Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

U1GGC9

Protein Details
Accession U1GGC9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
415-434EDKFKRPDSKSKRKAGEPFSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
419-429KRPDSKSKRKA
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 8, cyto_mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MALPSAKSPSGHPWILPHFRESLRYPWSASCEGLPPRHIFYDAKFYPYHTSSTTAPVFALVGNREIVICRPSTIRGEGLVRIHVFRDLEPVPDDWSIHLSSILNSCAWNYVEQSVPLISVAGPSGLIKVLNALTGDLVTTLVGHGAEINDLATHPLYPWILASASGDHSIRIWDLRRKIELGENACLIICGHGHGHKEPVLTCAWHSSGTYLISGGQDHMVCIWTIPDLAPASLLFDVGEKPAKALRSSAETKVIHYPHFATSAVHSNYVDCVCFYGDLILSKAAEENKIVLWMVTGFDSRALTPSQECAPGAGTFQDTRSGFLPQSACSQESERTGPQEPLRASSIPLFHRLLEFQVPFSELFYMRFSLLMPTQTHPHLHPVLAIGNTKTKVFFWDLMGLEMGHDAGMTGPNDEDKFKRPDSKSKRKAGEPFSRRALEGYSASDVRSESPLASSSRRSSSVITTANASSPAMSSLQEPEVSTTGTSPALFDPPSVVPSMLPRMNKYRINDPFMPVPAHYSHTPNVNYHLSARQAAWSPCGRWCVIAGESGSKDAMAVIYDRWV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.52
3 0.5
4 0.45
5 0.43
6 0.43
7 0.48
8 0.44
9 0.43
10 0.4
11 0.4
12 0.41
13 0.39
14 0.44
15 0.4
16 0.37
17 0.32
18 0.33
19 0.37
20 0.38
21 0.39
22 0.36
23 0.37
24 0.38
25 0.39
26 0.33
27 0.31
28 0.37
29 0.34
30 0.35
31 0.31
32 0.32
33 0.36
34 0.36
35 0.36
36 0.27
37 0.29
38 0.27
39 0.34
40 0.33
41 0.26
42 0.24
43 0.21
44 0.2
45 0.18
46 0.2
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.15
54 0.14
55 0.13
56 0.13
57 0.15
58 0.18
59 0.21
60 0.23
61 0.23
62 0.24
63 0.26
64 0.28
65 0.28
66 0.29
67 0.27
68 0.25
69 0.24
70 0.24
71 0.22
72 0.18
73 0.23
74 0.19
75 0.2
76 0.21
77 0.21
78 0.21
79 0.21
80 0.21
81 0.16
82 0.18
83 0.16
84 0.15
85 0.15
86 0.13
87 0.13
88 0.15
89 0.16
90 0.13
91 0.12
92 0.12
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.15
98 0.16
99 0.16
100 0.17
101 0.14
102 0.13
103 0.12
104 0.1
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.05
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.06
124 0.06
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.08
151 0.1
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.1
158 0.12
159 0.15
160 0.2
161 0.26
162 0.29
163 0.32
164 0.32
165 0.33
166 0.36
167 0.38
168 0.35
169 0.32
170 0.28
171 0.26
172 0.24
173 0.23
174 0.17
175 0.11
176 0.07
177 0.06
178 0.07
179 0.09
180 0.12
181 0.12
182 0.15
183 0.16
184 0.18
185 0.17
186 0.18
187 0.16
188 0.15
189 0.14
190 0.15
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.12
197 0.11
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.09
227 0.07
228 0.08
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.17
235 0.2
236 0.21
237 0.26
238 0.25
239 0.27
240 0.32
241 0.32
242 0.26
243 0.24
244 0.25
245 0.18
246 0.2
247 0.18
248 0.12
249 0.13
250 0.2
251 0.19
252 0.18
253 0.17
254 0.15
255 0.17
256 0.16
257 0.15
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.09
297 0.11
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.09
304 0.14
305 0.12
306 0.14
307 0.14
308 0.15
309 0.14
310 0.17
311 0.18
312 0.13
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.17
317 0.19
318 0.17
319 0.19
320 0.21
321 0.18
322 0.2
323 0.21
324 0.23
325 0.22
326 0.26
327 0.24
328 0.23
329 0.25
330 0.22
331 0.22
332 0.22
333 0.25
334 0.2
335 0.24
336 0.23
337 0.2
338 0.21
339 0.2
340 0.19
341 0.19
342 0.18
343 0.14
344 0.14
345 0.15
346 0.14
347 0.14
348 0.14
349 0.09
350 0.11
351 0.12
352 0.12
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.12
358 0.14
359 0.15
360 0.15
361 0.18
362 0.2
363 0.21
364 0.19
365 0.24
366 0.22
367 0.2
368 0.19
369 0.18
370 0.19
371 0.18
372 0.19
373 0.14
374 0.17
375 0.18
376 0.18
377 0.17
378 0.15
379 0.16
380 0.18
381 0.19
382 0.17
383 0.22
384 0.22
385 0.22
386 0.22
387 0.19
388 0.15
389 0.14
390 0.11
391 0.05
392 0.04
393 0.03
394 0.03
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.07
399 0.09
400 0.1
401 0.12
402 0.14
403 0.17
404 0.23
405 0.26
406 0.35
407 0.38
408 0.48
409 0.57
410 0.66
411 0.71
412 0.75
413 0.78
414 0.76
415 0.81
416 0.8
417 0.8
418 0.75
419 0.71
420 0.68
421 0.63
422 0.56
423 0.48
424 0.4
425 0.33
426 0.28
427 0.25
428 0.22
429 0.2
430 0.2
431 0.2
432 0.18
433 0.16
434 0.17
435 0.15
436 0.11
437 0.12
438 0.15
439 0.17
440 0.19
441 0.22
442 0.24
443 0.27
444 0.29
445 0.3
446 0.29
447 0.3
448 0.35
449 0.34
450 0.3
451 0.3
452 0.28
453 0.27
454 0.26
455 0.21
456 0.14
457 0.12
458 0.12
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.13
463 0.14
464 0.15
465 0.15
466 0.16
467 0.17
468 0.17
469 0.16
470 0.13
471 0.13
472 0.13
473 0.13
474 0.11
475 0.11
476 0.14
477 0.14
478 0.13
479 0.15
480 0.15
481 0.17
482 0.17
483 0.15
484 0.13
485 0.17
486 0.24
487 0.25
488 0.26
489 0.29
490 0.35
491 0.42
492 0.47
493 0.48
494 0.51
495 0.55
496 0.6
497 0.59
498 0.56
499 0.55
500 0.52
501 0.5
502 0.4
503 0.36
504 0.31
505 0.32
506 0.3
507 0.28
508 0.28
509 0.34
510 0.36
511 0.34
512 0.37
513 0.36
514 0.35
515 0.34
516 0.36
517 0.32
518 0.32
519 0.3
520 0.29
521 0.32
522 0.32
523 0.35
524 0.35
525 0.34
526 0.35
527 0.39
528 0.35
529 0.3
530 0.3
531 0.29
532 0.25
533 0.27
534 0.24
535 0.26
536 0.26
537 0.27
538 0.25
539 0.2
540 0.19
541 0.15
542 0.14
543 0.09
544 0.09