Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GSV4

Protein Details
Accession U1GSV4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-223MAPAVKVVKKEKPKKKIRRGGKVTNTHMQGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
200-215VVKKEKPKKKIRRGGK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito_nucl 9.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
Amino Acid Sequences MSSTEIYSQPAATGTGTDVRTKVLFAIDSLKAKSPASIPTATLIADNIRGPEQTPELVSRFRQFLNANEKVSYNKETDSYSFRPVHDIFNADDLIGFLQSQTTALGLNVRDLKDGWNDVEKTIDQLEKDQKLLVVRNKKDNHAKMVWADDPTLHAPMDDEFVKLWDEISMPSGGHEAVVKELKQKGMTSADSGMAPAVKVVKKEKPKKKIRRGGKVTNTHMQGILRDYSHLKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.16
3 0.17
4 0.19
5 0.18
6 0.2
7 0.2
8 0.19
9 0.18
10 0.15
11 0.14
12 0.13
13 0.18
14 0.2
15 0.23
16 0.24
17 0.26
18 0.26
19 0.25
20 0.26
21 0.23
22 0.23
23 0.25
24 0.25
25 0.22
26 0.22
27 0.22
28 0.21
29 0.19
30 0.15
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.11
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.13
39 0.14
40 0.13
41 0.15
42 0.16
43 0.17
44 0.2
45 0.21
46 0.21
47 0.22
48 0.21
49 0.24
50 0.23
51 0.28
52 0.35
53 0.37
54 0.36
55 0.34
56 0.35
57 0.32
58 0.34
59 0.3
60 0.22
61 0.18
62 0.18
63 0.19
64 0.21
65 0.25
66 0.24
67 0.28
68 0.29
69 0.28
70 0.32
71 0.31
72 0.31
73 0.26
74 0.25
75 0.19
76 0.19
77 0.19
78 0.14
79 0.13
80 0.1
81 0.09
82 0.07
83 0.06
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.04
88 0.04
89 0.03
90 0.04
91 0.04
92 0.06
93 0.06
94 0.08
95 0.11
96 0.11
97 0.12
98 0.12
99 0.13
100 0.12
101 0.13
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.14
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.09
112 0.13
113 0.19
114 0.18
115 0.19
116 0.18
117 0.17
118 0.18
119 0.23
120 0.26
121 0.3
122 0.32
123 0.41
124 0.43
125 0.48
126 0.55
127 0.53
128 0.53
129 0.45
130 0.44
131 0.37
132 0.38
133 0.34
134 0.26
135 0.23
136 0.16
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.12
141 0.1
142 0.09
143 0.1
144 0.12
145 0.1
146 0.09
147 0.08
148 0.09
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.1
165 0.13
166 0.13
167 0.17
168 0.2
169 0.22
170 0.23
171 0.24
172 0.24
173 0.26
174 0.27
175 0.25
176 0.24
177 0.23
178 0.21
179 0.2
180 0.17
181 0.12
182 0.11
183 0.09
184 0.13
185 0.13
186 0.16
187 0.22
188 0.3
189 0.41
190 0.52
191 0.61
192 0.66
193 0.76
194 0.84
195 0.9
196 0.92
197 0.92
198 0.93
199 0.92
200 0.92
201 0.91
202 0.9
203 0.86
204 0.84
205 0.76
206 0.66
207 0.59
208 0.49
209 0.41
210 0.35
211 0.31
212 0.23
213 0.23