0.08
600 0.07
601 0.08
602 0.06
603 0.07
604 0.08
605 0.08
606 0.09
607 0.09
608 0.09
609 0.08
610 0.09
611 0.09
612 0.08
613 0.07
614 0.06
615 0.06
616 0.05
617 0.05
618 0.04
619 0.04
620 0.04
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.03
626 0.03
627 0.03
628 0.04
629 0.04
630 0.04
631 0.04
632 0.04
633 0.06
634 0.06
635 0.06
636 0.05
637 0.06
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.06
642 0.07
643 0.07
644 0.08
645 0.09
646 0.08
647 0.08
648 0.08
649 0.09
650 0.08
651 0.08
652 0.09
653 0.08
654 0.09
655 0.09
656 0.1
657 0.1
658 0.11
659 0.1
660 0.09
661 0.08
662 0.08
663 0.08
664 0.07
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.07
670 0.07
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.09
676 0.08
677 0.08
678 0.09
679 0.08
680 0.08
681 0.08
682 0.09
683 0.08
684 0.09
685 0.14
686 0.16
687 0.16
688 0.17
689 0.17
690 0.17
691 0.17
692 0.19
693 0.16
694 0.14
695 0.13
696 0.13
697 0.13
698 0.12
699 0.12
700 0.1
701 0.09
702 0.11
703 0.12
704 0.13
705 0.15
706 0.21
707 0.21
708 0.22
709 0.25
710 0.23
711 0.23
712 0.21
713 0.26
714 0.21
715 0.22
716 0.26
717 0.26
718 0.25
719 0.24
720 0.26
721 0.19
722 0.18
723 0.17
724 0.12
725 0.09
726 0.1
727 0.1
728 0.09
729 0.09
730 0.09
731 0.08
732 0.08
733 0.08
734 0.08
735 0.07
736 0.06
737 0.05
738 0.05
739 0.05
740 0.05
741 0.04
742 0.04
743 0.05
744 0.07
745 0.07
746 0.09
747 0.08
748 0.09
749 0.09
750 0.09
751 0.08
752 0.05
753 0.05
754 0.07
755 0.08
756 0.1
757 0.1
758 0.09
759 0.09
760 0.09
761 0.1
762 0.08
763 0.11
764 0.09
765 0.15
766 0.15
767 0.16
768 0.21
769 0.22
770 0.25
771 0.26
772 0.33
773 0.32
774 0.34
775 0.34
776 0.31
777 0.3
778 0.3
779 0.27
780 0.19
781 0.15
782 0.13
783 0.13
784 0.11
785 0.11
786 0.1
787 0.09
788 0.1
789 0.12
790 0.12
791 0.13
792 0.14
793 0.15
794 0.13
795 0.13
796 0.12
797 0.15
798 0.19
799 0.24
800 0.27
801 0.27
802 0.29
803 0.3
804 0.3
805 0.26
806 0.22
807 0.16
808 0.12
809 0.11
810 0.09
811 0.08
812 0.07
813 0.06
814 0.07
815 0.08
816 0.08
817 0.07
818 0.07
819 0.07
820 0.07
821 0.07
822 0.06
823 0.05
824 0.04
825 0.05
826 0.06
827 0.06
828 0.07
829 0.09
830 0.12
831 0.13
832 0.16
833 0.18
834 0.24
835 0.26
836 0.28
837 0.28
838 0.26
839 0.26
840 0.24
841 0.24
842 0.19
843 0.16
844 0.14
845 0.13
846 0.12
847 0.1
848 0.1
849 0.07
850 0.06
851 0.06
852 0.05
853 0.04
854 0.06
855 0.07
856 0.07
857 0.07
858 0.08
859 0.08
860 0.1
861 0.11
862 0.1
863 0.11
864 0.11
865 0.11
866 0.11
867 0.1
868 0.1
869 0.09
870 0.08
871 0.06
872 0.06
873 0.05
874 0.05
875 0.05
876 0.04
877 0.04
878 0.04
879 0.05
880 0.06
881 0.07
882 0.09
883 0.1
884 0.1
885 0.15
886 0.23
887 0.26
888 0.29
889 0.35
890 0.4
891 0.42
892 0.47
893 0.47
894 0.42
895 0.4
896 0.41
897 0.39
898 0.36
899 0.39
900 0.38
901 0.38
902 0.34
903 0.33
904 0.27
905 0.22
906 0.2
907 0.14
908 0.1
909 0.06
910 0.06
911 0.06
912 0.06
913 0.06
914 0.05
915 0.07
916 0.08
917 0.09
918 0.1
919 0.1
920 0.1
921 0.11
922 0.19
923 0.18
924 0.18
925 0.16
926 0.16
927 0.16
928 0.16
929 0.17
930 0.12
931 0.13
932 0.12
933 0.13
934 0.18
935 0.18
936 0.2
937 0.19
938 0.16
939 0.17
940 0.18
941 0.17
942 0.12
943 0.12
944 0.1
945 0.1
946 0.09
947 0.07
948 0.06
949 0.07
950 0.09
951 0.09
952 0.09
953 0.09
954 0.12
955 0.12
956 0.12
957 0.13
958 0.15
959 0.16
960 0.16
961 0.17
962 0.14
963 0.14
964 0.14
965 0.11
966 0.08
967 0.07
968 0.05
969 0.05
970 0.05
971 0.06
972 0.05
973 0.05
974 0.06
975 0.06
976 0.06
977 0.07
978 0.1
