Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GIR6

Protein Details
Accession U1GIR6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-167RRGYQACDPCRKRKVKCDLGSVDNPHDPPCMRCRREHKNCVFSTTRRKRKQSQEADDASSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 3, pero 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd12148  fungal_TF_MHR  
cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MSGPDSNYLESVGDDLVHLGGNWASLQYELELNQANQPNRPAPPPTDSTAAPQSRLGPAPLPHQPPTTELSTVAMTTDAQPYGQSSSYESAEAEETNQEPTPPRDQHRRGYQACDPCRKRKVKCDLGSVDNPHDPPCMRCRREHKNCVFSTTRRKRKQSQEADDASSDGGLGRDKRRLTEPTEPTDDSKDDRLGYSYPYSSASPYPPNVNTGPQWPLHPMQTSYPMQPRSSNGYELNMMVDSNSCTGGRSSQTLSPRPLAPITSPRTNPRNANEHMVNKEAANILHPSIATSHEALHLLSVAAGQTEEANRQNSQSLPSHLLSPSTTLGTPSSAGAPHRRTMSNTMAPGEQTSDQAASYGMRSGPNSNTAENQNYQEALKMWSRMRLVKDGWFTATEAMAYIDYYYEHLAPMTPVVINNYRPLSMHTSLVTDEPILAITMLTIASRHMQLAGPGATSRAYQIHDVLWNNLRGMVQRLVWGQEQFGGGFCSGGAVKTHESRTGQITWKGSLRTLGTIEALLLLTDWHPRALHFPPGDNENRLLDADFPLSEEDEAPKAASLEANEDGKVAFSSWLEPAWRSDRMSWMLLGAAVTLSFELGVFDKEHYNCKHHHGPDSECARKQRVRRMVLVYVSQTSGRLGFTPMLSFEAWRKDAVFEETDPIHRTGPTNPIELMQECWMGIAGLMYKANEEIFSSKQYTRDLTSSGQYIEAIAKFKPMLQDWKAKFDRVRHQFDPVMQHLLSMEHDYARLYINSLGLQKVVESWINISNEAATTGNNHNNGSHGVGDASAVSGGITFSLLLEIWRPNKEYIDEVSDAARSILKTVKEGLVPGGHLTHASVRSYFRILSGLMFTLKRFSFGASEQGVRESFMLLDSITDELSRSVVDDVHLSARTAELVKMLSSHLHAKFIRLQAPNSGSTGSSRENSRHQTPQRQQDQSSLQHQFAGQPGQPQARTALNNPFIFGQHLPSLHDPLAGIQAQSMSEVTNVAYMPPINYNDYMEGNHGLGQNPADFGTGVDELGDWFALPLNNFFSTDPALVHQGFGGIGPTVGSRDMLEFITNEQYDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.07
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.09
15 0.1
16 0.1
17 0.13
18 0.16
19 0.17
20 0.24
21 0.3
22 0.3
23 0.32
24 0.37
25 0.38
26 0.39
27 0.42
28 0.4
29 0.38
30 0.43
31 0.44
32 0.43
33 0.42
34 0.39
35 0.41
36 0.46
37 0.43
38 0.38
39 0.36
40 0.35
41 0.35
42 0.36
43 0.33
44 0.28
45 0.28
46 0.33
47 0.39
48 0.42
49 0.41
50 0.42
51 0.41
52 0.38
53 0.4
54 0.37
55 0.3
56 0.25
57 0.24
58 0.22
59 0.21
60 0.18
61 0.14
62 0.11
63 0.12
64 0.15
65 0.13
66 0.12
67 0.12
68 0.14
69 0.16
70 0.17
71 0.16
72 0.16
73 0.19
74 0.2
75 0.21
76 0.19
77 0.17
78 0.17
79 0.17
80 0.15
81 0.14
82 0.14
83 0.16
84 0.16
85 0.16
86 0.18
87 0.22
88 0.3
89 0.34
90 0.4
91 0.49
92 0.55
93 0.63
94 0.7
95 0.76
96 0.7
97 0.71
98 0.72
99 0.71
100 0.74
101 0.75
102 0.71
103 0.71
104 0.78
105 0.79
106 0.79
107 0.79
108 0.82
109 0.82
110 0.82
111 0.82
112 0.78
113 0.77
114 0.76
115 0.71
116 0.65
117 0.58
118 0.52
119 0.43
120 0.4
121 0.33
122 0.3
123 0.35
124 0.41
125 0.4
126 0.48
127 0.56
128 0.64
129 0.74
130 0.81
131 0.81
132 0.81
133 0.79
134 0.77
135 0.74
136 0.7
137 0.71
138 0.71
139 0.72
140 0.71
141 0.78
142 0.81
143 0.85
144 0.89
145 0.89
146 0.87
147 0.86
148 0.81
149 0.77
150 0.67
151 0.57
152 0.46
153 0.34
154 0.25
155 0.15
156 0.11
157 0.1
158 0.14
159 0.16
160 0.22
161 0.24
162 0.27
163 0.32
164 0.36
165 0.4
166 0.46
167 0.49
168 0.5
169 0.55
170 0.54
171 0.5
172 0.5
173 0.45
174 0.38
175 0.35
176 0.31
177 0.26
178 0.25
179 0.25
180 0.21
181 0.23
182 0.23
183 0.21
184 0.19
185 0.2
186 0.2
187 0.2
188 0.22
189 0.22
190 0.24
191 0.25
192 0.3
193 0.28
194 0.32
195 0.31
196 0.32
197 0.3
198 0.29
199 0.3
200 0.25
201 0.26
202 0.26
203 0.27
204 0.27
205 0.28
206 0.25
207 0.25
208 0.31
209 0.32
210 0.33
211 0.38
212 0.38
213 0.37
214 0.38
215 0.38
216 0.39
217 0.39
218 0.38
219 0.32
220 0.31
221 0.31
222 0.29
223 0.26
224 0.18
225 0.15
226 0.11
227 0.11
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.13
235 0.14
236 0.15
237 0.18
238 0.21
239 0.28
240 0.32
241 0.35
242 0.35
243 0.35
244 0.35
245 0.33
246 0.29
247 0.27
248 0.31
249 0.33
250 0.37
251 0.38
252 0.43
253 0.47
254 0.5
255 0.52
256 0.49
257 0.51
258 0.47
259 0.51
260 0.5
261 0.5
262 0.48
263 0.45
264 0.4
265 0.32
266 0.31
267 0.25
268 0.19
269 0.16
270 0.14
271 0.12
272 0.13
273 0.12
274 0.11
275 0.1
276 0.12
277 0.12
278 0.11
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.11
284 0.09
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.06
294 0.09
295 0.11
296 0.14
297 0.14
298 0.15
299 0.17
300 0.17
301 0.2
302 0.21
303 0.21
304 0.24
305 0.24
306 0.26
307 0.24
308 0.24
309 0.2
310 0.19
311 0.17
312 0.14
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.12
322 0.18
323 0.2
324 0.22
325 0.26
326 0.26
327 0.28
328 0.32
329 0.38
330 0.36
331 0.35
332 0.33
333 0.3
334 0.29
335 0.27
336 0.24
337 0.17
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.1
350 0.13
351 0.14
352 0.2
353 0.21
354 0.2
355 0.22
356 0.24
357 0.26
358 0.25
359 0.25
360 0.2
361 0.19
362 0.18
363 0.17
364 0.15
365 0.15
366 0.15
367 0.17
368 0.17
369 0.21
370 0.23
371 0.26
372 0.28
373 0.3
374 0.29
375 0.31
376 0.33
377 0.3
378 0.29
379 0.25
380 0.23
381 0.19
382 0.17
383 0.11
384 0.08
385 0.08
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.05
401 0.05
402 0.09
403 0.11
404 0.12
405 0.15
406 0.15
407 0.15
408 0.15
409 0.18
410 0.21
411 0.2
412 0.2
413 0.18
414 0.18
415 0.18
416 0.18
417 0.16
418 0.09
419 0.08
420 0.06
421 0.06
422 0.05
423 0.04
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.04
431 0.05
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.07
437 0.1
438 0.1
439 0.09
440 0.08
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.09
445 0.08
446 0.09
447 0.09
448 0.1
449 0.11
450 0.14
451 0.15
452 0.16
453 0.17
454 0.17
455 0.16
456 0.17
457 0.15
458 0.13
459 0.15
460 0.14
