Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GJA1

Protein Details
Accession U1GJA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-50SATAAKHCPECKRPWRRRFSSTRSCDMTHydrophilic
321-341REQRAGKKEARRKQIEKHTTRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
312-334RHHARLREEREQRAGKKEARRKQ
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 11.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021036  Ribosomal_S35_mit  
Pfam View protein in Pfam  
PF12298  Bot1p  
Amino Acid Sequences MTRRALQYIQVPLSSFTASLTPSATAAKHCPECKRPWRRRFSSTRSCDMTRLRTDMFSWLNSHGKNFLDPVEGKTNYLTDYDKRGFRRHKEPDAAGEQADSPAREKGAREEPRRPFPLNEHFFSQPILSEELREEIWRRVKVDKKSIRNVSVELGVEMRRVGAVVRLQELEKQWRAENKPLALPYAEAIHSMVPSTPLKTPPVPHETVNDLPVHSMTLPQLFYPTSESRQFNRVDAGRIFSGAPRLPDEADIAQGGQSVEPWKDTSIEIVGKPGHERPVLKAADARIPHPHLIAYEKDKLDPELDALERHERHHARLREEREQRAGKKEARRKQIEKHTTRVDTGRYEFLIRDCQTTRLGTGLDGRGTASPGRRYGVPSQDRKRGAIKIPTKVEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.23
3 0.15
4 0.15
5 0.14
6 0.14
7 0.13
8 0.12
9 0.12
10 0.14
11 0.15
12 0.16
13 0.2
14 0.27
15 0.32
16 0.37
17 0.44
18 0.5
19 0.59
20 0.67
21 0.74
22 0.77
23 0.81
24 0.87
25 0.86
26 0.89
27 0.89
28 0.89
29 0.88
30 0.85
31 0.83
32 0.78
33 0.72
34 0.69
35 0.65
36 0.63
37 0.57
38 0.54
39 0.47
40 0.42
41 0.41
42 0.41
43 0.37
44 0.31
45 0.28
46 0.28
47 0.32
48 0.31
49 0.31
50 0.28
51 0.26
52 0.25
53 0.24
54 0.21
55 0.21
56 0.22
57 0.26
58 0.31
59 0.3
60 0.29
61 0.29
62 0.28
63 0.23
64 0.24
65 0.21
66 0.16
67 0.24
68 0.28
69 0.32
70 0.36
71 0.44
72 0.51
73 0.55
74 0.64
75 0.65
76 0.69
77 0.71
78 0.7
79 0.68
80 0.64
81 0.58
82 0.47
83 0.39
84 0.3
85 0.23
86 0.22
87 0.15
88 0.12
89 0.12
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.19
94 0.28
95 0.37
96 0.42
97 0.5
98 0.56
99 0.63
100 0.68
101 0.64
102 0.56
103 0.54
104 0.59
105 0.55
106 0.5
107 0.45
108 0.42
109 0.39
110 0.37
111 0.3
112 0.2
113 0.16
114 0.17
115 0.13
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.14
122 0.16
123 0.23
124 0.24
125 0.26
126 0.32
127 0.39
128 0.45
129 0.54
130 0.57
131 0.58
132 0.66
133 0.7
134 0.67
135 0.61
136 0.55
137 0.46
138 0.4
139 0.32
140 0.23
141 0.18
142 0.14
143 0.12
144 0.11
145 0.09
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.11
153 0.12
154 0.12
155 0.15
156 0.17
157 0.2
158 0.2
159 0.21
160 0.22
161 0.28
162 0.31
163 0.35
164 0.37
165 0.33
166 0.33
167 0.32
168 0.31
169 0.25
170 0.21
171 0.15
172 0.13
173 0.11
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.12
185 0.14
186 0.16
187 0.18
188 0.21
189 0.27
190 0.27
191 0.26
192 0.26
193 0.28
194 0.28
195 0.28
196 0.23
197 0.16
198 0.15
199 0.14
200 0.13
201 0.08
202 0.08
203 0.06
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.08
209 0.09
210 0.13
211 0.15
212 0.16
213 0.22
214 0.24
215 0.25
216 0.31
217 0.31
218 0.27
219 0.3
220 0.28
221 0.26
222 0.25
223 0.26
224 0.2
225 0.2
226 0.2
227 0.15
228 0.17
229 0.14
230 0.15
231 0.14
232 0.15
233 0.14
234 0.15
235 0.16
236 0.13
237 0.12
238 0.11
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.08
243 0.06
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.1
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.11
253 0.13
254 0.15
255 0.14
256 0.16
257 0.16
258 0.16
259 0.18
260 0.19
261 0.2
262 0.2
263 0.21
264 0.22
265 0.31
266 0.3
267 0.29
268 0.29
269 0.27
270 0.3
271 0.3
272 0.28
273 0.25
274 0.28
275 0.29
276 0.26
277 0.25
278 0.2
279 0.22
280 0.25
281 0.24
282 0.28
283 0.27
284 0.28
285 0.29
286 0.29
287 0.26
288 0.22
289 0.18
290 0.15
291 0.15
292 0.15
293 0.17
294 0.23
295 0.23
296 0.24
297 0.32
298 0.3
299 0.36
300 0.45
301 0.48
302 0.48
303 0.56
304 0.61
305 0.62
306 0.68
307 0.67
308 0.67
309 0.69
310 0.66
311 0.65
312 0.65
313 0.63
314 0.66
315 0.7
316 0.7
317 0.72
318 0.78
319 0.76
320 0.79
321 0.82
322 0.83
323 0.79
324 0.79
325 0.77
326 0.71
327 0.69
328 0.63
329 0.56
330 0.51
331 0.48
332 0.44
333 0.36
334 0.35
335 0.32
336 0.3
337 0.35
338 0.3
339 0.32
340 0.29
341 0.31
342 0.32
343 0.32
344 0.3
345 0.24
346 0.23
347 0.19
348 0.24
349 0.24
350 0.22
351 0.21
352 0.21
353 0.2
354 0.21
355 0.24
356 0.24
357 0.25
358 0.27
359 0.3
360 0.3
361 0.35
362 0.4
363 0.47
364 0.51
365 0.56
366 0.62
367 0.68
368 0.7
369 0.68
370 0.67
371 0.64
372 0.63
373 0.63
374 0.63
375 0.63