Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HQ11

Protein Details
Accession U1HQ11    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
68-101GGDVKEPQRKHRTSKRRKNKLRRIWKPPRVAELGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
74-96PQRKHRTSKRRKNKLRRIWKPPR
Subcellular Location(s) mito 19.5, mito_nucl 12.5, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR032741  Sls1  
Gene Ontology GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14611  SLS  
Amino Acid Sequences MWIRVPKDASVCLRCRLQITRSLLHQAPHCRRPDRPSPRTQSTAAAVVENIGEDTGEDAGEDIGENIGGDVKEPQRKHRTSKRRKNKLRRIWKPPRVAELGVSALGKPAEVLVLKDRDRHIPAATDDEAERSKASQPRILEALQAENIPLSSESVRQSLDQIADPYRNQSKALSGEQRVELKKKLMDGFTQEQLRSYCEIDNRPKLVTNTDSHASNSIGRPKPTGNSTPDGDPLKDVTAEKGLPKLGKAGLVDHILRHKWAFTSLADEQTEQYVPLPTQKLEYVLKHRQSLLKEVEEQFSVTIEVVGGNGRINIQGGLKQVTAARDALTSFCRDITHLRVRSASKGTDLKKVVTSSLLDHLTRTYNVMIAWAFKQGEDIIGHEGSLSICYHKTQDLQNALNAERTILLAERNSLPAIKDAEPQEKVSMWVWENSSQADLVLHHSPEQWNRLDQKTWSRWTFPQLPLGRGYIDSGSDLSAGHQMVKQLTSINKQSTTISKTLKGVLDEFFMDMSLKKKYGIRRLIDSSYVKEEIFAQIGKILFPHGKMTVADAFRPLGKFTKWKLLRAKTLNSTLMSPDIPGLPNFLASLAPFDEPESAIGGSNDQKHTRKYRLRYVPLTSQLFPGLQLPAIEIDVLRKGKSGSVVTDSIIGAWAVLAEQSHKLLLPAFTVDLLFGRRLKRKLSIIPSEDDIRPHSTAGLEEFGQQIKNSDSDKFSPFLKVDIRKYTVKYSLLQDDAGNHKDQVIQHGSDQRESIKGLTNALGPLQEPAGLASGNPSYTTTNAPNNIDYMLESWNVVHSTPFRSKRLCLEHLRLEGMNADEDQHILRLSRQPLLASDIRQLNITLLLERAFKTAALLSDPRLLDQSNEPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.49
3 0.48
4 0.44
5 0.45
6 0.48
7 0.49
8 0.49
9 0.54
10 0.51
11 0.49
12 0.52
13 0.54
14 0.55
15 0.58
16 0.62
17 0.59
18 0.63
19 0.67
20 0.71
21 0.72
22 0.72
23 0.75
24 0.76
25 0.8
26 0.79
27 0.73
28 0.67
29 0.59
30 0.56
31 0.46
32 0.37
33 0.29
34 0.24
35 0.22
36 0.17
37 0.13
38 0.07
39 0.06
40 0.05
41 0.06
42 0.06
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.06
48 0.06
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.04
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.13
58 0.19
59 0.27
60 0.29
61 0.39
62 0.47
63 0.54
64 0.63
65 0.69
66 0.74
67 0.78
68 0.88
69 0.89
70 0.9
71 0.95
72 0.97
73 0.97
74 0.97
75 0.97
76 0.96
77 0.96
78 0.96
79 0.94
80 0.93
81 0.88
82 0.84
83 0.78
84 0.69
85 0.59
86 0.52
87 0.44
88 0.35
89 0.29
90 0.21
91 0.17
92 0.16
93 0.13
94 0.1
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.11
99 0.15
100 0.22
101 0.23
102 0.29
103 0.31
104 0.35
105 0.38
106 0.39
107 0.34
108 0.33
109 0.34
110 0.35
111 0.34
112 0.29
113 0.25
114 0.27
115 0.25
116 0.22
117 0.2
118 0.16
119 0.21
120 0.24
121 0.28
122 0.29
123 0.29
124 0.33
125 0.36
126 0.35
127 0.31
128 0.27
129 0.27
130 0.24
131 0.22
132 0.18
133 0.14
134 0.14
135 0.12
136 0.11
137 0.09
138 0.09
139 0.12
140 0.14
141 0.16
142 0.17
143 0.16
144 0.18
145 0.19
146 0.2
147 0.19
148 0.2
149 0.21
150 0.23
151 0.23
152 0.27
153 0.29
154 0.28
155 0.27
156 0.26
157 0.27
158 0.29
159 0.36
160 0.37
161 0.34
162 0.37
163 0.4
164 0.46
165 0.45
166 0.44
167 0.39
168 0.36
169 0.36
170 0.37
171 0.38
172 0.34
173 0.33
174 0.36
175 0.38
176 0.4
177 0.41
178 0.36
179 0.34
180 0.33
