FuNGI

U1GDA3

Protein Details

Accession

U1GDA3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
541-579	AEKGKDRAAKKDKDKAKQNAERRPQKRLEPQDPARKKLF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
531-577	RRNDHKKDGGAEKGKDRAAKKDKDKAKQNAERRPQKRLEPQDPARKK

Subcellular Location(s)

cyto 10.5, cyto_nucl 8, nucl 4.5, plas 3, mito 2, extr 2, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019049 Nucleoporin_prot_Ndc1/Nup
Gene Ontology	GO:0031965 C:nuclear membrane GO:0005643 C:nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF09531 Ndc1_Nup

Amino Acid Sequences

MKGDMSTPDRLNERPIYLRSVFLMLALCQTAIHVYSDYSSVHIPVSAPAKTPEPDSRTHKLPPISMRVQNAIPRITQRCAAVCVLVALFGPFIYALFLRQTFWSWHLRFAKLIYSLPRSDARPTGYPPSKPKFMLRSFGVGFLLMLTWETTSFFFSTFLAQEPLKKDQPLSTGSKDPNGTLITGLKATRNLVKTFAFWELVLLAQKNPERRKVIFADIGREGGPAWTQMLSAALNVVQGINSRIEAATTKPRPKDEAPNPDTMEIDSLPCIAPPIKERPIFASSPPPQTRTEEIESYIDWGAKRIGQSKNPYEPPISKWKGLLKYVTPAGIPPENLNLRALFRWFSSLLQNSPIGWFFLTTFARKVNTTILGCPHSNAAVIIDAIEATTRMLVASLSEDTYGKVISGVPTTVRTFTATVNAIESFVQDHVKEEAGPDEDIEEVEIVLARLKTGLAELLSAFQLYLTDQGLSAVEHRAAQNACAKGRLLPEREERRKEQNRQVAEMEKARQRERERELEAEAEAQQKGDDGRRNDHKKDGGAEKGKDRAAKKDKDKAKQNAERRPQKRLEPQDPARKKLFQNTVPKSMGRNREMEMVR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.4
3	0.43
4	0.41
5	0.41
6	0.36
7	0.34
8	0.28
9	0.23
10	0.23
11	0.16
12	0.17
13	0.15
14	0.13
15	0.1
16	0.11
17	0.11
18	0.1
19	0.11
20	0.09
21	0.09
22	0.11
23	0.13
24	0.13
25	0.13
26	0.13
27	0.12
28	0.12
29	0.13
30	0.12
31	0.15
32	0.19
33	0.18
34	0.19
35	0.21
36	0.25
37	0.25
38	0.3
39	0.34
40	0.33
41	0.39
42	0.45
43	0.49
44	0.5
45	0.53
46	0.55
47	0.5
48	0.53
49	0.53
50	0.54
51	0.55
52	0.55
53	0.54
54	0.51
55	0.51
56	0.49
57	0.47
58	0.4
59	0.35
60	0.37
61	0.38
62	0.37
63	0.36
64	0.34
65	0.32
66	0.33
67	0.31
68	0.25
69	0.2
70	0.19
71	0.16
72	0.14
73	0.11
74	0.08
75	0.07
76	0.06
77	0.06
78	0.04
79	0.04
80	0.06
81	0.06
82	0.07
83	0.1
84	0.1
85	0.11
86	0.13
87	0.15
88	0.16
89	0.2
90	0.29
91	0.26
92	0.35
93	0.39
94	0.39
95	0.38
96	0.37
97	0.39
98	0.32
99	0.35
100	0.31
101	0.32
102	0.31
103	0.33
104	0.36
105	0.32
106	0.33
107	0.34
108	0.33
109	0.32
110	0.35
111	0.41
112	0.43
113	0.47
114	0.52
115	0.55
116	0.55
117	0.53
118	0.56
119	0.56
120	0.54
121	0.55
122	0.49
123	0.49
124	0.45
125	0.44
126	0.37
127	0.28
128	0.23
129	0.16
130	0.14
131	0.07
132	0.06
133	0.05
134	0.05
135	0.05
136	0.06
137	0.06
138	0.08
139	0.09
140	0.09
141	0.09
142	0.09
143	0.11
144	0.11
145	0.12
146	0.13
147	0.13
148	0.17
149	0.2
150	0.26
151	0.27
152	0.27
153	0.27
154	0.27
155	0.31
156	0.31
157	0.33
158	0.31
159	0.35
160	0.35
161	0.39
162	0.36
163	0.33
164	0.31
165	0.26
166	0.22
167	0.17
168	0.17
169	0.13
170	0.14
171	0.14
172	0.12
173	0.13
174	0.14
175	0.18
176	0.2
177	0.2
178	0.22
179	0.22
180	0.22
181	0.23
182	0.24
183	0.19
184	0.15
185	0.15
186	0.12
187	0.12
188	0.12
189	0.11
190	0.09
191	0.12
192	0.15
193	0.22
194	0.25
195	0.31
196	0.34
197	0.35
198	0.41
199	0.4
200	0.43
201	0.42
202	0.4
203	0.38
204	0.33
205	0.33
206	0.27
207	0.23
208	0.18
209	0.12
210	0.11
211	0.07
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.04
225	0.04
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.07
232	0.07
233	0.1
234	0.18
235	0.23
236	0.29
237	0.31
238	0.33
239	0.37
