Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GMH2

Protein Details
Accession U1GMH2    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSPRRSSRARTTQPPPPPAHHydrophilic
66-86GEPPATRRSKRSNTNEKEEVTHydrophilic
220-240SSSSNRDKTRRRDGKSRQSASHydrophilic
411-430QPTNHRKTGRPPARRGRLGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
331-372KRARGAAARNPRDKEHRDRQKDLAAQRAEAASKRNARSERRR
416-427RKTGRPPARRGR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003903  UIM_dom  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50330  UIM  
Amino Acid Sequences MSPRRSSRARTTQPPPPPAHTNSSTSLSSLTRAERNTRANNKPTSPQDSATQSSESIEDAERLGRGEPPATRRSKRSNTNEKEEVTKKAQQPDVDEEAESEEVTRCICGNAEYPGPPPFARDGGRPHSAKAGIKEETAPKIPAGSDGLLDDTGNFFIQCDNCQVWQHGGCVGLLDESMSPDEYFCEECKPEYHKIHRISTGPRSSQYLPVLEASSPEPSSSSSNRDKTRRRDGKSRQSASSVSGKRRATMNSRDAAYDEDEMLRRAIEESRETGSLGKRTRDDSEDGKPNSKRRRTSSDSLPPSKVTPSPSQVNSEEDSSKPTANGSNVVKRARGAAARNPRDKEHRDRQKDLAAQRAEAASKRNARSERRRGDESPPPTPTLSPSKTAGQVPNGPQKSSAPDTPSHRANQPTNHRKTGRPPARRGRLGRNQYTRDQPLNGGGGGAETPLRDTSRGPTRRSSPVTAMNGFSNGINGESGRSSRPKYHHPNRTSMNEMKRRVAAILEFVNKMNGEKSSQNNSHGSSTGPSGSRTPNGITQSSGSGAHGNVQPTALLKGVEASLSAAQVLGEKAEREFRDMASGEMMHVLTRELVGWQSMYGKYGEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.75
3 0.71
4 0.7
5 0.65
6 0.66
7 0.61
8 0.56
9 0.52
10 0.51
11 0.45
12 0.38
13 0.36
14 0.28
15 0.26
16 0.25
17 0.25
18 0.26
19 0.29
20 0.35
21 0.4
22 0.47
23 0.55
24 0.61
25 0.66
26 0.69
27 0.73
28 0.71
29 0.72
30 0.71
31 0.69
32 0.64
33 0.57
34 0.55
35 0.53
36 0.52
37 0.46
38 0.4
39 0.32
40 0.29
41 0.27
42 0.22
43 0.18
44 0.15
45 0.13
46 0.12
47 0.13
48 0.12
49 0.13
50 0.13
51 0.14
52 0.15
53 0.17
54 0.21
55 0.26
56 0.35
57 0.42
58 0.46
59 0.51
60 0.6
61 0.66
62 0.72
63 0.76
64 0.79
65 0.79
66 0.83
67 0.82
68 0.74
69 0.73
70 0.66
71 0.61
72 0.56
73 0.56
74 0.52
75 0.54
76 0.56
77 0.5
78 0.52
79 0.53
80 0.52
81 0.45
82 0.39
83 0.31
84 0.3
85 0.27
86 0.22
87 0.15
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.08
93 0.08
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.14
98 0.17
99 0.17
100 0.19
101 0.21
102 0.24
103 0.21
104 0.22
105 0.21
106 0.22
107 0.23
108 0.25
109 0.3
110 0.33
111 0.41
112 0.39
113 0.38
114 0.4
115 0.42
116 0.41
117 0.38
118 0.38
119 0.32
120 0.32
121 0.35
122 0.34
123 0.34
124 0.33
125 0.29
126 0.23
127 0.23
128 0.22
129 0.2
130 0.19
131 0.15
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.12
136 0.11
137 0.1
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.13
147 0.14
148 0.16
149 0.18
150 0.19
151 0.2
152 0.21
153 0.21
154 0.18
155 0.17
156 0.15
157 0.14
158 0.13
159 0.09
160 0.07
161 0.07
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.13
173 0.13
174 0.14
175 0.18
176 0.22
177 0.28
178 0.35
179 0.42
180 0.47
181 0.52
182 0.56
183 0.56
184 0.55
185 0.53
186 0.54
187 0.54
188 0.47
189 0.43
190 0.43
191 0.41
192 0.42
193 0.38
194 0.3
195 0.24
196 0.24
197 0.23
198 0.18
199 0.18
200 0.14
201 0.14
202 0.12
203 0.11
204 0.1
205 0.11
206 0.15
207 0.16
208 0.21
209 0.26
210 0.33
211 0.39
212 0.48
213 0.54
214 0.59
215 0.68
216 0.71
217 0.7
218 0.74
219 0.78
220 0.8
221 0.83
222 0.79
223 0.7
224 0.63
225 0.58
226 0.51
227 0.5
228 0.44
229 0.37
230 0.4
231 0.38
232 0.36