181 0.32
182 0.27
183 0.24
184 0.21
185 0.23
186 0.3
187 0.36
188 0.42
189 0.42
190 0.41
191 0.43
192 0.41
193 0.41
194 0.38
195 0.32
196 0.3
197 0.3
198 0.3
199 0.27
200 0.28
201 0.24
202 0.23
203 0.25
204 0.29
205 0.31
206 0.31
207 0.33
208 0.33
209 0.36
210 0.38
211 0.41
212 0.36
213 0.36
214 0.37
215 0.37
216 0.4
217 0.38
218 0.33
219 0.27
220 0.23
221 0.2
222 0.2
223 0.18
224 0.15
225 0.16
226 0.16
227 0.16
228 0.17
229 0.19
230 0.17
231 0.17
232 0.19
233 0.16
234 0.18
235 0.17
236 0.17
237 0.17
238 0.2
239 0.2
240 0.18
241 0.22
242 0.19
243 0.2
244 0.19
245 0.17
246 0.14
247 0.16
248 0.16
249 0.12
250 0.18
251 0.19
252 0.23
253 0.22
254 0.22
255 0.21
256 0.21
257 0.2
258 0.14
259 0.13
260 0.1
261 0.1
262 0.14
263 0.15
264 0.14
265 0.15
266 0.16
267 0.19
268 0.21
269 0.25
270 0.29
271 0.36
272 0.39
273 0.39
274 0.41
275 0.42
276 0.41
277 0.44
278 0.4
279 0.34
280 0.36
281 0.35
282 0.34
283 0.3
284 0.29
285 0.21
286 0.17
287 0.14
288 0.09
289 0.07
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.09
303 0.1
304 0.12
305 0.11
306 0.12
307 0.13
308 0.13
309 0.14
310 0.12
311 0.11
312 0.1
313 0.1
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.14
322 0.2
323 0.28
324 0.29
325 0.3
326 0.33
327 0.34
328 0.37
329 0.38
330 0.31
331 0.26
332 0.3
333 0.31
334 0.35
335 0.35
336 0.32
337 0.32
338 0.32
339 0.27
340 0.22
341 0.21
342 0.15
343 0.18
344 0.19
345 0.16
346 0.15
347 0.16
348 0.16
349 0.15
350 0.15
351 0.11
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.11
359 0.1
360 0.09
361 0.1
362 0.09
363 0.11
364 0.09
365 0.1
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.07
372 0.08
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.08
378 0.09
379 0.12
380 0.13
381 0.19
382 0.23
383 0.24
384 0.25
385 0.26
386 0.25
387 0.24
388 0.21
389 0.15
390 0.1
391 0.09
392 0.08
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.07
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.1
403 0.13
404 0.13
405 0.16
406 0.18
407 0.22
408 0.23
409 0.23
410 0.22
411 0.18
412 0.19
413 0.15
414 0.16
415 0.12
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.15
420 0.14
421 0.13
422 0.1
423 0.1
424 0.08
425 0.07
426 0.08
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.1
431 0.12
432 0.14
433 0.17
434 0.15
435 0.17
436 0.2
437 0.22
438 0.23
439 0.23
440 0.3
441 0.33
442 0.37
443 0.36
444 0.36
445 0.35
446 0.4
447 0.45
448 0.37
449 0.4
450 0.36
451 0.36
452 0.34
453 0.33
454 0.28
455 0.2
456 0.2
457 0.11
458 0.1
459 0.08
460 0.07
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.07
466 0.07
467 0.08
468 0.08
469 0.09
470 0.1
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.12
475 0.16
476 0.19
477 0.2
478 0.2
479 0.21
480 0.22
481 0.23
482 0.25
483 0.26
484 0.24
485 0.24
486 0.25
487 0.27
488 0.27
489 0.23
490 0.21
491 0.17
492 0.16
493 0.14
494 0.13
495 0.1
496 0.09
497 0.08
498 0.07
499 0.08
500 0.09
501 0.09
502 0.1
503 0.14
504 0.2
505 0.3
506 0.37
507 0.38
508 0.42
509 0.47
510 0.47
511 0.49
512 0.44
513 0.37
514 0.33
515 0.31
516 0.25
517 0.21
518 0.2
519 0.15
520 0.15
521 0.13
522 0.09
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.09
527 0.1
528 0.09
529 0.1
530 0.12
531 0.1
532 0.11
533 0.11
534 0.14
535 0.18
536 0.17
537 0.17
538 0.16
539 0.16
540 0.17
541 0.17
542 0.15
543 0.13
544 0.14
545 0.2
546 0.21
547 0.31
548 0.32
549 0.39
550 0.47
551 0.51
552 0.58
553 0.58
554 0.61
555 0.55
556 0.58
557 0.54
558 0.45
559 0.4
560 0.31
561 0.28
562 0.22
563 0.17
564 0.13
565 0.11
566 0.11
567 0.1
568 0.11
569 0.1
570 0.1
571 0.09
572 0.09
573 0.08
574 0.07
575 0.09
576 0.08
577 0.08
578 0.08
579 0.09
580 0.09
581 0.09
582 0.09
583 0.09
584 0.08
585 0.08
586 0.08
587 0.09
588 0.12
589 0.16
590 0.18
591 0.22
592 0.24
593 0.3
594 0.37
595 0.45
596 0.5
597 0.53
598 0.61
599 0.66
600 0.72
601 0.72
602 0.71
603 0.69
604 0.68
605 0.65
606 0.56
607 0.46
608 0.4
609 0.34
610 0.28
611 0.22
612 0.15
613 0.11
614 0.1
615 0.09
616 0.08
617 0.08
618 0.08
619 0.06
620 0.07
621 0.12
622 0.13
623 0.12
624 0.13
625 0.13
626 0.15
627 0.19
628 0.19
629 0.17
630 0.2
631 0.21
632 0.2
633 0.22
634 0.2
635 0.16
636 0.14
637 0.12
638 0.07
639 0.06
640 0.05
641 0.03
642 0.04
643 0.04
644 0.05
645 0.06
646 0.07
647 0.07
648 0.07
649 0.08
650 0.1
651 0.1
652 0.1
653 0.1
654 0.1
655 0.1
656 0.1
657 0.1
658 0.09
659 0.1
660 0.11
661 0.13
662 0.19
663 0.26
664 0.29
665 0.32
666 0.38
667 0.43
668 0.49
669 0.55
670 0.58
671 0.55
672 0.55
673 0.55
674 0.52
675 0.47
676 0.39
677 0.34
678 0.29
679 0.26
680 0.23
681 0.2
682 0.17
683 0.17
684 0.17
685 0.16
686 0.12
687 0.13
688 0.14
689 0.15
690 0.15
691 0.14
692 0.14
693 0.13
694 0.16
695 0.16
696 0.18
697 0.21
698 0.24
699 0.27
700 0.27
701 0.26
702 0.27
703 0.26
704 0.27
705 0.31
706 0.34
707 0.38
708 0.44
709 0.47
710 0.47
711 0.5
712 0.52
713 0.51
714 0.46
715 0.44
716 0.41
717 0.43
718 0.4
719 0.38
720 0.32
721 0.31
722 0.34
723 0.33
724 0.29
725 0.22
726 0.22
727 0.24
728 0.24
729 0.27
730 0.26
731 0.25
732 0.28
733 0.35
734 0.36
735 0.34
736 0.35
737 0.29
738 0.26
739 0.26
740 0.24
741 0.24
742 0.23
743 0.24
744 0.24
745 0.24
746 0.22
747 0.22
748 0.2
749 0.13
750 0.13
751 0.12
752 0.11
753 0.09
754 0.09
755 0.1
756 0.09
757 0.08
758 0.1
759 0.11
760 0.1
761 0.11
762 0.12
763 0.12
764 0.14
765 0.19
766 0.21
767 0.26
768 0.31
769 0.33
770 0.32
771 0.31
772 0.3
773 0.26
774 0.22
775 0.17
776 0.14
777 0.12
778 0.12
779 0.11
780 0.13
781 0.13
782 0.13
783 0.14
784 0.14
785 0.21
786 0.31
787 0.37
788 0.4
789 0.43
790 0.46
791 0.53
792 0.6
793 0.61
794 0.6
795 0.62
796 0.64
797 0.64
798 0.64
799 0.55
800 0.47
801 0.41
802 0.34
803 0.27
804 0.19
805 0.17
806 0.14
807 0.15
808 0.15
809 0.13
810 0.12
811 0.11
812 0.15
813 0.21
814 0.24
815 0.27
816 0.28
817 0.28
818 0.29
819 0.35
820 0.35
821 0.3
822 0.35
823 0.34
824 0.34
825 0.33
826 0.32
827 0.26
828 0.25
829 0.24
830 0.18
831 0.14
832 0.16
833 0.17
834 0.18
835 0.18
836 0.16
837 0.14
838 0.16
839 0.17
840 0.17
841 0.2
842 0.21
843 0.22
844 0.28
845 0.29
846 0.28
847 0.27
848 0.26
849 0.24