Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HQ33

Protein Details
Accession U1HQ33    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-70YGNGTGPRPNRQRKESQRMGEPTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MKRPPPPYLQTSTNGNRTSNPSPSPSSASKRLPGSAAPLSANSQNGVYGNGTGPRPNRQRKESQRMGEPTGRPQRLATRNGVVDGLPLERRSAKRYPEPYVPSESHILRKFKGHLPSLIVHLHPTHFRFDQQEGSFSYHSEMRMFIEHLQKRTIPHDMLEELRKSDVRFYDGWLIVRVVDHKSVSATAGSASNTSSDDQYSIHNHNPYITPSPWRPYPLKNLLRAEGERKSPPLKQEPNEDSSIRPKSASSMNIQNGLHEASPKSRQPQPKIYHVALRPTALSKHMDLVIDSMTPDPKAVNRRQSQAYPTARTPSSSMPPPTPLSAVPSTPSVERGPPTKKLKMKIESKDLLEYEARIVNSTAPPLFLDALNSLDEAQNLLEFLKDPWHDEPPPSPKGRKRTIAELAADDALAKEQERFMLIMDERNIGSSATANATNADGPAAATLFQPRFEKFNALENIKSQHAENKRLEEERKSQQDHQRRNHQREEEARRVRAHEQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQRMEETRRQQMAQLQMSQRHAGIQATVATTGQQQQQPGTNHINGISAVPPNMQNHIAHVSQAQRSSPVVRTSTPHAHSSPLVGHVSHASQSVSMAPTSSNQGAAGSPPRPESGMQHGHPGVAMTRGPSGQGSSRHGTPQISQGTPAMRHSTPVVRQVTPTSRMNNASPHVGMVAPTPHMSQGAMMNGVNGMSGMAAQNAVMGANRQQQQHQLQNFNQPGNPHTLTPEQVAYRQRQQHTLHQQRAMQHQLQQQQQDGQNPQTFQQPPSAQNAFPHTTANYNAQLHKMTQDLMQAQAAAAGSPPQNHAPHQQAVQMNHHPSQSGMQSQVPGQQQQQRPAQPTNPAQVQQFFTQRLRVVQQHLFQTLANQHYGGNPQLIQPAQREILQQRAKQQVMHEITQRGMLNPAQRQGQITQQQMMQMQQAQQHGQGSPQNIALMRQQMMQQQAIQQHQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.51
3 0.49
4 0.51
5 0.53
6 0.5
7 0.47
8 0.44
9 0.46
10 0.48
11 0.51
12 0.5
13 0.52
14 0.54
15 0.56
16 0.57
17 0.55
18 0.54
19 0.5
20 0.44
21 0.43
22 0.39
23 0.36
24 0.31
25 0.29
26 0.29
27 0.3
28 0.29
29 0.23
30 0.19
31 0.17
32 0.16
33 0.17
34 0.15
35 0.13
36 0.14
37 0.18
38 0.19
39 0.23
40 0.25
41 0.33
42 0.43
43 0.52
44 0.59
45 0.62
46 0.72
47 0.78
48 0.86
49 0.86
50 0.83
51 0.82
52 0.79
53 0.78
54 0.76
55 0.67
56 0.67
57 0.68
58 0.62
59 0.53
60 0.5
61 0.53
62 0.53
63 0.55
64 0.51
65 0.48
66 0.48
67 0.48
68 0.45
69 0.35
70 0.29
71 0.24
72 0.22
73 0.17
74 0.16
75 0.17
76 0.23
77 0.26
78 0.31
79 0.36
80 0.41
81 0.48
82 0.55
83 0.59
84 0.61
85 0.65
86 0.63
87 0.64
88 0.58
89 0.51
90 0.5
91 0.46
92 0.46
93 0.47
94 0.46
95 0.41
96 0.45
97 0.46
98 0.47
99 0.53
100 0.48
101 0.45
102 0.46
103 0.47
104 0.46
105 0.43
106 0.37
107 0.31
108 0.28
109 0.27
110 0.27
111 0.26
112 0.27
113 0.25
114 0.28
115 0.3
116 0.31
117 0.37
118 0.34
119 0.36
120 0.33
121 0.37
122 0.34
123 0.3
124 0.3
125 0.24
126 0.23
127 0.2
128 0.19
129 0.15
130 0.18
131 0.19
132 0.21
133 0.29
134 0.33
135 0.34
136 0.37
137 0.37
138 0.37
139 0.39
140 0.41
141 0.32
142 0.29
143 0.31
144 0.3
145 0.33
146 0.35
147 0.33
148 0.28
149 0.29
150 0.3
