FuNGI

U1HZB0

Protein Details

Accession

U1HZB0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-124	GVAPRAKMNQQRARRFRSARD	Hydrophilic
407-429	DAIFRRRRQTEERREQNQKRRDQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
419-447	RREQNQKRRDQEKDAREQREQGRDAKRRR

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, cyto_nucl 9, cyto 6.5, mito 5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLHKKYPKIITPVIEEQPYEVDGQQYPVDTTRSNPNGEEFDNLYLDFNGIVHPCSHPENKPPPATESEMMMEIFKYTERVVNMVRPRKLLLIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRSARDAKEADEKKAEFQTLLRSQQHSRGDPETALEDVVKKTWDSNVITPGTPFMVILAISIRYWVQWKLNTDPAWEKLKVLISDATVPGEGEHKIMQFIRSQRADPEYDPNTKHVMYGLDADLIMLGIATHEPHFRILREDVEIRDAKAKTCNLCGQKGHYADNCRGNTKDKAGDYDEKEKTPDLKPFIWLNVPTLREYLGAEMFVPGQPFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIHEDGIDTLIAIWRDNIPIMGGYLTCDGKVDLSRAQFILQGLAKQEDAIFRRRRQTEERREQNQKRRDQEKDAREQREQGRDAKRRRSSPDYGQGGFNGSIKGRSDDRAPTNAPMNLISPQSIEVDYNMVVNRGAVDRANAANKSAAAALKAQLMQKNKPAETPEKPTNEPGAVEQTPPSALGKRKAELLEEDDDSSTPGRSTPISQPETKTNGANPDDLPPDTVRLWETGYAERYYEQKFHVAPDDYEFRRKVAQSYVEGLAWVLLYYFQGCASWTWYYPYHYAPFAADFIDLDKMDIQFAKGKPFKPYEQLMGVLPAASNHAIPPVFHSLMTDPDSEIVDFYPEDFDLDANGKKQSWKAIVLLPFIDEKRLLSAMNTKYPLLTAEEHARNEMGKDALFVSDRHPLYDLLATEFYSKRQRNANGENTVKLPVRTGGLAGIAEKNSSYLPHMSLQGPEEDIKLEPEVDDDRSMSVLYTMPTSKHVHKSMLLRGVKEPAKVLDHSDIAILKSKARNSGRSYGGAPLGDRNGSYGNGGGRGGRGGGNISFQADRPPPPQYDQQRGGTGEVDRSNPFAAFLDPKFVPPPVVGANGRIPPPPPPVSQQYGRGPPSAGSSSYAHGGYGQRDDGGYGSGSGSQRGQYGGYGQGQYNGGRGGGGDRYGGSQQQYSGPPGGGAGGRSISDSYYASGSGQSYGQGGYGVNGDTGGGRGGGGGSQNYRGSYDPRYGDGYGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.7
3	0.7
4	0.72
5	0.67
6	0.66
7	0.66
8	0.61
9	0.53
10	0.46
11	0.39
12	0.35
13	0.31
14	0.25
15	0.18
16	0.17
17	0.15
18	0.18
19	0.18
20	0.17
21	0.18
22	0.18
23	0.21
24	0.18
25	0.2
26	0.28
27	0.31
28	0.32
29	0.32
30	0.34
31	0.35
32	0.36
33	0.37
34	0.29
35	0.28
36	0.26
37	0.26
38	0.23
39	0.18
40	0.17
41	0.13
42	0.11
43	0.11
44	0.1
45	0.11
46	0.11
47	0.13
48	0.15
49	0.21
50	0.27
51	0.28
52	0.37
53	0.46
54	0.53
55	0.58
56	0.58
57	0.56
58	0.57
59	0.59
60	0.5
61	0.43
62	0.37
63	0.32
64	0.3
65	0.25
66	0.2
67	0.14
68	0.14
69	0.11
70	0.1
71	0.1
72	0.14
73	0.14
74	0.18
75	0.2
76	0.28
77	0.37
78	0.44
79	0.47
80	0.45
81	0.46
82	0.45
83	0.44
84	0.39
85	0.32
86	0.29
87	0.27
88	0.25
89	0.24
90	0.21
91	0.21
92	0.18
93	0.15
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.37
99	0.45
100	0.54
101	0.65
102	0.74
103	0.79
104	0.82
105	0.8
106	0.78
107	0.79
108	0.8
109	0.75
110	0.76
111	0.7
112	0.63
113	0.68
114	0.63
115	0.56
116	0.53
117	0.47
118	0.42
119	0.43
120	0.41
121	0.32
122	0.3
123	0.35
124	0.34
125	0.41
126	0.41
127	0.41
128	0.43
129	0.5
130	0.56
131	0.5
132	0.48
133	0.43
134	0.41
135	0.38
136	0.37
137	0.31
138	0.24
139	0.21
140	0.17
141	0.16
142	0.14
143	0.15
144	0.14
145	0.13
146	0.14
147	0.16
148	0.22
149	0.23
150	0.26
151	0.31
152	0.32
153	0.33
154	0.31
155	0.29
156	0.24
157	0.2
158	0.16
159	0.09
160	0.08
161	0.07
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.07
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.11
170	0.13
171	0.17
172	0.21
173	0.26
174	0.31
175	0.38
176	0.38
177	0.4
178	0.42
179	0.42
180	0.43
181	0.39
182	0.34
183	0.31
184	0.35
185	0.31
186	0.29
187	0.26
188	0.21
189	0.24
190	0.24
191	0.21
192	0.16
193	0.15
194	0.13
195	0.13
196	0.12
197	0.1
198	0.11
199	0.11
200	0.13
201	0.14
202	0.15
203	0.19
204	0.23
205	0.3
206	0.31
207	0.31
208	0.33
209	0.36
210	0.38
211	0.35
212	0.38
213	0.35
214	0.39
215	0.39
216	0.37
217	0.37
218	0.34
219	0.32
220	0.25
221	0.22
222	0.17
223	0.19
224	0.17
225	0.14
226	0.13
227	0.13
228	0.11
229	0.09
230	0.08
231	0.04
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.05
237	0.07
238	0.08
239	0.11
240	0.14
241	0.14
242	0.18
243	0.19
244	0.21
245	0.24
246	0.26
247	0.23
248	0.28
249	0.28
250	0.25
251	0.3
252	0.28
253	0.25
254	0.29
255	0.32
256	0.28
257	0.32
258	0.38
259	0.36
260	0.41
261	0.41
262	0.41
263	0.44
264	0.44
265	0.44
266	0.41
267	0.42
268	0.43
269	0.49
270	0.46
271	0.41
272	0.41
273	0.41
274	0.4
275	0.4
276	0.4
277	0.32
278	0.35
279	0.37
280	0.42
281	0.43
282	0.48
283	0.46
284	0.41
285	0.41
286	0.39
287	0.37
288	0.34
289	0.35
290	0.31
291	0.29
292	0.32
293	0.33
294	0.34
295	0.34
296	0.3
297	0.28
298	0.27
299	0.28
300	0.25
301	0.23
302	0.21
303	0.18
304	0.17
305	0.16
306	0.11
307	0.1
308	0.09
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.1
313	0.08
314	0.08
315	0.09
316	0.09
317	0.11
318	0.12
319	0.12
320	0.14
321	0.18
322	0.18
323	0.19
324	0.21
325	0.18
326	0.17
327	0.16
328	0.14
329	0.1
330	0.09
331	0.08
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.08
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.07
344	0.08
345	0.11
346	0.12
347	0.13
348	0.12
349	0.12
350	0.11
351	0.11
352	0.11
353	0.07
354	0.04
355	0.04
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.07
361	0.07
362	0.08
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.05
369	0.06
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.07
375	0.08
376	0.09
377	0.1
378	0.11
379	0.12
380	0.14
381	0.14
382	0.15
383	0.15
384	0.14
385	0.16
386	0.13
387	0.13
388	0.13
389	0.14
390	0.13
391	0.11
392	0.12
393	0.13
394	0.14
395	0.22
396	0.27
397	0.29
398	0.38
399	0.4
400	0.45
401	0.51
402	0.6
403	0.62
404	0.67
405	0.73
406	0.73
407	0.81
408	0.85
409	0.85
410	0.83
411	0.79
412	0.77
413	0.75
414	0.72
415	0.72
416	0.72
417	0.7
418	0.72
419	0.73
420	0.69
421	0.63
422	0.64
423	0.6
424	0.59
425	0.53
426	0.5
427	0.52
428	0.56
429	0.61
430	0.65
431	0.65
432	0.63
433	0.67
434	0.67
435	0.63
436	0.63
437	0.65
438	0.6
439	0.55
440	0.5
441	0.43
442	0.38
443	0.32
444	0.25
445	0.16
446	0.11
447	0.11
448	0.11
449	0.13
450	0.12
451	0.13
452	0.15
453	0.2
454	0.23
455	0.25
456	0.26
457	0.25
458	0.27
459	0.27
460	0.25
461	0.2
462	0.18
463	0.15
464	0.14
465	0.13
466	0.1
467	0.1
468	0.1
469	0.1
470	0.09
471	0.07
472	0.08
473	0.08
474	0.08
475	0.08
476	0.07
477	0.06
478	0.06
479	0.07
480	0.06
481	0.06
482	0.05
483	0.06
484	0.07
485	0.09
486	0.12
487	0.11
488	0.11
489	0.11
490	0.11
491	0.11
492	0.1
493	0.09
494	0.07
495	0.08
496	0.08
497	0.09
498	0.11
499	0.12
500	0.15
501	0.18
502	0.19
503	0.24
504	0.27
505	0.26
506	0.26
507	0.29
508	0.31
509	0.32
510	0.37
511	0.39
512	0.38
513	0.39
514	0.39
515	0.37
516	0.31
517	0.27
518	0.21
519	0.2
520	0.17
521	0.16
522	0.14
523	0.12
524	0.12
525	0.12
526	0.12
527	0.1
528	0.12
529	0.17
530	0.19
531	0.2
532	0.23
533	0.23
534	0.23
535	0.21
536	0.22
537	0.19
538	0.17
539	0.18
540	0.14
541	0.14
542	0.13
543	0.12
544	0.09
545	0.06
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.1
550	0.14
551	0.22
552	0.25
553	0.27
554	0.28
555	0.32
556	0.36
557	0.34
558	0.3
559	0.23
560	0.26
561	0.26
562	0.25
563	0.21
564	0.2
565	0.2
566	0.19
567	0.2
568	0.14
569	0.14
570	0.13
571	0.13
572	0.11
573	0.1
574	0.1
575	0.11
576	0.12
577	0.12
578	0.14
579	0.14
580	0.14
581	0.14
582	0.16
583	0.16
584	0.16
585	0.15
586	0.16
587	0.16
588	0.17
589	0.21
590	0.19
591	0.18
592	0.2
593	0.25
594	0.23
595	0.27
596	0.26
597	0.22
598	0.24
599	0.24
600	0.23
601	0.22
602	0.24
603	0.22
604	0.25
605	0.25
606	0.22
607	0.21
608	0.19
609	0.14
610	0.1
611	0.08
612	0.04
613	0.03
614	0.03
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.04
619	0.05
620	0.05
621	0.08
622	0.09
623	0.09
624	0.12
625	0.13
626	0.16
627	0.17
628	0.19
629	0.18
630	0.18
631	0.18
632	0.15
633	0.15
634	0.13
635	0.12
636	0.09
637	0.07
638	0.08
639	0.09
640	0.08
641	0.08
642	0.08
643	0.08
644	0.09
645	0.09
646	0.09
647	0.13
648	0.14
649	0.22
650	0.25
651	0.26
652	0.31
653	0.36
654	0.37
655	0.36
656	0.38
657	0.33
658	0.31
659	0.31
660	0.25
661	0.22
662	0.2
663	0.15
664	0.12
665	0.08
666	0.08
667	0.07
668	0.07
669	0.05
670	0.08
671	0.08
672	0.08
673	0.11
674	0.16
675	0.16
676	0.15
677	0.17
678	0.15
679	0.18
680	0.21
681	0.17
682	0.12
683	0.12
684	0.13
685	0.12
686	0.11
687	0.08
688	0.07
689	0.06
690	0.07
691	0.07
692	0.06
693	0.07
694	0.06
695	0.06
696	0.06
697	0.09
698	0.1
699	0.1
700	0.11
701	0.11
702	0.13
703	0.15
704	0.19
705	0.2
706	0.21
707	0.22
708	0.26
709	0.28
710	0.27
711	0.26
712	0.22
713	0.21
714	0.19
715	0.18
716	0.13
717	0.11
718	0.12
719	0.12
720	0.11
721	0.1
722	0.18
723	0.2
724	0.25
725	0.26
726	0.24
727	0.23
728	0.23
729	0.23
730	0.18
731	0.17
732	0.14
733	0.21
734	0.25
735	0.25
736	0.25
737	0.25
738	0.21
739	0.2
740	0.2
741	0.12
742	0.09
743	0.09
744	0.09
745	0.1
746	0.11
747	0.11
748	0.12
749	0.19
750	0.19
751	0.18
752	0.19
753	0.18
754	0.19
755	0.21
756	0.19
757	0.14
758	0.15
759	0.15
760	0.17
761	0.17
762	0.18
763	0.25
764	0.26
765	0.27
766	0.34
767	0.4
768	0.46