233 0.38
234 0.39
235 0.36
236 0.39
237 0.41
238 0.37
239 0.38
240 0.36
241 0.34
242 0.31
243 0.26
244 0.19
245 0.14
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.09
251 0.07
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.12
257 0.13
258 0.14
259 0.14
260 0.15
261 0.16
262 0.2
263 0.21
264 0.22
265 0.21
266 0.24
267 0.26
268 0.26
269 0.27
270 0.25
271 0.29
272 0.35
273 0.35
274 0.39
275 0.4
276 0.45
277 0.51
278 0.54
279 0.53
280 0.51
281 0.59
282 0.6
283 0.62
284 0.64
285 0.65
286 0.66
287 0.64
288 0.59
289 0.51
290 0.44
291 0.4
292 0.33
293 0.27
294 0.23
295 0.23
296 0.26
297 0.27
298 0.3
299 0.29
300 0.3
301 0.26
302 0.25
303 0.22
304 0.18
305 0.2
306 0.17
307 0.16
308 0.13
309 0.13
310 0.13
311 0.12
312 0.17
313 0.17
314 0.21
315 0.25
316 0.26
317 0.26
318 0.24
319 0.25
320 0.22
321 0.23
322 0.2
323 0.25
324 0.34
325 0.41
326 0.46
327 0.47
328 0.47
329 0.51
330 0.54
331 0.55
332 0.55
333 0.59
334 0.61
335 0.64
336 0.64
337 0.64
338 0.64
339 0.57
340 0.55
341 0.45
342 0.37
343 0.34
344 0.31
345 0.25
346 0.2
347 0.21
348 0.18
349 0.24
350 0.25
351 0.31
352 0.36
353 0.43
354 0.53
355 0.6
356 0.63
357 0.62
358 0.67
359 0.63
360 0.64
361 0.64
362 0.59
363 0.55
364 0.48
365 0.44
366 0.39
367 0.36
368 0.34
369 0.34
370 0.3
371 0.27
372 0.27
373 0.28
374 0.3
375 0.33
376 0.32
377 0.27
378 0.3
379 0.33
380 0.4
381 0.39
382 0.36
383 0.33
384 0.32
385 0.34
386 0.32
387 0.3
388 0.24
389 0.27
390 0.33
391 0.37
392 0.4
393 0.37
394 0.37
395 0.4
396 0.41
397 0.45
398 0.5
399 0.56
400 0.59
401 0.64
402 0.63
403 0.61
404 0.65
405 0.68
406 0.67
407 0.66
408 0.69
409 0.71
410 0.78
411 0.82
412 0.79
413 0.78
414 0.78
415 0.78
416 0.78
417 0.76
418 0.71
419 0.68
420 0.7
421 0.66
422 0.59
423 0.51
424 0.42
425 0.37
426 0.33
427 0.28
428 0.21
429 0.15
430 0.12
431 0.1
432 0.09
433 0.06
434 0.04
435 0.06
436 0.08
437 0.09
438 0.09
439 0.1
440 0.17
441 0.27
442 0.33
443 0.35
444 0.4
445 0.45
446 0.53
447 0.57
448 0.55
449 0.5
450 0.52
451 0.54
452 0.5
453 0.46
454 0.38
455 0.34
456 0.3
457 0.24
458 0.16
459 0.11
460 0.09
461 0.08
462 0.07
463 0.08
464 0.09
465 0.1
466 0.13
467 0.17
468 0.2
469 0.27
470 0.32
471 0.41
472 0.51
473 0.6
474 0.67
475 0.68
476 0.73
477 0.73
478 0.74
479 0.71
480 0.68
481 0.68
482 0.66
483 0.65
484 0.6
485 0.56
486 0.5
487 0.44
488 0.38
489 0.29
490 0.25
491 0.27
492 0.26
493 0.25
494 0.24
495 0.25
496 0.23
497 0.23
498 0.2
499 0.16
500 0.16
501 0.2
502 0.26
503 0.33
504 0.37
505 0.41
506 0.42
507 0.43
508 0.42
509 0.38
510 0.33
511 0.26
512 0.25
513 0.25
514 0.22
515 0.21
516 0.22
517 0.26
518 0.27
519 0.28
520 0.28
521 0.29
522 0.32
523 0.32
524 0.3
525 0.28
526 0.27
527 0.26
528 0.24
529 0.19
530 0.17
531 0.16
532 0.19
533 0.2
534 0.2
535 0.18
536 0.18
537 0.17
538 0.17
539 0.18
540 0.14
541 0.11
542 0.1
543 0.11
544 0.11
545 0.11
546 0.1
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.1
551 0.08
552 0.08
553 0.09
554 0.09
555 0.09
556 0.09
557 0.1
558 0.12
559 0.2
560 0.21
561 0.24
562 0.26
563 0.25
564 0.3
565 0.3
566 0.29
567 0.25
568 0.25
569 0.2
570 0.21
571 0.2
572 0.14
573 0.13
574 0.13
575 0.09
576 0.1
577 0.09
578 0.08
579 0.09
580 0.1
581 0.1
582 0.11
583 0.14
584 0.15
585 0.16