151 0.26
152 0.29
153 0.27
154 0.26
155 0.25
156 0.27
157 0.33
158 0.34
159 0.34
160 0.3
161 0.28
162 0.24
163 0.24
164 0.23
165 0.17
166 0.17
167 0.16
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.16
172 0.14
173 0.11
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.12
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.14
187 0.18
188 0.21
189 0.25
190 0.27
191 0.26
192 0.28
193 0.29
194 0.3
195 0.31
196 0.28
197 0.29
198 0.31
199 0.36
200 0.37
201 0.4
202 0.4
203 0.4
204 0.48
205 0.53
206 0.56
207 0.58
208 0.59
209 0.57
210 0.59
211 0.56
212 0.51
213 0.45
214 0.43
215 0.38
216 0.38
217 0.39
218 0.37
219 0.41
220 0.46
221 0.5
222 0.48
223 0.56
224 0.57
225 0.58
226 0.58
227 0.52
228 0.44
229 0.44
230 0.45
231 0.36
232 0.3
233 0.26
234 0.26
235 0.3
236 0.3
237 0.27
238 0.31
239 0.33
240 0.38
241 0.37
242 0.34
243 0.3
244 0.29
245 0.24
246 0.18
247 0.17
248 0.15
249 0.21
250 0.24
251 0.27
252 0.33
253 0.41
254 0.47
255 0.56
256 0.57
257 0.61
258 0.65
259 0.63
260 0.63
261 0.57
262 0.57
263 0.48
264 0.44
265 0.35
266 0.3
267 0.3
268 0.24
269 0.24
270 0.17
271 0.18
272 0.19
273 0.18
274 0.16
275 0.16
276 0.14
277 0.12
278 0.12
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.12
285 0.2
286 0.26
287 0.35
288 0.38
289 0.44
290 0.48
291 0.5
292 0.51
293 0.52
294 0.52
295 0.47
296 0.44
297 0.44
298 0.4
299 0.38
300 0.36
301 0.31
302 0.29
303 0.31
304 0.31
305 0.28
306 0.31
307 0.32
308 0.31
309 0.28
310 0.23
311 0.23
312 0.22
313 0.2
314 0.18
315 0.18
316 0.18
317 0.17
318 0.19
319 0.15
320 0.16
321 0.17
322 0.22
323 0.25
324 0.32
325 0.39
326 0.44
327 0.48
328 0.53
329 0.6
330 0.63
331 0.68
332 0.66
333 0.68
334 0.64
335 0.6
336 0.57
337 0.48
338 0.41
339 0.33
340 0.26
341 0.19
342 0.18
343 0.16
344 0.13
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.14
349 0.12
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.11
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.1
372 0.1
373 0.13
374 0.15
375 0.2
376 0.21
377 0.22
378 0.28
379 0.29
380 0.34
381 0.35
382 0.4
383 0.41
384 0.49
385 0.54
386 0.56
387 0.53
388 0.55
389 0.58
390 0.56
391 0.52
392 0.44
393 0.39
394 0.3
395 0.27
396 0.19
397 0.12
398 0.08
399 0.06
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.1
408 0.1
409 0.12
410 0.13
411 0.14
412 0.13
413 0.14
414 0.14
415 0.1
416 0.1
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.06
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.07
434 0.08
435 0.1
436 0.11
437 0.12
438 0.14
439 0.15
440 0.18
441 0.16
442 0.24
