Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HUP0

Protein Details
Accession U1HUP0    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
448-473MPLHDPRKDEKLKKGRPEMRLKAGTRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
457-465EKLKKGRPE
503-527GKVGRGGGKRSGRGRGAGRGRGRGR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 8, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MDVDLSEETQDFRFLSVLTSNTTLANTTTTPSVASTETLIPKRGIKDFEPNPTRSQQNALRASRQAMHDVLSGERVHGSKNWVIGYFVGSIGGEGESAPLEGRDSGEDGIGLEDRDKRLRGCVVRIDQPRGSTFRTMGVSDRENRIWLLPEEALYCIERGSLDIRWGLPEAEKDDVKGGPVTGGNDEGSAKREGKKDDDDDDYDDAPAFSDLPMSLQGAYATFISDKDLTLARYTVFAGLRRLGYTVIRAPTWDDSAPPSSQTRQEDKTEDKIEDLPITSHARTVSPPSALTSQQPFFKWPSLRTFITRVFQLLFRWESPSKPYHRHPNSYPSFGPLVAPGLYRSYIDIYRALALIPFHNPTSKPQPAHTAPATTSSPETPSIQPQPPNPSMTSTTPPFRISYHVYKPTTPYRKTSPPAPDFRLAVIDAHAHATIPNLTELGTLLEEMPLHDPRKDEKLKKGRPEMRLKAGTRSVVLAVVDNGVVSFLRLAEMGSGREKIYEGKVGRGGGKRSGRGRGAGRGRGRGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.15
4 0.16
5 0.17
6 0.19
7 0.19
8 0.19
9 0.19
10 0.17
11 0.15
12 0.16
13 0.14
14 0.14
15 0.14
16 0.14
17 0.14
18 0.14
19 0.15
20 0.14
21 0.14
22 0.15
23 0.19
24 0.26
25 0.28
26 0.3
27 0.29
28 0.33
29 0.37
30 0.39
31 0.38
32 0.35
33 0.43
34 0.46
35 0.55
36 0.57
37 0.56
38 0.55
39 0.56
40 0.57
41 0.48
42 0.5
43 0.46
44 0.49
45 0.55
46 0.55
47 0.54
48 0.53
49 0.55
50 0.52
51 0.47
52 0.41
53 0.32
54 0.3
55 0.27
56 0.26
57 0.23
58 0.22
59 0.2
60 0.16
61 0.18
62 0.17
63 0.16
64 0.17
65 0.21
66 0.2
67 0.24
68 0.25
69 0.23
70 0.23
71 0.22
72 0.22
73 0.18
74 0.15
75 0.12
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.09
100 0.12
101 0.14
102 0.18
103 0.19
104 0.19
105 0.23
106 0.3
107 0.32
108 0.34
109 0.4
110 0.41
111 0.49
112 0.53
113 0.55
114 0.49
115 0.48
116 0.46
117 0.41
118 0.39
119 0.33
120 0.28
121 0.27
122 0.27
123 0.25
124 0.24
125 0.25
126 0.27
127 0.28
128 0.32
129 0.28
130 0.27
131 0.27
132 0.25
133 0.24
134 0.2
135 0.19
136 0.15
137 0.16
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.12
142 0.12
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.13
157 0.14
158 0.15
159 0.15
160 0.14
161 0.16
162 0.15
163 0.15
164 0.13
165 0.11
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.09
170 0.1
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.13
177 0.14
178 0.17
179 0.21
180 0.23
181 0.28
182 0.33
183 0.34
184 0.35
185 0.37
186 0.35
187 0.34
188 0.33
189 0.29
190 0.23
191 0.19
192 0.15
193 0.11
194 0.1
195 0.07
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.07
212 0.08
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.11
223 0.11
224 0.12
225 0.12
226 0.14
227 0.14
228 0.13
229 0.14
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.14
234 0.13
235 0.13
236 0.12
237 0.14
238 0.14
239 0.16
240 0.14
241 0.11
242 0.12
243 0.14
244 0.15
245 0.14
246 0.15
247 0.14
248 0.19
249 0.23
250 0.25
251 0.26
252 0.28
253 0.3
254 0.32
255 0.37
256 0.35
257 0.31
258 0.27
259 0.25
260 0.23
261 0.2
262 0.17
263 0.11
264 0.12
265 0.14
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.13
270 0.13
271 0.17
272 0.16
273 0.14
274 0.14
275 0.15
276 0.17
277 0.17
278 0.19
279 0.19
280 0.18
281 0.2
282 0.21
283 0.21
284 0.21
285 0.26
286 0.27
287 0.25
288 0.29
289 0.32
290 0.33
291 0.33
292 0.35
293 0.33
294 0.32
295 0.3
296 0.25
297 0.21
298 0.21
299 0.19
300 0.18
301 0.17
302 0.15
303 0.2
304 0.2
305 0.2
306 0.23
307 0.29
308 0.3
309 0.34
310 0.39
311 0.45
312 0.51
313 0.56
314 0.56
315 0.61
316 0.6
317 0.59
318 0.53
319 0.45
320 0.4
321 0.33
322 0.3
323 0.2
324 0.17
325 0.12
326 0.12
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.11
333 0.11
334 0.12
335 0.13
336 0.12
337 0.13
338 0.13
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.11
344 0.12
345 0.11
346 0.14
347 0.15
348 0.19
349 0.27
350 0.32
351 0.31
352 0.32
353 0.4
354 0.4
355 0.46
356 0.42
357 0.36
358 0.3
359 0.33
360 0.32
361 0.25
362 0.24
363 0.18
364 0.19
365 0.18
366 0.21
367 0.18
368 0.23
369 0.29
370 0.32
371 0.34
372 0.37
373 0.43
374 0.43
375 0.45
376 0.39
377 0.37
378 0.36
379 0.36
380 0.37
381 0.33
382 0.33
383 0.32
384 0.33
385 0.3
386 0.27
387 0.28
388 0.3
389 0.34
390 0.39
391 0.46
392 0.46
393 0.47
394 0.51
395 0.57
396 0.6
397 0.55
398 0.52
399 0.5
400 0.57
401 0.59
402 0.62
403 0.62
404 0.61
405 0.66
406 0.66
407 0.62
408 0.54
409 0.52
410 0.46
411 0.36
412 0.28
413 0.21
414 0.17
415 0.14
416 0.14
417 0.13
418 0.1
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.1
424 0.09
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.08
430 0.08
431 0.07
432 0.08
433 0.08
434 0.09
435 0.13
436 0.16
437 0.17
438 0.19
439 0.21
440 0.24
441 0.34
442 0.43
443 0.46
444 0.52
445 0.61
446 0.69
447 0.77
448 0.84
449 0.82
450 0.82
451 0.86
452 0.84
453 0.82
454 0.82
455 0.74
456 0.71
457 0.68
458 0.6
459 0.51
460 0.44
461 0.35
462 0.28
463 0.26
464 0.19
465 0.15
466 0.13
467 0.12
468 0.1
469 0.09
470 0.07
471 0.07
472 0.06
473 0.06
474 0.05
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.09
479 0.11
480 0.13
481 0.16
482 0.18
483 0.17
484 0.18
485 0.19
486 0.19
487 0.21
488 0.27
489 0.26
490 0.3
491 0.34
492 0.35
493 0.41
494 0.44
495 0.44
496 0.45
497 0.5
498 0.52
499 0.54
500 0.6
501 0.56
502 0.57
503 0.58
504 0.59
505 0.61
506 0.63
507 0.63