FuNGI

U1HME3

Protein Details

Accession

U1HME3

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
9-28	STHRFRVKAGINRKNPEQRA	Hydrophilic
274-295	LPSQSPTKRRRKSSTKGLKPEF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
281-286	KRRRKS

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSDLPSNASTHRFRVKAGINRKNPEQRAAAIQAEALRLANQIQPQASPAQQDAARRTASTQRDARVKTQNTASVFGSGAGATSSKSKNAHAVSGTEELIQGAEGGESVSLERERLGKARAVASNEEKPISANQKKSGRQAKTTAKKEDAIYFSDGDVEGQEGKPVDIEDIDRISISSDGDEEVDDDIVLSRRRRVNKTPKPTLGLRPVRAVRDTHVRDDTENEAYTKVRRKAKGIDPQKADKDHGDTMDVDEEDENIAVTAEQTTPPLADKSNLPSQSPTKRRRKSSTKGLKPEFETIEERAERARYASDLRRLKNELAPGTHEHHQGDEKSHEAAPLSDPREGGLYLFQFPPLTPMLINPSQPPKQPEIKSEPTTTFTEPNAPASASAPAPAEPQVKKEDGADTKTPLTTTSATEPERPPLLTACNPSSLPAGLAGKLHVHQSGKVTLEWGHGGHTNEATNLEVKWGAEVDFLQDVVLLASSSSPSSAAGGGGGGGDGGDQSVSGGFDGGKKAWALSQVRNKFVVVPDWGRIYE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.5
3	0.53
4	0.61
5	0.65
6	0.66
7	0.72
8	0.8
9	0.81
10	0.76
11	0.72
12	0.65
13	0.58
14	0.56
15	0.55
16	0.47
17	0.37
18	0.35
19	0.31
20	0.27
21	0.24
22	0.17
23	0.13
24	0.12
25	0.13
26	0.15
27	0.15
28	0.18
29	0.19
30	0.18
31	0.2
32	0.23
33	0.23
34	0.22
35	0.21
36	0.23
37	0.24
38	0.29
39	0.31
40	0.33
41	0.32
42	0.3
43	0.33
44	0.35
45	0.39
46	0.42
47	0.43
48	0.44
49	0.52
50	0.55
51	0.58
52	0.6
53	0.58
54	0.55
55	0.56
56	0.55
57	0.49
58	0.49
59	0.43
60	0.34
61	0.31
62	0.25
63	0.2
64	0.14
65	0.11
66	0.09
67	0.08
68	0.07
69	0.12
70	0.13
71	0.16
72	0.18
73	0.2
74	0.27
75	0.29
76	0.32
77	0.29
78	0.29
79	0.29
80	0.3
81	0.29
82	0.22
83	0.2
84	0.15
85	0.14
86	0.12
87	0.08
88	0.05
89	0.04
90	0.04
91	0.04
92	0.04
93	0.04
94	0.04
95	0.06
96	0.06
97	0.07
98	0.08
99	0.1
100	0.12
101	0.15
102	0.17
103	0.18
104	0.21
105	0.27
106	0.29
107	0.3
108	0.33
109	0.36
110	0.39
111	0.38
112	0.36
113	0.3
114	0.28
115	0.3
116	0.35
117	0.35
118	0.34
119	0.41
120	0.48
121	0.53
122	0.61
123	0.65
124	0.6
125	0.59
126	0.64
127	0.67
128	0.68
129	0.72
130	0.69
131	0.63
132	0.61
133	0.58
134	0.56
135	0.47
136	0.4
137	0.35
138	0.29
139	0.25
140	0.23
141	0.21
142	0.14
143	0.12
144	0.09
145	0.08
146	0.07
147	0.09
148	0.08
149	0.08
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.07
154	0.08
155	0.09
156	0.09
157	0.09
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.08
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.06
171	0.05
172	0.05
173	0.06
174	0.08
175	0.11
176	0.11
177	0.17
178	0.22
179	0.29
180	0.35
181	0.45
182	0.54
183	0.61
184	0.71
185	0.75
186	0.73
187	0.72
188	0.7
189	0.66
190	0.65
191	0.62
192	0.54
193	0.51
194	0.5
195	0.47
196	0.45
197	0.38
198	0.31
199	0.34
200	0.35
201	0.32
202	0.32
203	0.31
204	0.29
205	0.31
206	0.31
207	0.24
208	0.22
209	0.18
210	0.16
211	0.16
212	0.19
213	0.24
214	0.28
215	0.32
216	0.34
217	0.37
