Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GIM8

Protein Details
Accession U1GIM8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
395-426EDSSADEKPKSKRKKRKRGKGKDKSGGQQTMABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
402-418KPKSKRKKRKRGKGKDK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 14.333, cyto 10, cyto_mito 6.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Amino Acid Sequences MFDTICSLPLTSDLFAQAINPSEPIVAVGLASGHVQSFKLPPAPTSAESSPRPDEAPVQPFGRRRSSTASENGLGEVETAWRTRRHKGSCRCLAYSLDGEILYSAGTDELVKAARSEDGRVIGKFAIPEVDGKPDAPTSLHILTPQTLLLGTDSSALYLYDLRDSKPVTAALKPTQTHRPHDDYISSITPLPPSSTSTSGLPKQFLTAGGTTIAVTDLRKGVVSRSEDQEDELTSSLFVSGLKAGGTSQGEKVLVGGAGGVITLWEKGVWDDQDERIVVDKLGESVDCLAKVPEGVGGLALQGQQKLVAVGLADGRVRFVRVGPNRVVQDMDVKHDDIEGVVALGFDVAGRMVSGGGQVVKVWREAPELKKSVSLNGGKRVVGSDSEEDSDGGEEDSSADEKPKSKRKKRKRGKGKDKSGGQQTMAFDLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.14
4 0.13
5 0.14
6 0.14
7 0.13
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.11
13 0.08
14 0.07
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.07
19 0.06
20 0.06
21 0.07
22 0.07
23 0.09
24 0.12
25 0.15
26 0.2
27 0.21
28 0.21
29 0.27
30 0.32
31 0.32
32 0.36
33 0.36
34 0.37
35 0.39
36 0.44
37 0.4
38 0.37
39 0.36
40 0.31
41 0.34
42 0.34
43 0.36
44 0.35
45 0.34
46 0.38
47 0.42
48 0.46
49 0.49
50 0.44
51 0.43
52 0.47
53 0.5
54 0.51
55 0.52
56 0.52
57 0.45
58 0.44
59 0.4
60 0.32
61 0.26
62 0.2
63 0.14
64 0.1
65 0.09
66 0.1
67 0.12
68 0.18
69 0.22
70 0.3
71 0.39
72 0.47
73 0.56
74 0.65
75 0.73
76 0.77
77 0.8
78 0.74
79 0.67
80 0.6
81 0.54
82 0.45
83 0.36
84 0.27
85 0.2
86 0.18
87 0.15
88 0.13
89 0.08
90 0.06
91 0.05
92 0.03
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.08
101 0.11
102 0.12
103 0.14
104 0.14
105 0.18
106 0.21
107 0.21
108 0.22
109 0.19
110 0.19
111 0.17
112 0.15
113 0.12
114 0.1
115 0.12
116 0.11
117 0.15
118 0.14
119 0.14
120 0.15
121 0.14
122 0.14
123 0.12
124 0.13
125 0.13
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.15
130 0.15
131 0.16
132 0.14
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.1
148 0.11
149 0.12
150 0.15
151 0.15
152 0.16
153 0.16
154 0.18
155 0.16
156 0.18
157 0.21
158 0.21
159 0.26
160 0.26
161 0.28
162 0.35
163 0.37
164 0.4
165 0.42
166 0.44
167 0.41
168 0.42
169 0.39
170 0.31
171 0.31
172 0.27
173 0.22
174 0.16
175 0.15
176 0.14
177 0.13
178 0.13
179 0.1
180 0.12
181 0.14
182 0.15
183 0.16
184 0.17
185 0.2
186 0.23
187 0.24
188 0.22
189 0.19
190 0.18
191 0.17
192 0.16
193 0.15
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.12
210 0.16
211 0.17
212 0.2
213 0.22
214 0.21
215 0.22
216 0.22
217 0.17
218 0.14
219 0.12
220 0.09
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.04
232 0.07
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.02
249 0.02
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.07
256 0.07
257 0.09
258 0.11
259 0.12
260 0.15
261 0.15
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.12
266 0.1
267 0.1
268 0.08
269 0.09
270 0.08
271 0.06
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.05
296 0.04
297 0.05
298 0.06
299 0.07
300 0.08
301 0.07
302 0.09
303 0.09
304 0.1
305 0.09
306 0.1
307 0.19
308 0.24
309 0.3
310 0.32
311 0.38
312 0.38
313 0.39
314 0.38
315 0.29
316 0.31
317 0.26
318 0.28
319 0.25
320 0.24
321 0.23
322 0.22
323 0.22
324 0.13
325 0.13
326 0.08
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.1
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.18
352 0.24
353 0.3
354 0.37
355 0.39
356 0.39
357 0.44
358 0.43
359 0.42
360 0.44
361 0.45
362 0.41
363 0.46
364 0.48
365 0.43
366 0.43
367 0.4
368 0.33
369 0.28
370 0.27
371 0.22
372 0.22
373 0.23
374 0.23
375 0.21
376 0.2
377 0.19
378 0.15
379 0.12
380 0.09
381 0.07
382 0.07
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.12
387 0.14
388 0.2
389 0.29
390 0.39
391 0.49
392 0.59
393 0.7
394 0.79
395 0.87
396 0.93
397 0.95
398 0.96
399 0.97
400 0.97
401 0.97
402 0.97
403 0.96
404 0.93
405 0.91
406 0.89
407 0.83
408 0.74
409 0.68
410 0.58