Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HHK4

Protein Details
Accession U1HHK4    Localization Confidence Low Confidence Score 6.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-97KMYLDFRIKHLRRKNPIKQKPEFNKVNAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 8.5, nucl 6.5, pero 6, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Amino Acid Sequences MAKSAPQNPDFFLISSEDTIYEQDILRNPGSVRPWLTYIDHKLRNGTIHEQAFVQERACISLPRSYKLWKMYLDFRIKHLRRKNPIKQKPEFNKVNALFERAIILLNKMPVIWEMYLSFLLRQPLVTKTRRTFDRALRALPITQHNRIWRLYKTFANSAGGDTAVKIWTRYMQIHPEDMEDFIELLIETGNYTEAVKRYIQILNNPKFQSKSAKSQFQLWSEMVELMVSKAREIGDNTASGLDVDAIIRSGIERFADQRGKLWTGLATYWITRGDFERARDVFEEGITTVMTVRDFTLIFDSYVEFEESIISNLMESASARAAKGVTNEDADFDLDMRMMRFEHLMDRRPFLVNDVLLRQNPNNVIEWEKRVALWNDNKVEVVQTYTDAIAAIQPKKAVGKFHELWLNYAKLYEDGGDLATARVILDKAVKVPYKSVAELAETWIGWAEMELRNENFDRAIEIMATATRAPKRSTVDYFDETLSPQQRVHKAWKLWSFYVDLVESVASLDETRAIYDRIFELRIATPQTVVNYANLLEEHNYYEDSFKIYERGLDLFSYPVAFELWNLYLTKAVDRRISMERLRDLFEQAVESVPPQFAKAIYLMYGNLEEERGLARHAMRIYERATRAVSDEDRSSMFSFYITKSASNFGLTSTRPIYERAIAALPDKEAKDMCLKFAEMERRLGEIDRARAIYGHASQFADPRTQKDFWDQWEKFEVGHGNEDTFKEMLRVRRSVASQYNTDVNYIASQAIARANASKANQANGAGDAYADHNADDNADDGRDAMAALERQARAPVGFVAASTAPQNGNQPVQPPQPAASVANPDAIEVDVDDDDDP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.21
4 0.17
5 0.16
6 0.16
7 0.16
8 0.15
9 0.13
10 0.16
11 0.19
12 0.23
13 0.23
14 0.25
15 0.25
16 0.29
17 0.31
18 0.33
19 0.32
20 0.3
21 0.32
22 0.33
23 0.35
24 0.38
25 0.44
26 0.48
27 0.51
28 0.5
29 0.51
30 0.51
31 0.52
32 0.49
33 0.45
34 0.44
35 0.39
36 0.39
37 0.35
38 0.34
39 0.34
40 0.31
41 0.25
42 0.19
43 0.18
44 0.21
45 0.21
46 0.22
47 0.19
48 0.25
49 0.27
50 0.29
51 0.32
52 0.32
53 0.37
54 0.42
55 0.45
56 0.43
57 0.45
58 0.5
59 0.56
60 0.61
61 0.56
62 0.56
63 0.61
64 0.61
65 0.66
66 0.67
67 0.68
68 0.69
69 0.79
70 0.84
71 0.84
72 0.9
73 0.9
74 0.89
75 0.9
76 0.89
77 0.88
78 0.84
79 0.77
80 0.77
81 0.69
82 0.69
83 0.59
84 0.54
85 0.44
86 0.37
87 0.35
88 0.25
89 0.24
90 0.16
91 0.17
92 0.15
93 0.15
94 0.15
95 0.13
96 0.13
97 0.12
98 0.15
99 0.13
100 0.12
101 0.11
102 0.13
103 0.15
104 0.15
105 0.15
106 0.14
107 0.16
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.21
112 0.28
113 0.32
114 0.39
115 0.42
116 0.5
117 0.53
118 0.58
119 0.59
120 0.61
121 0.66
122 0.62
123 0.59
124 0.55
125 0.53
126 0.48
127 0.44
128 0.44
129 0.39
130 0.39
131 0.42
132 0.43
133 0.45
134 0.46
135 0.47
136 0.43
137 0.43
138 0.44
139 0.44
140 0.44
141 0.44
142 0.44
143 0.42
144 0.37
145 0.32
146 0.28
147 0.23
148 0.18
149 0.14
150 0.13
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.13
156 0.17
157 0.2
158 0.23
159 0.29
160 0.31
161 0.34
162 0.34
163 0.33
164 0.3
165 0.27
166 0.23
167 0.15
168 0.13
169 0.09
170 0.09
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.08
181 0.09
182 0.12
183 0.12
184 0.13
185 0.16
186 0.2
187 0.22
188 0.28
189 0.38
190 0.42
191 0.49
192 0.5
193 0.49
194 0.46
195 0.46
196 0.47
197 0.42
198 0.46
199 0.47
200 0.53
201 0.52
202 0.59
203 0.62
204 0.54
205 0.54
206 0.43
207 0.37
208 0.29
209 0.28
210 0.2
211 0.14
212 0.11
213 0.08
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.1
218 0.1
219 0.12
220 0.14
221 0.17
222 0.16
223 0.16
224 0.17
225 0.15
226 0.14
227 0.12
228 0.11
229 0.07
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.09
242 0.16
243 0.2
244 0.2
245 0.23
246 0.26
247 0.27
248 0.27
249 0.25
250 0.2
251 0.17
252 0.17
253 0.16
254 0.13
255 0.11
256 0.12
257 0.13
258 0.12
259 0.11
260 0.13
261 0.17
262 0.19
263 0.2
264 0.27
265 0.26
266 0.28
267 0.28
268 0.27
269 0.22
270 0.19
271 0.18
272 0.1
273 0.1
274 0.08
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.1
292 0.08
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.09
311 0.1
312 0.12
313 0.11
314 0.13
315 0.13
316 0.13
317 0.13
318 0.13
319 0.11
320 0.09
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.13
331 0.17
332 0.24
333 0.25
334 0.26
335 0.28
336 0.28
337 0.28
338 0.23
339 0.23
340 0.16
341 0.16
342 0.17
343 0.18
344 0.17
345 0.19
346 0.17
347 0.17
348 0.17
349 0.17
350 0.15
351 0.14
352 0.18
353 0.18
354 0.21
355 0.2
356 0.19
357 0.18
358 0.2
359 0.2
360 0.22
361 0.25
362 0.28
363 0.29
364 0.29
365 0.28
366 0.25
367 0.24
368 0.18
369 0.14
370 0.08
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.13
384 0.15
385 0.16
386 0.15
387 0.22
388 0.23
389 0.26
390 0.3
391 0.28
392 0.28
393 0.28
394 0.26
395 0.17
396 0.17
397 0.14
398 0.1
399 0.1
400 0.08
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.04
408 0.04
409 0.03
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.06
414 0.06
415 0.08
416 0.12
417 0.13
418 0.13
419 0.14
420 0.18
421 0.18
422 0.18
423 0.18
424 0.14
425 0.14
426 0.14
427 0.15
428 0.12
429 0.1
430 0.09
431 0.08
432 0.07
433 0.06
434 0.05
435 0.06
436 0.08
437 0.09
438 0.1
439 0.1
440 0.12
441 0.13
442 0.13
443 0.11
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.05
452 0.06
453 0.05
454 0.08
455 0.1
456 0.12
457 0.13
458 0.17
459 0.21
460 0.25
461 0.28
462 0.3
463 0.33
464 0.33
465 0.34
466 0.3
467 0.27
468 0.23
469 0.24
470 0.21
471 0.17
472 0.16
473 0.19
474 0.23
475 0.26
476 0.32
477 0.35
478 0.36
479 0.42
480 0.47
481 0.47
482 0.43
483 0.42
484 0.37
485 0.3
486 0.29
487 0.22
488 0.15
489 0.11
490 0.1
491 0.08
492 0.06
493 0.05
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.08
504 0.1
505 0.1
506 0.11
507 0.1
508 0.12
509 0.12
510 0.15
511 0.16
512 0.14
513 0.14
514 0.14
515 0.15
516 0.14
517 0.14
518 0.12
519 0.1
520 0.1
521 0.1
522 0.09
523 0.09
524 0.08
525 0.08
526 0.09
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.1
531 0.1
532 0.1
533 0.1
534 0.1
535 0.11
536 0.1
537 0.11
538 0.12
539 0.13
540 0.12
541 0.11
542 0.11
543 0.1
544 0.1
545 0.09
546 0.08
547 0.07
548 0.06
549 0.06
550 0.05
551 0.08
552 0.08
553 0.09
554 0.1
555 0.1
556 0.11
557 0.12
558 0.16
559 0.16
560 0.18
561 0.2
562 0.2
563 0.24
564 0.26
565 0.31
566 0.3
567 0.33
568 0.35
569 0.34
570 0.37
571 0.34
572 0.31
573 0.27
574 0.24
575 0.2
576 0.15
577 0.14
578 0.11
579 0.1
580 0.09
581 0.09
582 0.09
583 0.08
584 0.08
585 0.08
586 0.09
587 0.09
588 0.09
589 0.09
590 0.09
591 0.09
592 0.09
593 0.09
594 0.09
595 0.08
596 0.08
597 0.07
598 0.07
599 0.08
600 0.07
601 0.07
602 0.09
603 0.09
604 0.13
605 0.14
606 0.17
607 0.17
608 0.2
609 0.23
610 0.28
611 0.29
612 0.27
613 0.27
614 0.25
615 0.26
616 0.27
617 0.26
618 0.22
619 0.22
620 0.21
621 0.21
622 0.23
623 0.22
624 0.17
625 0.15
626 0.13
627 0.14
628 0.13
629 0.17
630 0.16
631 0.16
632 0.16
633 0.19
634 0.19
635 0.18
636 0.17
637 0.14
638 0.17
639 0.17
640 0.2
641 0.19
642 0.2
643 0.19
644 0.21
645 0.23
646 0.22
647 0.22
648 0.2
649 0.2
650 0.19
651 0.2
652 0.2
653 0.18
654 0.19
655 0.18
656 0.18
657 0.16
658 0.18
659 0.24
660 0.24
661 0.24
662 0.23
663 0.23
664 0.23
665 0.29
666 0.36
667 0.29
668 0.33
669 0.32
670 0.31
671 0.32
672 0.31
673 0.3
674 0.26
675 0.28
676 0.27
677 0.27
678 0.25
679 0.25
680 0.25
681 0.24
682 0.23
683 0.22
684 0.21
685 0.21
686 0.22
687 0.25
688 0.26
689 0.29
690 0.26
691 0.28
692 0.31
693 0.31
694 0.32
695 0.37
696 0.4
697 0.39
698 0.49
699 0.45
700 0.43
701 0.48
702 0.46
703 0.38
704 0.38
705 0.35
706 0.26
707 0.31
708 0.28
709 0.24
710 0.26
711 0.27
712 0.25
713 0.2
714 0.18
715 0.16
716 0.2
717 0.26
718 0.3
719 0.31
720 0.31
721 0.37
722 0.4
723 0.44
724 0.48
725 0.45
726 0.42
727 0.43
728 0.45
729 0.4
730 0.38
731 0.31
732 0.23
733 0.19
734 0.18
735 0.14
736 0.09
737 0.09
738 0.1
739 0.11
740 0.11
741 0.11
742 0.13
743 0.14
744 0.18
745 0.2
746 0.25
747 0.25
748 0.27
749 0.29
750 0.27
751 0.27
752 0.24
753 0.23
754 0.16
755 0.14
756 0.12
757 0.11
758 0.12
759 0.11
760 0.1
761 0.1
762 0.1
763 0.11
764 0.1
765 0.1
766 0.09
767 0.09
768 0.08
769 0.08
770 0.08
771 0.08
772 0.07
773 0.07
774 0.09
775 0.1
776 0.12
777 0.18
778 0.18
779 0.19
780 0.21
781 0.22
782 0.18
783 0.19
784 0.18
785 0.15
786 0.14
787 0.13
788 0.15
789 0.14
790 0.14
791 0.14
792 0.15
793 0.13
794 0.15
795 0.2
796 0.2
797 0.23
798 0.24
799 0.27
800 0.32
801 0.37
802 0.38
803 0.36
804 0.35
805 0.34
806 0.34
807 0.34
808 0.31
809 0.31
810 0.29
811 0.31
812 0.29
813 0.26
814 0.24
815 0.22
816 0.18
817 0.12
818 0.13
819 0.09