461 0.12
462 0.13
463 0.14
464 0.15
465 0.16
466 0.15
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.1
471 0.1
472 0.08
473 0.07
474 0.07
475 0.06
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.06
481 0.08
482 0.11
483 0.12
484 0.14
485 0.15
486 0.16
487 0.19
488 0.21
489 0.23
490 0.24
491 0.24
492 0.23
493 0.25
494 0.24
495 0.21
496 0.19
497 0.17
498 0.14
499 0.14
500 0.13
501 0.1
502 0.1
503 0.09
504 0.07
505 0.06
506 0.05
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.05
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.11
516 0.12
517 0.18
518 0.17
519 0.18
520 0.19
521 0.23
522 0.25
523 0.22
524 0.21
525 0.15
526 0.16
527 0.14
528 0.13
529 0.1
530 0.09
531 0.08
532 0.07
533 0.07
534 0.06
535 0.07
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.05
547 0.07
548 0.09
549 0.09
550 0.09
551 0.09
552 0.09
553 0.09
554 0.08
555 0.06
556 0.05
557 0.05
558 0.06
559 0.06
560 0.07
561 0.08
562 0.08
563 0.1
564 0.13
565 0.15
566 0.15
567 0.16
568 0.19
569 0.21
570 0.21
571 0.19
572 0.15
573 0.13
574 0.12
575 0.11
576 0.07
577 0.04
578 0.03
579 0.03
580 0.03
581 0.03
582 0.02
583 0.02
584 0.03
585 0.03
586 0.04
587 0.05
588 0.06
589 0.1
590 0.11
591 0.17
592 0.19
593 0.21
594 0.22
595 0.28
596 0.35
597 0.34
598 0.4
599 0.38
600 0.4
601 0.46
602 0.52
603 0.49
604 0.44
605 0.44
606 0.44
607 0.45
608 0.46
609 0.48
610 0.49
611 0.49
612 0.52
613 0.54
614 0.52
615 0.49
616 0.46
617 0.38
618 0.3
619 0.26
620 0.21
621 0.16
622 0.12
623 0.11
624 0.09
625 0.08
626 0.08
627 0.08
628 0.09
629 0.09
630 0.09
631 0.1
632 0.1
633 0.1
634 0.11
635 0.15
636 0.15
637 0.15
638 0.15
639 0.14
640 0.15
641 0.18
642 0.17
643 0.13
644 0.15
645 0.16
646 0.17
647 0.18
648 0.18
649 0.16
650 0.15
651 0.16
652 0.16
653 0.22
654 0.22
655 0.22
656 0.21
657 0.21
658 0.22
659 0.22
660 0.21
661 0.14
662 0.13
663 0.11
664 0.1
665 0.09
666 0.07
667 0.06
668 0.05
669 0.04
670 0.05
671 0.05
672 0.05
673 0.06
674 0.06
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.08
679 0.09
680 0.12
681 0.16
682 0.17
683 0.19
684 0.21
685 0.22
686 0.22
687 0.22
688 0.22
689 0.2
690 0.21
691 0.2
692 0.18
693 0.17
694 0.14
695 0.13
696 0.13
697 0.12
698 0.12
699 0.1
700 0.11
701 0.11
702 0.12
703 0.15
704 0.15
705 0.21
706 0.24
707 0.34
708 0.34
709 0.44
710 0.44
711 0.44
712 0.46
713 0.46
714 0.52
715 0.51
716 0.58
717 0.49
718 0.53
719 0.52
720 0.52
721 0.51
722 0.43
723 0.39
724 0.3
725 0.29
726 0.24
727 0.22
728 0.2
729 0.15
730 0.13
731 0.09
732 0.09
733 0.1
734 0.1
735 0.11
736 0.1
737 0.09
738 0.1
739 0.1
740 0.12
741 0.13
742 0.13
743 0.12
744 0.11
745 0.1
746 0.09
747 0.1
748 0.09
749 0.08
750 0.1
751 0.15
752 0.16
753 0.16
754 0.15
755 0.14
756 0.13
757 0.14
758 0.12
759 0.07
760 0.1
761 0.14
762 0.19
763 0.2
764 0.2
765 0.19
766 0.2
767 0.21
768 0.19
769 0.15
770 0.11
771 0.09
772 0.09
773 0.09
774 0.07
775 0.06
776 0.05
777 0.04
778 0.04
779 0.04
780 0.04
781 0.03
782 0.03
783 0.03
784 0.03
785 0.04
786 0.04
787 0.04
788 0.06
789 0.1
790 0.14
791 0.16
792 0.19
793 0.19
794 0.22
795 0.23
796 0.24
797 0.23
798 0.25
799 0.24
800 0.22
801 0.22
802 0.2
803 0.18
804 0.16
805 0.15
806 0.09
807 0.1
808 0.14
809 0.14
810 0.15
811 0.18
812 0.2
813 0.19
814 0.19
815 0.2
816 0.17
817 0.17
818 0.16
819 0.14
820 0.11
821 0.11
822 0.11
823 0.13
824 0.14
825 0.14
826 0.15
827 0.17
828 0.19
829 0.21
830 0.2
831 0.16
832 0.16
833 0.15
834 0.15
835 0.15
836 0.14
837 0.14
838 0.15
839 0.14
840 0.18
841 0.17
842 0.18
843 0.17
844 0.17
845 0.17
846 0.18
847 0.24
848 0.21
849 0.24
850 0.22
851 0.24
852 0.23
853 0.21
854 0.2
855 0.14
856 0.11
857 0.09
858 0.09
859 0.07
860 0.07
861 0.07
862 0.07
863 0.07
864 0.06
865 0.06
866 0.06
867 0.07
868 0.06
869 0.07
870 0.07
871 0.07
872 0.08
873 0.09
874 0.1
875 0.13
876 0.14
877 0.13
878 0.13
879 0.12
880 0.13
881 0.13
882 0.12
883 0.1
884 0.1
885 0.1
886 0.11
887 0.11
888 0.11
889 0.13
890 0.2
891 0.19
892 0.25
893 0.26
894 0.29
895 0.35
896 0.38
897 0.43
898 0.39
899 0.39
900 0.4
901 0.44
902 0.41
903 0.36
904 0.32
905 0.24
906 0.23
907 0.26
908 0.21
909 0.21
910 0.23
911 0.25
912 0.32
913 0.39
914 0.43
915 0.49
916 0.54
917 0.62
918 0.68
919 0.75
920 0.77
921 0.76
922 0.71
923 0.69
924 0.69
925 0.64
926 0.64
927 0.57
928 0.47
929 0.43
930 0.42
931 0.36
932 0.32
933 0.32
934 0.24
935 0.25
936 0.29
937 0.33
938 0.33
939 0.32
940 0.31
941 0.32
942 0.33
943 0.33
944 0.38
945 0.39
946 0.39
947 0.39
948 0.37
949 0.33
950 0.33
951 0.3
952 0.24
953 0.2
954 0.21
955 0.24
956 0.25
957 0.29
958 0.25
959 0.25
960 0.21
961 0.19
962 0.23
963 0.2
964 0.17
965 0.13
966 0.14
967 0.13
968 0.14
969 0.13
970 0.08
971 0.08
972 0.08
973 0.08
974 0.09
975 0.09
976 0.08
977 0.1
978 0.1
979 0.11
980 0.15
981 0.18
982 0.19
983 0.2
984 0.22
985 0.23
986 0.24
987 0.24
988 0.22
989 0.21
990 0.18
991 0.21
992 0.2
993 0.18
994 0.18
995 0.19
996 0.17
997 0.16
998 0.15
999 0.13
1000 0.11
1001 0.11
1002 0.13
1003 0.12
1004 0.11
1005 0.1
1006 0.1
1007 0.09
1008 0.1
1009 0.1
1010 0.05
1011 0.05
1012 0.08
1013 0.09
1014 0.1
1015 0.12
1016 0.15
1017 0.16
1018 0.18
1019 0.18
1020 0.19
1021 0.2
1022 0.2
1023 0.19
1024 0.18
1025 0.22
1026 0.2
1027 0.2
1028 0.18
1029 0.15
1030 0.14
1031 0.13
1032 0.12
1033 0.07
1034 0.07
1035 0.07
1036 0.07
1037 0.08
1038 0.09
1039 0.09
1040 0.09
1041 0.1
1042 0.12
1043 0.12
1044 0.13
1045 0.13
1046 0.15
1047 0.22