Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HU10

Protein Details
Accession U1HU10    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-61EIGSKPSQKKQKSQGTPSSKSTHydrophilic
312-338SSSLLESTSKRKKKHKRLHPREEDGIIHydrophilic
373-398NDVSHHRATPKEEKRKKKRAHEEPSPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
321-331KRKKKHKRLHP
379-394RATPKEEKRKKKRAHE
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MPRKKDSGKPLVLSEEYVIDSDSDGLAQPESVNSKNSSNEIGSKPSQKKQKSQGTPSSKSTVPAQRSGSESPANDGKNGVETSSSSSKAGSIETESDREGAAPAKQKLQKKRAASLPNQTPVAIPAKLFRPPNGFEELPPNALNSTTEGFEAVSGVLTGKQIWHITAPTSIPLNSIEDFDVDVVRSGRPILTYDSRQYGLAFGDKDSQHLLLPGKVGGSSYKRSRVHVSKSYHLREIPNQSQSTSSKAVQSTEDSVFFAKEQPLARPPREQPKMLRMRYKPFGTDDSPSTSTSIRENFGVKEGSSNPTLQPSSSLLESTSKRKKKHKRLHPREEDGIIDDRMQVDESPAESSVVQETPSKAEVLARKRLRDTNDVSHHRATPKEEKRKKKRAHEEPSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.32
3 0.25
4 0.22
5 0.19
6 0.12
7 0.12
8 0.11
9 0.1
10 0.08
11 0.07
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.1
17 0.14
18 0.15
19 0.18
20 0.2
21 0.23
22 0.25
23 0.27
24 0.28
25 0.26
26 0.32
27 0.31
28 0.35
29 0.37
30 0.44
31 0.49
32 0.52
33 0.6
34 0.6
35 0.66
36 0.7
37 0.76
38 0.76
39 0.79
40 0.83
41 0.83
42 0.82
43 0.78
44 0.72
45 0.63
46 0.55
47 0.53
48 0.51
49 0.46
50 0.46
51 0.44
52 0.42
53 0.46
54 0.46
55 0.42
56 0.38
57 0.34
58 0.32
59 0.34
60 0.32
61 0.28
62 0.26
63 0.22
64 0.22
65 0.22
66 0.18
67 0.13
68 0.13
69 0.18
70 0.22
71 0.22
72 0.18
73 0.18
74 0.19
75 0.19
76 0.19
77 0.14
78 0.12
79 0.15
80 0.17
81 0.18
82 0.18
83 0.18
84 0.17
85 0.16
86 0.14
87 0.12
88 0.14
89 0.19
90 0.2
91 0.28
92 0.34
93 0.41
94 0.5
95 0.57
96 0.61
97 0.59
98 0.65
99 0.66
100 0.69
101 0.67
102 0.67
103 0.66
104 0.63
105 0.58
106 0.51
107 0.42
108 0.36
109 0.34
110 0.25
111 0.17
112 0.15
113 0.17
114 0.22
115 0.23
116 0.23
117 0.25
118 0.27
119 0.29
120 0.33
121 0.31
122 0.27
123 0.32
124 0.3
125 0.27
126 0.25
127 0.22
128 0.16
129 0.16
130 0.15
131 0.11
132 0.11
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.06
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.11
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.12
161 0.1
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.08
177 0.11
178 0.13
179 0.16
180 0.18
181 0.2
182 0.2
183 0.2
184 0.19
185 0.16
186 0.13
187 0.13
188 0.11
189 0.09
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.12
196 0.14
197 0.14
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.11
206 0.15
207 0.18
208 0.27
209 0.28
210 0.3
211 0.38
212 0.42
213 0.46
214 0.5
215 0.51
216 0.51
217 0.58
218 0.59
219 0.55
220 0.5
221 0.45
222 0.43
223 0.46
224 0.44
225 0.41
226 0.39
227 0.36
228 0.37
229 0.35
230 0.34
231 0.29
232 0.25
233 0.22
234 0.23
235 0.23
236 0.21
237 0.22
238 0.22
239 0.2
240 0.19
241 0.16
242 0.16
243 0.15
244 0.14
245 0.14
246 0.11
247 0.13
248 0.14
249 0.16
250 0.23
251 0.29
252 0.31
253 0.35
254 0.39
255 0.46
256 0.5
257 0.51
258 0.49
259 0.54
260 0.62
261 0.61
262 0.65
263 0.59
264 0.62
265 0.66
266 0.63
267 0.55
268 0.49
269 0.49
270 0.42
271 0.41
272 0.36
273 0.35
274 0.34
275 0.32
276 0.29
277 0.25
278 0.23
279 0.23
280 0.23
281 0.18
282 0.18
283 0.19
284 0.19
285 0.21
286 0.22
287 0.18
288 0.19
289 0.2
290 0.21
291 0.21
292 0.21
293 0.19
294 0.23
295 0.23
296 0.19
297 0.19
298 0.19
299 0.19
300 0.19
301 0.18
302 0.14
303 0.2
304 0.23
305 0.29
306 0.38
307 0.42
308 0.49
309 0.6
310 0.7
311 0.75
312 0.83
313 0.85
314 0.87
315 0.91
316 0.95
317 0.95
318 0.92
319 0.87
320 0.78
321 0.68
322 0.6
323 0.53
324 0.42
325 0.32
326 0.24
327 0.19
328 0.17
329 0.17
330 0.13
331 0.11
332 0.12
333 0.12
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.13
339 0.14
340 0.13
341 0.13
342 0.15
343 0.16
344 0.18
345 0.19
346 0.19
347 0.16
348 0.22
349 0.28
350 0.32
351 0.41
352 0.43
353 0.48
354 0.53
355 0.59
356 0.59
357 0.6
358 0.61
359 0.61
360 0.66
361 0.68
362 0.67
363 0.66
364 0.65
365 0.6
366 0.57
367 0.54
368 0.55
369 0.58
370 0.64
371 0.7
372 0.76
373 0.83
374 0.9
375 0.92
376 0.92
377 0.93
378 0.93