240	0.4
241	0.48
242	0.48
243	0.53
244	0.51
245	0.54
246	0.54
247	0.5
248	0.46
249	0.36
250	0.28
251	0.17
252	0.14
253	0.08
254	0.08
255	0.07
256	0.06
257	0.07
258	0.06
259	0.07
260	0.1
261	0.16
262	0.22
263	0.23
264	0.24
265	0.28
266	0.31
267	0.31
268	0.29
269	0.32
270	0.29
271	0.37
272	0.38
273	0.36
274	0.34
275	0.36
276	0.38
277	0.33
278	0.33
279	0.25
280	0.25
281	0.23
282	0.21
283	0.2
284	0.18
285	0.14
286	0.1
287	0.1
288	0.09
289	0.1
290	0.11
291	0.16
292	0.18
293	0.23
294	0.29
295	0.34
296	0.4
297	0.41
298	0.42
299	0.38
300	0.37
301	0.35
302	0.4
303	0.37
304	0.31
305	0.32
306	0.36
307	0.37
308	0.37
309	0.36
310	0.26
311	0.27
312	0.27
313	0.25
314	0.19
315	0.16
316	0.16
317	0.15
318	0.14
319	0.11
320	0.15
321	0.15
322	0.16
323	0.16
324	0.14
325	0.14
326	0.14
327	0.15
328	0.1
329	0.1
330	0.12
331	0.12
332	0.12
333	0.16
334	0.17
335	0.17
336	0.18
337	0.19
338	0.16
339	0.16
340	0.16
341	0.11
342	0.09
343	0.09
344	0.07
345	0.12
346	0.13
347	0.13
348	0.14
349	0.15
350	0.16
351	0.16
352	0.17
353	0.15
354	0.19
355	0.19
356	0.19
357	0.21
358	0.23
359	0.23
360	0.22
361	0.19
362	0.15
363	0.14
364	0.12
365	0.09
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.05
370	0.05
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.03
381	0.05
382	0.06
383	0.06
384	0.07
385	0.07
386	0.08
387	0.08
388	0.08
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.08
394	0.08
395	0.09
396	0.11
397	0.13
398	0.13
399	0.13
400	0.14
401	0.14
402	0.14
403	0.18
404	0.16
405	0.16
406	0.16
407	0.16
408	0.14
409	0.13
410	0.13
411	0.1
412	0.09
413	0.1
414	0.09
415	0.1
416	0.11
417	0.11
418	0.11
419	0.11
420	0.12
421	0.13
422	0.13
423	0.11
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.1
428	0.07
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.04
433	0.07
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.07
440	0.08
441	0.06
442	0.07
443	0.07
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.08
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.07
452	0.06
453	0.07
454	0.06
455	0.07
456	0.08
457	0.08
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.11
462	0.11
463	0.15
464	0.15
465	0.18
466	0.23
467	0.25
468	0.25
469	0.25
470	0.25
471	0.24
472	0.31
473	0.35
474	0.33
475	0.35
476	0.45
477	0.54
478	0.63
479	0.67
480	0.65
481	0.68
482	0.75
483	0.78
484	0.78
485	0.76
486	0.72
487	0.7
488	0.69
489	0.63
490	0.58
491	0.54
492	0.5
493	0.46
494	0.47
495	0.45
496	0.49
497	0.5
498	0.54
499	0.55
500	0.58
501	0.58
502	0.55
503	0.54
504	0.48
505	0.43
506	0.36
507	0.31
508	0.25
509	0.21
510	0.18
511	0.15
512	0.14
513	0.16
514	0.2
515	0.25
516	0.26
517	0.35
518	0.46
519	0.54
520	0.56
521	0.62
522	0.6
523	0.58
524	0.61
525	0.59
526	0.59
527	0.59
528	0.6
529	0.57
530	0.58
531	0.57
532	0.56
533	0.52
534	0.52
535	0.54
536	0.59
537	0.63
538	0.67
539	0.73
540	0.77
541	0.85
542	0.84
543	0.85
544	0.85
545	0.86
546	0.87
547	0.89
548	0.9
549	0.84
550	0.83
551	0.79
552	0.79
553	0.8
554	0.8
555	0.79
556	0.79
557	0.84
558	0.85
559	0.85
560	0.82
561	0.77
562	0.73
563	0.68
564	0.67
565	0.67
566	0.65
567	0.69
568	0.7
569	0.73
570	0.69
571	0.67
572	0.64
573	0.63
574	0.64
575	0.57
576	0.54
577	0.48

U1GDA3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer