Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GED0

Protein Details
Accession U1GED0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
340-368GTEGLSSRMRKSRQKKRRQNVAIMETRTVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
349-357RKSRQKKRR
Subcellular Location(s) mito 13.5, cyto_mito 8.5, nucl 8, cyto 2.5
Family & Domain DBs
CDD cd09917  F-box_SF  
Amino Acid Sequences MPFNGKAKTRKGLPLPFRACDCVSCEEDQGKFREIILHRQHRLNPSTTDCRLKVNFEFAASPANALDSHSTSKTTILRLPDELLLRIFKLTRFVPTAICLALTCKRLCSLYLDNLKDRSEKIENRLWNSTSGFWKYKLIDNLIRGWIPQQSVRFCWACWLFRPYGEASTEFWRAKIPALTAIPERERSRVAGGYCCCFQNAAHCTGSLLFSLSTMIYEEVPGLRDTSQDPIDWEEEYEYARRLRDCDDLPQYQNNWEVQFWLGEQGLAGVETSLAKDKRIRCPSCVLVDNQLRLGHRGMKVVWPDGHPDPSVIVKDTLKRRASLLGYEWNPRIAFYSLTGTEGLSSRMRKSRQKKRRQNVAIMETRTVSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.73
3 0.69
4 0.66
5 0.62
6 0.54
7 0.46
8 0.42
9 0.37
10 0.34
11 0.32
12 0.32
13 0.32
14 0.33
15 0.35
16 0.35
17 0.32
18 0.29
19 0.28
20 0.33
21 0.31
22 0.38
23 0.45
24 0.51
25 0.52
26 0.58
27 0.64
28 0.63
29 0.66
30 0.6
31 0.55
32 0.53
33 0.57
34 0.55
35 0.57
36 0.49
37 0.52
38 0.49
39 0.49
40 0.44
41 0.42
42 0.38
43 0.32
44 0.32
45 0.26
46 0.29
47 0.23
48 0.21
49 0.14
50 0.14
51 0.13
52 0.13
53 0.15
54 0.12
55 0.16
56 0.16
57 0.18
58 0.17
59 0.21
60 0.23
61 0.23
62 0.25
63 0.25
64 0.27
65 0.27
66 0.29
67 0.29
68 0.27
69 0.25
70 0.23
71 0.2
72 0.17
73 0.17
74 0.16
75 0.13
76 0.16
77 0.16
78 0.18
79 0.21
80 0.22
81 0.21
82 0.22
83 0.23
84 0.19
85 0.18
86 0.14
87 0.14
88 0.17
89 0.2
90 0.18
91 0.18
92 0.19
93 0.19
94 0.2
95 0.23
96 0.23
97 0.28
98 0.36
99 0.38
100 0.4
101 0.41
102 0.42
103 0.37
104 0.33
105 0.3
106 0.29
107 0.3
108 0.33
109 0.38
110 0.4
111 0.43
112 0.47
113 0.42
114 0.37
115 0.34
116 0.32
117 0.3
118 0.31
119 0.28
120 0.25
121 0.28
122 0.27
123 0.31
124 0.31
125 0.31
126 0.3
127 0.3
128 0.32
129 0.31
130 0.29
131 0.24
132 0.21
133 0.19
134 0.16
135 0.17
136 0.18
137 0.18
138 0.19
139 0.23
140 0.23
141 0.2
142 0.25
143 0.25
144 0.23
145 0.23
146 0.26
147 0.23
148 0.22
149 0.25
150 0.2
151 0.19
152 0.19
153 0.18
154 0.16
155 0.18
156 0.22
157 0.2
158 0.19
159 0.17
160 0.17
161 0.17
162 0.17
163 0.14
164 0.13
165 0.14
166 0.15
167 0.15
168 0.17
169 0.17
170 0.19
171 0.2
172 0.17
173 0.18
174 0.17
175 0.18
176 0.19
177 0.18
178 0.2
179 0.2
180 0.21
181 0.21
182 0.2
183 0.18
184 0.15
185 0.14
186 0.17
187 0.18
188 0.2
189 0.19
190 0.19
191 0.19
192 0.19
193 0.2
194 0.12
195 0.1
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.14
218 0.15
219 0.14
220 0.13
221 0.11
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.13
228 0.13
229 0.14
230 0.16
231 0.21
232 0.22
233 0.27
234 0.32
235 0.34
236 0.36
237 0.39
238 0.37
239 0.34
240 0.36
241 0.3
242 0.25
243 0.21
244 0.2
245 0.16
246 0.15
247 0.13
248 0.12
249 0.1
250 0.08
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.03
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.11
261 0.11
262 0.13
263 0.19
264 0.25
265 0.35
266 0.46
267 0.48
268 0.46
269 0.53
270 0.56
271 0.57
272 0.55
273 0.46
274 0.45
275 0.47
276 0.45
277 0.4
278 0.38
279 0.32
280 0.3
281 0.3
282 0.28
283 0.24
284 0.26
285 0.24
286 0.27
287 0.3
288 0.32
289 0.33
290 0.28
291 0.31
292 0.32
293 0.34
294 0.29
295 0.26
296 0.23
297 0.23
298 0.24
299 0.2
300 0.2
301 0.2
302 0.27
303 0.35
304 0.42
305 0.41
306 0.41
307 0.4
308 0.44
309 0.44
310 0.41
311 0.38
312 0.38
313 0.39
314 0.44
315 0.43
316 0.39
317 0.37
318 0.32
319 0.31
320 0.23
321 0.21
322 0.18
323 0.23
324 0.2
325 0.22
326 0.22
327 0.18
328 0.18
329 0.18
330 0.19
331 0.18
332 0.2
333 0.24
334 0.32
335 0.39
336 0.48
337 0.58
338 0.66
339 0.72
340 0.81
341 0.87
342 0.9
343 0.94
344 0.93
345 0.93
346 0.92
347 0.91
348 0.88
349 0.8
350 0.71