443 0.27
444 0.27
445 0.27
446 0.26
447 0.27
448 0.25
449 0.24
450 0.16
451 0.19
452 0.22
453 0.28
454 0.29
455 0.31
456 0.33
457 0.36
458 0.38
459 0.36
460 0.37
461 0.38
462 0.43
463 0.42
464 0.46
465 0.51
466 0.58
467 0.63
468 0.64
469 0.68
470 0.7
471 0.73
472 0.74
473 0.68
474 0.64
475 0.64
476 0.65
477 0.64
478 0.6
479 0.56
480 0.5
481 0.5
482 0.47
483 0.45
484 0.44
485 0.42
486 0.43
487 0.47
488 0.54
489 0.57
490 0.56
491 0.53
492 0.51
493 0.49
494 0.49
495 0.49
496 0.48
497 0.48
498 0.53
499 0.55
500 0.57
501 0.58
502 0.57
503 0.56
504 0.52
505 0.47
506 0.43
507 0.41
508 0.39
509 0.37
510 0.36
511 0.38
512 0.37
513 0.36
514 0.34
515 0.34
516 0.36
517 0.33
518 0.33
519 0.28
520 0.3
521 0.31
522 0.3
523 0.26
524 0.2
525 0.18
526 0.13
527 0.11
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.1
536 0.12
537 0.12
538 0.13
539 0.13
540 0.2
541 0.21
542 0.25
543 0.26
544 0.23
545 0.22
546 0.22
547 0.21
548 0.16
549 0.15
550 0.11
551 0.08
552 0.08
553 0.08
554 0.1
555 0.1
556 0.12
557 0.12
558 0.11
559 0.13
560 0.16
561 0.15
562 0.13
563 0.15
564 0.16
565 0.17
566 0.18
567 0.16
568 0.14
569 0.15
570 0.17
571 0.18
572 0.19
573 0.18
574 0.18
575 0.2
576 0.25
577 0.32
578 0.31
579 0.31
580 0.28
581 0.28
582 0.27
583 0.27
584 0.22
585 0.18
586 0.16
587 0.13
588 0.13
589 0.12
590 0.12
591 0.11
592 0.11
593 0.08
594 0.07
595 0.08
596 0.09
597 0.08
598 0.08
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.11
603 0.11
604 0.09
605 0.09
606 0.09
607 0.09
608 0.11
609 0.13
610 0.11
611 0.12
612 0.13
613 0.14
614 0.14
615 0.15
616 0.16
617 0.21
618 0.27
619 0.26
620 0.3
621 0.29
622 0.28
623 0.28
624 0.25
625 0.17
626 0.12
627 0.11
628 0.07
629 0.08
630 0.08
631 0.09
632 0.09
633 0.1
634 0.12
635 0.15
636 0.19
637 0.21
638 0.22
639 0.23
640 0.25
641 0.25
642 0.22
643 0.26
644 0.26
645 0.23
646 0.23
647 0.23
648 0.24
649 0.24
650 0.25
651 0.22
652 0.17
653 0.18
654 0.2
655 0.23
656 0.23
657 0.3
658 0.32
659 0.28
660 0.29
661 0.33
662 0.36
663 0.35
664 0.36
665 0.31
666 0.31
667 0.33
668 0.33
669 0.32
670 0.29
671 0.27
672 0.23
673 0.21
674 0.18
675 0.15
676 0.14
677 0.11
678 0.1
679 0.09
680 0.09
681 0.1
682 0.09
683 0.09
684 0.09
685 0.09
686 0.09
687 0.09
688 0.1
689 0.09
690 0.09
691 0.09
692 0.09
693 0.07
694 0.05
695 0.04
696 0.03
697 0.03
698 0.03
699 0.03
700 0.04
701 0.03
702 0.04
703 0.04
704 0.04
705 0.04
706 0.04
707 0.07
708 0.14
709 0.18
710 0.19
711 0.2
712 0.27
713 0.34
714 0.41
715 0.44
716 0.44
717 0.43
718 0.52
719 0.54
720 0.48
721 0.43
722 0.36
723 0.32
724 0.33
725 0.31
726 0.22
727 0.22
728 0.23
729 0.23
730 0.24
731 0.26
732 0.19
733 0.23
734 0.27
735 0.28
736 0.35
737 0.41
738 0.41
739 0.46
740 0.49
741 0.54
742 0.61
743 0.67
744 0.65
745 0.62
746 0.63
747 0.59
748 0.62
749 0.58
750 0.5
751 0.46
752 0.45
753 0.47
754 0.49
755 0.47
756 0.42
757 0.41
758 0.42
759 0.42
760 0.39
761 0.38
762 0.37
763 0.35
764 0.34
765 0.36
766 0.35
767 0.3
768 0.35
769 0.33
770 0.32
771 0.39
772 0.4
773 0.33
774 0.34
775 0.39
776 0.34
777 0.3
778 0.3
779 0.23
780 0.23
781 0.25
782 0.26
783 0.25
784 0.25
785 0.26
786 0.26
787 0.27
788 0.25
789 0.25
790 0.22
791 0.17
792 0.16
793 0.19
794 0.18
795 0.18
796 0.17
797 0.16
798 0.14
799 0.15
800 0.13
801 0.09
802 0.07
803 0.09
804 0.09
805 0.1
806 0.13
807 0.17
808 0.18
809 0.21
810 0.27
811 0.29
812 0.32
813 0.32
814 0.36
815 0.36
816 0.38
817 0.42
818 0.44
819 0.42
820 0.41
821 0.4
822 0.34
823 0.3
824 0.3
825 0.26
826 0.23
827 0.21
828 0.2
829 0.21
830 0.22
831 0.28
832 0.27
833 0.26
834 0.28
835 0.34
836 0.38
837 0.44
838 0.51
839 0.51
840 0.54
841 0.56
842 0.55
843 0.55
844 0.55
845 0.54
846 0.51
847 0.48
848 0.45
849 0.44
850 0.43
851 0.4
852 0.4
853 0.37
854 0.34
855 0.36
856 0.35
857 0.35
858 0.36
859 0.36
860 0.38
861 0.4
862 0.43
863 0.43
864 0.42
865 0.39
866 0.34
867 0.34
868 0.33
869 0.3
870 0.26
871 0.21
872 0.2
873 0.22
874 0.25
875 0.22
876 0.18
877 0.16
878 0.17
879 0.21
880 0.22
881 0.22
882 0.21
883 0.24
884 0.23
885 0.24
886 0.28
887 0.26
888 0.35
889 0.4
890 0.41
891 0.45
892 0.52
893 0.52
894 0.49
895 0.49
896 0.49
897 0.47
898 0.48
899 0.46
900 0.39
901 0.38
902 0.41
903 0.39
904 0.3
905 0.27
906 0.26
907 0.28
908 0.3
909 0.33
910 0.31
911 0.32
912 0.34
913 0.33
914 0.39
915 0.39
916 0.39
917 0.38
918 0.35
919 0.38
920 0.36
921 0.36
922 0.3
923 0.26
924 0.26
925 0.27
926 0.29
927 0.28
928 0.29
929 0.3
930 0.27
931 0.27
932 0.28
933 0.26
934 0.25
935 0.25
936 0.25
937 0.22
938 0.24
939 0.24
940 0.25
941 0.23
942 0.23
943 0.25
944 0.27
945 0.31
946 0.31
947 0.28
948 0.29
949 0.34
950 0.36
951 0.38
952 0.39
953 0.44
954 0.49
955 0.54
956 0.56
957 0.59
958 0.64
959 0.7
960 0.71
961 0.69
962 0.68
963 0.67
964 0.67
965 0.64
966 0.61
967 0.57
968 0.57
969 0.57
970 0.57
971 0.57
972 0.57
973 0.57
974 0.57
975 0.57
976 0.57
977 0.57
978 0.57
979 0.57
980 0.57
981 0.57
982 0.57
983 0.57
984 0.57
985 0.57
986 0.57
987 0.57
988 0.57
989 0.57
990 0.57
991 0.57
992 0.57
993 0.57
994 0.57
995 0.57
996 0.57
997 0.57
998 0.57
999 0.57
1000 0.57
1001 0.57
1002 0.57