Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HTX5

Protein Details
Accession U1HTX5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-70FSAKGPMTYKKQHKSKLKPHRNPYRDAQAHydrophilic
323-343KNDKHNKRSLRLLVHRRQKLLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-59KSKLK
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 9.833, nucl 8.5, cyto_nucl 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000589  Ribosomal_S15  
IPR005290  Ribosomal_S15_bac-type  
IPR009068  S15_NS1_RNA-bd  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00312  Ribosomal_S15  
CDD cd00353  Ribosomal_S15p_S13e  
Amino Acid Sequences MPPRLLPIGGAPPFNLRSLLQSLPAAASYAKNGICASCSYSFSAKGPMTYKKQHKSKLKPHRNPYRDAQANQRKAANQARQKLLQEQRAKAMGDPIRSLPTPFIESLSTGRMPDEPAEEELRNYFLGPDELPSSLEYSKKLSAPYIPKAEETAQSAEASPSPLAWAVPPPAPDSSTKELSSLSSSTDPPILPIERGDTSLPQPRTFPVDNPYTRSYSVPAQPTAKELVNLHEAAHRNATRALTLISSLTNGSSSDFTRHNVQRCISTFGRHNTDAYLPPRPTSIYNTNPSPPKLRAGPDTGSSEVQVAILTTKINVLADNLHKNDKHNKRSLRLLVHRRQKLLAYLQRRERGSARWKNLVENLGIQDAMWKGEISL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.28
3 0.19
4 0.22
5 0.26
6 0.26
7 0.23
8 0.22
9 0.22
10 0.21
11 0.21
12 0.17
13 0.13
14 0.13
15 0.12
16 0.17
17 0.16
18 0.16
19 0.17
20 0.16
21 0.17
22 0.17
23 0.2
24 0.19
25 0.21
26 0.22
27 0.24
28 0.26
29 0.25
30 0.31
31 0.27
32 0.28
33 0.31
34 0.36
35 0.41
36 0.49
37 0.58
38 0.6
39 0.68
40 0.74
41 0.8
42 0.83
43 0.86
44 0.88
45 0.9
46 0.9
47 0.92
48 0.93
49 0.88
50 0.83
51 0.8
52 0.8
53 0.76
54 0.68
55 0.69
56 0.68
57 0.69
58 0.66
59 0.62
60 0.53
61 0.52
62 0.58
63 0.56
64 0.54
65 0.56
66 0.58
67 0.59
68 0.59
69 0.62
70 0.6
71 0.6
72 0.59
73 0.53
74 0.52
75 0.51
76 0.5
77 0.41
78 0.41
79 0.36
80 0.31
81 0.3
82 0.27
83 0.27
84 0.27
85 0.27
86 0.2
87 0.2
88 0.2
89 0.18
90 0.18
91 0.15
92 0.16
93 0.17
94 0.19
95 0.17
96 0.14
97 0.15
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.15
102 0.13
103 0.15
104 0.18
105 0.18
106 0.18
107 0.17
108 0.17
109 0.15
110 0.13
111 0.11
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.12
124 0.14
125 0.16
126 0.17
127 0.18
128 0.17
129 0.22
130 0.27
131 0.32
132 0.34
133 0.32
134 0.31
135 0.33
136 0.33
137 0.28
138 0.25
139 0.22
140 0.17
141 0.16
142 0.16
143 0.15
144 0.13
145 0.13
146 0.1
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.08
154 0.1
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.13
159 0.15
160 0.19
161 0.21
162 0.23
163 0.22
164 0.21
165 0.21
166 0.21
167 0.21
168 0.15
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.13
174 0.12
175 0.11
176 0.13
177 0.12
178 0.1
179 0.1
180 0.12
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.13
186 0.21
187 0.22
188 0.2
189 0.2
190 0.19
191 0.25
192 0.24
193 0.23
194 0.21
195 0.27
196 0.28
197 0.32
198 0.34
199 0.3
200 0.3
201 0.29
202 0.26
203 0.23
204 0.27
205 0.25
206 0.25
207 0.25
208 0.24
209 0.26
210 0.26
211 0.22
212 0.19
213 0.16
214 0.17
215 0.18
216 0.18
217 0.16
218 0.18
219 0.19
220 0.18
221 0.24
222 0.21
223 0.2
224 0.22
225 0.21
226 0.17
227 0.16
228 0.16
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.07
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.23
245 0.28
246 0.32
247 0.35
248 0.35
249 0.39
250 0.4
251 0.45
252 0.37
253 0.36
254 0.37
255 0.38
256 0.43
257 0.37
258 0.36
259 0.31
260 0.33
261 0.35
262 0.32
263 0.34
264 0.29
265 0.28
266 0.29
267 0.29
268 0.28
269 0.29
270 0.34
271 0.33
272 0.38
273 0.41
274 0.46
275 0.48
276 0.49
277 0.47
278 0.41
279 0.39
280 0.38
281 0.39
282 0.38
283 0.39
284 0.39
285 0.38
286 0.4
287 0.37
288 0.33
289 0.29
290 0.25
291 0.19
292 0.17
293 0.12
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.07
303 0.08
304 0.13
305 0.19
306 0.25
307 0.27
308 0.33
309 0.34
310 0.38
311 0.48
312 0.53
313 0.56
314 0.59
315 0.65
316 0.65
317 0.74
318 0.77
319 0.77
320 0.77
321 0.79
322 0.79
323 0.81
324 0.81
325 0.75
326 0.69
327 0.62
328 0.58
329 0.58
330 0.57
331 0.56
332 0.58
333 0.64
334 0.69
335 0.67
336 0.65
337 0.58
338 0.58
339 0.6
340 0.61
341 0.6
342 0.62
343 0.62
344 0.63
345 0.66
346 0.6
347 0.51
348 0.45
349 0.41
350 0.33
351 0.31
352 0.25
353 0.23
354 0.2
355 0.19
356 0.15