769	0.54
770	0.59
771	0.58
772	0.58
773	0.56
774	0.5
775	0.47
776	0.4
777	0.32
778	0.24
779	0.17
780	0.16
781	0.15
782	0.14
783	0.11
784	0.1
785	0.1
786	0.1
787	0.11
788	0.1
789	0.09
790	0.09
791	0.09
792	0.09
793	0.09
794	0.1
795	0.1
796	0.12
797	0.14
798	0.17
799	0.17
800	0.19
801	0.19
802	0.18
803	0.18
804	0.16
805	0.15
806	0.13
807	0.12
808	0.12
809	0.11
810	0.1
811	0.09
812	0.1
813	0.12
814	0.12
815	0.13
816	0.12
817	0.12
818	0.12
819	0.12
820	0.1
821	0.09
822	0.08
823	0.08
824	0.1
825	0.11
826	0.11
827	0.15
828	0.2
829	0.25
830	0.31
831	0.34
832	0.34
833	0.38
834	0.44
835	0.47
836	0.52
837	0.48
838	0.42
839	0.41
840	0.46
841	0.44
842	0.39
843	0.33
844	0.27
845	0.28
846	0.27
847	0.29
848	0.25
849	0.23
850	0.22
851	0.22
852	0.2
853	0.17
854	0.23
855	0.19
856	0.2
857	0.24
858	0.26
859	0.33
860	0.37
861	0.43
862	0.43
863	0.5
864	0.5
865	0.48
866	0.48
867	0.42
868	0.4
869	0.34
870	0.28
871	0.24
872	0.22
873	0.2
874	0.18
875	0.16
876	0.15
877	0.14
878	0.14
879	0.13
880	0.12
881	0.13
882	0.13
883	0.12
884	0.11
885	0.11
886	0.12
887	0.1
888	0.1
889	0.1
890	0.11
891	0.12
892	0.12
893	0.14
894	0.14
895	0.13
896	0.19
897	0.2
898	0.23
899	0.24
900	0.28
901	0.29
902	0.33
903	0.42
904	0.44
905	0.5
906	0.53
907	0.54
908	0.54
909	0.53
910	0.5
911	0.43
912	0.37
913	0.33
914	0.29
915	0.27
916	0.23
917	0.24
918	0.23
919	0.2
920	0.2
921	0.15
922	0.16
923	0.18
924	0.17
925	0.21
926	0.21
927	0.22
928	0.24
929	0.23
930	0.22
931	0.17
932	0.2
933	0.17
934	0.23
935	0.21
936	0.23
937	0.28
938	0.3
939	0.31
940	0.29
941	0.27
942	0.26
943	0.33
944	0.34
945	0.31
946	0.34
947	0.39
948	0.44
949	0.48
950	0.51
951	0.51
952	0.55
953	0.55
954	0.51
955	0.45
956	0.39
957	0.41
958	0.36
959	0.28
960	0.24
961	0.23
962	0.23
963	0.24
964	0.24
965	0.18
966	0.18
967	0.2
968	0.19
969	0.21
970	0.2
971	0.18
972	0.18
973	0.18
974	0.16
975	0.14
976	0.12
977	0.09
978	0.09
979	0.13
980	0.14
981	0.15
982	0.16
983	0.15
984	0.16
985	0.16
986	0.16
987	0.12
988	0.15
989	0.18
990	0.21
991	0.22
992	0.21
993	0.24
994	0.25
995	0.25
996	0.24
997	0.2
998	0.15
999	0.13
1000	0.13
1001	0.12
1002	0.12
1003	0.13
1004	0.12
1005	0.12
1006	0.14
1007	0.16
1008	0.18
1009	0.18
1010	0.17
1011	0.18
1012	0.23
1013	0.26
1014	0.27
1015	0.27
1016	0.25
1017	0.22
1018	0.21
1019	0.21
1020	0.17
1021	0.15
1022	0.13
1023	0.11
1024	0.11
1025	0.13
1026	0.13
1027	0.11
1028	0.12
1029	0.13
1030	0.12
1031	0.12
1032	0.13
1033	0.12
1034	0.14
1035	0.14
1036	0.13
1037	0.13
1038	0.12
1039	0.12
1040	0.12
1041	0.11
1042	0.1
1043	0.09
1044	0.09
1045	0.1
1046	0.1
1047	0.09
1048	0.09
1049	0.09
1050	0.08
1051	0.08
1052	0.08
1053	0.06
1054	0.06
1055	0.06
1056	0.06
1057	0.07
1058	0.09
1059	0.11
1060	0.13
1061	0.17
1062	0.19
1063	0.2
1064	0.22
1065	0.23
1066	0.25
1067	0.27
1068	0.32
1069	0.31
1070	0.32
1071	0.36
1072	0.35

U1HZB0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer