Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HPQ2

Protein Details
Accession U1HPQ2    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-117LTTRAFQQVPRKMRRRTASHNVKKVPRRLRRRAEKEMKEDNTPHydrophilic
137-166AKRIKAMSSKHKSARARKKEAKRNAQETDPHydrophilic
183-208LADPPKATSKFKKRQIHKTWLPTHLWHydrophilic
626-647EAEKRYNIWKRKPPSRRVNYDAHydrophilic
800-822DSHSNPCTKTKKIKTNWRGDTANHydrophilic
850-879ELEKKKGELRAKREKFQKQKLEKRAKAGGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-160RKMRRRTASHNVKKVPRRLRRRAEKEMKEDNTPTVTARRRIPSTKMRLRLQTAKRIKAMSSKHKSARARKKEAKRN
178-197IKRNRLADPPKATSKFKKRQ
853-879KKKGELRAKREKFQKQKLEKRAKAGGR
Subcellular Location(s) mito 13.5, mito_nucl 12.833, nucl 11, cyto_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MSTRAQKREAPEASEASSSVARKRQKTQAIRAIPSQSTDAALSVTGELDVASFVKAREYEINALEKSMQNTRHGLTTRAFQQVPRKMRRRTASHNVKKVPRRLRRRAEKEMKEDNTPTVTARRRIPSTKMRLRLQTAKRIKAMSSKHKSARARKKEAKRNAQETDPEARLSTTIVPRIKRNRLADPPKATSKFKKRQIHKTWLPTHLWHAKRAHMTRPSEPLWRMAIPLSPTEKSYRPSHRASGGRGAVAWDMSYMATIGCEGPEPALVAMLKAVGFGRDDLWASKGKRWRNGVRSASGWAYERDNDKRTITPMTVLWEYQHNKSSVDSSQEPMVDTIASEMEHAANRHASNPSLPNKFKPAKKKVLLRVHPSAFHQLWTELFKVAKMQRPPIVLEDLRFEIASLEVTGPASTEALYAVLQPTVASDEPIPSSARTWTRLPGLTNPASLPLGAILGFKTSDPRLTHPRKPIAIKTDQNSNDELTDLMMDWPPDNGVVQADIFSHKARRTASRSLPSQKAVNRRKGLTLPGETPEPKETDPHVPVMLLACRPNPSASGAQGTWTVLLPWKCLDPIWRCLMYYPLSSGGTVRFGGLDETRQIALERNEPWFPGDFPATEAGKAWERTEAEKRYNIWKRKPPSRRVNYDALKLDNKGKGEHGNGWACDWSFLLGFDVDKSNPHPHVEEISGSTNIASSEHGPSTNPGTFESKDTTQDTNEKHTHSSATSATPVSQLSPERAKIFLDSSFNTIPTSPTNKAHLATIRIDLLTRGTPFPCARIYRLPFRSSSGTSALCYKWLALDSHSNPCTKTKKIKTNWRGDTANHSAYPNEYAEINAINYQPPNMVPEAIVELEKKKGELRAKREKFQKQKLEKRAKAGGRGEEDIEGMTAEERETLMEELMRPSADKDQDGSVPDCPGGEDLIGFVTSGGYNLRVGRGTGVGAIWAERVLEGWGRGSQDMQGRGAGSTRDVKRLDRERRLCVVRNAGETAGRLGLWELCE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.37
3 0.29
4 0.29
5 0.26
6 0.26
7 0.31
8 0.36
9 0.41
10 0.49
11 0.56
12 0.62
13 0.7
14 0.75
15 0.78
16 0.79
17 0.78
18 0.76
19 0.72
20 0.63
21 0.55
22 0.47
23 0.37
24 0.3
25 0.26
26 0.21
27 0.15
28 0.14
29 0.12
30 0.1
31 0.09
32 0.07
33 0.07
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.07
40 0.07
41 0.11
42 0.12
43 0.15
44 0.2
45 0.24
46 0.28
47 0.31
48 0.36
49 0.33
50 0.33
51 0.33
52 0.31
53 0.3
54 0.32
55 0.31
56 0.3
57 0.33
58 0.34
59 0.38
60 0.37
61 0.37
62 0.32
63 0.35
64 0.37
65 0.41
66 0.4
67 0.37
68 0.46
69 0.52
70 0.59
71 0.63
72 0.67
73 0.67
74 0.76
75 0.81
76 0.8
77 0.8
78 0.81
79 0.82
80 0.84
81 0.86
82 0.86
83 0.86
84 0.86
85 0.86
86 0.85
87 0.84
88 0.85
89 0.86
90 0.88
91 0.9
92 0.91
93 0.92
94 0.92
95 0.91
96 0.89
97 0.89
98 0.81
99 0.76
100 0.68
101 0.6
102 0.52
103 0.43
104 0.37
105 0.35
106 0.38
107 0.37
108 0.42
109 0.46
110 0.49
111 0.53
112 0.6
113 0.61
114 0.66
115 0.7
116 0.71
117 0.71
118 0.72
119 0.74
120 0.76
121 0.73
122 0.73
123 0.73
124 0.71
125 0.69
126 0.64
127 0.58
128 0.57
129 0.58
130 0.59
131 0.59
132 0.61
133 0.63
134 0.69
135 0.76
136 0.79
137 0.81
138 0.8
139 0.82
140 0.83
141 0.88
142 0.9
143 0.92
144 0.92
145 0.9
146 0.88
147 0.82
148 0.77
149 0.71
150 0.65
151 0.62
152 0.52
153 0.43
154 0.34
155 0.3
156 0.25
157 0.22
158 0.23
159 0.2
160 0.25
161 0.29
162 0.32
163 0.4
164 0.49
165 0.56
166 0.59
167 0.6
168 0.63
169 0.69
170 0.75
171 0.75
172 0.74
173 0.71
174 0.72
175 0.71
176 0.67
177 0.67
178 0.69
179 0.7
180 0.72
181 0.76
182 0.76
183 0.82
184 0.86
185 0.87
186 0.85
187 0.86
188 0.83
189 0.8
190 0.75
191 0.66
192 0.64
193 0.63
194 0.56
195 0.52
196 0.47
197 0.47
198 0.52
199 0.54
200 0.54
201 0.52
202 0.56
203 0.53
204 0.57
205 0.54
206 0.51
207 0.49
208 0.44
209 0.4
210 0.35
211 0.31
212 0.26
213 0.26
214 0.21
215 0.24
216 0.25
217 0.22
218 0.23
219 0.26
220 0.28
221 0.29
222 0.35
223 0.4
224 0.42
225 0.46
226 0.49
227 0.53
228 0.55
229 0.55
230 0.56
231 0.48
232 0.42
233 0.38
234 0.34
235 0.26
236 0.22
237 0.17
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.11
270 0.17
271 0.18
272 0.24
273 0.29
274 0.34
275 0.4
276 0.48
277 0.56
278 0.57
279 0.65
280 0.65
281 0.62
282 0.58
283 0.54
284 0.46
285 0.38
286 0.32
287 0.24
288 0.21
289 0.2
290 0.24
291 0.26
292 0.28
293 0.29
294 0.3
295 0.3
296 0.3
297 0.3
298 0.26
299 0.23
300 0.21
301 0.22
302 0.21
303 0.19
304 0.18
305 0.22
306 0.24
307 0.25
308 0.28
309 0.24
310 0.24
311 0.25
312 0.27
313 0.21
314 0.24
315 0.23
316 0.2
317 0.22
318 0.22
319 0.21
320 0.18
321 0.17
322 0.11
323 0.09
324 0.08
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.11
334 0.12
335 0.14
336 0.15
337 0.14
338 0.16
339 0.22
340 0.28
341 0.33
342 0.34
343 0.34
344 0.42
345 0.48
346 0.51
347 0.55
348 0.57
349 0.6
350 0.66
351 0.72
352 0.73
353 0.77
354 0.79
355 0.75
356 0.74
357 0.66
358 0.6
359 0.54
360 0.51
361 0.4
362 0.34
363 0.28
364 0.2
365 0.2
366 0.2
367 0.19
368 0.13
369 0.13
370 0.12
371 0.16
372 0.2
373 0.24
374 0.24
375 0.28
376 0.3
377 0.32
378 0.33
379 0.3
380 0.32
381 0.26
382 0.24
383 0.23
384 0.2
385 0.19
386 0.17
387 0.15
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.06
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.04