218	0.44
219	0.53
220	0.59
221	0.6
222	0.61
223	0.59
224	0.63
225	0.63
226	0.57
227	0.49
228	0.41
229	0.36
230	0.29
231	0.25
232	0.21
233	0.17
234	0.16
235	0.16
236	0.14
237	0.11
238	0.09
239	0.08
240	0.07
241	0.07
242	0.06
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.06
254	0.07
255	0.06
256	0.07
257	0.08
258	0.13
259	0.19
260	0.2
261	0.19
262	0.21
263	0.26
264	0.35
265	0.43
266	0.48
267	0.53
268	0.59
269	0.66
270	0.73
271	0.78
272	0.77
273	0.79
274	0.8
275	0.79
276	0.81
277	0.78
278	0.73
279	0.66
280	0.62
281	0.52
282	0.44
283	0.37
284	0.28
285	0.29
286	0.25
287	0.22
288	0.19
289	0.18
290	0.15
291	0.13
292	0.13
293	0.09
294	0.14
295	0.18
296	0.26
297	0.32
298	0.33
299	0.37
300	0.39
301	0.4
302	0.38
303	0.38
304	0.32
305	0.27
306	0.28
307	0.27
308	0.28
309	0.3
310	0.29
311	0.24
312	0.23
313	0.25
314	0.23
315	0.23
316	0.2
317	0.18
318	0.18
319	0.18
320	0.17
321	0.14
322	0.14
323	0.14
324	0.18
325	0.19
326	0.18
327	0.18
328	0.18
329	0.19
330	0.18
331	0.15
332	0.12
333	0.11
334	0.12
335	0.12
336	0.12
337	0.11
338	0.11
339	0.13
340	0.11
341	0.11
342	0.09
343	0.09
344	0.15
345	0.17
346	0.18
347	0.19
348	0.25
349	0.27
350	0.3
351	0.33
352	0.33
353	0.4
354	0.41
355	0.45
356	0.47
357	0.52
358	0.53
359	0.53
360	0.49
361	0.44
362	0.45
363	0.4
364	0.34
365	0.27
366	0.29
367	0.26
368	0.27
369	0.24
370	0.21
371	0.19
372	0.17
373	0.19
374	0.12
375	0.13
376	0.11
377	0.1
378	0.12
379	0.15
380	0.19
381	0.17
382	0.21
383	0.24
384	0.24
385	0.24
386	0.25
387	0.29
388	0.27
389	0.32
390	0.32
391	0.3
392	0.31
393	0.31
394	0.29
395	0.23
396	0.22
397	0.18
398	0.18
399	0.2
400	0.24
401	0.25
402	0.31
403	0.31
404	0.32
405	0.33
406	0.3
407	0.27
408	0.23
409	0.27
410	0.26
411	0.3
412	0.28
413	0.28
414	0.28
415	0.28
416	0.28
417	0.22
418	0.18
419	0.17
420	0.16
421	0.14
422	0.14
423	0.14
424	0.14
425	0.15
426	0.16
427	0.16
428	0.16
429	0.17
430	0.21
431	0.24
432	0.24
433	0.23
434	0.23
435	0.21
436	0.22
437	0.22
438	0.18
439	0.16
440	0.18
441	0.2
442	0.2
443	0.2
444	0.18
445	0.18
446	0.18
447	0.17
448	0.15
449	0.13
450	0.12
451	0.12
452	0.11
453	0.11
454	0.11
455	0.11
456	0.1
457	0.11
458	0.12
459	0.11
460	0.11
461	0.1
462	0.09
463	0.09
464	0.08
465	0.08
466	0.05
467	0.04
468	0.05
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.08
475	0.08
476	0.08
477	0.07
478	0.07
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.04
483	0.03
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.03
488	0.03
489	0.03
490	0.04
491	0.05
492	0.05
493	0.06
494	0.06
495	0.09
496	0.12
497	0.13
498	0.14
499	0.14
500	0.15
501	0.16
502	0.24
503	0.26
504	0.33
505	0.43
506	0.48
507	0.52
508	0.52
509	0.51
510	0.47
511	0.45
512	0.42
513	0.38
514	0.35
515	0.35

U1HME3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer