Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HHW2

Protein Details
Accession U1HHW2    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-46AEEFAEPRRKRRKTGRDNKESAALHydrophilic
248-272EDSSEEERKRKRKAKEKRRLQGGSGBasic
539-564KLKNAVREWKPRSNRKHHSHLAPHKWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-38PRRKRRKTGR
254-273ERKRKRKAKEKRRLQGGSGA
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10.5, cyto 8.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR022783  GCFC_dom  
IPR022159  STIP/TFIP11_N  
IPR045211  TFP11/STIP/Ntr1  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000390  P:spliceosomal complex disassembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF07842  GCFC  
PF12457  TIP_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MSDSSETSSAEDGFLFPNTDPGAEEFAEPRRKRRKTGRDNKESAALGIFGSDSDDDRPVQQWKSRTLRGKGVGFVSSKADGGSEVDEEDGEEMLGVEVHDTAGLRPSTGTGLGWSQAARESSPQNMSKNHDMGTPLGLGFAPSSAQQAYTGAREFMKTESPPPAMSRPSNFGASSKGGMNNNSFAAKMMAKMGYVAGQGLGSSGQGIVNPIETKLRPQGAGLGTVKEKTQQAKEEAKREAARRGEVLEDSSEEERKRKRKAKEKRRLQGGSGASTPGSKPRTKYRTVGDIEAAAEGLEVPKVLKSLIDATGRETRLLTSTSGLMTPTNEVSDGESTKIAKRAKRDLEAFADAWNAETEKKKYIDAQELLLSGEIEANNLAIDQTRALLKALDSLSLEGNGSLDEQWDEVIQNLEILQVEFSGRLEEYGLPEAAVASLEPLFRRKMEGWDPLQDPEGLVSALRRVLPILGVNDDQPVHQKSTTLYESMIVTLWLPKVRTVLVNDWNVHEAKNAVNLLESWKQILPRFAYEQLLTQTIVPKLKNAVREWKPRSNRKHHSHLAPHKWLFEWLPLLSERQRDLKNANGVMGEVRRKFRSTFDHWDVTRGVMEGISHWRNLLQSDLDVILRNHLLPRLARHLRNHLEINPQEQDLAPLEDVLKWTEFFNPHVMGELLVAEFFPKWHDVLHIWLTSDPNYEEVGEWFSWWKEQIPEAIRDLKPAADEWQKGLEMMELALELGDRAAEELPAPVARLTEDFVKRSTNGHTAVKAEKVEPVAEQDMSFKDQVDQWSISENLLMIPMREAHATTGLPVFRITASATGKGGVLVYLKGDVVWAQNRTRDAWHPVGLDNSLVDRAEGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.12
4 0.16
5 0.15
6 0.15
7 0.16
8 0.16
9 0.19
10 0.18
11 0.19
12 0.18
13 0.26
14 0.36
15 0.36
16 0.44
17 0.51
18 0.56
19 0.64
20 0.73
21 0.76
22 0.77
23 0.87
24 0.88
25 0.89
26 0.89
27 0.83
28 0.79
29 0.68
30 0.58
31 0.48
32 0.37
33 0.26
34 0.2
35 0.17
36 0.09
37 0.1
38 0.09
39 0.09
40 0.11
41 0.13
42 0.13
43 0.15
44 0.19
45 0.22
46 0.27
47 0.31
48 0.35
49 0.42
50 0.5
51 0.57
52 0.63
53 0.63
54 0.67
55 0.7
56 0.68
57 0.62
58 0.57
59 0.53
60 0.45
61 0.41
62 0.35
63 0.28
64 0.25
65 0.2
66 0.17
67 0.13
68 0.13
69 0.14
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.08
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.11
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.1
98 0.12
99 0.12
100 0.13
101 0.12
102 0.11
103 0.14
104 0.15
105 0.14
106 0.16
107 0.18
108 0.22
109 0.29
110 0.33
111 0.34
112 0.37
113 0.43
114 0.46
115 0.46
116 0.42
117 0.38
118 0.35
119 0.32
120 0.3
121 0.24
122 0.17
123 0.15
124 0.14
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.07
129 0.06
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.12
136 0.14
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.16
142 0.17
143 0.21
144 0.19
145 0.22
146 0.26
147 0.28
148 0.29
149 0.31
150 0.34
151 0.34
152 0.36
153 0.36
154 0.35
155 0.36
156 0.37
157 0.34
158 0.3
159 0.29
160 0.27
161 0.25
162 0.23
163 0.25
164 0.24
165 0.26
166 0.27
167 0.25
168 0.24
169 0.23
170 0.2
171 0.16
172 0.17
173 0.15
174 0.13
175 0.14
176 0.13
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.1
182 0.1
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.13
199 0.13
200 0.16
201 0.21
202 0.23
203 0.21
204 0.21
205 0.27
206 0.24
207 0.3
208 0.27
209 0.24
210 0.23
211 0.24
212 0.24
213 0.2
214 0.23
215 0.21
216 0.26
217 0.28
218 0.33
219 0.43
220 0.49
221 0.52
222 0.52
223 0.54
224 0.54
225 0.51
226 0.52
227 0.45
228 0.42
229 0.36
230 0.35
231 0.3
232 0.26
233 0.25
234 0.18
235 0.15
236 0.16
237 0.16
238 0.18
239 0.17
240 0.22
241 0.29
242 0.35
243 0.44
244 0.5
245 0.58
246 0.65
247 0.76
248 0.82
249 0.85
250 0.89
251 0.88
252 0.91
253 0.84
254 0.75
255 0.72
256 0.64
257 0.56
258 0.45
259 0.37
260 0.26
261 0.24
262 0.22
263 0.2
264 0.21
265 0.2
266 0.23
267 0.32
268 0.39
269 0.42
270 0.47
271 0.46
272 0.51
273 0.52
274 0.5
275 0.41
276 0.36
277 0.32
278 0.27
279 0.21
280 0.11
281 0.08
282 0.06
283 0.05
284 0.04
285 0.03
286 0.03
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.06
292 0.09
293 0.13
294 0.16
295 0.16
296 0.19
297 0.26
298 0.26
299 0.26
300 0.23
301 0.19
302 0.18
303 0.19
304 0.16
305 0.1
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.1
310 0.09
311 0.08
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.1
319 0.11
320 0.1
321 0.11
322 0.12
323 0.13
324 0.19
325 0.21
326 0.22
327 0.27
328 0.35
329 0.4
330 0.45
331 0.46
332 0.44
333 0.44
334 0.45
335 0.39
336 0.31
337 0.26
338 0.19
339 0.17
340 0.13
341 0.09
342 0.08
343 0.11
344 0.12
345 0.16
346 0.17
347 0.17
348 0.21
349 0.25
350 0.31
351 0.28
352 0.28
353 0.25
354 0.25
355 0.24
356 0.2
357 0.16
358 0.08
359 0.08
360 0.07
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.04
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.05
412 0.05
413 0.07
414 0.08
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.06
420 0.05
421 0.04
422 0.03
423 0.04
424 0.05
425 0.05
426 0.07
427 0.08
428 0.08
429 0.11
430 0.12
431 0.16
432 0.2
433 0.26
434 0.27
435 0.31
436 0.33
437 0.3
438 0.3
439 0.25
440 0.2
441 0.14
442 0.12
443 0.07
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.09
457 0.1
458 0.1
459 0.11
460 0.1
461 0.12
462 0.13
463 0.13
464 0.12
465 0.13
466 0.13
467 0.18
468 0.19
469 0.16
470 0.15
471 0.14
472 0.14
473 0.14
474 0.13
475 0.07
476 0.06
477 0.07
478 0.08
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.1
483 0.11
484 0.13
485 0.15
486 0.19
487 0.24
488 0.27
489 0.27
490 0.27
491 0.28
492 0.26
493 0.23
494 0.18
495 0.13
496 0.09
497 0.13
498 0.12
499 0.1
500 0.1
501 0.1
502 0.14
503 0.16
504 0.16
505 0.14
506 0.15
507 0.17
508 0.18
509 0.22
510 0.19
511 0.19
512 0.23
513 0.23
514 0.23
515 0.22
516 0.22