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.06
414 0.08
415 0.08
416 0.1
417 0.1
418 0.08
419 0.09
420 0.13
421 0.14
422 0.17
423 0.18
424 0.19
425 0.22
426 0.23
427 0.24
428 0.25
429 0.29
430 0.26
431 0.26
432 0.24
433 0.21
434 0.19
435 0.18
436 0.13
437 0.07
438 0.06
439 0.05
440 0.05
441 0.04
442 0.04
443 0.05
444 0.05
445 0.07
446 0.07
447 0.11
448 0.13
449 0.17
450 0.27
451 0.33
452 0.4
453 0.45
454 0.5
455 0.5
456 0.52
457 0.53
458 0.49
459 0.5
460 0.48
461 0.42
462 0.45
463 0.43
464 0.41
465 0.37
466 0.31
467 0.24
468 0.2
469 0.18
470 0.09
471 0.07
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.05
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.1
491 0.1
492 0.14
493 0.15
494 0.21
495 0.26
496 0.32
497 0.39
498 0.42
499 0.47
500 0.5
501 0.51
502 0.47
503 0.45
504 0.42
505 0.46
506 0.48
507 0.51
508 0.49
509 0.47
510 0.48
511 0.45
512 0.45
513 0.39
514 0.35
515 0.27
516 0.25
517 0.27
518 0.24
519 0.24
520 0.22
521 0.18
522 0.16
523 0.16
524 0.17
525 0.21
526 0.21
527 0.21
528 0.19
529 0.17
530 0.17
531 0.16
532 0.15
533 0.1
534 0.1
535 0.1
536 0.11
537 0.12
538 0.12
539 0.11
540 0.13
541 0.13
542 0.13
543 0.15
544 0.14
545 0.14
546 0.14
547 0.13
548 0.11
549 0.09
550 0.09
551 0.09
552 0.1
553 0.1
554 0.1
555 0.1
556 0.1
557 0.1
558 0.17
559 0.17
560 0.21
561 0.26
562 0.26
563 0.25
564 0.25
565 0.28
566 0.24
567 0.2
568 0.17
569 0.14
570 0.14
571 0.14
572 0.14
573 0.12
574 0.11
575 0.11
576 0.09
577 0.07
578 0.07
579 0.08
580 0.08
581 0.09
582 0.08
583 0.09
584 0.09
585 0.1
586 0.1
587 0.12
588 0.13
589 0.16
590 0.17
591 0.18
592 0.18
593 0.18
594 0.19
595 0.17
596 0.16
597 0.14
598 0.14
599 0.11
600 0.12
601 0.16
602 0.15
603 0.14
604 0.14
605 0.13
606 0.16
607 0.17
608 0.16
609 0.15
610 0.16
611 0.2
612 0.28
613 0.3
614 0.3
615 0.33
616 0.35
617 0.41
618 0.49
619 0.53
620 0.54
621 0.59
622 0.64
623 0.71
624 0.78
625 0.78
626 0.8
627 0.82
628 0.81
629 0.78
630 0.8
631 0.73
632 0.7
633 0.63
634 0.56
635 0.48
636 0.41
637 0.4
638 0.33
639 0.31
640 0.25
641 0.24
642 0.24
643 0.25
644 0.27
645 0.28
646 0.29
647 0.28
648 0.27
649 0.26
650 0.22
651 0.2
652 0.16
653 0.11
654 0.08
655 0.08
656 0.08
657 0.07
658 0.07
659 0.07
660 0.09
661 0.09
662 0.1
663 0.13
664 0.17
665 0.18
666 0.2
667 0.2
668 0.2
669 0.22
670 0.22
671 0.2
672 0.18
673 0.19
674 0.17
675 0.16
676 0.15
677 0.12
678 0.11
679 0.1
680 0.08
681 0.08
682 0.1
683 0.11
684 0.12
685 0.12
686 0.13
687 0.18
688 0.19
689 0.17
690 0.17
691 0.2
692 0.21
693 0.23
694 0.26
695 0.23
696 0.24
697 0.27
698 0.26
699 0.25
700 0.3
701 0.3
702 0.33
703 0.35
704 0.33
705 0.32
706 0.31
707 0.31
708 0.25
709 0.26
710 0.2
711 0.19
712 0.19
713 0.17
714 0.17
715 0.16
716 0.16
717 0.14
718 0.15
719 0.14
720 0.16
721 0.2
722 0.22
723 0.22
724 0.23
725 0.23
726 0.21
727 0.22
728 0.21
729 0.2
730 0.19
731 0.23
732 0.23
733 0.23
734 0.22
735 0.2
736 0.18
737 0.19
738 0.24
739 0.22
740 0.24
741 0.29
742 0.3
743 0.3
744 0.33
745 0.32
746 0.3
747 0.29
748 0.28
749 0.24
750 0.22
751 0.22
752 0.18
753 0.17
754 0.15
755 0.15
756 0.15
757 0.14
758 0.19
759 0.2
760 0.22
761 0.25
762 0.25
763 0.28
764 0.35
765 0.4
766 0.45
767 0.5
768 0.5
769 0.46
770 0.48
771 0.48
772 0.41
773 0.4
774 0.34
775 0.29
776 0.28
777 0.31
778 0.26
779 0.22
780 0.21
781 0.17
782 0.15
783 0.16
784 0.16
785 0.15
786 0.23
787 0.25
788 0.34
789 0.36
790 0.35
791 0.34
792 0.4
793 0.43
794 0.41
795 0.48
796 0.5
797 0.58
798 0.67
799 0.77
800 0.8
801 0.86
802 0.86
803 0.83
804 0.76
805 0.67
806 0.66
807 0.62
808 0.56
809 0.46
810 0.39
811 0.32
812 0.31
813 0.32
814 0.24
815 0.18
816 0.14
817 0.12
818 0.13
819 0.14
820 0.13
821 0.12
822 0.12
823 0.13
824 0.13
825 0.14
826 0.13
827 0.13
828 0.15
829 0.14
830 0.14
831 0.12
832 0.13
833 0.15
834 0.15
835 0.15
836 0.14
837 0.14
838 0.18
839 0.18
840 0.18
841 0.18
842 0.24
843 0.33
844 0.4
845 0.48
846 0.56
847 0.62
848 0.7
849 0.77
850 0.8
851 0.82
852 0.83
853 0.85
854 0.84
855 0.88
856 0.91
857 0.92
858 0.87
859 0.84
860 0.83
861 0.77
862 0.75
863 0.71
864 0.67
865 0.61
866 0.58
867 0.52
868 0.43
869 0.38
870 0.29
871 0.22
872 0.15
873 0.1
874 0.08
875 0.07
876 0.06
877 0.06
878 0.06
879 0.07
880 0.08
881 0.09
882 0.09
883 0.1
884 0.11
885 0.13
886 0.14
887 0.14
888 0.12
889 0.14
890 0.21
891 0.22
892 0.22
893 0.23
894 0.25
895 0.27
896 0.31
897 0.3
898 0.25
899 0.23
900 0.22
901 0.2
902 0.18
903 0.15
904 0.12
905 0.1
906 0.08
907 0.07
908 0.08
909 0.08
910 0.07
911 0.07
912 0.07
913 0.06
914 0.07
915 0.08
916 0.08
917 0.1
918 0.11
919 0.13
920 0.13
921 0.14
922 0.15
923 0.15
924 0.15
925 0.14
926 0.13
927 0.12
928 0.11
929 0.11
930 0.09
931 0.08
932 0.08
933 0.07
934 0.07
935 0.08
936 0.1
937 0.1
938 0.12
939 0.15
940 0.17
941 0.17
942 0.17
943 0.2
944 0.25
945 0.27
946 0.26
947 0.25
948 0.24
949 0.24
950 0.25
951 0.22
952 0.19
953 0.25
954 0.27
955 0.33
956 0.34
957 0.38
958 0.46
959 0.55
960 0.62
961 0.64
962 0.68
963 0.68
964 0.75
965 0.79
966 0.76
967 0.73
968 0.73
969 0.67
970 0.64
971 0.59
972 0.51
973 0.46
974 0.4
975 0.35
976 0.26
977 0.2
978 0.16
979 0.15