Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GMG0

Protein Details
Accession U1GMG0    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-33LPFRTDNKQRRQALHVKRKRBasic
36-58DAQRRDERFARKKQEAKDPRLREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-58KQRRQALHVKRKRALDAQRRDERFARKKQEAKDPRLRE
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MPSKRLKLSDKASLPFRTDNKQRRQALHVKRKRALDAQRRDERFARKKQEAKDPRLREDRLKHNVPLTLDRKRVWDDVQEDVEDGLGLSVDVERIKRQRLEEDEALPDGELDGKSDEEDKDSMLDEASADEDDEPIDENEVVSNPLPTPKQIRTATQRATSPNRSTTSTNLNLAPEALAAKFPTLFGTDPPPDPKILITTSLNSTLHDQASILTTLFPNSHYIRRTSHRYGHKFSVREISSFASHRGYTALLVLTEDLKRPSGLTIVHLPSGPTFHFTISNWIEGRKMPGHGNPTSHTPELILNNFRTPLGLLTAHLFRTLFPPQPELRGRQVVTLHNQRDYIFLRRHRYVFREKKETEKSVIGPDGKEVKGVEGIRAGLQELGPRFTLKLRRVDKGIQRGSGQEWEWKGKMEKTRTKFQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.58
3 0.56
4 0.55
5 0.59
6 0.64
7 0.67
8 0.73
9 0.76
10 0.73
11 0.78
12 0.79
13 0.8
14 0.81
15 0.79
16 0.79
17 0.78
18 0.79
19 0.76
20 0.75
21 0.74
22 0.74
23 0.75
24 0.76
25 0.79
26 0.77
27 0.76
28 0.74
29 0.74
30 0.73
31 0.72
32 0.72
33 0.72
34 0.75
35 0.77
36 0.81
37 0.81
38 0.81
39 0.81
40 0.79
41 0.78
42 0.8
43 0.77
44 0.75
45 0.74
46 0.74
47 0.73
48 0.71
49 0.65
50 0.61
51 0.6
52 0.54
53 0.55
54 0.51
55 0.5
56 0.49
57 0.47
58 0.47
59 0.48
60 0.48
61 0.41
62 0.41
63 0.36
64 0.37
65 0.39
66 0.34
67 0.31
68 0.27
69 0.24
70 0.16
71 0.13
72 0.07
73 0.04
74 0.04
75 0.03
76 0.04
77 0.05
78 0.06
79 0.07
80 0.12
81 0.16
82 0.21
83 0.25
84 0.28
85 0.35
86 0.4
87 0.47
88 0.46
89 0.46
90 0.43
91 0.39
92 0.37
93 0.29
94 0.22
95 0.14
96 0.12
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.09
111 0.09
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.07
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.17
136 0.18
137 0.27
138 0.28
139 0.34
140 0.39
141 0.46
142 0.49
143 0.47
144 0.48
145 0.45
146 0.51
147 0.51
148 0.47
149 0.44
150 0.42
151 0.41
152 0.4
153 0.37
154 0.37
155 0.34
156 0.32
157 0.28
158 0.26
159 0.23
160 0.21
161 0.18
162 0.11
163 0.09
164 0.07
165 0.06
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.13
175 0.15
176 0.16
177 0.19
178 0.19
179 0.17
180 0.17
181 0.17
182 0.14
183 0.13
184 0.14
185 0.12
186 0.13
187 0.14
188 0.17
189 0.17
190 0.15
191 0.17
192 0.16
193 0.15
194 0.13
195 0.12
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.1
206 0.11
207 0.15
208 0.16
209 0.18
210 0.22
211 0.26
212 0.34
213 0.35
214 0.41
215 0.47
216 0.52
217 0.55
218 0.6
219 0.61
220 0.54
221 0.5
222 0.51
223 0.42
224 0.36
225 0.33
226 0.27
227 0.23
228 0.23
229 0.23
230 0.16
231 0.15
232 0.14
233 0.14
234 0.12
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.12
252 0.17
253 0.18
254 0.19
255 0.18
256 0.18
257 0.16
258 0.18
259 0.15
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.12
264 0.12
265 0.2
266 0.2
267 0.23
268 0.21
269 0.21
270 0.21
271 0.2
272 0.25
273 0.19
274 0.2
275 0.19
276 0.22
277 0.28
278 0.29
279 0.32
280 0.28
281 0.32
282 0.34
283 0.32
284 0.28
285 0.23
286 0.24
287 0.25
288 0.28
289 0.26
290 0.23
291 0.24
292 0.24
293 0.23
294 0.2
295 0.16
296 0.13
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.13
301 0.15
302 0.15
303 0.15
304 0.14
305 0.12
306 0.16
307 0.19
308 0.21
309 0.21
310 0.26
311 0.27
312 0.34
313 0.38
314 0.38
315 0.41
316 0.42
317 0.41
318 0.4
319 0.43
320 0.4
321 0.45
322 0.5
323 0.46
324 0.42
325 0.43
326 0.39
327 0.4
328 0.38
329 0.38
330 0.36
331 0.4
332 0.45
333 0.5
334 0.54
335 0.55
336 0.58
337 0.62
338 0.65
339 0.66
340 0.69
341 0.66
342 0.71
343 0.75
344 0.72
345 0.66
346 0.61
347 0.55
348 0.51
349 0.55
350 0.47
351 0.38
352 0.39
353 0.4
354 0.34
355 0.34
356 0.28
357 0.23
358 0.27
359 0.27
360 0.24
361 0.19
362 0.2
363 0.19
364 0.19
365 0.18
366 0.13
367 0.13
368 0.17
369 0.16
370 0.17
371 0.17
372 0.18
373 0.19
374 0.24
375 0.32
376 0.33
377 0.41
378 0.45
379 0.49
380 0.54
381 0.62
382 0.65
383 0.67
384 0.68
385 0.61
386 0.58
387 0.55
388 0.53
389 0.5
390 0.43
391 0.39
392 0.37
393 0.4
394 0.39
395 0.41
396 0.42
397 0.43
398 0.5
399 0.54
400 0.59
401 0.59