Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HW30

Protein Details
Accession U1HW30    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
387-437EEERKRLAEKVKKEERDRKMRGMTAEEQRKFLEKESDRKRKKDEKRMTRKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
388-437EERKRLAEKVKKEERDRKMRGMTAEEQRKFLEKESDRKRKKDEKRMTRKG
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 10.5, nucl 9.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MSFLKNILGQKPAQEPLPSVDSDFADFAGAPSPSPVSVPSASSPLPAQPTGFRGGPVPYTKWYRVWERTQLSDFKGELILLPFLILAVLVHLWGTRTNRRKSKQWMAAHAPVLNSEFALVGYDSKSPQIEGITADNLPAELLKEKTAQDFQSYATGRQNVAWVDLQLRLFRLSNPPLMGAEWLVSLFFESYPAPRQVTEAVMYTFDGSEKKFVLPGVPGSNEGAPKPGNSAYDGFVFAIVNKTAMRHLRDERYDVSLTYTKDHTKLPAWATVMSESAEVTETMLTKELIAAIETAGEALEYLIVTDQPTDKPTKLEEAVPRKRLYLCTKVPPGSDYSSTLPLFQAFLRLPDHLAQNAHFRPEILRKLNQTREAEIKKLKRVSDEEGEEERKRLAEKVKKEERDRKMRGMTAEEQRKFLEKESDRKRKKDEKRMTRKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.32
4 0.34
5 0.3
6 0.25
7 0.26
8 0.23
9 0.23
10 0.22
11 0.17
12 0.14
13 0.13
14 0.12
15 0.13
16 0.12
17 0.1
18 0.11
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.13
23 0.14
24 0.15
25 0.18
26 0.18
27 0.21
28 0.21
29 0.22
30 0.22
31 0.21
32 0.24
33 0.22
34 0.22
35 0.21
36 0.24
37 0.27
38 0.26
39 0.23
40 0.21
41 0.22
42 0.26
43 0.28
44 0.28
45 0.29
46 0.35
47 0.38
48 0.4
49 0.44
50 0.47
51 0.51
52 0.55
53 0.59
54 0.57
55 0.6
56 0.6
57 0.59
58 0.53
59 0.5
60 0.43
61 0.35
62 0.31
63 0.25
64 0.21
65 0.18
66 0.15
67 0.1
68 0.1
69 0.08
70 0.07
71 0.07
72 0.05
73 0.03
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.05
80 0.09
81 0.14
82 0.23
83 0.32
84 0.41
85 0.51
86 0.56
87 0.65
88 0.71
89 0.77
90 0.77
91 0.76
92 0.75
93 0.74
94 0.74
95 0.68
96 0.6
97 0.49
98 0.4
99 0.35
100 0.26
101 0.17
102 0.11
103 0.09
104 0.07
105 0.08
106 0.07
107 0.06
108 0.07
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.12
119 0.13
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.07
126 0.06
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.12
131 0.12
132 0.16
133 0.19
134 0.19
135 0.19
136 0.19
137 0.18
138 0.23
139 0.24
140 0.23
141 0.23
142 0.24
143 0.22
144 0.22
145 0.24
146 0.17
147 0.18
148 0.16
149 0.13
150 0.13
151 0.15
152 0.15
153 0.13
154 0.14
155 0.13
156 0.13
157 0.14
158 0.18
159 0.18
160 0.2
161 0.2
162 0.2
163 0.19
164 0.19
165 0.18
166 0.12
167 0.09
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.1
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.14
185 0.14
186 0.12
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.11
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.14
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.1
212 0.09
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.14
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.08
225 0.09
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.07
230 0.1
231 0.14
232 0.16
233 0.19
234 0.24
235 0.29
236 0.31
237 0.34
238 0.32
239 0.33
240 0.31
241 0.27
242 0.26
243 0.24
244 0.23
245 0.22
246 0.23
247 0.2
248 0.21
249 0.22
250 0.2
251 0.18
252 0.23
253 0.22
254 0.24
255 0.24
256 0.23
257 0.23
258 0.21
259 0.19
260 0.15
261 0.13
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.07
294 0.08
295 0.11
296 0.14
297 0.14
298 0.16
299 0.18
300 0.22
301 0.22
302 0.27
303 0.34
304 0.41
305 0.49
306 0.53
307 0.52
308 0.49
309 0.5
310 0.51
311 0.49
312 0.48
313 0.46
314 0.49
315 0.55
316 0.55
317 0.54
318 0.48
319 0.45
320 0.4
321 0.36
322 0.31
323 0.27
324 0.3
325 0.29
326 0.28
327 0.24
328 0.2
329 0.2
330 0.16
331 0.18
332 0.13
333 0.15
334 0.16
335 0.16
336 0.18
337 0.2
338 0.22
339 0.2
340 0.21
341 0.2
342 0.27
343 0.28
344 0.29
345 0.26
346 0.24
347 0.26
348 0.33
349 0.4
350 0.37
351 0.41
352 0.46
353 0.55
354 0.62
355 0.65
356 0.61
357 0.57
358 0.61
359 0.59
360 0.59
361 0.59
362 0.58
363 0.58
364 0.61
365 0.58
366 0.55
367 0.56
368 0.56
369 0.56
370 0.53
371 0.5
372 0.51
373 0.55
374 0.49
375 0.46
376 0.4
377 0.33
378 0.3
379 0.3
380 0.33
381 0.36
382 0.44
383 0.54
384 0.63
385 0.71
386 0.8
387 0.84
388 0.85
389 0.87
390 0.85
391 0.83
392 0.81
393 0.77
394 0.71
395 0.68
396 0.65
397 0.65
398 0.68
399 0.61
400 0.55
401 0.52
402 0.53
403 0.47
404 0.44
405 0.44
406 0.4
407 0.49
408 0.58
409 0.67
410 0.7
411 0.76
412 0.82
413 0.82
414 0.87
415 0.87
416 0.88
417 0.88