Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1I140

Protein Details
Accession U1I140    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
141-163KKEEEARRKKSDRTRSRKAGELWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-158EARRKKSDRTRSRK
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 9.5, cyto 8.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034104  Lsm1  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR044642  PTHR15588  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0000932  C:P-body  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
CDD cd01728  LSm1  
Amino Acid Sequences MENLTISDPPRGGTPHSGGQLGAAAGAPAGPPQLPPQMFTTAAQLLDLTDKKLMLVLRDGRKLIGVLRTWDQFANLVLTSTTERYFVSSSNDRRLFADIPRGTYLVRGENVLLIGEIDLDKDDDLPPGYTEAHIEDVFALKKEEEARRKKSDRTRSRKAGELWGGEMEGSGEILF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.32
4 0.31
5 0.28
6 0.27
7 0.25
8 0.19
9 0.14
10 0.08
11 0.06
12 0.05
13 0.06
14 0.05
15 0.04
16 0.05
17 0.04
18 0.05
19 0.09
20 0.16
21 0.16
22 0.18
23 0.22
24 0.24
25 0.25
26 0.25
27 0.26
28 0.2
29 0.2
30 0.18
31 0.14
32 0.11
33 0.15
34 0.15
35 0.12
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.14
40 0.14
41 0.1
42 0.16
43 0.22
44 0.26
45 0.29
46 0.3
47 0.27
48 0.27
49 0.26
50 0.23
51 0.2
52 0.16
53 0.16
54 0.18
55 0.19
56 0.19
57 0.19
58 0.17
59 0.13
60 0.12
61 0.11
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.09
69 0.07
70 0.07
71 0.09
72 0.1
73 0.09
74 0.14
75 0.19
76 0.21
77 0.29
78 0.31
79 0.3
80 0.3
81 0.33
82 0.29
83 0.24
84 0.31
85 0.23
86 0.24
87 0.25
88 0.24
89 0.21
90 0.21
91 0.21
92 0.14
93 0.14
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.09
99 0.08
100 0.05
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.1
123 0.12
124 0.13
125 0.13
126 0.13
127 0.09
128 0.12
129 0.19
130 0.27
131 0.34
132 0.43
133 0.5
134 0.59
135 0.64
136 0.71
137 0.75
138 0.77
139 0.79
140 0.79
141 0.82
142 0.82
143 0.82
144 0.81
145 0.75
146 0.74
147 0.69
148 0.62
149 0.54
150 0.45
151 0.4
152 0.31
153 0.27
154 0.18
155 0.11