Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GCA7

Protein Details
Accession U1GCA7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-188MPPFPVKKVARNPPRRRKVAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-185KKVARNPPRRRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13, cyto 11.5, nucl 9.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
CDD cd00303  retropepsin_like  
Amino Acid Sequences MSREDTPEEVAQPDEARTEKPPSGMSFARFDIATTLHYPPDASTPLSFCLDSGSSISLIGRACFEKYFQDSTIRLAPILIPVAGVAGVTRTTEYINIEVRLKSEKGKFIRIGGEFHIVPSLSCSILLANDILHTYQGILDIGAEKATFANTHVIPISVFKKASALPNMPPFPVKKVARNPPRRRKVAVYAAGSTVIEAGQGINISVKHRPLPAGKSYLFMPYPIEDMATGRLASGSKAILSDDPEAVPFANFGESAIRIHPKRQLGCLEELKDSHLGAQVIRDTLMTRVFIGETDLGDNQPFVIAKDKDEDFDVVLADISEH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.18
4 0.21
5 0.26
6 0.26
7 0.27
8 0.31
9 0.3
10 0.36
11 0.37
12 0.36
13 0.34
14 0.33
15 0.32
16 0.28
17 0.25
18 0.21
19 0.18
20 0.18
21 0.17
22 0.18
23 0.17
24 0.17
25 0.17
26 0.16
27 0.2
28 0.19
29 0.17
30 0.17
31 0.18
32 0.21
33 0.22
34 0.21
35 0.16
36 0.18
37 0.16
38 0.16
39 0.15
40 0.14
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.12
48 0.11
49 0.13
50 0.13
51 0.14
52 0.17
53 0.21
54 0.24
55 0.23
56 0.28
57 0.27
58 0.3
59 0.34
60 0.3
61 0.25
62 0.22
63 0.21
64 0.17
65 0.18
66 0.14
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.04
73 0.03
74 0.04
75 0.04
76 0.05
77 0.05
78 0.06
79 0.07
80 0.09
81 0.11
82 0.13
83 0.15
84 0.17
85 0.17
86 0.17
87 0.2
88 0.19
89 0.22
90 0.24
91 0.3
92 0.31
93 0.38
94 0.38
95 0.37
96 0.42
97 0.37
98 0.35
99 0.3
100 0.3
101 0.24
102 0.22
103 0.21
104 0.15
105 0.13
106 0.13
107 0.11
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.05
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.12
143 0.13
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.16
150 0.18
151 0.18
152 0.19
153 0.25
154 0.26
155 0.25
156 0.25
157 0.22
158 0.22
159 0.29
160 0.28
161 0.28
162 0.36
163 0.46
164 0.55
165 0.65
166 0.73
167 0.75
168 0.83
169 0.8
170 0.76
171 0.72
172 0.7
173 0.68
174 0.64
175 0.56
176 0.48
177 0.44
178 0.4
179 0.34
180 0.25
181 0.16
182 0.09
183 0.05
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.05
190 0.05
191 0.07
192 0.09
193 0.11
194 0.12
195 0.14
196 0.17
197 0.2
198 0.24
199 0.27
200 0.31
201 0.3
202 0.3
203 0.3
204 0.31
205 0.27
206 0.22
207 0.19
208 0.14
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.09
213 0.1
214 0.11
215 0.1
216 0.09
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.11
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.08
241 0.09
242 0.1
243 0.13
244 0.19
245 0.19
246 0.23
247 0.29
248 0.34
249 0.36
250 0.4
251 0.44
252 0.41
253 0.47
254 0.51
255 0.48
256 0.43
257 0.4
258 0.38
259 0.33
260 0.28
261 0.22
262 0.19
263 0.17
264 0.15
265 0.18
266 0.17
267 0.17
268 0.17
269 0.16
270 0.13
271 0.14
272 0.16
273 0.14
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.12
278 0.15
279 0.14
280 0.12
281 0.14
282 0.15
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.11
287 0.12
288 0.11
289 0.1
290 0.18
291 0.18
292 0.2
293 0.25
294 0.26
295 0.26
296 0.28
297 0.28
298 0.21
299 0.21
300 0.19
301 0.14
302 0.13