Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GCV6

Protein Details
Accession U1GCV6    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-80NDASRQTNAPAKRKRPKKYIREEQRRRVSKHFTNHydrophilic
135-154AKLKRPTKSPYFPNKPRPNFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-73PAKRKRPKKYIREEQRRR
249-259RAPVKGKRWRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR045138  MeCP2/MBD4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
Amino Acid Sequences MTPFDFRQQFQPWITTPPASRIYSNDDSLPIISTDELGMIADDELDNDASRQTNAPAKRKRPKKYIREEQRRRVSKHFTNEESTVATPPATPRKPLIISGLKVDELSSDSSLTDVPSDIGPDPFDSDIEVHLKPAKLKRPTKSPYFPNKPRPNFLSCLPFPPLSAEKFGLMQERLAHDPFRLLIATIFLNRTRGEQAMPVFFQLMQQYPTAADLAAAEFEDVVAIIHRLGFQNQRAQKCIEMASTWSKRAPVKGKRWRKLHYPMKGDGKDIQTEEVLEDEDSRVAWEISYLPGLGPYSHDSWRIFCRDKLRGLAESWNGEGATDGFEPEWKRVLPTDKELRAYLTWMWLKEGWIWNKETGQRTKADEELLERARGGGIVQEQNEKKHLVLTSNSQLDGSRHGALERPAGTFLPG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.41
3 0.37
4 0.37
5 0.41
6 0.38
7 0.38
8 0.36
9 0.41
10 0.42
11 0.42
12 0.37
13 0.32
14 0.31
15 0.3
16 0.27
17 0.19
18 0.15
19 0.13
20 0.11
21 0.1
22 0.09
23 0.08
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.05
30 0.06
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.09
36 0.09
37 0.11
38 0.12
39 0.14
40 0.21
41 0.29
42 0.38
43 0.47
44 0.56
45 0.66
46 0.74
47 0.81
48 0.85
49 0.88
50 0.89
51 0.9
52 0.91
53 0.92
54 0.94
55 0.94
56 0.94
57 0.94
58 0.92
59 0.86
60 0.84
61 0.82
62 0.78
63 0.78
64 0.76
65 0.69
66 0.66
67 0.62
68 0.55
69 0.48
70 0.41
71 0.32
72 0.24
73 0.19
74 0.15
75 0.18
76 0.27
77 0.25
78 0.26
79 0.27
80 0.34
81 0.35
82 0.36
83 0.39
84 0.36
85 0.36
86 0.38
87 0.37
88 0.3
89 0.29
90 0.27
91 0.19
92 0.14
93 0.15
94 0.11
95 0.1
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.13
116 0.12
117 0.12
118 0.15
119 0.16
120 0.2
121 0.26
122 0.32
123 0.39
124 0.46
125 0.51
126 0.58
127 0.63
128 0.68
129 0.69
130 0.71
131 0.72
132 0.75
133 0.78
134 0.79
135 0.84
136 0.8
137 0.78
138 0.73
139 0.66
140 0.59
141 0.53
142 0.5
143 0.41
144 0.4
145 0.37
146 0.32
147 0.28
148 0.29
149 0.28
150 0.21
151 0.23
152 0.19
153 0.16
154 0.17
155 0.18
156 0.17
157 0.14
158 0.14
159 0.13
160 0.15
161 0.17
162 0.17
163 0.16
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.11
168 0.09
169 0.07
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.15
185 0.15
186 0.13
187 0.12
188 0.11
189 0.12
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.08
198 0.06
199 0.06
200 0.04
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.04
215 0.05
216 0.07
217 0.1
218 0.12
219 0.2
220 0.26
221 0.27
222 0.29
223 0.3
224 0.28
225 0.27
226 0.26
227 0.19
228 0.15
229 0.16
230 0.22
231 0.23
232 0.23
233 0.22
234 0.24
235 0.25
236 0.31
237 0.38
238 0.39
239 0.48
240 0.57
241 0.67
242 0.73
243 0.79
244 0.77
245 0.77
246 0.78
247 0.77
248 0.75
249 0.7
250 0.68
251 0.7
252 0.67
253 0.59
254 0.54
255 0.47
256 0.41
257 0.35
258 0.29
259 0.2
260 0.19
261 0.17
262 0.12
263 0.1
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.07
278 0.06
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.12
284 0.14
285 0.16
286 0.19
287 0.19
288 0.22
289 0.27
290 0.32
291 0.32
292 0.32
293 0.39
294 0.41
295 0.45
296 0.47
297 0.46
298 0.41
299 0.4
300 0.43
301 0.38
302 0.34
303 0.3
304 0.26
305 0.22
306 0.19
307 0.17
308 0.11
309 0.11
310 0.09
311 0.09
312 0.08
313 0.12
314 0.13
315 0.14
316 0.17
317 0.15
318 0.16
319 0.2
320 0.28
321 0.3
322 0.37
323 0.45
324 0.46
325 0.48
326 0.47
327 0.47
328 0.39
329 0.37
330 0.3
331 0.28
332 0.28
333 0.25
334 0.28
335 0.25
336 0.26
337 0.29
338 0.36
339 0.33
340 0.34
341 0.36
342 0.36
343 0.4
344 0.46
345 0.47
346 0.46
347 0.45
348 0.45
349 0.48
350 0.49
351 0.46
352 0.42
353 0.36
354 0.33
355 0.37
356 0.35
357 0.31
358 0.27
359 0.25
360 0.22
361 0.21
362 0.17
363 0.13
364 0.16
365 0.2
366 0.22
367 0.3
368 0.32
369 0.35
370 0.38
371 0.35
372 0.3
373 0.3
374 0.31
375 0.26
376 0.28
377 0.33
378 0.39
379 0.41
380 0.41
381 0.36
382 0.35
383 0.32
384 0.33
385 0.3
386 0.23
387 0.21
388 0.21
389 0.25
390 0.26
391 0.31
392 0.28
393 0.26
394 0.25