979 0.11
980 0.11
981 0.12
982 0.15
983 0.17
984 0.17
985 0.16
986 0.14
987 0.14
988 0.14
989 0.15
990 0.12
991 0.11
992 0.11
993 0.11
994 0.13
995 0.18
996 0.24
997 0.31
998 0.34
999 0.34
1000 0.41
1001 0.51
1002 0.53
1003 0.51
1004 0.49
1005 0.46
1006 0.49
1007 0.51
1008 0.46
1009 0.45
1010 0.44
1011 0.46
1012 0.5
1013 0.51
1014 0.48
1015 0.49
1016 0.55
1017 0.54
1018 0.57
1019 0.6
1020 0.59
1021 0.55
1022 0.54
1023 0.54
1024 0.5
1025 0.46
1026 0.41
1027 0.32
1028 0.29
1029 0.3
1030 0.35
1031 0.34
1032 0.3
1033 0.27
1034 0.3
1035 0.31
1036 0.34
1037 0.33
1038 0.26
1039 0.25
1040 0.26
1041 0.31
1042 0.29
1043 0.27
1044 0.21
1045 0.22
1046 0.23
1047 0.24
1048 0.27
1049 0.22
1050 0.25
1051 0.31
1052 0.35
1053 0.4
1054 0.38
1055 0.38
1056 0.4
1057 0.4
1058 0.37
1059 0.35
1060 0.32
1061 0.31
1062 0.35
1063 0.37
1064 0.33
1065 0.35
1066 0.34
1067 0.31
1068 0.28
1069 0.25
1070 0.21
1071 0.2
1072 0.21
1073 0.2
1074 0.26
1075 0.31
1076 0.34
1077 0.32
1078 0.37
1079 0.37
1080 0.42
1081 0.46
1082 0.39
1083 0.35
1084 0.37
1085 0.37
1086 0.37
1087 0.41
1088 0.36
1089 0.37
1090 0.44
1091 0.46
1092 0.5
1093 0.58
1094 0.62
1095 0.64
1096 0.68
1097 0.7
1098 0.72
1099 0.74
1100 0.68
1101 0.65
1102 0.63
1103 0.59
1104 0.57
1105 0.5
1106 0.42
1107 0.37
1108 0.41
1109 0.41
1110 0.35
1111 0.32
1112 0.28
1113 0.27
1114 0.27
1115 0.29
1116 0.28
1117 0.26
1118 0.27
1119 0.26
1120 0.29
1121 0.3
1122 0.29
1123 0.34
1124 0.29
1125 0.25
1126 0.24
1127 0.25
1128 0.28
1129 0.33
1130 0.35
1131 0.32
1132 0.39
1133 0.4
1134 0.45
1135 0.47
1136 0.43
1137 0.41
1138 0.39
1139 0.37
1140 0.38
1141 0.37
1142 0.32
1143 0.32
1144 0.3
1145 0.28
1146 0.29
1147 0.25
1148 0.17
1149 0.15
1150 0.16
1151 0.12
1152 0.12
1153 0.1
1154 0.1
1155 0.1
1156 0.11
1157 0.11
1158 0.09
1159 0.09
1160 0.11
1161 0.13
1162 0.11
1163 0.13
1164 0.2
1165 0.21
1166 0.28
1167 0.32
1168 0.34
1169 0.35
1170 0.34
1171 0.34
1172 0.29
1173 0.34
1174 0.35
1175 0.38
1176 0.43
1177 0.43
1178 0.45
1179 0.45
1180 0.5
1181 0.46
1182 0.42
1183 0.39
1184 0.33
1185 0.4
1186 0.38
1187 0.36
1188 0.3
1189 0.28
1190 0.26
1191 0.22
1192 0.21
1193 0.13
1194 0.12
1195 0.12
1196 0.12
1197 0.11
1198 0.1
1199 0.11
1200 0.09
1201 0.09
1202 0.08
1203 0.08
1204 0.09
1205 0.09
1206 0.08
1207 0.07
1208 0.09
1209 0.14
1210 0.15
1211 0.17
1212 0.2
1213 0.23
1214 0.26
1215 0.29
1216 0.37
1217 0.43
1218 0.53
1219 0.61
1220 0.67
1221 0.69
1222 0.71
1223 0.69
1224 0.65
1225 0.64
1226 0.6
1227 0.58
1228 0.57
1229 0.58
1230 0.57
1231 0.58
1232 0.57
1233 0.56
1234 0.57
1235 0.55
1236 0.53
1237 0.53
1238 0.57
1239 0.58
1240 0.54
1241 0.48
1242 0.41
1243 0.35
1244 0.27
1245 0.22
1246 0.16
1247 0.13
1248 0.11
1249 0.09
1250 0.11
1251 0.14
1252 0.17
1253 0.19
1254 0.19
1255 0.21
1256 0.28
1257 0.32
1258 0.32
1259 0.33
1260 0.39
1261 0.43
1262 0.47
1263 0.48
1264 0.44
1265 0.44
1266 0.49
1267 0.54
1268 0.55
1269 0.52
1270 0.53
1271 0.56
1272 0.6
1273 0.57
1274 0.56
1275 0.54
1276 0.48
1277 0.52
1278 0.47
1279 0.42
1280 0.37
1281 0.35
1282 0.3
1283 0.22
1284 0.2
1285 0.12
1286 0.12
1287 0.11
1288 0.09
1289 0.09
1290 0.09
1291 0.08
1292 0.08
1293 0.09
1294 0.09
1295 0.1
1296 0.13
1297 0.15
1298 0.18
1299 0.18
1300 0.17
1301 0.17
1302 0.16
1303 0.15
1304 0.14
1305 0.12
1306 0.09
1307 0.09
1308 0.09
1309 0.1
1310 0.09
1311 0.08
1312 0.06
1313 0.06
1314 0.05
1315 0.05
1316 0.04
1317 0.04
1318 0.04
1319 0.04
1320 0.04
1321 0.03
1322 0.04
1323 0.07
1324 0.07
1325 0.09
1326 0.11
1327 0.15