Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B2ABE0

Protein Details
Accession B2ABE0    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
379-398APIVRKRKPVDIFMRPSKRVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
172-175RPKK
382-388VRKRKPV
392-400MRPSKRVPR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG pan:PODANSg09969  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MELQISTGPFRRNGPRPLLDMALDVAIRNIQDIPSLGDMPTHLLQPVLRAVKTAEHLHTLEQETDERIYEVSPSHWKHLIERDFKTLAAQYSWQPKDPKSWYKVYKKYETVYNQQLEEATNAFMKKMEDANGQRSSRQAKIISVPESRRLPLHYSQRQREGPKAGHWSSQPRPKKTFIAKAKRQVAAETSRLKLSNPAGRIPVRQSQIRQAPIAMQNDARINRQFDAAATIVNAPIRKASDTTVSDRDRKERENRLLSIKGKGTAIAKPANIISFSDDEDDHIPSNGGDDLFGDDEPASPPQRGSLSVEELEAAVERVVSPKKQPVARPRGLLSATPGAIKAPVAARSPPKSFTGETSPAPAPAGASNSPAVGSRGPAAPIVRKRKPVDIFMRPSKRVPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.56
3 0.58
4 0.59
5 0.55
6 0.47
7 0.4
8 0.33
9 0.26
10 0.2
11 0.16
12 0.13
13 0.11
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.08
18 0.1
19 0.11
20 0.14
21 0.15
22 0.17
23 0.15
24 0.15
25 0.15
26 0.19
27 0.19
28 0.16
29 0.13
30 0.13
31 0.14
32 0.16
33 0.23
34 0.22
35 0.2
36 0.21
37 0.22
38 0.25
39 0.29
40 0.32
41 0.27
42 0.27
43 0.28
44 0.29
45 0.32
46 0.3
47 0.27
48 0.24
49 0.23
50 0.2
51 0.21
52 0.2
53 0.15
54 0.13
55 0.12
56 0.12
57 0.11
58 0.13
59 0.21
60 0.23
61 0.26
62 0.3
63 0.31
64 0.34
65 0.43
66 0.49
67 0.47
68 0.48
69 0.5
70 0.47
71 0.46
72 0.43
73 0.37
74 0.29
75 0.23
76 0.22
77 0.21
78 0.3
79 0.32
80 0.35
81 0.35
82 0.35
83 0.42
84 0.49
85 0.53
86 0.49
87 0.56
88 0.61
89 0.68
90 0.75
91 0.74
92 0.75
93 0.7
94 0.68
95 0.67
96 0.63
97 0.6
98 0.6
99 0.55
100 0.46
101 0.42
102 0.39
103 0.31
104 0.27
105 0.2
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.15
115 0.2
116 0.23
117 0.3
118 0.36
119 0.36
120 0.34
121 0.36
122 0.38
123 0.33
124 0.35
125 0.29
126 0.24
127 0.29
128 0.34
129 0.35
130 0.36
131 0.35
132 0.37
133 0.38
134 0.36
135 0.32
136 0.3
137 0.3
138 0.31
139 0.4
140 0.42
141 0.49
142 0.53
143 0.59
144 0.62
145 0.6
146 0.59
147 0.55
148 0.49
149 0.45
150 0.49
151 0.42
152 0.39
153 0.39
154 0.41
155 0.41
156 0.48
157 0.5
158 0.48
159 0.51
160 0.52
161 0.57
162 0.57
163 0.61
164 0.62
165 0.65
166 0.66
167 0.71
168 0.74
169 0.69
170 0.62
171 0.53
172 0.47
173 0.4
174 0.38
175 0.32
176 0.27
177 0.25
178 0.25
179 0.24
180 0.24
181 0.24
182 0.23
183 0.21
184 0.22
185 0.24
186 0.25
187 0.26
188 0.26
189 0.28
190 0.26
191 0.27
192 0.26
193 0.3
194 0.35
195 0.35
196 0.32
197 0.26
198 0.27
199 0.3
200 0.3
201 0.23
202 0.18
203 0.18
204 0.21
205 0.22
206 0.21
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.18
211 0.17
212 0.13
213 0.15
214 0.13
215 0.11
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.1
226 0.11
227 0.16
228 0.19
229 0.23
230 0.3
231 0.32
232 0.36
233 0.37
234 0.42
235 0.39
236 0.43
237 0.46
238 0.48
239 0.54
240 0.56
241 0.57
242 0.57
243 0.6
244 0.56
245 0.52
246 0.44
247 0.37
248 0.31
249 0.3
250 0.25
251 0.21
252 0.24
253 0.22
254 0.2
255 0.19
256 0.2
257 0.19
258 0.17
259 0.15
260 0.14
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.12
265 0.13
266 0.14
267 0.15
268 0.12
269 0.12
270 0.11
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.07
282 0.08
283 0.1
284 0.12
285 0.12
286 0.11
287 0.12
288 0.14
289 0.15
290 0.16
291 0.19
292 0.2
293 0.23
294 0.23
295 0.23
296 0.21
297 0.2
298 0.18
299 0.14
300 0.1
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.09
305 0.12
306 0.13
307 0.17
308 0.23
309 0.3
310 0.36
311 0.44
312 0.5
313 0.58
314 0.62
315 0.63
316 0.59
317 0.59
318 0.55
319 0.48
320 0.42
321 0.37
322 0.32
323 0.28
324 0.25
325 0.19
326 0.18
327 0.17
328 0.15
329 0.12
330 0.16
331 0.18
332 0.22
333 0.29
334 0.35
335 0.38
336 0.38
337 0.38
338 0.38
339 0.37
340 0.38
341 0.39
342 0.38
343 0.36
344 0.39
345 0.37
346 0.33
347 0.32
348 0.27
349 0.2
350 0.17
351 0.21
352 0.16
353 0.18
354 0.17
355 0.17
356 0.17
357 0.17
358 0.17
359 0.13
360 0.14
361 0.14
362 0.16
363 0.17
364 0.19
365 0.21
366 0.28
367 0.37
368 0.46
369 0.5
370 0.57
371 0.6
372 0.67
373 0.69
374 0.71
375 0.71
376 0.71
377 0.73
378 0.75
379 0.81
380 0.74