Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HWZ0

Protein Details
Accession U1HWZ0    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
601-626AEAEHKRRLKLKKQSRKDERNDRSGYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
606-623KRRLKLKKQSRKDERNDR
701-734RGRGRGRGRGNQGRGDRGNRGDRSGRGRVGRGRP
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MGDDFTMSNPTQLEEHAGPSIPGLSLMKPSIPKRQPDQSENEIPSGSGLLDTLMQHVDSQSGVRGSALSSEDNTATRAASLVAEEGVLEEGRRTSDAGQTGTGDVTNNEHECSSTSVVGMGTPASTEENGRYIANGRLVEKPEDKVDGKMALPNTSVATVREEEYAGLTDTSSHEQDASSAPAPKAASPRHPTPPTVSTTLLDDSRQEPTVKDEESVNVNGTHHVGQKEESQDRTALEEPQNQNSTATSLNEVRVDEDGGFMVEKANSGDALSSFGVHDQTAEGLDENRSLPNARQEEHGASQTDAPGPNVEAEIRTTQVETNEAEQRATDAMTTENELGKQENRYLEISTEADTPIASLREQLPAISIIEQPQNDQGGQDAEWEADSSPIDSSSDSDSTSDTTSTDDSDEDDVDVDGDYAMLDPEEQARILMQGDGGSDDEGNARSGAKGGTTHLRTANEKPEEVVPKPDIQVTEDMRIEELGCVEAIVENAVLIKAKTSGEYRVLESNSLLCLQNRSVVGVVSETLGRVQQPLYTIRFTNEEAIKEAGLGSKNTPVYYVEQHSTFVFTQPLRAVKGSDASNFHDEEVGAEEMEFSDDEAEAEHKRRLKLKKQSRKDERNDRSGYGRGNRGASMNGHARRTSSVNGDTAAEMNYDDISPIVEDGYTPLARPTNLHEMMGRGEAPLEGRQPVPFSDRGYDRGRGRGRGRGNQGRGDRGNRGDRSGRGRVGRGRPNDNQPPDRKGSFSNSQQASPTRKSEASSSPKTSAHGNQHQHQHQHQQSPQQPQPPTFALPPIPPPSQYPYPQMPPQPPHPPFSYQKPTLPHAPTIAPQASSYSTFSPSPISPLPQTHLNFNHYATQHNQHHPPAQAYHPYQPQQQHQPPYQDHSQQWQGPFHGGQQGQVQGHGQGQPPMPPPGSHINPAFFDALRQQRGGGGGGGGGGAGNWQDGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.2
4 0.2
5 0.19
6 0.18
7 0.19
8 0.12
9 0.13
10 0.12
11 0.11
12 0.15
13 0.16
14 0.2
15 0.26
16 0.3
17 0.39
18 0.44
19 0.5
20 0.53
21 0.62
22 0.67
23 0.67
24 0.71
25 0.69
26 0.72
27 0.67
28 0.62
29 0.52
30 0.43
31 0.36
32 0.29
33 0.2
34 0.11
35 0.08
36 0.07
37 0.09
38 0.09
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.12
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.14
54 0.16
55 0.14
56 0.15
57 0.17
58 0.18
59 0.18
60 0.19
61 0.16
62 0.14
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.17
83 0.2
84 0.21
85 0.22
86 0.22
87 0.22
88 0.21
89 0.2
90 0.15
91 0.12
92 0.13
93 0.17
94 0.16
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.17
99 0.21
100 0.2
101 0.16
102 0.15
103 0.16
104 0.15
105 0.15
106 0.14
107 0.09
108 0.07
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.1
114 0.11
115 0.12
116 0.14
117 0.14
118 0.14
119 0.15
120 0.18
121 0.21
122 0.22
123 0.22
124 0.27
125 0.3
126 0.34
127 0.34
128 0.33
129 0.31
130 0.35
131 0.34
132 0.3
133 0.3
134 0.27
135 0.25
136 0.27
137 0.26
138 0.22
139 0.22
140 0.21
141 0.19
142 0.18
143 0.18
144 0.14
145 0.17
146 0.16
147 0.17
148 0.17
149 0.16
150 0.14
151 0.15
152 0.15
153 0.12
154 0.11
155 0.09
156 0.09
157 0.11
158 0.15
159 0.14
160 0.13
161 0.12
162 0.12
163 0.14
164 0.15
165 0.16
166 0.16
167 0.19
168 0.19
169 0.22
170 0.23
171 0.24
172 0.29
173 0.29
174 0.36
175 0.38
176 0.45
177 0.51
178 0.53
179 0.53
180 0.51
181 0.52
182 0.48
183 0.45
184 0.41
185 0.31
186 0.32
187 0.32
188 0.27
189 0.23
190 0.2
191 0.18
192 0.19
193 0.21
194 0.19
195 0.16
196 0.21
197 0.25
198 0.24
199 0.23
200 0.21
201 0.21
202 0.24
203 0.25
204 0.21
205 0.18
206 0.17
207 0.17
208 0.18
209 0.18
210 0.18
211 0.17
212 0.17
213 0.17
214 0.22
215 0.28
216 0.3
217 0.3
218 0.27
219 0.28
220 0.28
221 0.3
222 0.27
223 0.25
224 0.25
225 0.32
226 0.33
227 0.38
228 0.39
229 0.35
230 0.34
231 0.29
232 0.27
233 0.2
234 0.19
235 0.15
236 0.15
237 0.16
238 0.18
239 0.17
240 0.17
241 0.16
242 0.15
243 0.12
244 0.11
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.06
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.11
279 0.19
280 0.21
281 0.21
282 0.23
283 0.25
284 0.28
285 0.3
286 0.31
287 0.24
288 0.22
289 0.22
290 0.2
291 0.2
292 0.16
293 0.15
294 0.12
295 0.11
296 0.11
297 0.11
298 0.1
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.13
308 0.12
309 0.14
310 0.19
311 0.18
312 0.18
313 0.16
314 0.17
315 0.15
316 0.14
317 0.11
318 0.06
319 0.07
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.12
328 0.14
329 0.15
330 0.15
331 0.17
332 0.18
333 0.18
334 0.17
335 0.17
336 0.16
337 0.14
338 0.14
339 0.12
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.08
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.1
357 0.13
358 0.13
359 0.13
360 0.14
361 0.15
362 0.13
363 0.12
364 0.11
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.09
382 0.1
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.1
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.07
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.04
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.04
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.04
427 0.05
428 0.05
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.05
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.13
440 0.14
441 0.16
442 0.18
443 0.2
444 0.22
445 0.25
446 0.31
447 0.27
448 0.25
449 0.24
450 0.26
451 0.28
452 0.26
453 0.26
454 0.2
455 0.2
456 0.2
457 0.21
458 0.16
459 0.14
460 0.18
461 0.16
462 0.18
463 0.17
464 0.17
465 0.15
466 0.15
467 0.14
468 0.09
469 0.08
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.03
484 0.05
485 0.05
486 0.07
487 0.08
488 0.1
489 0.14
490 0.16
491 0.17
492 0.19
493 0.2
494 0.18
495 0.17
496 0.16
497 0.12
498 0.13
499 0.11
500 0.08
501 0.09
502 0.09
503 0.12
504 0.12
505 0.12
506 0.1
507 0.1
508 0.1
509 0.09
510 0.08
511 0.06
512 0.06
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.08
521 0.11
522 0.14
523 0.15
524 0.15
525 0.16
526 0.18
527 0.18
528 0.21
529 0.2
530 0.18
531 0.19
532 0.19
533 0.18
534 0.15
535 0.15
536 0.11
537 0.1
538 0.1
539 0.09
540 0.13
541 0.14
542 0.13
543 0.14
544 0.13
545 0.15
546 0.17
547 0.2
548 0.17
549 0.17
550 0.18
551 0.17
552 0.19
553 0.16
554 0.14
555 0.14
556 0.12
557 0.14
558 0.16
559 0.18
560 0.16
561 0.17
562 0.16
563 0.14
564 0.18
565 0.18
566 0.18
567 0.19
568 0.2
569 0.22
570 0.22
571 0.21
572 0.17
573 0.16
574 0.13
575 0.14
576 0.11
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.07
581 0.08
582 0.07
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.05
588 0.06
589 0.07
590 0.1
591 0.13
592 0.16
593 0.19
594 0.27
595 0.35
596 0.43
597 0.53
