FuNGI

U1GPQ9

Protein Details

Accession

U1GPQ9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
405-436	PDVVLVKKYYARKKKSKNRNWRLKRMGKDEGE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
415-432	ARKKKSKNRNWRLKRMGK

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 12

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MSMDIDQPVALPSIHSNQTAATILCCNCGAPIDGTSSAGALCYDCVKLTIDVSAGIQREATLHTCKDCERWLQPPSQWMTAAPESRELLALCLRKLRGLNKVRIIDASFLWTEPHSKRIKVKITVQQEVFEATILQQTFEVEYVVASQQCPDCAKSYTANTWRAVVQVRQKVPHKRTFLYLEQLVLKHGAHKDAINIKEVKDGLDFFFAQRNHAEKFVDFLTSVAPVRAKKSQELISTDIHTSSKSYKFTFSCELVPICKDDLVALPFKLAKSIGNIAPLSICYRVGTSVNVIDPNTLKTADIPAAIYWRDPFKSLADVQELSEFIVLDIEAVGHQNGRFFLAEATVAKASDLGVNDRTYFVRTHLGGVLHAGDSVLGYHLTGTNFNNRHFEALELSNSYSSTIPDVVLVKKYYARKKKSKNRNWRLKRMGKDEGELLPKKADQDRLEADFEMFLRDVEEDPELRQTLAVYKANQRKAKGEMTGVEQDVMSMAETEDTEDEQVPKINMDELLEDFDELNVHDMG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.21
3	0.21
4	0.2
5	0.23
6	0.24
7	0.21
8	0.16
9	0.19
10	0.19
11	0.21
12	0.2
13	0.18
14	0.16
15	0.17
16	0.17
17	0.13
18	0.14
19	0.17
20	0.17
21	0.18
22	0.18
23	0.16
24	0.14
25	0.12
26	0.11
27	0.07
28	0.07
29	0.08
30	0.09
31	0.09
32	0.1
33	0.12
34	0.13
35	0.13
36	0.14
37	0.12
38	0.12
39	0.14
40	0.17
41	0.15
42	0.14
43	0.14
44	0.12
45	0.13
46	0.15
47	0.17
48	0.18
49	0.19
50	0.21
51	0.24
52	0.25
53	0.28
54	0.3
55	0.33
56	0.33
57	0.39
58	0.41
59	0.46
60	0.47
61	0.51
62	0.51
63	0.47
64	0.42
65	0.36
66	0.38
67	0.37
68	0.38
69	0.31
70	0.3
71	0.28
72	0.28
73	0.29
74	0.22
75	0.18
76	0.21
77	0.22
78	0.2
79	0.24
80	0.24
81	0.25
82	0.29
83	0.32
84	0.36
85	0.42
86	0.49
87	0.53
88	0.55
89	0.53
90	0.51
91	0.48
92	0.4
93	0.32
94	0.28
95	0.2
96	0.17
97	0.17
98	0.15
99	0.19
100	0.18
101	0.26
102	0.26
103	0.3
104	0.37
105	0.45
106	0.53
107	0.53
108	0.61
109	0.62
110	0.66
111	0.69
112	0.62
113	0.54
114	0.46
115	0.41
116	0.33
117	0.24
118	0.16
119	0.09
120	0.12
121	0.11
122	0.11
123	0.09
124	0.09
125	0.1
126	0.1
127	0.1
128	0.06
129	0.06
130	0.07
131	0.08
132	0.08
133	0.08
134	0.1
135	0.1
136	0.12
137	0.14
138	0.14
139	0.15
140	0.17
141	0.19
142	0.2
143	0.23
144	0.3
145	0.35
146	0.38
147	0.36
148	0.36
149	0.34
150	0.32
151	0.31
152	0.28
153	0.3
154	0.33
155	0.35
156	0.39
157	0.46
158	0.54
159	0.58
160	0.62
161	0.59
162	0.53
163	0.55
164	0.55
165	0.52
166	0.48
167	0.42
168	0.35
169	0.32
170	0.3
171	0.26
172	0.21
173	0.17
174	0.16
175	0.16
176	0.15
177	0.14
178	0.14
179	0.18
180	0.24
181	0.25
182	0.25
183	0.25
184	0.24
185	0.27
186	0.27
187	0.23
188	0.17
189	0.17
190	0.13
191	0.15
192	0.15
193	0.12
194	0.17
195	0.16
196	0.17
197	0.18
198	0.2
199	0.18
200	0.2
201	0.2
202	0.14
203	0.16
204	0.15
205	0.14
206	0.11
207	0.1
208	0.09
209	0.09
210	0.1
211	0.08
212	0.1
213	0.1
214	0.13
215	0.17
216	0.18
217	0.19
218	0.23
219	0.28
220	0.29
221	0.32
222	0.32
223	0.29
224	0.29
225	0.28
226	0.24
227	0.19
228	0.16
229	0.13
230	0.15
231	0.17
232	0.17
233	0.18
234	0.22
235	0.22
236	0.26
237	0.28
238	0.26
239	0.23
240	0.23
241	0.22
242	0.19
243	0.19
244	0.16
245	0.13
246	0.11
247	0.09
248	0.08
249	0.09
250	0.1
251	0.1
252	0.09
253	0.09
254	0.1
255	0.1
256	0.1
257	0.09
258	0.07
259	0.09
260	0.12
261	0.12
262	0.15
263	0.15
264	0.14
265	0.14
266	0.14
267	0.13
268	0.1
269	0.09
270	0.06
271	0.07
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.09
277	0.1
278	0.11
279	0.1
280	0.1
281	0.1
282	0.11
283	0.11
284	0.1
285	0.09
286	0.08
287	0.1
288	0.1
289	0.1
290	0.09
291	0.08
292	0.1
293	0.1
294	0.1
295	0.09
296	0.11
297	0.11
298	0.12
299	0.13
300	0.12
301	0.16
302	0.17
303	0.18
304	0.19
305	0.19
306	0.18
307	0.18
308	0.17
309	0.13
310	0.12
311	0.1
312	0.07
313	0.06
314	0.05
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.03
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.05
323	0.06
324	0.07
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.09
329	0.08
330	0.09
331	0.09
332	0.11
333	0.1
334	0.09
335	0.09
336	0.08
337	0.08
338	0.09
339	0.1
340	0.1
341	0.12
342	0.13
343	0.13
344	0.15
345	0.15
346	0.14
347	0.14
348	0.14
349	0.17
350	0.16
351	0.18
352	0.19
353	0.19
354	0.18
355	0.18
356	0.17
357	0.12
358	0.11
359	0.09
360	0.06
361	0.05
362	0.06
363	0.05
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.07
368	0.08
369	0.1
370	0.11
371	0.2
372	0.22
373	0.24
374	0.28
375	0.26
376	0.28
377	0.26
378	0.25
379	0.21
380	0.2
381	0.2
382	0.18
383	0.18
384	0.17
385	0.16
386	0.16
387	0.13
388	0.11
389	0.11
390	0.1
391	0.09
392	0.11
393	0.13
394	0.14
395	0.17
396	0.18
397	0.17
398	0.22
399	0.3
400	0.39
401	0.47
402	0.54
403	0.61
404	0.72
405	0.81
406	0.87
407	0.9
408	0.91
409	0.92
410	0.94
411	0.94
412	0.94
413	0.94
414	0.92
415	0.9
416	0.87
417	0.85
418	0.76
419	0.69
420	0.62
421	0.56
422	0.55
423	0.48
424	0.41
425	0.34
426	0.32
427	0.33
428	0.34
429	0.37
430	0.3
431	0.35
432	0.39
433	0.4
434	0.42
435	0.38
436	0.34
437	0.27
438	0.26
439	0.21
440	0.16
441	0.12
442	0.11
443	0.11
444	0.11
445	0.12
446	0.14
447	0.12
448	0.13
449	0.18
450	0.17
451	0.16
452	0.16
453	0.15
454	0.17
455	0.23
456	0.26
457	0.25
458	0.35
459	0.43
460	0.52
461	0.56
462	0.55
463	0.53
464	0.55
465	0.57
466	0.52
467	0.48
468	0.42
469	0.43
470	0.46
471	0.42
472	0.36
473	0.29
474	0.25
475	0.21
476	0.18
477	0.12
478	0.07
479	0.06
480	0.07
481	0.07
482	0.09
483	0.09
484	0.1
485	0.11
486	0.13
487	0.14
488	0.15
489	0.18
490	0.17
491	0.17
492	0.17
493	0.17
494	0.16
495	0.17
496	0.17
497	0.15
498	0.19
499	0.18
500	0.18
501	0.16
502	0.15
503	0.14
504	0.12

U1GPQ9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer