Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HHM1

Protein Details
Accession U1HHM1    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-145EEDLAPTATRQKRKKKRNGASTARPKLPSHydrophilic
162-185LSPAAHPKQQRRTKQPRSNVKASIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
126-139RQKRKKKRNGASTA
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018306  Phage_T5_Orf172_DNA-bd  
Pfam View protein in Pfam  
PF10544  T5orf172  
Amino Acid Sequences MAFAAHTPEALLPRSDSKNPATTCKGITANGRPCRRSLGSSPASSPGPSPLKGRGVLAVLREEQDDGNAAAAFYCWQHKDQAEKMANSEQNHTELFPLQERTSIDTLVDRVGVMNLEEDLAPTATRQKRKKKRNGASTARPKLPSDWQHMQGPLMSVPSDMLSPAAHPKQQRRTKQPRSNVKASILCCVRDVGDDEQSSSSHHSQDASNVPPNRVVEITQNNMVPAVQPARLSAQTPSPMSQRPNPSTPDRRSALSPGLRTPTTPTRPSMLTTPQSTGSQTQGLLSLLPPHLSPQTTSILLNELSKPISAADAEGYIYMFWLTPESDSSKPDDDAASDLLEAPTASQPQSRRKSDVLQRYASQRRGPTQPKTVLLKIGRAENVHRRLSQWSKQCSYNITLIRYYPYKPSRSPPQSDRSVLPRKVPHVHRVERLIHVELSEKRVTEQGACENCGREHREWFEVEASREGLRAVDEVIRRWVGWAEGLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.33
3 0.35
4 0.38
5 0.45
6 0.46
7 0.5
8 0.5
9 0.48
10 0.47
11 0.48
12 0.45
13 0.4
14 0.45
15 0.47
16 0.51
17 0.56
18 0.61
19 0.57
20 0.56
21 0.61
22 0.57
23 0.53
24 0.49
25 0.5
26 0.5
27 0.51
28 0.52
29 0.48
30 0.46
31 0.4
32 0.35
33 0.33
34 0.31
35 0.29
36 0.3
37 0.32
38 0.36
39 0.36
40 0.36
41 0.31
42 0.29
43 0.3
44 0.29
45 0.27
46 0.23
47 0.23
48 0.23
49 0.21
50 0.18
51 0.16
52 0.15
53 0.11
54 0.11
55 0.1
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.12
62 0.13
63 0.14
64 0.19
65 0.22
66 0.29
67 0.33
68 0.42
69 0.43
70 0.42
71 0.45
72 0.48
73 0.5
74 0.45
75 0.45
76 0.36
77 0.32
78 0.32
79 0.29
80 0.22
81 0.2
82 0.21
83 0.2
84 0.22
85 0.19
86 0.22
87 0.23
88 0.26
89 0.26
90 0.23
91 0.2
92 0.18
93 0.19
94 0.16
95 0.15
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.16
111 0.21
112 0.3
113 0.39
114 0.49
115 0.6
116 0.71
117 0.82
118 0.84
119 0.88
120 0.91
121 0.92
122 0.91
123 0.91
124 0.91
125 0.88
126 0.82
127 0.73
128 0.64
129 0.57
130 0.56
131 0.51
132 0.49
133 0.47
134 0.45
135 0.47
136 0.46
137 0.43
138 0.35
139 0.3
140 0.21
141 0.16
142 0.13
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.06
151 0.12
152 0.14
153 0.17
154 0.21
155 0.29
156 0.39
157 0.48
158 0.56
159 0.61
160 0.71
161 0.79
162 0.84
163 0.86
164 0.86
165 0.86
166 0.84
167 0.76
168 0.71
169 0.65
170 0.56
171 0.53
172 0.44
173 0.36
174 0.29
175 0.26
176 0.21
177 0.16
178 0.19
179 0.14
180 0.17
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.18
187 0.17
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.13
192 0.17
193 0.2
194 0.2
195 0.24
196 0.25
197 0.25
198 0.26
199 0.26
200 0.23
201 0.2
202 0.18
203 0.17
204 0.19
205 0.21
206 0.21
207 0.2
208 0.19
209 0.18
210 0.17
211 0.12
212 0.1
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.13
222 0.15
223 0.15
224 0.16
225 0.17
226 0.19
227 0.21
228 0.26
229 0.3
230 0.31
231 0.34
232 0.36
233 0.41
234 0.47
235 0.48
236 0.48
237 0.42
238 0.4
239 0.38
240 0.37
241 0.37
242 0.32
243 0.3
244 0.25
245 0.27
246 0.26
247 0.25
248 0.27
249 0.28
250 0.29
251 0.3
252 0.29
253 0.29
254 0.29
255 0.3
256 0.29
257 0.27
258 0.25
259 0.25
260 0.25
261 0.24
262 0.24
263 0.23
264 0.21
265 0.17
266 0.15
267 0.13
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.1
272 0.08
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.11
279 0.11
280 0.12
281 0.11
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.13
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.08
312 0.12
313 0.13
314 0.14
315 0.18
316 0.19
317 0.19
318 0.19
319 0.18
320 0.14
321 0.15
322 0.15
323 0.12
324 0.09
325 0.1
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.12
334 0.17
335 0.27
336 0.36
337 0.39
338 0.42
339 0.44
340 0.53
341 0.58
342 0.64
343 0.6
344 0.56
345 0.55
346 0.59
347 0.63
348 0.59
349 0.55
350 0.49
351 0.48
352 0.53
353 0.57
354 0.55
355 0.57
356 0.58
357 0.59
358 0.6
359 0.57
360 0.55
361 0.5
362 0.48
363 0.41
364 0.4
365 0.37
366 0.33
367 0.37
368 0.38
369 0.44
370 0.43
371 0.41
372 0.38
373 0.44
374 0.5
375 0.52
376 0.52
377 0.53
378 0.53
379 0.56
380 0.57
381 0.53
382 0.48
383 0.48
384 0.44
385 0.39
386 0.37
387 0.34
388 0.36
389 0.34
390 0.32
391 0.34
392 0.37
393 0.39
394 0.42
395 0.48
396 0.55
397 0.61
398 0.67
399 0.65
400 0.67
401 0.68
402 0.68
403 0.65
404 0.63
405 0.65
406 0.6
407 0.59
408 0.57
409 0.56
410 0.61
411 0.63
412 0.63
413 0.63
414 0.67
415 0.65
416 0.66
417 0.64
418 0.6
419 0.59
420 0.53
421 0.43
422 0.37
423 0.37
424 0.33
425 0.35
426 0.31
427 0.27
428 0.25
429 0.28
430 0.28
431 0.25
432 0.27
433 0.3
434 0.32
435 0.34
436 0.35
437 0.35
438 0.36
439 0.4
440 0.41
441 0.35
442 0.39
443 0.41
444 0.43
445 0.42
446 0.43
447 0.43
448 0.41
449 0.4
450 0.36
451 0.33
452 0.29
453 0.27
454 0.24
455 0.18
456 0.15
457 0.13
458 0.12
459 0.16
460 0.18
461 0.2
462 0.25
463 0.26
464 0.25
465 0.25
466 0.25
467 0.2