598 0.62
599 0.7
600 0.76
601 0.85
602 0.88
603 0.91
604 0.91
605 0.91
606 0.87
607 0.86
608 0.78
609 0.69
610 0.62
611 0.55
612 0.5
613 0.44
614 0.41
615 0.34
616 0.32
617 0.31
618 0.28
619 0.26
620 0.22
621 0.22
622 0.25
623 0.26
624 0.26
625 0.26
626 0.26
627 0.26
628 0.28
629 0.26
630 0.23
631 0.22
632 0.21
633 0.21
634 0.21
635 0.19
636 0.17
637 0.15
638 0.1
639 0.08
640 0.07
641 0.07
642 0.06
643 0.06
644 0.05
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.04
649 0.04
650 0.04
651 0.05
652 0.09
653 0.09
654 0.09
655 0.1
656 0.12
657 0.12
658 0.13
659 0.18
660 0.23
661 0.24
662 0.25
663 0.24
664 0.23
665 0.25
666 0.25
667 0.2
668 0.1
669 0.1
670 0.09
671 0.11
672 0.11
673 0.11
674 0.11
675 0.12
676 0.13
677 0.14
678 0.15
679 0.17
680 0.17
681 0.18
682 0.22
683 0.23
684 0.28
685 0.31
686 0.36
687 0.34
688 0.41
689 0.43
690 0.45
691 0.46
692 0.49
693 0.52
694 0.54
695 0.61
696 0.62
697 0.62
698 0.62
699 0.63
700 0.62
701 0.6
702 0.55
703 0.51
704 0.48
705 0.52
706 0.46
707 0.47
708 0.44
709 0.45
710 0.48
711 0.49
712 0.48
713 0.42
714 0.46
715 0.5
716 0.54
717 0.58
718 0.57
719 0.58
720 0.59
721 0.65
722 0.69
723 0.69
724 0.68
725 0.65
726 0.65
727 0.64
728 0.59
729 0.52
730 0.46
731 0.45
732 0.45
733 0.46
734 0.48
735 0.45
736 0.44
737 0.46
738 0.48
739 0.48
740 0.45
741 0.42
742 0.37
743 0.37
744 0.37
745 0.39
746 0.43
747 0.44
748 0.47
749 0.49
750 0.48
751 0.48
752 0.47
753 0.47
754 0.44
755 0.45
756 0.47
757 0.49
758 0.51
759 0.6
760 0.64
761 0.65
762 0.62
763 0.63
764 0.6
765 0.63
766 0.6
767 0.61
768 0.62
769 0.65
770 0.66
771 0.63
772 0.6
773 0.53
774 0.55
775 0.48
776 0.45
777 0.37
778 0.35
779 0.3
780 0.29
781 0.34
782 0.34
783 0.32
784 0.3
785 0.32
786 0.36
787 0.4
788 0.41
789 0.41
790 0.41
791 0.46
792 0.51
793 0.54
794 0.54
795 0.53
796 0.57
797 0.62
798 0.58
799 0.56
800 0.55
801 0.55
802 0.52
803 0.57
804 0.58
805 0.52
806 0.55
807 0.55
808 0.56
809 0.58
810 0.56
811 0.49
812 0.43
813 0.41
814 0.37
815 0.39
816 0.37
817 0.29
818 0.25
819 0.25
820 0.24
821 0.24
822 0.24
823 0.19
824 0.2
825 0.2
826 0.2
827 0.22
828 0.2
829 0.24
830 0.24
831 0.26
832 0.26
833 0.29
834 0.32
835 0.36
836 0.37
837 0.39
838 0.42
839 0.42
840 0.41
841 0.4
842 0.43
843 0.35
844 0.38
845 0.35
846 0.4
847 0.44
848 0.49
849 0.52
850 0.5
851 0.55
852 0.54
853 0.54
854 0.48
855 0.45
856 0.47
857 0.46
858 0.49
859 0.51
860 0.51
861 0.53
862 0.56
863 0.59
864 0.61
865 0.65
866 0.65
867 0.64
868 0.69
869 0.67
870 0.67
871 0.67
872 0.63
873 0.57
874 0.57
875 0.59
876 0.55
877 0.55
878 0.53
879 0.47
880 0.44
881 0.42
882 0.37
883 0.37
884 0.32
885 0.3
886 0.3
887 0.35
888 0.3
889 0.31
890 0.29
891 0.22
892 0.25
893 0.27
894 0.24
895 0.23
896 0.24
897 0.29
898 0.31
899 0.35
900 0.33
901 0.3
902 0.33
903 0.37
904 0.4
905 0.41
906 0.41
907 0.39
908 0.39
909 0.42
910 0.39
911 0.29
912 0.28
913 0.3
914 0.35
915 0.35
916 0.34
917 0.31
918 0.31
919 0.33
920 0.32
921 0.24
922 0.16
923 0.12
924 0.12
925 0.11
926 0.09
927 0.06
928 0.05
929 0.04
930 0.04