517 0.2
518 0.19
519 0.16
520 0.14
521 0.15
522 0.16
523 0.19
524 0.16
525 0.16
526 0.2
527 0.23
528 0.27
529 0.27
530 0.35
531 0.39
532 0.5
533 0.56
534 0.61
535 0.67
536 0.71
537 0.78
538 0.79
539 0.81
540 0.79
541 0.82
542 0.79
543 0.79
544 0.8
545 0.8
546 0.79
547 0.77
548 0.7
549 0.62
550 0.55
551 0.48
552 0.38
553 0.3
554 0.24
555 0.15
556 0.16
557 0.15
558 0.17
559 0.18
560 0.2
561 0.2
562 0.23
563 0.25
564 0.25
565 0.27
566 0.31
567 0.35
568 0.33
569 0.32
570 0.25
571 0.24
572 0.24
573 0.25
574 0.23
575 0.2
576 0.23
577 0.24
578 0.26
579 0.27
580 0.3
581 0.35
582 0.38
583 0.44
584 0.47
585 0.52
586 0.5
587 0.52
588 0.47
589 0.4
590 0.33
591 0.23
592 0.17
593 0.1
594 0.1
595 0.09
596 0.15
597 0.15
598 0.14
599 0.14
600 0.15
601 0.15
602 0.16
603 0.16
604 0.1
605 0.09
606 0.11
607 0.12
608 0.12
609 0.13
610 0.12
611 0.12
612 0.12
613 0.12
614 0.12
615 0.12
616 0.14
617 0.14
618 0.18
619 0.26
620 0.32
621 0.36
622 0.4
623 0.48
624 0.5
625 0.54
626 0.53
627 0.47
628 0.49
629 0.46
630 0.46
631 0.39
632 0.34
633 0.3
634 0.26
635 0.25
636 0.17
637 0.18
638 0.13
639 0.11
640 0.11
641 0.12
642 0.13
643 0.12
644 0.11
645 0.1
646 0.11
647 0.15
648 0.16
649 0.17
650 0.21
651 0.2
652 0.19
653 0.21
654 0.2
655 0.15
656 0.14
657 0.13
658 0.09
659 0.07
660 0.07
661 0.06
662 0.05
663 0.05
664 0.07
665 0.07
666 0.08
667 0.08
668 0.11
669 0.12
670 0.17
671 0.22
672 0.21
673 0.21
674 0.22
675 0.23
676 0.22
677 0.23
678 0.18
679 0.15
680 0.15
681 0.14
682 0.13
683 0.13
684 0.16
685 0.13
686 0.13
687 0.13
688 0.13
689 0.14
690 0.14
691 0.16
692 0.14
693 0.16
694 0.23
695 0.25
696 0.28
697 0.31
698 0.38
699 0.35
700 0.36
701 0.35
702 0.29
703 0.25
704 0.23
705 0.25
706 0.24
707 0.25
708 0.25
709 0.28
710 0.27
711 0.26
712 0.25
713 0.2
714 0.13
715 0.12
716 0.1
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.05
721 0.04
722 0.04
723 0.03
724 0.03
725 0.04
726 0.05
727 0.05
728 0.06
729 0.06
730 0.08
731 0.08
732 0.09
733 0.09
734 0.09
735 0.1
736 0.1
737 0.12
738 0.19
739 0.22
740 0.23
741 0.24
742 0.27
743 0.27
744 0.29
745 0.32
746 0.3
747 0.31
748 0.33
749 0.34
750 0.35
751 0.37
752 0.39
753 0.36
754 0.3
755 0.29
756 0.27
757 0.25
758 0.22
759 0.24
760 0.22
761 0.21
762 0.21
763 0.2
764 0.2
765 0.23
766 0.22
767 0.18
768 0.17
769 0.2
770 0.23
771 0.25
772 0.24
773 0.21
774 0.26
775 0.26
776 0.24
777 0.21
778 0.18
779 0.13
780 0.14
781 0.14
782 0.1
783 0.11
784 0.12
785 0.13
786 0.14
787 0.14
788 0.13
789 0.16
790 0.16
791 0.16
792 0.2
793 0.18
794 0.18
795 0.18
796 0.17
797 0.14
798 0.15
799 0.14
800 0.16
801 0.19
802 0.21
803 0.21
804 0.2
805 0.2
806 0.19
807 0.18
808 0.13
809 0.11
810 0.09
811 0.1
812 0.1
813 0.1
814 0.1
815 0.1
816 0.1
817 0.14
818 0.19
819 0.23
820 0.25
821 0.3
822 0.32
823 0.34
824 0.38
825 0.38
826 0.41
827 0.42
828 0.43
829 0.41
830 0.41
831 0.42
832 0.38
833 0.32
834 0.25
835 0.21
836 0.18
837 0.16